MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014160	GA	3	6	181394	181399	50 %	0 %	50 %	0 %	296241947
3002	NC_014160	CTC	2	6	181474	181479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241947
3003	NC_014160	AGT	2	6	181528	181533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241947
3004	NC_014160	TAA	2	6	181578	181583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241947
3005	NC_014160	TAG	2	6	181645	181650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241948
3006	NC_014160	ACA	2	6	181651	181656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241948
3007	NC_014160	TC	4	8	181665	181672	0 %	50 %	0 %	50 %	296241948
3008	NC_014160	AGG	2	6	181750	181755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241948
3009	NC_014160	AT	3	6	181763	181768	50 %	50 %	0 %	0 %	296241948
3010	NC_014160	CCG	2	6	181793	181798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241948
3011	NC_014160	TA	3	6	181823	181828	50 %	50 %	0 %	0 %	296241948
3012	NC_014160	TGGA	2	8	181833	181840	25 %	25 %	50 %	0 %	296241948
3013	NC_014160	GAG	2	6	181848	181853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241948
3014	NC_014160	GAAA	2	8	182089	182096	75 %	0 %	25 %	0 %	296241948
3015	NC_014160	AGA	2	6	182099	182104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241948
3016	NC_014160	TC	3	6	182164	182169	0 %	50 %	0 %	50 %	296241949
3017	NC_014160	A	6	6	182213	182218	100 %	0 %	0 %	0 %	296241949
3018	NC_014160	GTT	2	6	182221	182226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241949
3019	NC_014160	GCC	2	6	182244	182249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241949
3020	NC_014160	CAA	2	6	182381	182386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241949
3021	NC_014160	GCC	2	6	182437	182442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241949
3022	NC_014160	TAA	2	6	182531	182536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241949
3023	NC_014160	TAC	2	6	182588	182593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241949
3024	NC_014160	TTG	2	6	182613	182618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241949
3025	NC_014160	GAA	2	6	182626	182631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241949
3026	NC_014160	TTTC	2	8	182632	182639	0 %	75 %	0 %	25 %	296241949
3027	NC_014160	CTG	2	6	182673	182678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241949
3028	NC_014160	AT	3	6	182698	182703	50 %	50 %	0 %	0 %	296241949
3029	NC_014160	TAC	2	6	182704	182709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241949
3030	NC_014160	AGGGT	2	10	182711	182720	20 %	20 %	60 %	0 %	296241949
3031	NC_014160	GA	4	8	182755	182762	50 %	0 %	50 %	0 %	296241949
3032	NC_014160	ATGA	2	8	182779	182786	50 %	25 %	25 %	0 %	296241949
3033	NC_014160	GAA	2	6	182926	182931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241950
3034	NC_014160	ATT	2	6	182960	182965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241950
3035	NC_014160	GATAAA	2	12	183026	183037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296241950
3036	NC_014160	TTG	2	6	183039	183044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241950
3037	NC_014160	AGA	2	6	183079	183084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241950
3038	NC_014160	CTA	2	6	183127	183132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241950
3039	NC_014160	GATA	2	8	183142	183149	50 %	25 %	25 %	0 %	296241950
3040	NC_014160	AAT	2	6	183151	183156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241950
3041	NC_014160	TTCT	2	8	183160	183167	0 %	75 %	0 %	25 %	296241950
3042	NC_014160	AAT	2	6	183169	183174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241950
3043	NC_014160	GGA	2	6	183335	183340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241950
3044	NC_014160	AAT	2	6	183418	183423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241950
3045	NC_014160	GAG	3	9	183467	183475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241950
3046	NC_014160	ATT	2	6	183517	183522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241950
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3051	NC_014160	AT	3	6	183767	183772	50 %	50 %	0 %	0 %	296241951
3052	NC_014160	AAG	2	6	183835	183840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241951
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3054	NC_014160	T	6	6	183887	183892	0 %	100 %	0 %	0 %	296241951
3055	NC_014160	CCT	2	6	184021	184026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241951
3056	NC_014160	GAT	2	6	184061	184066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241951
3057	NC_014160	CAG	2	6	184102	184107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241951
3058	NC_014160	G	6	6	184123	184128	0 %	0 %	100 %	0 %	296241951
3059	NC_014160	ATTT	2	8	184145	184152	25 %	75 %	0 %	0 %	296241951
3060	NC_014160	ACC	2	6	184182	184187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241951
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3062	NC_014160	A	6	6	184323	184328	100 %	0 %	0 %	0 %	296241952
3063	NC_014160	CAA	2	6	184340	184345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241952
3064	NC_014160	TAG	2	6	184346	184351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241952
3065	NC_014160	GA	3	6	184410	184415	50 %	0 %	50 %	0 %	296241952
3066	NC_014160	CTT	2	6	184468	184473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241952
3067	NC_014160	GGA	2	6	184555	184560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241952
3068	NC_014160	TA	3	6	184674	184679	50 %	50 %	0 %	0 %	296241952
3069	NC_014160	TTC	2	6	184684	184689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241952
3070	NC_014160	CTC	2	6	184751	184756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241952
3071	NC_014160	TGG	2	6	184806	184811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241952
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3073	NC_014160	ATA	2	6	184819	184824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241952
3074	NC_014160	TGA	2	6	184838	184843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241952
3075	NC_014160	GTG	2	6	184891	184896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241952
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3077	NC_014160	AT	3	6	185058	185063	50 %	50 %	0 %	0 %	296241953
3078	NC_014160	TTG	2	6	185065	185070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241953
3079	NC_014160	AACGTA	2	12	185159	185170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296241953
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3081	NC_014160	GCTC	2	8	185358	185365	0 %	25 %	25 %	50 %	296241954
3082	NC_014160	TGG	2	6	185536	185541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241954
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3086	NC_014160	TCC	2	6	185718	185723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241954
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3088	NC_014160	AGGC	2	8	185832	185839	25 %	0 %	50 %	25 %	296241954
3089	NC_014160	TAT	2	6	185844	185849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241954
3090	NC_014160	ATT	2	6	186080	186085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241955
3091	NC_014160	A	6	6	186104	186109	100 %	0 %	0 %	0 %	296241955
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3093	NC_014160	TTG	2	6	186225	186230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241955
3094	NC_014160	CTG	2	6	186234	186239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241955
3095	NC_014160	AG	3	6	186281	186286	50 %	0 %	50 %	0 %	296241955
3096	NC_014160	AGA	2	6	186341	186346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241955
3097	NC_014160	TCC	2	6	186414	186419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241955
3098	NC_014160	CTG	2	6	186429	186434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241955
3099	NC_014160	ATG	2	6	186476	186481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241955
3100	NC_014160	CT	3	6	186561	186566	0 %	50 %	0 %	50 %	296241955
3101	NC_014160	TTC	2	6	186588	186593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241955
3102	NC_014160	CCG	2	6	186699	186704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241956
3103	NC_014160	TGG	2	6	186747	186752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241956
3104	NC_014160	AATA	2	8	186758	186765	75 %	25 %	0 %	0 %	296241956
3105	NC_014160	GCTC	2	8	186786	186793	0 %	25 %	25 %	50 %	296241956
3106	NC_014160	TA	3	6	186813	186818	50 %	50 %	0 %	0 %	296241956
3107	NC_014160	GAT	2	6	186844	186849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241956
3108	NC_014160	GA	3	6	186850	186855	50 %	0 %	50 %	0 %	296241956
3109	NC_014160	TA	3	6	186862	186867	50 %	50 %	0 %	0 %	296241956
3110	NC_014160	GGA	2	6	186874	186879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241956
3111	NC_014160	TGA	2	6	186910	186915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241956
3112	NC_014160	TCA	2	6	186939	186944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241956
3113	NC_014160	GAG	2	6	186973	186978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241956
3114	NC_014160	AAGG	2	8	187096	187103	50 %	0 %	50 %	0 %	296241956
3115	NC_014160	CGAGTA	2	12	187294	187305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296241956
3116	NC_014160	TCA	2	6	187337	187342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241956
3117	NC_014160	TTC	2	6	187366	187371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241956
3118	NC_014160	CTG	2	6	187438	187443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241956
3119	NC_014160	TC	3	6	187463	187468	0 %	50 %	0 %	50 %	296241956
3120	NC_014160	TAA	2	6	187556	187561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241956
3121	NC_014160	AGGA	2	8	187649	187656	50 %	0 %	50 %	0 %	296241956
3122	NC_014160	ATT	2	6	187672	187677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241956
3123	NC_014160	CGATG	2	10	187681	187690	20 %	20 %	40 %	20 %	296241956
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3372	NC_014160	ATC	2	6	201936	201941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241970
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3492	NC_014160	AGCG	2	8	208584	208591	25 %	0 %	50 %	25 %	296241980
3493	NC_014160	ATT	2	6	208649	208654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241980
3494	NC_014160	TTAAA	2	10	208655	208664	60 %	40 %	0 %	0 %	296241980
3495	NC_014160	ATGTTA	2	12	208703	208714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296241980
3496	NC_014160	CG	3	6	208722	208727	0 %	0 %	50 %	50 %	296241980
3497	NC_014160	T	6	6	208785	208790	0 %	100 %	0 %	0 %	296241980
3498	NC_014160	C	6	6	208814	208819	0 %	0 %	0 %	100 %	296241980
3499	NC_014160	CGG	2	6	208848	208853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241980
3500	NC_014160	ATGGAG	2	12	208861	208872	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296241980

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