MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_014160	CGG	2	6	1019604	1019609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242840
17502	NC_014160	TGAT	2	8	1019615	1019622	25 %	50 %	25 %	0 %	296242840
17503	NC_014160	CCA	2	6	1019647	1019652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242840
17504	NC_014160	TCA	2	6	1019675	1019680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242840
17505	NC_014160	AGT	2	6	1019684	1019689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242840
17506	NC_014160	CTC	2	6	1019718	1019723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242840
17507	NC_014160	GTTGT	2	10	1019752	1019761	0 %	60 %	40 %	0 %	296242840
17508	NC_014160	CGA	2	6	1019811	1019816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242840
17509	NC_014160	GAAT	2	8	1019892	1019899	50 %	25 %	25 %	0 %	296242840
17510	NC_014160	TTG	2	6	1019908	1019913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242840
17511	NC_014160	ATGA	2	8	1019959	1019966	50 %	25 %	25 %	0 %	296242840
17512	NC_014160	CAT	2	6	1020044	1020049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242840
17513	NC_014160	CTGG	2	8	1020124	1020131	0 %	25 %	50 %	25 %	296242840
17514	NC_014160	GGAG	2	8	1020147	1020154	25 %	0 %	75 %	0 %	296242840
17515	NC_014160	CAAC	2	8	1020164	1020171	50 %	0 %	0 %	50 %	296242840
17516	NC_014160	CCT	2	6	1020172	1020177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242840
17517	NC_014160	CAG	2	6	1020254	1020259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242840
17518	NC_014160	CCA	2	6	1020328	1020333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242840
17519	NC_014160	ATT	2	6	1020394	1020399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242840
17520	NC_014160	TTC	2	6	1020400	1020405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242840
17521	NC_014160	GTG	2	6	1020419	1020424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242840
17522	NC_014160	AAT	2	6	1020576	1020581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242841
17523	NC_014160	A	6	6	1020592	1020597	100 %	0 %	0 %	0 %	296242841
17524	NC_014160	CAA	2	6	1020611	1020616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242841
17525	NC_014160	CCT	2	6	1020637	1020642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242841
17526	NC_014160	A	7	7	1020712	1020718	100 %	0 %	0 %	0 %	296242841
17527	NC_014160	CTG	2	6	1020725	1020730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242841
17528	NC_014160	AAT	2	6	1020837	1020842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242841
17529	NC_014160	AGG	2	6	1020863	1020868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242841
17530	NC_014160	TAC	3	9	1020877	1020885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242841
17531	NC_014160	GAA	2	6	1020919	1020924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242841
17532	NC_014160	ATT	2	6	1020943	1020948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242841
17533	NC_014160	AG	3	6	1020963	1020968	50 %	0 %	50 %	0 %	296242841
17534	NC_014160	TGC	2	6	1020972	1020977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242841
17535	NC_014160	AGA	2	6	1021017	1021022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242841
17536	NC_014160	GGT	2	6	1021057	1021062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242841
17537	NC_014160	ATT	2	6	1021087	1021092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242841
17538	NC_014160	AGA	2	6	1021104	1021109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242841
17539	NC_014160	AG	3	6	1021118	1021123	50 %	0 %	50 %	0 %	296242841
17540	NC_014160	TGGT	2	8	1021187	1021194	0 %	50 %	50 %	0 %	296242841
17541	NC_014160	GAA	2	6	1021251	1021256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242841
17542	NC_014160	AG	3	6	1021309	1021314	50 %	0 %	50 %	0 %	296242841
17543	NC_014160	CTT	2	6	1021336	1021341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242841
17544	NC_014160	AT	3	6	1021371	1021376	50 %	50 %	0 %	0 %	296242841
17545	NC_014160	ATT	2	6	1021477	1021482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242841
17546	NC_014160	GAG	2	6	1021486	1021491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242841
17547	NC_014160	GAA	2	6	1021524	1021529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242841
17548	NC_014160	AGT	2	6	1021555	1021560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242841
17549	NC_014160	TAA	2	6	1021584	1021589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242841
17550	NC_014160	GC	3	6	1021617	1021622	0 %	0 %	50 %	50 %	296242841
17551	NC_014160	GA	3	6	1021738	1021743	50 %	0 %	50 %	0 %	296242842
17552	NC_014160	TAA	2	6	1021755	1021760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242842
17553	NC_014160	GAG	2	6	1021775	1021780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242842
17554	NC_014160	TCG	2	6	1021785	1021790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242842
17555	NC_014160	ATA	2	6	1021820	1021825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242842
17556	NC_014160	TAC	2	6	1021854	1021859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242842
17557	NC_014160	AG	3	6	1021871	1021876	50 %	0 %	50 %	0 %	296242842
17558	NC_014160	GAG	2	6	1021895	1021900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242842
17559	NC_014160	GAC	2	6	1021937	1021942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242842
17560	NC_014160	CTC	2	6	1022263	1022268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242843
17561	NC_014160	CGA	2	6	1022316	1022321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242843
17562	NC_014160	CTT	2	6	1022343	1022348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242843
17563	NC_014160	CCT	2	6	1022356	1022361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242843
17564	NC_014160	TTG	2	6	1022390	1022395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242843
17565	NC_014160	TAA	2	6	1022427	1022432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242843
17566	NC_014160	TCT	2	6	1022448	1022453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242843
17567	NC_014160	TC	3	6	1022500	1022505	0 %	50 %	0 %	50 %	296242843
17568	NC_014160	AAT	2	6	1022542	1022547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242843
17569	NC_014160	CT	3	6	1022602	1022607	0 %	50 %	0 %	50 %	296242843
17570	NC_014160	TGA	2	6	1022618	1022623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242843
17571	NC_014160	ATCT	2	8	1022625	1022632	25 %	50 %	0 %	25 %	296242843
17572	NC_014160	TCA	2	6	1022636	1022641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242843
17573	NC_014160	TGT	2	6	1022673	1022678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242843
17574	NC_014160	AAC	2	6	1022684	1022689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242843
17575	NC_014160	TGT	2	6	1022712	1022717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242843
17576	NC_014160	CACT	2	8	1022745	1022752	25 %	25 %	0 %	50 %	296242843
17577	NC_014160	CGA	2	6	1022811	1022816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242843
17578	NC_014160	ATT	2	6	1022900	1022905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242843
17579	NC_014160	CGG	2	6	1022973	1022978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242843
17580	NC_014160	TGACTG	2	12	1022992	1023003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296242843
17581	NC_014160	GGC	2	6	1023020	1023025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242843
17582	NC_014160	ATT	2	6	1023026	1023031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242843
17583	NC_014160	CTCGTA	2	12	1023043	1023054	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296242843
17584	NC_014160	CGC	2	6	1023069	1023074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242843
17585	NC_014160	ATG	3	9	1023123	1023131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242843
17586	NC_014160	T	6	6	1023138	1023143	0 %	100 %	0 %	0 %	296242843
17587	NC_014160	TCT	2	6	1023151	1023156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242843
17588	NC_014160	CT	3	6	1023155	1023160	0 %	50 %	0 %	50 %	296242843
17589	NC_014160	TGTC	2	8	1023641	1023648	0 %	50 %	25 %	25 %	296242844
17590	NC_014160	CTG	2	6	1023748	1023753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242844
17591	NC_014160	GTAG	2	8	1023818	1023825	25 %	25 %	50 %	0 %	296242844
17592	NC_014160	CCCA	2	8	1023845	1023852	25 %	0 %	0 %	75 %	296242844
17593	NC_014160	C	6	6	1023885	1023890	0 %	0 %	0 %	100 %	296242844
17594	NC_014160	CGA	2	6	1023938	1023943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242844
17595	NC_014160	TAG	2	6	1023964	1023969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242844
17596	NC_014160	TC	3	6	1024003	1024008	0 %	50 %	0 %	50 %	296242844
17597	NC_014160	TGA	2	6	1024022	1024027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242844
17598	NC_014160	CTG	2	6	1024097	1024102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242844
17599	NC_014160	CAG	2	6	1024223	1024228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242844
17600	NC_014160	ACG	2	6	1024291	1024296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242844
17601	NC_014160	GTTC	2	8	1024301	1024308	0 %	50 %	25 %	25 %	296242844
17602	NC_014160	GCG	2	6	1024357	1024362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242844
17603	NC_014160	CCA	2	6	1024376	1024381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242844
17604	NC_014160	CTC	2	6	1024386	1024391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242844
17605	NC_014160	AGCC	2	8	1024396	1024403	25 %	0 %	25 %	50 %	296242844
17606	NC_014160	TTC	2	6	1024427	1024432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242844
17607	NC_014160	AG	3	6	1024457	1024462	50 %	0 %	50 %	0 %	296242844
17608	NC_014160	CCT	2	6	1024547	1024552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242844
17609	NC_014160	TCA	2	6	1024564	1024569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242844
17610	NC_014160	ATC	2	6	1024587	1024592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242844
17611	NC_014160	TGC	2	6	1024610	1024615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242844
17612	NC_014160	TC	4	8	1024624	1024631	0 %	50 %	0 %	50 %	296242844
17613	NC_014160	CGC	2	6	1024778	1024783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242844
17614	NC_014160	GCT	2	6	1024795	1024800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242844
17615	NC_014160	CCA	2	6	1024827	1024832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242844
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17617	NC_014160	GGC	3	9	1025162	1025170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242845
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