MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_014160	CGG	2	6	1136255	1136260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242946
19502	NC_014160	AAG	2	6	1136283	1136288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242946
19503	NC_014160	AAC	2	6	1136342	1136347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242946
19504	NC_014160	CT	3	6	1136415	1136420	0 %	50 %	0 %	50 %	296242947
19505	NC_014160	TAT	2	6	1136561	1136566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242947
19506	NC_014160	GAA	3	9	1136673	1136681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242947
19507	NC_014160	ATG	2	6	1136743	1136748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242947
19508	NC_014160	GAA	2	6	1136802	1136807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242947
19509	NC_014160	CAT	3	9	1136826	1136834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242947
19510	NC_014160	CTT	2	6	1136844	1136849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242947
19511	NC_014160	CAT	2	6	1136877	1136882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242947
19512	NC_014160	GCTC	2	8	1136924	1136931	0 %	25 %	25 %	50 %	296242947
19513	NC_014160	CGG	2	6	1136934	1136939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242947
19514	NC_014160	GAA	2	6	1137003	1137008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242947
19515	NC_014160	CAC	2	6	1137027	1137032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242947
19516	NC_014160	GGC	2	6	1137094	1137099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242947
19517	NC_014160	TCA	2	6	1137104	1137109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242947
19518	NC_014160	ATT	2	6	1137403	1137408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242948
19519	NC_014160	CAT	3	9	1137415	1137423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242948
19520	NC_014160	C	6	6	1137497	1137502	0 %	0 %	0 %	100 %	296242948
19521	NC_014160	GGA	2	6	1137565	1137570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242948
19522	NC_014160	CT	3	6	1137597	1137602	0 %	50 %	0 %	50 %	296242948
19523	NC_014160	GAGG	2	8	1137648	1137655	25 %	0 %	75 %	0 %	296242948
19524	NC_014160	GCGT	2	8	1137656	1137663	0 %	25 %	50 %	25 %	296242948
19525	NC_014160	GGA	2	6	1137703	1137708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242948
19526	NC_014160	CCCT	2	8	1137745	1137752	0 %	25 %	0 %	75 %	296242948
19527	NC_014160	TGA	2	6	1137866	1137871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242948
19528	NC_014160	TTG	2	6	1138142	1138147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242949
19529	NC_014160	AGT	2	6	1138230	1138235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242949
19530	NC_014160	CAG	2	6	1138306	1138311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242949
19531	NC_014160	TGCT	2	8	1138334	1138341	0 %	50 %	25 %	25 %	296242949
19532	NC_014160	GC	3	6	1138366	1138371	0 %	0 %	50 %	50 %	296242949
19533	NC_014160	GAA	2	6	1138432	1138437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242949
19534	NC_014160	TC	3	6	1138537	1138542	0 %	50 %	0 %	50 %	296242949
19535	NC_014160	CCT	3	9	1138606	1138614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242949
19536	NC_014160	TCC	3	9	1138617	1138625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242949
19537	NC_014160	GAT	2	6	1138634	1138639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242949
19538	NC_014160	CCT	2	6	1138699	1138704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242949
19539	NC_014160	GTA	2	6	1138777	1138782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242949
19540	NC_014160	GCA	2	6	1138807	1138812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242949
19541	NC_014160	CTT	2	6	1138896	1138901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242950
19542	NC_014160	ATC	2	6	1138957	1138962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242950
19543	NC_014160	CTC	2	6	1138977	1138982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242950
19544	NC_014160	TC	3	6	1138981	1138986	0 %	50 %	0 %	50 %	296242950
19545	NC_014160	TGT	2	6	1139021	1139026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242950
19546	NC_014160	AATCT	2	10	1139083	1139092	40 %	40 %	0 %	20 %	296242950
19547	NC_014160	CTT	2	6	1139136	1139141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242950
19548	NC_014160	AGG	2	6	1139161	1139166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242950
19549	NC_014160	CCCT	2	8	1139173	1139180	0 %	25 %	0 %	75 %	296242950
19550	NC_014160	CT	3	6	1139193	1139198	0 %	50 %	0 %	50 %	296242950
19551	NC_014160	CCCTT	2	10	1139219	1139228	0 %	40 %	0 %	60 %	296242950
19552	NC_014160	CGA	2	6	1139430	1139435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242951
19553	NC_014160	TCCT	2	8	1139522	1139529	0 %	50 %	0 %	50 %	296242951
19554	NC_014160	GTA	2	6	1139596	1139601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242951
19555	NC_014160	GAAA	2	8	1139660	1139667	75 %	0 %	25 %	0 %	296242951
19556	NC_014160	CAC	2	6	1139698	1139703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242951
19557	NC_014160	CCT	2	6	1139715	1139720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242951
19558	NC_014160	AGG	2	6	1139735	1139740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242951
19559	NC_014160	GAG	2	6	1139752	1139757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242951
19560	NC_014160	GAA	2	6	1139836	1139841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242951
19561	NC_014160	TAT	2	6	1139902	1139907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242951
19562	NC_014160	AGC	2	6	1139999	1140004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242951
19563	NC_014160	TCATCT	2	12	1140021	1140032	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296242951
19564	NC_014160	CCTG	2	8	1140121	1140128	0 %	25 %	25 %	50 %	296242951
19565	NC_014160	GCG	2	6	1140453	1140458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242952
19566	NC_014160	CCT	2	6	1140535	1140540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242952
19567	NC_014160	AC	3	6	1140558	1140563	50 %	0 %	0 %	50 %	296242952
19568	NC_014160	GATAC	2	10	1140602	1140611	40 %	20 %	20 %	20 %	296242952
19569	NC_014160	GGAG	2	8	1140620	1140627	25 %	0 %	75 %	0 %	296242952
19570	NC_014160	GGA	2	6	1140727	1140732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242952
19571	NC_014160	AG	3	6	1140805	1140810	50 %	0 %	50 %	0 %	296242953
19572	NC_014160	GA	3	6	1140850	1140855	50 %	0 %	50 %	0 %	296242953
19573	NC_014160	GAGC	2	8	1140957	1140964	25 %	0 %	50 %	25 %	296242953
19574	NC_014160	AGTGG	2	10	1140996	1141005	20 %	20 %	60 %	0 %	296242953
19575	NC_014160	CAA	2	6	1141053	1141058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242953
19576	NC_014160	GCC	2	6	1141096	1141101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242953
19577	NC_014160	TCCC	2	8	1141130	1141137	0 %	25 %	0 %	75 %	296242953
19578	NC_014160	ACG	2	6	1141148	1141153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242953
19579	NC_014160	CTC	2	6	1141219	1141224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242953
19580	NC_014160	CAG	2	6	1141267	1141272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242953
19581	NC_014160	GGA	2	6	1141289	1141294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19582	NC_014160	CAG	2	6	1141358	1141363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242953
19583	NC_014160	GAG	2	6	1141377	1141382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19584	NC_014160	ATA	2	6	1141390	1141395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242953
19585	NC_014160	GAG	2	6	1141486	1141491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19586	NC_014160	ATA	2	6	1141513	1141518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242953
19587	NC_014160	ATA	2	6	1141540	1141545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242953
19588	NC_014160	CAC	2	6	1141591	1141596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242953
19589	NC_014160	AGGCT	2	10	1141648	1141657	20 %	20 %	40 %	20 %	296242953
19590	NC_014160	GGA	2	6	1141677	1141682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19591	NC_014160	GAG	2	6	1141693	1141698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19592	NC_014160	TTG	2	6	1141708	1141713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242953
19593	NC_014160	GGC	2	6	1141714	1141719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242953
19594	NC_014160	GAA	2	6	1141803	1141808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242953
19595	NC_014160	GGGA	2	8	1141864	1141871	25 %	0 %	75 %	0 %	296242953
19596	NC_014160	AAG	2	6	1141876	1141881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242953
19597	NC_014160	GAT	2	6	1141888	1141893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242953
19598	NC_014160	GGC	2	6	1142020	1142025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242953
19599	NC_014160	ATA	2	6	1142029	1142034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242953
19600	NC_014160	GAG	2	6	1142062	1142067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19601	NC_014160	C	6	6	1142109	1142114	0 %	0 %	0 %	100 %	296242953
19602	NC_014160	CAC	2	6	1142175	1142180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242953
19603	NC_014160	AAT	2	6	1142223	1142228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242953
19604	NC_014160	GAG	2	6	1142302	1142307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19605	NC_014160	AGG	3	9	1142359	1142367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242953
19606	NC_014160	AGT	2	6	1142408	1142413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242953
19607	NC_014160	CGG	2	6	1142435	1142440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242954
19608	NC_014160	CAC	2	6	1142520	1142525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242954
19609	NC_014160	TCC	2	6	1142528	1142533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242954
19610	NC_014160	CCA	2	6	1142705	1142710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242954
19611	NC_014160	AGCC	2	8	1142749	1142756	25 %	0 %	25 %	50 %	296242954
19612	NC_014160	AGG	2	6	1142791	1142796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242954
19613	NC_014160	CCAG	2	8	1142843	1142850	25 %	0 %	25 %	50 %	296242954
19614	NC_014160	GTA	2	6	1142868	1142873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242954
19615	NC_014160	G	6	6	1142922	1142927	0 %	0 %	100 %	0 %	296242954
19616	NC_014160	CAA	2	6	1142975	1142980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242954
19617	NC_014160	CG	3	6	1143004	1143009	0 %	0 %	50 %	50 %	296242954
19618	NC_014160	CTC	2	6	1143042	1143047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242954
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