MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_014160	AGT	2	6	990293	990298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242801
17003	NC_014160	GGA	2	6	990329	990334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242801
17004	NC_014160	GAG	2	6	990417	990422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242801
17005	NC_014160	GAG	2	6	990491	990496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242801
17006	NC_014160	GGA	2	6	990497	990502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242801
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17008	NC_014160	AGG	2	6	990604	990609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242801
17009	NC_014160	AAG	2	6	990639	990644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242801
17010	NC_014160	AT	3	6	990669	990674	50 %	50 %	0 %	0 %	296242801
17011	NC_014160	CTT	2	6	990703	990708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242801
17012	NC_014160	GCA	2	6	990717	990722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242801
17013	NC_014160	GGTG	2	8	990779	990786	0 %	25 %	75 %	0 %	296242801
17014	NC_014160	AT	3	6	990870	990875	50 %	50 %	0 %	0 %	296242801
17015	NC_014160	TAA	2	6	990902	990907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242801
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17017	NC_014160	G	6	6	990992	990997	0 %	0 %	100 %	0 %	296242801
17018	NC_014160	GAG	2	6	991011	991016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242801
17019	NC_014160	AAG	2	6	991102	991107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242801
17020	NC_014160	CCT	2	6	991169	991174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242801
17021	NC_014160	GAA	2	6	991187	991192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242801
17022	NC_014160	AG	3	6	991220	991225	50 %	0 %	50 %	0 %	296242801
17023	NC_014160	TTG	2	6	991231	991236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242801
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17025	NC_014160	ACG	2	6	991341	991346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242802
17026	NC_014160	GGA	2	6	991415	991420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242802
17027	NC_014160	CT	3	6	991436	991441	0 %	50 %	0 %	50 %	296242802
17028	NC_014160	GGT	2	6	991564	991569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242802
17029	NC_014160	CTT	2	6	991621	991626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242802
17030	NC_014160	TCA	3	9	991635	991643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242802
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17032	NC_014160	AT	3	6	991819	991824	50 %	50 %	0 %	0 %	296242802
17033	NC_014160	TAG	2	6	991852	991857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242802
17034	NC_014160	GA	4	8	991976	991983	50 %	0 %	50 %	0 %	296242803
17035	NC_014160	TTC	2	6	992014	992019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242803
17036	NC_014160	GGA	2	6	992042	992047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242803
17037	NC_014160	CTG	2	6	992127	992132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242803
17038	NC_014160	GGGA	2	8	992215	992222	25 %	0 %	75 %	0 %	296242803
17039	NC_014160	TAT	3	9	992228	992236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242803
17040	NC_014160	TCCC	2	8	992365	992372	0 %	25 %	0 %	75 %	296242803
17041	NC_014160	G	6	6	992432	992437	0 %	0 %	100 %	0 %	296242803
17042	NC_014160	AG	3	6	992469	992474	50 %	0 %	50 %	0 %	296242803
17043	NC_014160	AAC	2	6	992507	992512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242803
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17052	NC_014160	G	6	6	992903	992908	0 %	0 %	100 %	0 %	296242804
17053	NC_014160	ACG	2	6	993033	993038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242804
17054	NC_014160	CAT	2	6	993040	993045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242804
17055	NC_014160	AGG	2	6	993067	993072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242804
17056	NC_014160	ATC	2	6	993121	993126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242804
17057	NC_014160	GTT	2	6	993347	993352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242804
17058	NC_014160	CCT	2	6	993369	993374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242804
17059	NC_014160	CTC	2	6	993448	993453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242804
17060	NC_014160	GA	3	6	993487	993492	50 %	0 %	50 %	0 %	296242804
17061	NC_014160	ATA	2	6	993497	993502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242804
17062	NC_014160	GAA	3	9	993559	993567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242804
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17066	NC_014160	AGG	2	6	993801	993806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242804
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17069	NC_014160	TC	3	6	993902	993907	0 %	50 %	0 %	50 %	296242805
17070	NC_014160	AG	3	6	993966	993971	50 %	0 %	50 %	0 %	296242805
17071	NC_014160	AT	3	6	993995	994000	50 %	50 %	0 %	0 %	296242805
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17088	NC_014160	AT	3	6	994969	994974	50 %	50 %	0 %	0 %	296242807
17089	NC_014160	AGC	2	6	995028	995033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242807
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17104	NC_014160	GATA	2	8	996084	996091	50 %	25 %	25 %	0 %	296242808
17105	NC_014160	GAG	2	6	996151	996156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242808
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17108	NC_014160	CA	4	8	996295	996302	50 %	0 %	0 %	50 %	296242808
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