MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014160	GTA	2	6	93733	93738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241850
1502	NC_014160	AAAG	2	8	93819	93826	75 %	0 %	25 %	0 %	296241850
1503	NC_014160	CGG	2	6	93867	93872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241850
1504	NC_014160	GGAG	2	8	93902	93909	25 %	0 %	75 %	0 %	296241850
1505	NC_014160	ATT	2	6	93910	93915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241850
1506	NC_014160	GA	3	6	93921	93926	50 %	0 %	50 %	0 %	296241850
1507	NC_014160	CCG	2	6	93952	93957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241850
1508	NC_014160	GTGCT	2	10	93980	93989	0 %	40 %	40 %	20 %	296241850
1509	NC_014160	TCT	2	6	94051	94056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241850
1510	NC_014160	C	6	6	94098	94103	0 %	0 %	0 %	100 %	296241850
1511	NC_014160	GAT	2	6	94117	94122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241850
1512	NC_014160	AGG	2	6	94136	94141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241850
1513	NC_014160	GATT	2	8	94152	94159	25 %	50 %	25 %	0 %	296241850
1514	NC_014160	ACT	2	6	94166	94171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241850
1515	NC_014160	TA	3	6	94222	94227	50 %	50 %	0 %	0 %	296241850
1516	NC_014160	TGG	2	6	94317	94322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241851
1517	NC_014160	TCC	2	6	94330	94335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241851
1518	NC_014160	GA	4	8	94361	94368	50 %	0 %	50 %	0 %	296241851
1519	NC_014160	GCC	2	6	94419	94424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241851
1520	NC_014160	GCA	2	6	94591	94596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241851
1521	NC_014160	CCT	2	6	94600	94605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241851
1522	NC_014160	TCC	2	6	94699	94704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241851
1523	NC_014160	CCGG	2	8	94797	94804	0 %	0 %	50 %	50 %	296241851
1524	NC_014160	GCG	2	6	94852	94857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241851
1525	NC_014160	AAG	2	6	94890	94895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241851
1526	NC_014160	CCT	2	6	94929	94934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241851
1527	NC_014160	GAA	2	6	94968	94973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241851
1528	NC_014160	AGGCA	2	10	95019	95028	40 %	0 %	40 %	20 %	296241851
1529	NC_014160	CAA	2	6	95035	95040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241851
1530	NC_014160	AGGG	2	8	95085	95092	25 %	0 %	75 %	0 %	296241851
1531	NC_014160	GA	3	6	95148	95153	50 %	0 %	50 %	0 %	296241851
1532	NC_014160	TCC	3	9	95260	95268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241851
1533	NC_014160	ATG	2	6	95310	95315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241851
1534	NC_014160	GA	3	6	95388	95393	50 %	0 %	50 %	0 %	296241851
1535	NC_014160	ACAG	2	8	95658	95665	50 %	0 %	25 %	25 %	296241851
1536	NC_014160	GA	3	6	95691	95696	50 %	0 %	50 %	0 %	296241851
1537	NC_014160	ACA	2	6	95742	95747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241851
1538	NC_014160	CTC	2	6	95799	95804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241851
1539	NC_014160	CA	3	6	95844	95849	50 %	0 %	0 %	50 %	296241851
1540	NC_014160	AG	3	6	95892	95897	50 %	0 %	50 %	0 %	296241851
1541	NC_014160	ATG	2	6	95916	95921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241851
1542	NC_014160	ATG	2	6	96001	96006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241851
1543	NC_014160	AGT	2	6	96130	96135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241851
1544	NC_014160	GAG	2	6	96303	96308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241852
1545	NC_014160	GAA	2	6	96313	96318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241852
1546	NC_014160	CCTG	2	8	96447	96454	0 %	25 %	25 %	50 %	296241852
1547	NC_014160	GAG	2	6	96465	96470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241852
1548	NC_014160	ATT	2	6	96477	96482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241852
1549	NC_014160	ATT	2	6	96488	96493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241852
1550	NC_014160	CTC	2	6	96503	96508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241852
1551	NC_014160	ATT	2	6	96522	96527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241852
1552	NC_014160	GA	3	6	96542	96547	50 %	0 %	50 %	0 %	296241852
1553	NC_014160	AG	3	6	96597	96602	50 %	0 %	50 %	0 %	296241852
1554	NC_014160	TTC	2	6	96646	96651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241853
1555	NC_014160	TGA	2	6	96672	96677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241853
1556	NC_014160	CTA	2	6	96702	96707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241853
1557	NC_014160	GAA	2	6	96708	96713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241853
1558	NC_014160	AGG	2	6	96746	96751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241853
1559	NC_014160	CT	3	6	96787	96792	0 %	50 %	0 %	50 %	296241853
1560	NC_014160	AAT	2	6	96809	96814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241853
1561	NC_014160	CTG	2	6	96873	96878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241853
1562	NC_014160	GCG	2	6	96939	96944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241853
1563	NC_014160	TGA	2	6	97050	97055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241853
1564	NC_014160	TCA	2	6	97176	97181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241853
1565	NC_014160	GA	3	6	97280	97285	50 %	0 %	50 %	0 %	296241853
1566	NC_014160	TA	3	6	97333	97338	50 %	50 %	0 %	0 %	296241853
1567	NC_014160	TCC	2	6	97360	97365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241853
1568	NC_014160	TAC	2	6	97372	97377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241853
1569	NC_014160	CGC	2	6	97455	97460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241853
1570	NC_014160	GGT	2	6	97529	97534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241853
1571	NC_014160	GAG	2	6	97609	97614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241853
1572	NC_014160	CAAC	2	8	97619	97626	50 %	0 %	0 %	50 %	296241853
1573	NC_014160	CGAG	2	8	97713	97720	25 %	0 %	50 %	25 %	296241853
1574	NC_014160	ATG	2	6	97722	97727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241853
1575	NC_014160	GAA	2	6	97762	97767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241853
1576	NC_014160	AAT	2	6	97780	97785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241853
1577	NC_014160	GTG	2	6	97895	97900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241853
1578	NC_014160	AG	3	6	97908	97913	50 %	0 %	50 %	0 %	296241853
1579	NC_014160	GCCA	2	8	97956	97963	25 %	0 %	25 %	50 %	296241853
1580	NC_014160	GT	3	6	97983	97988	0 %	50 %	50 %	0 %	296241853
1581	NC_014160	TAG	2	6	98057	98062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241853
1582	NC_014160	GTG	2	6	98100	98105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241853
1583	NC_014160	AT	3	6	98154	98159	50 %	50 %	0 %	0 %	296241853
1584	NC_014160	ACC	2	6	98174	98179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241854
1585	NC_014160	CTC	2	6	98212	98217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241854
1586	NC_014160	CTT	2	6	98227	98232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241854
1587	NC_014160	TCC	2	6	98237	98242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241854
1588	NC_014160	AGT	2	6	98280	98285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241854
1589	NC_014160	TAGCC	2	10	98344	98353	20 %	20 %	20 %	40 %	296241854
1590	NC_014160	AAC	2	6	98422	98427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241854
1591	NC_014160	TG	3	6	98433	98438	0 %	50 %	50 %	0 %	296241854
1592	NC_014160	AGT	2	6	98472	98477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241854
1593	NC_014160	GCTG	2	8	98498	98505	0 %	25 %	50 %	25 %	296241854
1594	NC_014160	ACC	2	6	98567	98572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241854
1595	NC_014160	GAT	2	6	98623	98628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241854
1596	NC_014160	CCT	2	6	98675	98680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241855
1597	NC_014160	CAC	2	6	98694	98699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241855
1598	NC_014160	AGTC	2	8	98946	98953	25 %	25 %	25 %	25 %	296241855
1599	NC_014160	CTC	2	6	98974	98979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241855
1600	NC_014160	ATA	2	6	98986	98991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241855
1601	NC_014160	GTTA	2	8	99012	99019	25 %	50 %	25 %	0 %	296241855
1602	NC_014160	CCT	2	6	99089	99094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241856
1603	NC_014160	CTG	2	6	99130	99135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241856
1604	NC_014160	AGA	2	6	99175	99180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241856
1605	NC_014160	CAG	2	6	99214	99219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241856
1606	NC_014160	GAA	2	6	99265	99270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241856
1607	NC_014160	AC	3	6	99285	99290	50 %	0 %	0 %	50 %	296241856
1608	NC_014160	GGC	2	6	99296	99301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241856
1609	NC_014160	AGT	2	6	99378	99383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241856
1610	NC_014160	ATT	2	6	99468	99473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241856
1611	NC_014160	AGG	2	6	99474	99479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241856
1612	NC_014160	CCT	2	6	99526	99531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241856
1613	NC_014160	GAC	2	6	99546	99551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241856
1614	NC_014160	TAT	2	6	99578	99583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241856
1615	NC_014160	GAA	2	6	99590	99595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241856
1616	NC_014160	AAT	2	6	99705	99710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241856
1617	NC_014160	AAG	2	6	99795	99800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241856
1618	NC_014160	CCT	2	6	99812	99817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241856
1619	NC_014160	ACG	2	6	99859	99864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241857
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1621	NC_014160	AAC	2	6	99913	99918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241857
1622	NC_014160	TGC	2	6	99927	99932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241857
1623	NC_014160	AAC	2	6	99934	99939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241857
1624	NC_014160	GGA	2	6	99941	99946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241857
1625	NC_014160	TCC	3	9	100089	100097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241858
1626	NC_014160	CCA	2	6	100105	100110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241858
1627	NC_014160	AGC	2	6	100142	100147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241858
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1747	NC_014160	CAAT	2	8	107140	107147	50 %	25 %	0 %	25 %	296241866
1748	NC_014160	GCAC	2	8	107218	107225	25 %	0 %	25 %	50 %	296241866
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1869	NC_014160	G	6	6	116149	116154	0 %	0 %	100 %	0 %	296241874
1870	NC_014160	CCT	2	6	116199	116204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241874
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1872	NC_014160	TCA	2	6	116291	116296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241874
1873	NC_014160	ACT	2	6	116341	116346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241874
1874	NC_014160	CGTTAA	2	12	116665	116676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296241875
1875	NC_014160	AGTGAA	2	12	116707	116718	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296241875
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1878	NC_014160	TGATGC	2	12	117224	117235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296241876
1879	NC_014160	ATAC	2	8	117264	117271	50 %	25 %	0 %	25 %	296241876
1880	NC_014160	ACT	2	6	117299	117304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241876
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1992	NC_014160	GGTAT	2	10	124424	124433	20 %	40 %	40 %	0 %	296241884
1993	NC_014160	ACA	2	6	124534	124539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241884
1994	NC_014160	CTGC	2	8	124655	124662	0 %	25 %	25 %	50 %	296241884
1995	NC_014160	AAT	2	6	124667	124672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241884
1996	NC_014160	G	6	6	124821	124826	0 %	0 %	100 %	0 %	296241885
1997	NC_014160	GCG	2	6	124889	124894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241885
1998	NC_014160	GAA	2	6	124971	124976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241885
1999	NC_014160	GGA	2	6	125115	125120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241885
2000	NC_014160	GGT	2	6	125121	125126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241885

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