MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_014160	TAC	2	6	1290542	1290547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243104
22002	NC_014160	GGA	2	6	1290601	1290606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243104
22003	NC_014160	TGA	2	6	1290629	1290634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243104
22004	NC_014160	ATGGA	2	10	1290641	1290650	40 %	20 %	40 %	0 %	296243104
22005	NC_014160	AGGGAT	2	12	1290673	1290684	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296243104
22006	NC_014160	AGG	2	6	1290695	1290700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243104
22007	NC_014160	GGCC	2	8	1290705	1290712	0 %	0 %	50 %	50 %	296243104
22008	NC_014160	TGA	2	6	1290846	1290851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243104
22009	NC_014160	AG	3	6	1290865	1290870	50 %	0 %	50 %	0 %	296243104
22010	NC_014160	AAG	3	9	1290883	1290891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243104
22011	NC_014160	GAG	2	6	1291045	1291050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243105
22012	NC_014160	CCA	2	6	1291055	1291060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243105
22013	NC_014160	CAT	2	6	1291061	1291066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243105
22014	NC_014160	GAA	2	6	1291120	1291125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243105
22015	NC_014160	TTA	2	6	1291127	1291132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243105
22016	NC_014160	AGA	2	6	1291133	1291138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243105
22017	NC_014160	AG	3	6	1291212	1291217	50 %	0 %	50 %	0 %	296243105
22018	NC_014160	TGA	2	6	1291223	1291228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243105
22019	NC_014160	ATT	2	6	1291300	1291305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243105
22020	NC_014160	AAG	2	6	1291330	1291335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243105
22021	NC_014160	AAG	2	6	1291432	1291437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243105
22022	NC_014160	GAG	2	6	1291441	1291446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243105
22023	NC_014160	AAT	2	6	1291536	1291541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243106
22024	NC_014160	GA	3	6	1291557	1291562	50 %	0 %	50 %	0 %	296243106
22025	NC_014160	CTT	2	6	1291607	1291612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243106
22026	NC_014160	CTT	2	6	1291629	1291634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243106
22027	NC_014160	CTC	2	6	1291741	1291746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243106
22028	NC_014160	CCT	2	6	1291754	1291759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243106
22029	NC_014160	CGC	2	6	1291767	1291772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243106
22030	NC_014160	ATG	2	6	1291777	1291782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243106
22031	NC_014160	GA	3	6	1291792	1291797	50 %	0 %	50 %	0 %	296243106
22032	NC_014160	AG	3	6	1291911	1291916	50 %	0 %	50 %	0 %	296243106
22033	NC_014160	TTA	2	6	1292117	1292122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243106
22034	NC_014160	GAA	2	6	1292196	1292201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243106
22035	NC_014160	GGAT	2	8	1292255	1292262	25 %	25 %	50 %	0 %	296243106
22036	NC_014160	TCT	2	6	1292270	1292275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243106
22037	NC_014160	AGG	2	6	1292380	1292385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243106
22038	NC_014160	ACCT	2	8	1292578	1292585	25 %	25 %	0 %	50 %	296243107
22039	NC_014160	TGT	2	6	1292639	1292644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296243107
22040	NC_014160	ATT	2	6	1292677	1292682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243107
22041	NC_014160	ACAT	2	8	1292698	1292705	50 %	25 %	0 %	25 %	296243107
22042	NC_014160	GA	3	6	1292907	1292912	50 %	0 %	50 %	0 %	296243108
22043	NC_014160	GCC	2	6	1292924	1292929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243108
22044	NC_014160	GAG	2	6	1292946	1292951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243108
22045	NC_014160	CGG	2	6	1292962	1292967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243108
22046	NC_014160	ATA	2	6	1292979	1292984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243108
22047	NC_014160	ATC	2	6	1293009	1293014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243108
22048	NC_014160	AGGGA	2	10	1293037	1293046	40 %	0 %	60 %	0 %	296243108
22049	NC_014160	GA	4	8	1293120	1293127	50 %	0 %	50 %	0 %	296243108
22050	NC_014160	GACTT	2	10	1293257	1293266	20 %	40 %	20 %	20 %	296243109
22051	NC_014160	CTG	2	6	1293312	1293317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243109
22052	NC_014160	TGCT	2	8	1293332	1293339	0 %	50 %	25 %	25 %	296243109
22053	NC_014160	ACGTAG	2	12	1293344	1293355	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296243109
22054	NC_014160	TCT	2	6	1293363	1293368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243109
22055	NC_014160	CAG	2	6	1293376	1293381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243109
22056	NC_014160	TAC	2	6	1293427	1293432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243109
22057	NC_014160	TGCC	2	8	1293439	1293446	0 %	25 %	25 %	50 %	296243109
22058	NC_014160	CT	3	6	1293447	1293452	0 %	50 %	0 %	50 %	296243109
22059	NC_014160	CTT	2	6	1293481	1293486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243109
22060	NC_014160	T	6	6	1293511	1293516	0 %	100 %	0 %	0 %	296243109
22061	NC_014160	ACC	2	6	1293700	1293705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243110
22062	NC_014160	TA	3	6	1293746	1293751	50 %	50 %	0 %	0 %	296243110
22063	NC_014160	TAT	2	6	1293756	1293761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243110
22064	NC_014160	CCT	2	6	1293767	1293772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243110
22065	NC_014160	TTCTC	2	10	1293785	1293794	0 %	60 %	0 %	40 %	296243110
22066	NC_014160	ATT	2	6	1293880	1293885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243110
22067	NC_014160	CCT	3	9	1293905	1293913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243110
22068	NC_014160	CTG	2	6	1293919	1293924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243110
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22071	NC_014160	GAT	2	6	1294039	1294044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243110
22072	NC_014160	GTA	2	6	1294080	1294085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243110
22073	NC_014160	TCC	2	6	1294138	1294143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243110
22074	NC_014160	CTC	3	9	1294306	1294314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243110
22075	NC_014160	ATC	2	6	1294372	1294377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243110
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22084	NC_014160	CTC	2	6	1294908	1294913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243110
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22088	NC_014160	TCT	2	6	1295174	1295179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243110
22089	NC_014160	AGC	2	6	1295185	1295190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243110
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22099	NC_014160	CCTC	2	8	1295678	1295685	0 %	25 %	0 %	75 %	296243111
22100	NC_014160	TAT	2	6	1295698	1295703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243111
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22102	NC_014160	GAA	2	6	1295890	1295895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243111
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22105	NC_014160	AGCC	2	8	1296128	1296135	25 %	0 %	25 %	50 %	296243112
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22107	NC_014160	AAT	2	6	1296198	1296203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243112
22108	NC_014160	GGGT	2	8	1296248	1296255	0 %	25 %	75 %	0 %	296243112
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22110	NC_014160	CT	3	6	1296465	1296470	0 %	50 %	0 %	50 %	296243112
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22112	NC_014160	CCT	2	6	1296590	1296595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243112
22113	NC_014160	CG	4	8	1296662	1296669	0 %	0 %	50 %	50 %	296243112
22114	NC_014160	ACT	2	6	1296685	1296690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243112
22115	NC_014160	CCT	2	6	1296774	1296779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243112
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22117	NC_014160	TGG	2	6	1296904	1296909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296243112
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22236	NC_014160	CCT	2	6	1303907	1303912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243124
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22351	NC_014160	TG	3	6	1310295	1310300	0 %	50 %	50 %	0 %	296243131
22352	NC_014160	GTC	2	6	1310305	1310310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243131
22353	NC_014160	GCCTC	2	10	1310397	1310406	0 %	20 %	20 %	60 %	296243131
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22355	NC_014160	TCA	2	6	1310438	1310443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243131
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22432	NC_014160	T	6	6	1314455	1314460	0 %	100 %	0 %	0 %	296243132
22433	NC_014160	GAC	2	6	1314627	1314632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243133
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22440	NC_014160	TGA	2	6	1315168	1315173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243134
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22445	NC_014160	TAC	2	6	1315643	1315648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243134
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22449	NC_014160	ATG	2	6	1315776	1315781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243134
22450	NC_014160	GAG	2	6	1315784	1315789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243134
22451	NC_014160	TTG	2	6	1315797	1315802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296243134
22452	NC_014160	CTC	2	6	1315888	1315893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243135
22453	NC_014160	CTC	2	6	1315897	1315902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243135
22454	NC_014160	GTAGCT	2	12	1316298	1316309	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296243135
22455	NC_014160	CTA	2	6	1316358	1316363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243135
22456	NC_014160	CGG	2	6	1316471	1316476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243135

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