MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014160	TCC	2	6	870018	870023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242656
15002	NC_014160	ACT	2	6	870024	870029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242656
15003	NC_014160	TGG	2	6	870103	870108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242656
15004	NC_014160	GAA	2	6	870163	870168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242656
15005	NC_014160	GAGGG	2	10	870214	870223	20 %	0 %	80 %	0 %	296242656
15006	NC_014160	GAA	2	6	870354	870359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242657
15007	NC_014160	GGGA	2	8	870372	870379	25 %	0 %	75 %	0 %	296242657
15008	NC_014160	GGT	2	6	870455	870460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242657
15009	NC_014160	AGC	2	6	870624	870629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242657
15010	NC_014160	CAT	2	6	870655	870660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242657
15011	NC_014160	CG	3	6	870707	870712	0 %	0 %	50 %	50 %	296242657
15012	NC_014160	GCA	2	6	870750	870755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242657
15013	NC_014160	ATCA	2	8	870851	870858	50 %	25 %	0 %	25 %	296242657
15014	NC_014160	TAT	2	6	871126	871131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242658
15015	NC_014160	AGG	2	6	871139	871144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242658
15016	NC_014160	GGA	2	6	871222	871227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242658
15017	NC_014160	GCC	2	6	871262	871267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242658
15018	NC_014160	GGGA	2	8	871316	871323	25 %	0 %	75 %	0 %	296242658
15019	NC_014160	CTC	2	6	871350	871355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242658
15020	NC_014160	CCA	2	6	871369	871374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242658
15021	NC_014160	CTC	2	6	871445	871450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242658
15022	NC_014160	T	6	6	871607	871612	0 %	100 %	0 %	0 %	296242658
15023	NC_014160	ATCTT	2	10	871979	871988	20 %	60 %	0 %	20 %	296242659
15024	NC_014160	TAG	2	6	872083	872088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242659
15025	NC_014160	GGA	2	6	872205	872210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242659
15026	NC_014160	TAA	2	6	872321	872326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242659
15027	NC_014160	CTT	2	6	872364	872369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242659
15028	NC_014160	G	6	6	872387	872392	0 %	0 %	100 %	0 %	296242659
15029	NC_014160	ATC	2	6	872434	872439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242659
15030	NC_014160	CCT	2	6	872454	872459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242659
15031	NC_014160	AAG	2	6	872480	872485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242659
15032	NC_014160	CAA	2	6	872526	872531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242659
15033	NC_014160	GTGCCT	2	12	872584	872595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242659
15034	NC_014160	T	6	6	872704	872709	0 %	100 %	0 %	0 %	296242659
15035	NC_014160	CTG	2	6	872714	872719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242659
15036	NC_014160	GGC	2	6	872767	872772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242659
15037	NC_014160	AGA	2	6	872962	872967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242660
15038	NC_014160	GCG	2	6	873008	873013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242660
15039	NC_014160	CTT	2	6	873088	873093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242660
15040	NC_014160	ATA	2	6	873124	873129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242660
15041	NC_014160	CTA	2	6	873155	873160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242660
15042	NC_014160	CACC	2	8	873166	873173	25 %	0 %	0 %	75 %	296242660
15043	NC_014160	GGA	2	6	873192	873197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242660
15044	NC_014160	TGG	2	6	873230	873235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242660
15045	NC_014160	ATC	2	6	873247	873252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242660
15046	NC_014160	AGCAT	2	10	873298	873307	40 %	20 %	20 %	20 %	296242660
15047	NC_014160	TGA	2	6	873312	873317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242660
15048	NC_014160	AGCC	2	8	873398	873405	25 %	0 %	25 %	50 %	296242660
15049	NC_014160	CAA	2	6	873415	873420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242660
15050	NC_014160	CAT	2	6	873448	873453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242661
15051	NC_014160	GAAA	2	8	873462	873469	75 %	0 %	25 %	0 %	296242661
15052	NC_014160	CA	3	6	873485	873490	50 %	0 %	0 %	50 %	296242661
15053	NC_014160	AC	3	6	873498	873503	50 %	0 %	0 %	50 %	296242661
15054	NC_014160	GTT	2	6	873522	873527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242661
15055	NC_014160	AGG	2	6	873530	873535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242661
15056	NC_014160	GAT	2	6	873551	873556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242661
15057	NC_014160	GAC	2	6	873557	873562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242661
15058	NC_014160	CAA	2	6	873592	873597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242661
15059	NC_014160	GAG	2	6	873629	873634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242661
15060	NC_014160	AGT	2	6	873681	873686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242661
15061	NC_014160	CTG	2	6	873730	873735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242661
15062	NC_014160	CT	4	8	873796	873803	0 %	50 %	0 %	50 %	296242661
15063	NC_014160	GA	3	6	873863	873868	50 %	0 %	50 %	0 %	296242661
15064	NC_014160	CCT	2	6	873877	873882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242661
15065	NC_014160	GTAG	2	8	873937	873944	25 %	25 %	50 %	0 %	296242661
15066	NC_014160	CAA	2	6	873976	873981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242661
15067	NC_014160	GAG	2	6	874134	874139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242661
15068	NC_014160	TA	3	6	874140	874145	50 %	50 %	0 %	0 %	296242661
15069	NC_014160	AG	3	6	874146	874151	50 %	0 %	50 %	0 %	296242661
15070	NC_014160	CTCC	2	8	874254	874261	0 %	25 %	0 %	75 %	296242662
15071	NC_014160	GTA	2	6	874293	874298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
15072	NC_014160	ATT	2	6	874383	874388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242662
15073	NC_014160	TGGC	2	8	874400	874407	0 %	25 %	50 %	25 %	296242662
15074	NC_014160	CCT	2	6	874478	874483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15075	NC_014160	CAT	2	6	874500	874505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242662
15076	NC_014160	CTC	2	6	874508	874513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15077	NC_014160	CCTCGA	2	12	874538	874549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296242662
15078	NC_014160	GTA	2	6	874578	874583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
15079	NC_014160	CGG	2	6	874613	874618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242662
15080	NC_014160	TCC	2	6	874766	874771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15081	NC_014160	TCA	2	6	874772	874777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242662
15082	NC_014160	CCT	2	6	874800	874805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15083	NC_014160	GTGC	2	8	874887	874894	0 %	25 %	50 %	25 %	296242662
15084	NC_014160	CTC	2	6	874902	874907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15085	NC_014160	CTC	2	6	875037	875042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15086	NC_014160	C	6	6	875042	875047	0 %	0 %	0 %	100 %	296242662
15087	NC_014160	CCA	2	6	875081	875086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242662
15088	NC_014160	CTC	2	6	875149	875154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15089	NC_014160	AGT	2	6	875156	875161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
15090	NC_014160	CCT	2	6	875171	875176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15091	NC_014160	CTC	2	6	875185	875190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15092	NC_014160	TTG	2	6	875230	875235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242662
15093	NC_014160	TGG	2	6	875261	875266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242662
15094	NC_014160	CCT	3	9	875468	875476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15095	NC_014160	TCC	2	6	875500	875505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15096	NC_014160	CCG	2	6	875506	875511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242662
15097	NC_014160	TCC	2	6	875537	875542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15098	NC_014160	TGG	2	6	875597	875602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242662
15099	NC_014160	CTG	2	6	875634	875639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242662
15100	NC_014160	GAGCCC	2	12	875652	875663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296242662
15101	NC_014160	TGA	2	6	875672	875677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
15102	NC_014160	AGT	2	6	875747	875752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
15103	NC_014160	GGCC	2	8	875787	875794	0 %	0 %	50 %	50 %	296242662
15104	NC_014160	CTG	2	6	875836	875841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242662
15105	NC_014160	GAG	2	6	875937	875942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242662
15106	NC_014160	TCCTC	2	10	875963	875972	0 %	40 %	0 %	60 %	296242662
15107	NC_014160	GAA	2	6	875985	875990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242662
15108	NC_014160	CTC	2	6	876054	876059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
15109	NC_014160	AACC	2	8	876089	876096	50 %	0 %	0 %	50 %	296242662
15110	NC_014160	CAG	2	6	876213	876218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242663
15111	NC_014160	CAA	2	6	876222	876227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242663
15112	NC_014160	TGT	2	6	876267	876272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242663
15113	NC_014160	GCT	2	6	876307	876312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242663
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15115	NC_014160	GTT	2	6	876369	876374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242663
15116	NC_014160	TCC	2	6	876421	876426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242663
15117	NC_014160	AAG	2	6	876429	876434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242663
15118	NC_014160	GCT	2	6	876454	876459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242663
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15120	NC_014160	AGT	2	6	876538	876543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242663
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15362	NC_014160	GA	3	6	888235	888240	50 %	0 %	50 %	0 %	296242681
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