MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_014160	AGG	2	6	1258356	1258361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243069
21502	NC_014160	GAC	2	6	1258381	1258386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243069
21503	NC_014160	CT	3	6	1258402	1258407	0 %	50 %	0 %	50 %	296243069
21504	NC_014160	CTT	2	6	1258452	1258457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243070
21505	NC_014160	TC	3	6	1258464	1258469	0 %	50 %	0 %	50 %	296243070
21506	NC_014160	TCT	2	6	1258538	1258543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243070
21507	NC_014160	GAT	2	6	1258631	1258636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243070
21508	NC_014160	TCC	2	6	1258678	1258683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243070
21509	NC_014160	GTA	2	6	1258689	1258694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243070
21510	NC_014160	GCC	2	6	1258729	1258734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243070
21511	NC_014160	CTC	2	6	1258737	1258742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243070
21512	NC_014160	CCT	2	6	1258947	1258952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243070
21513	NC_014160	TCA	2	6	1258973	1258978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243070
21514	NC_014160	TC	3	6	1258988	1258993	0 %	50 %	0 %	50 %	296243070
21515	NC_014160	CTT	2	6	1259004	1259009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243070
21516	NC_014160	GCC	3	9	1259137	1259145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243071
21517	NC_014160	ACC	2	6	1259235	1259240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243071
21518	NC_014160	GAG	2	6	1259329	1259334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243071
21519	NC_014160	AGGC	2	8	1259450	1259457	25 %	0 %	50 %	25 %	296243071
21520	NC_014160	TGT	2	6	1259473	1259478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296243071
21521	NC_014160	GGA	2	6	1259542	1259547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243071
21522	NC_014160	AGG	2	6	1259561	1259566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243071
21523	NC_014160	GA	3	6	1259716	1259721	50 %	0 %	50 %	0 %	296243071
21524	NC_014160	CAGC	2	8	1259757	1259764	25 %	0 %	25 %	50 %	296243071
21525	NC_014160	ACC	2	6	1259835	1259840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243071
21526	NC_014160	GGA	2	6	1259848	1259853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243071
21527	NC_014160	TGA	2	6	1259884	1259889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243071
21528	NC_014160	GAT	2	6	1259917	1259922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243071
21529	NC_014160	GAA	2	6	1259926	1259931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243071
21530	NC_014160	ACT	2	6	1259955	1259960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243071
21531	NC_014160	TCC	2	6	1260174	1260179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243071
21532	NC_014160	ACG	2	6	1260206	1260211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243071
21533	NC_014160	GAG	2	6	1260277	1260282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243071
21534	NC_014160	AAAGG	2	10	1260283	1260292	60 %	0 %	40 %	0 %	296243071
21535	NC_014160	GA	3	6	1260297	1260302	50 %	0 %	50 %	0 %	296243071
21536	NC_014160	TAG	2	6	1260423	1260428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243072
21537	NC_014160	GAA	2	6	1260449	1260454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243072
21538	NC_014160	TCC	2	6	1260468	1260473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243072
21539	NC_014160	CCTC	2	8	1260496	1260503	0 %	25 %	0 %	75 %	296243072
21540	NC_014160	GAC	2	6	1260536	1260541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243072
21541	NC_014160	CTT	2	6	1260550	1260555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243072
21542	NC_014160	CTT	2	6	1260570	1260575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243072
21543	NC_014160	CCT	2	6	1260655	1260660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243072
21544	NC_014160	TC	3	6	1260670	1260675	0 %	50 %	0 %	50 %	296243072
21545	NC_014160	CTT	3	9	1260692	1260700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243072
21546	NC_014160	CAT	2	6	1260955	1260960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243073
21547	NC_014160	TGA	2	6	1261207	1261212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243073
21548	NC_014160	TCC	2	6	1261232	1261237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243073
21549	NC_014160	TACA	2	8	1261240	1261247	50 %	25 %	0 %	25 %	296243073
21550	NC_014160	CTC	2	6	1261270	1261275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243073
21551	NC_014160	TTA	2	6	1261319	1261324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243073
21552	NC_014160	CCA	2	6	1261360	1261365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243073
21553	NC_014160	TGG	2	6	1261525	1261530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296243073
21554	NC_014160	CAA	2	6	1261545	1261550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243073
21555	NC_014160	GGT	2	6	1261719	1261724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296243073
21556	NC_014160	CGGG	2	8	1261758	1261765	0 %	0 %	75 %	25 %	296243073
21557	NC_014160	ATC	2	6	1261823	1261828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243073
21558	NC_014160	TACC	2	8	1262058	1262065	25 %	25 %	0 %	50 %	296243074
21559	NC_014160	ACTGG	2	10	1262075	1262084	20 %	20 %	40 %	20 %	296243074
21560	NC_014160	ACT	2	6	1262089	1262094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243074
21561	NC_014160	GGCT	2	8	1262097	1262104	0 %	25 %	50 %	25 %	296243074
21562	NC_014160	TCC	2	6	1262285	1262290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243074
21563	NC_014160	CTC	2	6	1262299	1262304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243074
21564	NC_014160	AGC	2	6	1262334	1262339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243074
21565	NC_014160	CAC	2	6	1262352	1262357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243074
21566	NC_014160	ATCC	2	8	1262360	1262367	25 %	25 %	0 %	50 %	296243074
21567	NC_014160	TAC	2	6	1262399	1262404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243074
21568	NC_014160	TCC	2	6	1262408	1262413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243074
21569	NC_014160	TC	3	6	1262434	1262439	0 %	50 %	0 %	50 %	296243074
21570	NC_014160	CTC	2	6	1262478	1262483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243074
21571	NC_014160	CAA	2	6	1262558	1262563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243074
21572	NC_014160	GTC	2	6	1262586	1262591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243074
21573	NC_014160	CTT	2	6	1262652	1262657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243074
21574	NC_014160	ATC	2	6	1262704	1262709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243074
21575	NC_014160	AGT	2	6	1262783	1262788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243075
21576	NC_014160	AGG	2	6	1262865	1262870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243075
21577	NC_014160	ACT	2	6	1262885	1262890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243075
21578	NC_014160	TGA	2	6	1262955	1262960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243075
21579	NC_014160	GAT	2	6	1262975	1262980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243075
21580	NC_014160	ATC	2	6	1263032	1263037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243076
21581	NC_014160	GAT	2	6	1263116	1263121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243076
21582	NC_014160	ATG	2	6	1263171	1263176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243076
21583	NC_014160	ACC	2	6	1263270	1263275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243076
21584	NC_014160	AT	3	6	1263281	1263286	50 %	50 %	0 %	0 %	296243076
21585	NC_014160	ATT	2	6	1263438	1263443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243076
21586	NC_014160	GAA	2	6	1263539	1263544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243076
21587	NC_014160	CAA	2	6	1263593	1263598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243076
21588	NC_014160	CCCCGG	2	12	1263613	1263624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243076
21589	NC_014160	TCC	2	6	1263679	1263684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243076
21590	NC_014160	CGC	2	6	1263724	1263729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243076
21591	NC_014160	TC	3	6	1263777	1263782	0 %	50 %	0 %	50 %	296243076
21592	NC_014160	CAC	2	6	1263869	1263874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243076
21593	NC_014160	ACT	2	6	1263887	1263892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243076
21594	NC_014160	AAT	2	6	1263977	1263982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243076
21595	NC_014160	TGC	2	6	1264020	1264025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243076
21596	NC_014160	GCT	2	6	1264073	1264078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243076
21597	NC_014160	TAA	2	6	1264117	1264122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243076
21598	NC_014160	AGT	2	6	1264362	1264367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243077
21599	NC_014160	GCC	2	6	1264435	1264440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243077
21600	NC_014160	GTG	2	6	1264501	1264506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296243077
21601	NC_014160	CCCT	2	8	1264603	1264610	0 %	25 %	0 %	75 %	296243077
21602	NC_014160	TAG	2	6	1264627	1264632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243077
21603	NC_014160	ACC	2	6	1264694	1264699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243077
21604	NC_014160	AAC	2	6	1264730	1264735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243077
21605	NC_014160	GAA	2	6	1264762	1264767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243077
21606	NC_014160	CT	3	6	1264799	1264804	0 %	50 %	0 %	50 %	296243077
21607	NC_014160	TGA	2	6	1264924	1264929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243077
21608	NC_014160	CGCCTC	2	12	1264938	1264949	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296243077
21609	NC_014160	TC	3	6	1264948	1264953	0 %	50 %	0 %	50 %	296243077
21610	NC_014160	CT	3	6	1265006	1265011	0 %	50 %	0 %	50 %	296243077
21611	NC_014160	GAA	2	6	1265026	1265031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243077
21612	NC_014160	CTC	2	6	1265041	1265046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243077
21613	NC_014160	GA	3	6	1265105	1265110	50 %	0 %	50 %	0 %	296243077
21614	NC_014160	TGT	2	6	1265134	1265139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296243077
21615	NC_014160	TCA	2	6	1265141	1265146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243077
21616	NC_014160	GAC	2	6	1265173	1265178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243077
21617	NC_014160	CAT	2	6	1265202	1265207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243077
21618	NC_014160	AGCC	2	8	1265402	1265409	25 %	0 %	25 %	50 %	296243077
21619	NC_014160	CTC	2	6	1265449	1265454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243077
21620	NC_014160	GAT	2	6	1265548	1265553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243077
21621	NC_014160	GAG	2	6	1265599	1265604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243077
21622	NC_014160	GAG	2	6	1265644	1265649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243077
21623	NC_014160	GTA	3	9	1265746	1265754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243077
21624	NC_014160	AAC	2	6	1265773	1265778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243077
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21628	NC_014160	ACC	2	6	1265986	1265991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243077
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21729	NC_014160	GTGGC	2	10	1272082	1272091	0 %	20 %	60 %	20 %	296243082
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