MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014160	GAA	2	6	927149	927154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242719
16002	NC_014160	AAC	2	6	927272	927277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242719
16003	NC_014160	GTA	2	6	927440	927445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242719
16004	NC_014160	AAG	2	6	927451	927456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242719
16005	NC_014160	CAA	2	6	927480	927485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242720
16006	NC_014160	TCA	2	6	927488	927493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242720
16007	NC_014160	GTT	2	6	927521	927526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242720
16008	NC_014160	TC	3	6	927618	927623	0 %	50 %	0 %	50 %	296242720
16009	NC_014160	CAC	2	6	927634	927639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242720
16010	NC_014160	CCA	2	6	927661	927666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242720
16011	NC_014160	CTC	2	6	927667	927672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242720
16012	NC_014160	T	6	6	927682	927687	0 %	100 %	0 %	0 %	296242720
16013	NC_014160	AGC	2	6	927706	927711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242720
16014	NC_014160	ATT	2	6	927779	927784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242720
16015	NC_014160	TGA	2	6	927881	927886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242721
16016	NC_014160	AGTG	2	8	927942	927949	25 %	25 %	50 %	0 %	296242721
16017	NC_014160	CTT	2	6	927984	927989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242721
16018	NC_014160	GTTG	2	8	928161	928168	0 %	50 %	50 %	0 %	296242721
16019	NC_014160	GGA	2	6	928182	928187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242721
16020	NC_014160	CCCGTC	2	12	928215	928226	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296242721
16021	NC_014160	TTC	2	6	928237	928242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242721
16022	NC_014160	GAAC	2	8	928348	928355	50 %	0 %	25 %	25 %	296242721
16023	NC_014160	CTT	2	6	928393	928398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242721
16024	NC_014160	CAA	2	6	928400	928405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242721
16025	NC_014160	CTG	2	6	928448	928453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242721
16026	NC_014160	GAG	2	6	928503	928508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242721
16027	NC_014160	GAA	2	6	928637	928642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242722
16028	NC_014160	GCC	2	6	928643	928648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242722
16029	NC_014160	CAA	2	6	928763	928768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242722
16030	NC_014160	GTC	2	6	928845	928850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242723
16031	NC_014160	TCC	2	6	928855	928860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242723
16032	NC_014160	TAA	2	6	928987	928992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242723
16033	NC_014160	TCT	2	6	929036	929041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242723
16034	NC_014160	AGGTTG	2	12	929065	929076	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296242723
16035	NC_014160	GTT	2	6	929145	929150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242724
16036	NC_014160	TAC	2	6	929172	929177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242724
16037	NC_014160	AGG	2	6	929215	929220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242724
16038	NC_014160	GGAG	2	8	929280	929287	25 %	0 %	75 %	0 %	296242724
16039	NC_014160	CCT	3	9	929289	929297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242724
16040	NC_014160	CTA	2	6	929333	929338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242724
16041	NC_014160	GAA	2	6	929391	929396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242724
16042	NC_014160	GTT	2	6	929419	929424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242724
16043	NC_014160	ATT	2	6	929480	929485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242724
16044	NC_014160	ATT	2	6	929530	929535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242724
16045	NC_014160	GGA	2	6	929550	929555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242724
16046	NC_014160	TGA	2	6	929640	929645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242724
16047	NC_014160	GAG	2	6	929665	929670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242724
16048	NC_014160	CGG	2	6	929709	929714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242724
16049	NC_014160	CCA	2	6	929827	929832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242724
16050	NC_014160	TTGC	2	8	929848	929855	0 %	50 %	25 %	25 %	296242724
16051	NC_014160	TAT	2	6	929923	929928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242724
16052	NC_014160	GAA	2	6	929973	929978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242724
16053	NC_014160	AAG	2	6	929983	929988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242724
16054	NC_014160	GA	3	6	930061	930066	50 %	0 %	50 %	0 %	296242724
16055	NC_014160	CTG	2	6	930091	930096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242724
16056	NC_014160	AGC	2	6	930132	930137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242724
16057	NC_014160	AAG	2	6	930220	930225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242724
16058	NC_014160	ATAC	2	8	930247	930254	50 %	25 %	0 %	25 %	296242724
16059	NC_014160	AGC	2	6	930345	930350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242724
16060	NC_014160	GAG	2	6	930424	930429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242724
16061	NC_014160	G	6	6	930547	930552	0 %	0 %	100 %	0 %	296242724
16062	NC_014160	AG	3	6	930579	930584	50 %	0 %	50 %	0 %	296242724
16063	NC_014160	C	6	6	930637	930642	0 %	0 %	0 %	100 %	296242724
16064	NC_014160	CCT	2	6	930664	930669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242724
16065	NC_014160	GA	4	8	930786	930793	50 %	0 %	50 %	0 %	296242724
16066	NC_014160	GTC	2	6	930826	930831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242724
16067	NC_014160	TTC	2	6	930832	930837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242724
16068	NC_014160	GATG	2	8	930924	930931	25 %	25 %	50 %	0 %	296242724
16069	NC_014160	CAAC	2	8	930968	930975	50 %	0 %	0 %	50 %	296242724
16070	NC_014160	CTGAT	2	10	930980	930989	20 %	40 %	20 %	20 %	296242724
16071	NC_014160	ATG	2	6	931052	931057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242724
16072	NC_014160	GAG	2	6	931086	931091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242724
16073	NC_014160	GGA	2	6	931133	931138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242724
16074	NC_014160	ATT	2	6	931258	931263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242724
16075	NC_014160	ATA	2	6	931280	931285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242724
16076	NC_014160	G	6	6	931307	931312	0 %	0 %	100 %	0 %	296242724
16077	NC_014160	CT	3	6	931413	931418	0 %	50 %	0 %	50 %	296242725
16078	NC_014160	ACC	2	6	931446	931451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242725
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16080	NC_014160	TGA	2	6	931539	931544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242725
16081	NC_014160	TAAA	2	8	931630	931637	75 %	25 %	0 %	0 %	296242725
16082	NC_014160	GAC	2	6	931715	931720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242726
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16085	NC_014160	TCG	2	6	931899	931904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242726
16086	NC_014160	AGG	2	6	931905	931910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242726
16087	NC_014160	AGG	2	6	931976	931981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242726
16088	NC_014160	AGG	2	6	931989	931994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242726
16089	NC_014160	AGC	2	6	932014	932019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242726
16090	NC_014160	ATG	2	6	932060	932065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242726
16091	NC_014160	TGA	2	6	932080	932085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242726
16092	NC_014160	AGG	2	6	932094	932099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242726
16093	NC_014160	AGC	2	6	932164	932169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242726
16094	NC_014160	A	6	6	932180	932185	100 %	0 %	0 %	0 %	296242726
16095	NC_014160	GCCA	2	8	932204	932211	25 %	0 %	25 %	50 %	296242726
16096	NC_014160	CCT	2	6	932224	932229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242726
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16098	NC_014160	AG	3	6	932291	932296	50 %	0 %	50 %	0 %	296242726
16099	NC_014160	GGTA	2	8	932392	932399	25 %	25 %	50 %	0 %	296242726
16100	NC_014160	TCGA	2	8	932471	932478	25 %	25 %	25 %	25 %	296242726
16101	NC_014160	C	6	6	932552	932557	0 %	0 %	0 %	100 %	296242726
16102	NC_014160	GA	3	6	932584	932589	50 %	0 %	50 %	0 %	296242726
16103	NC_014160	TGA	2	6	932593	932598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242726
16104	NC_014160	TGA	2	6	933010	933015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242727
16105	NC_014160	GTG	2	6	933082	933087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242727
16106	NC_014160	TAG	2	6	933115	933120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242727
16107	NC_014160	CTAT	2	8	933129	933136	25 %	50 %	0 %	25 %	296242727
16108	NC_014160	T	6	6	933164	933169	0 %	100 %	0 %	0 %	296242727
16109	NC_014160	AGG	2	6	933192	933197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242727
16110	NC_014160	T	6	6	933271	933276	0 %	100 %	0 %	0 %	296242728
16111	NC_014160	CAC	2	6	933277	933282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242728
16112	NC_014160	TCCA	2	8	933293	933300	25 %	25 %	0 %	50 %	296242728
16113	NC_014160	ATT	2	6	933349	933354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242728
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16116	NC_014160	TAT	2	6	933483	933488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242728
16117	NC_014160	CTT	2	6	933503	933508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242728
16118	NC_014160	ACC	2	6	933538	933543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242728
16119	NC_014160	CT	3	6	933566	933571	0 %	50 %	0 %	50 %	296242728
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16243	NC_014160	TGA	2	6	940908	940913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242740
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