MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014160	CTC	3	9	782973	782981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242552
13502	NC_014160	CGG	2	6	783003	783008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242552
13503	NC_014160	AGGAGC	2	12	783027	783038	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296242552
13504	NC_014160	AAG	2	6	783050	783055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242552
13505	NC_014160	CAG	2	6	783142	783147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242552
13506	NC_014160	GAG	2	6	783171	783176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242552
13507	NC_014160	AGT	2	6	783353	783358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242552
13508	NC_014160	AGG	2	6	783361	783366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242552
13509	NC_014160	CTACCC	2	12	783401	783412	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	296242552
13510	NC_014160	CAGG	2	8	783446	783453	25 %	0 %	50 %	25 %	296242552
13511	NC_014160	GGGA	2	8	783501	783508	25 %	0 %	75 %	0 %	296242552
13512	NC_014160	GAT	2	6	783564	783569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242553
13513	NC_014160	CAT	2	6	783579	783584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242553
13514	NC_014160	CAT	2	6	783710	783715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242553
13515	NC_014160	AGG	2	6	783743	783748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242553
13516	NC_014160	GTG	2	6	783859	783864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242553
13517	NC_014160	GAA	2	6	783927	783932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242553
13518	NC_014160	AGGG	2	8	783943	783950	25 %	0 %	75 %	0 %	296242553
13519	NC_014160	CGG	2	6	784113	784118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242553
13520	NC_014160	A	6	6	784301	784306	100 %	0 %	0 %	0 %	296242553
13521	NC_014160	AG	3	6	784346	784351	50 %	0 %	50 %	0 %	296242553
13522	NC_014160	GAA	2	6	784371	784376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242553
13523	NC_014160	GAG	2	6	784477	784482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242553
13524	NC_014160	AGT	2	6	784485	784490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242553
13525	NC_014160	GAG	2	6	784531	784536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242553
13526	NC_014160	AGGA	2	8	784585	784592	50 %	0 %	50 %	0 %	296242553
13527	NC_014160	AGC	2	6	784603	784608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242553
13528	NC_014160	AGG	2	6	784609	784614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242553
13529	NC_014160	GGGGA	2	10	784615	784624	20 %	0 %	80 %	0 %	296242553
13530	NC_014160	CCCCGT	2	12	784638	784649	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296242553
13531	NC_014160	AGGG	2	8	784732	784739	25 %	0 %	75 %	0 %	296242553
13532	NC_014160	AAG	2	6	784783	784788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242553
13533	NC_014160	AAC	2	6	784816	784821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242553
13534	NC_014160	GCGA	2	8	784873	784880	25 %	0 %	50 %	25 %	296242553
13535	NC_014160	CGA	2	6	784890	784895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242553
13536	NC_014160	ATG	2	6	784948	784953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242553
13537	NC_014160	TAG	2	6	785015	785020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242553
13538	NC_014160	GAG	2	6	785026	785031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242553
13539	NC_014160	GGA	2	6	785033	785038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242553
13540	NC_014160	ATG	2	6	785089	785094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242553
13541	NC_014160	GAC	2	6	785098	785103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242553
13542	NC_014160	CCGCCC	2	12	785770	785781	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	296242554
13543	NC_014160	CCCCCT	2	12	785893	785904	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	296242554
13544	NC_014160	GTA	2	6	785952	785957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242554
13545	NC_014160	AGGG	2	8	785974	785981	25 %	0 %	75 %	0 %	296242554
13546	NC_014160	CTC	2	6	786007	786012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242554
13547	NC_014160	CCT	2	6	786179	786184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242554
13548	NC_014160	TCA	2	6	786263	786268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242554
13549	NC_014160	TCG	2	6	786322	786327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242554
13550	NC_014160	GAA	2	6	786330	786335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242554
13551	NC_014160	GCCT	2	8	786396	786403	0 %	25 %	25 %	50 %	296242554
13552	NC_014160	CTC	2	6	786435	786440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242554
13553	NC_014160	TAG	2	6	786463	786468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242554
13554	NC_014160	CTC	2	6	786490	786495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242554
13555	NC_014160	ACAT	2	8	786577	786584	50 %	25 %	0 %	25 %	296242554
13556	NC_014160	CCT	2	6	786596	786601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242554
13557	NC_014160	CGC	2	6	786602	786607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242554
13558	NC_014160	TCT	2	6	786680	786685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242554
13559	NC_014160	CG	3	6	786746	786751	0 %	0 %	50 %	50 %	296242554
13560	NC_014160	CAC	2	6	786784	786789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242555
13561	NC_014160	TCC	2	6	786923	786928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242555
13562	NC_014160	C	6	6	786983	786988	0 %	0 %	0 %	100 %	296242555
13563	NC_014160	CTC	2	6	787001	787006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242555
13564	NC_014160	AGA	2	6	787047	787052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242555
13565	NC_014160	TCG	2	6	787220	787225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242555
13566	NC_014160	CATAC	2	10	787380	787389	40 %	20 %	0 %	40 %	296242556
13567	NC_014160	TGG	2	6	787411	787416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242556
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13569	NC_014160	CAT	2	6	787515	787520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242556
13570	NC_014160	GAG	2	6	787612	787617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242556
13571	NC_014160	TTGC	2	8	787714	787721	0 %	50 %	25 %	25 %	296242556
13572	NC_014160	GGA	3	9	787791	787799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242556
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13575	NC_014160	GAA	2	6	787947	787952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242556
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13579	NC_014160	AAC	2	6	788185	788190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242556
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13582	NC_014160	CAGACC	2	12	788351	788362	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296242556
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13586	NC_014160	CAAA	2	8	788605	788612	75 %	0 %	0 %	25 %	296242557
13587	NC_014160	CAGA	2	8	788637	788644	50 %	0 %	25 %	25 %	296242557
13588	NC_014160	ATAAAT	2	12	788660	788671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242557
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13590	NC_014160	CTCAG	2	10	788774	788783	20 %	20 %	20 %	40 %	296242557
13591	NC_014160	AG	3	6	788793	788798	50 %	0 %	50 %	0 %	296242557
13592	NC_014160	TAA	2	6	788825	788830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242557
13593	NC_014160	CAG	2	6	789093	789098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242558
13594	NC_014160	TGG	2	6	789141	789146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242558
13595	NC_014160	GCTG	2	8	789154	789161	0 %	25 %	50 %	25 %	296242558
13596	NC_014160	GGA	2	6	789232	789237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242558
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13601	NC_014160	CCTG	2	8	789851	789858	0 %	25 %	25 %	50 %	296242559
13602	NC_014160	GCTG	2	8	789880	789887	0 %	25 %	50 %	25 %	296242559
13603	NC_014160	AAG	2	6	789899	789904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242559
13604	NC_014160	GAA	2	6	789961	789966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242559
13605	NC_014160	TA	3	6	789993	789998	50 %	50 %	0 %	0 %	296242559
13606	NC_014160	AGG	2	6	790045	790050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242560
13607	NC_014160	AAG	2	6	790051	790056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242560
13608	NC_014160	AGG	2	6	790057	790062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242560
13609	NC_014160	AGA	2	6	790070	790075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242560
13610	NC_014160	AGT	2	6	790077	790082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242560
13611	NC_014160	ACA	2	6	790256	790261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242560
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13616	NC_014160	CCTT	2	8	790494	790501	0 %	50 %	0 %	50 %	296242561
13617	NC_014160	AGG	2	6	790504	790509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242561
13618	NC_014160	GAG	2	6	790529	790534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242561
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13980	NC_014160	TC	3	6	811562	811567	0 %	50 %	0 %	50 %	296242583
13981	NC_014160	AAG	2	6	811581	811586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242583
13982	NC_014160	TTG	2	6	811594	811599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242583
13983	NC_014160	CGG	2	6	811610	811615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242583
13984	NC_014160	CGG	2	6	811658	811663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242583
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