MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014160	TTCA	2	8	66364	66371	25 %	50 %	0 %	25 %	296241820
1002	NC_014160	TCC	2	6	66435	66440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241820
1003	NC_014160	TGA	2	6	66444	66449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241820
1004	NC_014160	TTA	2	6	66461	66466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241820
1005	NC_014160	TAC	2	6	66524	66529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241820
1006	NC_014160	GTT	2	6	66548	66553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241820
1007	NC_014160	ACT	2	6	66600	66605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241820
1008	NC_014160	ACT	2	6	66690	66695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241820
1009	NC_014160	GGA	2	6	66787	66792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241820
1010	NC_014160	ACT	2	6	66917	66922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241820
1011	NC_014160	GAG	2	6	67007	67012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241820
1012	NC_014160	GAA	2	6	67017	67022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241820
1013	NC_014160	GAG	3	9	67031	67039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241820
1014	NC_014160	CTT	3	9	67081	67089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241820
1015	NC_014160	GAAA	2	8	67114	67121	75 %	0 %	25 %	0 %	296241820
1016	NC_014160	TCG	2	6	67134	67139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241820
1017	NC_014160	ATT	2	6	67192	67197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241820
1018	NC_014160	TGG	2	6	67228	67233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241820
1019	NC_014160	GAAT	2	8	67339	67346	50 %	25 %	25 %	0 %	296241821
1020	NC_014160	CTCA	2	8	67380	67387	25 %	25 %	0 %	50 %	296241821
1021	NC_014160	GAA	2	6	67410	67415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241821
1022	NC_014160	CAA	2	6	67441	67446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241821
1023	NC_014160	GTC	2	6	67512	67517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241821
1024	NC_014160	GA	3	6	67545	67550	50 %	0 %	50 %	0 %	296241821
1025	NC_014160	CTA	2	6	67564	67569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241821
1026	NC_014160	AC	3	6	67677	67682	50 %	0 %	0 %	50 %	296241821
1027	NC_014160	AG	3	6	67698	67703	50 %	0 %	50 %	0 %	296241821
1028	NC_014160	GGA	2	6	67745	67750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241821
1029	NC_014160	ACC	2	6	67835	67840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241821
1030	NC_014160	GA	3	6	68025	68030	50 %	0 %	50 %	0 %	296241821
1031	NC_014160	GAT	2	6	68061	68066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241821
1032	NC_014160	TTC	2	6	68076	68081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241821
1033	NC_014160	C	6	6	68081	68086	0 %	0 %	0 %	100 %	296241821
1034	NC_014160	GTA	2	6	68109	68114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241821
1035	NC_014160	AAT	2	6	68120	68125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241821
1036	NC_014160	CAA	2	6	68302	68307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241821
1037	NC_014160	AGA	2	6	68325	68330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241821
1038	NC_014160	AT	3	6	68367	68372	50 %	50 %	0 %	0 %	296241821
1039	NC_014160	GAG	2	6	68394	68399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241821
1040	NC_014160	GA	3	6	68418	68423	50 %	0 %	50 %	0 %	296241821
1041	NC_014160	GTC	2	6	68448	68453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241821
1042	NC_014160	GAGG	2	8	68466	68473	25 %	0 %	75 %	0 %	296241821
1043	NC_014160	GA	3	6	68519	68524	50 %	0 %	50 %	0 %	296241821
1044	NC_014160	AGA	2	6	68531	68536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241821
1045	NC_014160	AGA	2	6	68631	68636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241821
1046	NC_014160	CTA	2	6	68666	68671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241821
1047	NC_014160	AT	3	6	68753	68758	50 %	50 %	0 %	0 %	296241822
1048	NC_014160	GCG	3	9	68818	68826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241822
1049	NC_014160	TGT	2	6	68852	68857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241822
1050	NC_014160	ACA	2	6	68905	68910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241822
1051	NC_014160	T	6	6	69008	69013	0 %	100 %	0 %	0 %	296241823
1052	NC_014160	GAA	2	6	69020	69025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241823
1053	NC_014160	TC	3	6	69041	69046	0 %	50 %	0 %	50 %	296241823
1054	NC_014160	CCA	2	6	69094	69099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241823
1055	NC_014160	CCT	2	6	69117	69122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241823
1056	NC_014160	AAG	2	6	69127	69132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241823
1057	NC_014160	TC	3	6	69167	69172	0 %	50 %	0 %	50 %	296241823
1058	NC_014160	TCC	2	6	69177	69182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241823
1059	NC_014160	TG	3	6	69208	69213	0 %	50 %	50 %	0 %	296241823
1060	NC_014160	GTT	2	6	69225	69230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241823
1061	NC_014160	TC	3	6	69354	69359	0 %	50 %	0 %	50 %	296241823
1062	NC_014160	TCT	2	6	69407	69412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241823
1063	NC_014160	AC	3	6	69414	69419	50 %	0 %	0 %	50 %	296241823
1064	NC_014160	TCG	2	6	69432	69437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241823
1065	NC_014160	CT	3	6	69449	69454	0 %	50 %	0 %	50 %	296241823
1066	NC_014160	CAC	2	6	69464	69469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241823
1067	NC_014160	TC	3	6	69603	69608	0 %	50 %	0 %	50 %	296241823
1068	NC_014160	TCC	2	6	69638	69643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241823
1069	NC_014160	TCG	2	6	69741	69746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241824
1070	NC_014160	GAT	2	6	69749	69754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241824
1071	NC_014160	ACAG	2	8	69758	69765	50 %	0 %	25 %	25 %	296241824
1072	NC_014160	ATT	3	9	69796	69804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241824
1073	NC_014160	AAG	2	6	69810	69815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241824
1074	NC_014160	GAG	2	6	69848	69853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241824
1075	NC_014160	TC	3	6	70022	70027	0 %	50 %	0 %	50 %	296241824
1076	NC_014160	ACC	2	6	70064	70069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241824
1077	NC_014160	GTT	2	6	70091	70096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241824
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1081	NC_014160	TTG	2	6	70302	70307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241824
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1083	NC_014160	CTGCA	2	10	70337	70346	20 %	20 %	20 %	40 %	296241824
1084	NC_014160	GAG	2	6	70351	70356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241824
1085	NC_014160	CAG	2	6	70384	70389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241824
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1087	NC_014160	CTT	2	6	70491	70496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241825
1088	NC_014160	T	6	6	70515	70520	0 %	100 %	0 %	0 %	296241825
1089	NC_014160	CTC	2	6	70524	70529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241825
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1091	NC_014160	T	6	6	70647	70652	0 %	100 %	0 %	0 %	296241825
1092	NC_014160	CT	3	6	70695	70700	0 %	50 %	0 %	50 %	296241825
1093	NC_014160	TGA	2	6	70750	70755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241825
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1095	NC_014160	TCA	2	6	70790	70795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241825
1096	NC_014160	GA	3	6	70801	70806	50 %	0 %	50 %	0 %	296241825
1097	NC_014160	TCA	2	6	70808	70813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241825
1098	NC_014160	TGTAA	2	10	70878	70887	40 %	40 %	20 %	0 %	296241825
1099	NC_014160	TGG	2	6	70997	71002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241825
1100	NC_014160	TCC	2	6	71050	71055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241825
1101	NC_014160	CT	3	6	71070	71075	0 %	50 %	0 %	50 %	296241825
1102	NC_014160	TCA	2	6	71105	71110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241825
1103	NC_014160	CT	3	6	71185	71190	0 %	50 %	0 %	50 %	296241825
1104	NC_014160	CGT	2	6	71276	71281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241825
1105	NC_014160	GAC	2	6	71307	71312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241825
1106	NC_014160	CTTCT	2	10	71319	71328	0 %	60 %	0 %	40 %	296241825
1107	NC_014160	TGCC	2	8	71343	71350	0 %	25 %	25 %	50 %	296241825
1108	NC_014160	AAT	2	6	71431	71436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241825
1109	NC_014160	TTCG	2	8	71469	71476	0 %	50 %	25 %	25 %	296241825
1110	NC_014160	AGT	2	6	71522	71527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241825
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1113	NC_014160	TTC	2	6	71582	71587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241825
1114	NC_014160	TCT	2	6	71645	71650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241825
1115	NC_014160	CCG	2	6	71671	71676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241825
1116	NC_014160	CGA	2	6	71792	71797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241825
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1118	NC_014160	AGT	2	6	71881	71886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241826
1119	NC_014160	TTCT	2	8	71892	71899	0 %	75 %	0 %	25 %	296241826
1120	NC_014160	ATC	2	6	71904	71909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241826
1121	NC_014160	T	6	6	71996	72001	0 %	100 %	0 %	0 %	296241826
1122	NC_014160	AGG	2	6	72084	72089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241826
1123	NC_014160	CT	3	6	72135	72140	0 %	50 %	0 %	50 %	296241826
1124	NC_014160	TCT	2	6	72172	72177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241826
1125	NC_014160	CTA	2	6	72197	72202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241826
1126	NC_014160	CTC	2	6	72213	72218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241826
1127	NC_014160	GTA	2	6	72236	72241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241826
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1132	NC_014160	TAC	2	6	72399	72404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241826
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