MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014160	TGG	2	6	898039	898044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242689
15502	NC_014160	TTA	2	6	898045	898050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242689
15503	NC_014160	GGAG	2	8	898126	898133	25 %	0 %	75 %	0 %	296242689
15504	NC_014160	TAC	2	6	898176	898181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242690
15505	NC_014160	CAG	2	6	898201	898206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242690
15506	NC_014160	AGCGGT	2	12	898263	898274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296242690
15507	NC_014160	TGA	2	6	898297	898302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242690
15508	NC_014160	GAA	2	6	898321	898326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242690
15509	NC_014160	GAG	2	6	898509	898514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242690
15510	NC_014160	CTC	2	6	898536	898541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242690
15511	NC_014160	CCA	2	6	898583	898588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242690
15512	NC_014160	CGA	2	6	898661	898666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242690
15513	NC_014160	TGA	2	6	898714	898719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242690
15514	NC_014160	AAT	2	6	898748	898753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242690
15515	NC_014160	TGG	2	6	898814	898819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242690
15516	NC_014160	AAT	2	6	898823	898828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242690
15517	NC_014160	TGA	2	6	898852	898857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242690
15518	NC_014160	GA	3	6	898856	898861	50 %	0 %	50 %	0 %	296242690
15519	NC_014160	CCAT	2	8	898868	898875	25 %	25 %	0 %	50 %	296242690
15520	NC_014160	GAG	2	6	899148	899153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242691
15521	NC_014160	GATT	2	8	899201	899208	25 %	50 %	25 %	0 %	296242691
15522	NC_014160	AGCGGT	2	12	899227	899238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296242691
15523	NC_014160	GTA	2	6	899293	899298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242691
15524	NC_014160	CT	3	6	899323	899328	0 %	50 %	0 %	50 %	296242691
15525	NC_014160	ACA	2	6	899457	899462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242691
15526	NC_014160	G	6	6	899554	899559	0 %	0 %	100 %	0 %	296242691
15527	NC_014160	AG	3	6	899567	899572	50 %	0 %	50 %	0 %	296242691
15528	NC_014160	TGT	2	6	899591	899596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242691
15529	NC_014160	TTG	2	6	899612	899617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242691
15530	NC_014160	CGA	2	6	899619	899624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242691
15531	NC_014160	ATA	2	6	899662	899667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242691
15532	NC_014160	CTC	2	6	899671	899676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242691
15533	NC_014160	AATC	2	8	899698	899705	50 %	25 %	0 %	25 %	296242691
15534	NC_014160	TAT	2	6	899708	899713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242691
15535	NC_014160	GGATA	2	10	899751	899760	40 %	20 %	40 %	0 %	296242691
15536	NC_014160	GAG	2	6	899788	899793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242691
15537	NC_014160	GCG	2	6	899801	899806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242691
15538	NC_014160	TTA	2	6	899845	899850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242691
15539	NC_014160	T	7	7	899894	899900	0 %	100 %	0 %	0 %	296242691
15540	NC_014160	AGG	2	6	900012	900017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242691
15541	NC_014160	AAAGT	2	10	900025	900034	60 %	20 %	20 %	0 %	296242691
15542	NC_014160	GA	3	6	900046	900051	50 %	0 %	50 %	0 %	296242691
15543	NC_014160	CCT	2	6	900261	900266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242692
15544	NC_014160	CTT	2	6	900267	900272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242692
15545	NC_014160	TCA	2	6	900299	900304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242692
15546	NC_014160	GAGG	2	8	900597	900604	25 %	0 %	75 %	0 %	296242693
15547	NC_014160	GAG	3	9	900616	900624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242693
15548	NC_014160	TGA	2	6	900628	900633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242693
15549	NC_014160	GCA	2	6	900647	900652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242693
15550	NC_014160	GGT	2	6	900685	900690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242693
15551	NC_014160	AG	3	6	900706	900711	50 %	0 %	50 %	0 %	296242693
15552	NC_014160	GAA	2	6	900724	900729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242693
15553	NC_014160	GAG	2	6	900757	900762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242694
15554	NC_014160	TAC	2	6	900767	900772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242694
15555	NC_014160	TAG	2	6	900938	900943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242694
15556	NC_014160	TTG	2	6	900959	900964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242694
15557	NC_014160	GA	3	6	900988	900993	50 %	0 %	50 %	0 %	296242694
15558	NC_014160	AT	3	6	901015	901020	50 %	50 %	0 %	0 %	296242694
15559	NC_014160	TC	3	6	901026	901031	0 %	50 %	0 %	50 %	296242694
15560	NC_014160	GATA	2	8	901041	901048	50 %	25 %	25 %	0 %	296242694
15561	NC_014160	C	6	6	901078	901083	0 %	0 %	0 %	100 %	296242694
15562	NC_014160	GGA	2	6	901098	901103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242694
15563	NC_014160	AT	3	6	901144	901149	50 %	50 %	0 %	0 %	296242694
15564	NC_014160	TAA	2	6	901221	901226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242694
15565	NC_014160	GTTG	2	8	901281	901288	0 %	50 %	50 %	0 %	296242694
15566	NC_014160	AGC	2	6	901295	901300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242694
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15568	NC_014160	AGG	2	6	902640	902645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242695
15569	NC_014160	TAC	2	6	902679	902684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242695
15570	NC_014160	GAAA	2	8	902708	902715	75 %	0 %	25 %	0 %	296242695
15571	NC_014160	TACAA	2	10	902753	902762	60 %	20 %	0 %	20 %	296242695
15572	NC_014160	TGT	2	6	902768	902773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242695
15573	NC_014160	CTTG	2	8	902783	902790	0 %	50 %	25 %	25 %	296242695
15574	NC_014160	TAA	2	6	902918	902923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242695
15575	NC_014160	TGT	2	6	902924	902929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242695
15576	NC_014160	AAAC	2	8	902977	902984	75 %	0 %	0 %	25 %	296242695
15577	NC_014160	AGG	2	6	903042	903047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242695
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15580	NC_014160	ATG	2	6	903157	903162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242695
15581	NC_014160	A	6	6	903184	903189	100 %	0 %	0 %	0 %	296242695
15582	NC_014160	GAG	2	6	903192	903197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242695
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15584	NC_014160	CTC	2	6	903257	903262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242695
15585	NC_014160	TCGA	2	8	903294	903301	25 %	25 %	25 %	25 %	296242695
15586	NC_014160	GAAGGC	2	12	903356	903367	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296242695
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15588	NC_014160	AGA	3	9	903412	903420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242695
15589	NC_014160	GAA	2	6	903425	903430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242695
15590	NC_014160	CAT	2	6	903460	903465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242695
15591	NC_014160	GAT	3	9	903468	903476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242695
15592	NC_014160	GAA	2	6	903491	903496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242695
15593	NC_014160	ACA	2	6	903523	903528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242695
15594	NC_014160	GA	3	6	903566	903571	50 %	0 %	50 %	0 %	296242695
15595	NC_014160	AGG	2	6	903589	903594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242695
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15598	NC_014160	ACA	2	6	903774	903779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242695
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15600	NC_014160	GGA	2	6	903798	903803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242695
15601	NC_014160	AAG	2	6	903882	903887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242695
15602	NC_014160	TTG	2	6	903918	903923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242695
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15604	NC_014160	GTTT	2	8	903951	903958	0 %	75 %	25 %	0 %	296242695
15605	NC_014160	GAG	2	6	904023	904028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242695
15606	NC_014160	AGATGA	2	12	904030	904041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296242695
15607	NC_014160	ATGA	2	8	904142	904149	50 %	25 %	25 %	0 %	296242696
15608	NC_014160	AAT	2	6	904195	904200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242696
15609	NC_014160	CAG	2	6	904232	904237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242696
15610	NC_014160	AGT	2	6	904333	904338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242696
15611	NC_014160	TCAT	2	8	904475	904482	25 %	50 %	0 %	25 %	296242696
15612	NC_014160	ATG	2	6	904514	904519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242696
15613	NC_014160	TC	3	6	904534	904539	0 %	50 %	0 %	50 %	296242696
15614	NC_014160	GCG	2	6	904559	904564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242696
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15861	NC_014160	CTG	2	6	918532	918537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242712
15862	NC_014160	CTT	2	6	918581	918586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242712
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15864	NC_014160	CAT	2	6	918671	918676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242712
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15982	NC_014160	GAG	2	6	926157	926162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242718
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