MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014160	GCG	2	6	636518	636523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242411
11002	NC_014160	AG	3	6	636532	636537	50 %	0 %	50 %	0 %	296242411
11003	NC_014160	AATC	2	8	636539	636546	50 %	25 %	0 %	25 %	296242411
11004	NC_014160	GGAT	2	8	636707	636714	25 %	25 %	50 %	0 %	296242411
11005	NC_014160	GTG	2	6	636733	636738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242411
11006	NC_014160	ATC	2	6	636757	636762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242411
11007	NC_014160	GA	3	6	636808	636813	50 %	0 %	50 %	0 %	296242411
11008	NC_014160	AGT	2	6	636831	636836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242411
11009	NC_014160	CAT	2	6	636854	636859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242411
11010	NC_014160	GTT	2	6	636877	636882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242411
11011	NC_014160	GTAG	2	8	636921	636928	25 %	25 %	50 %	0 %	296242411
11012	NC_014160	T	6	6	636930	636935	0 %	100 %	0 %	0 %	296242412
11013	NC_014160	TCT	2	6	636975	636980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242412
11014	NC_014160	CTT	2	6	637078	637083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242412
11015	NC_014160	GAAA	2	8	637134	637141	75 %	0 %	25 %	0 %	296242412
11016	NC_014160	ATT	2	6	637153	637158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242412
11017	NC_014160	TGA	2	6	637161	637166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242412
11018	NC_014160	TAA	2	6	637263	637268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242412
11019	NC_014160	CAG	2	6	637277	637282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242412
11020	NC_014160	CGATAA	2	12	637334	637345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296242412
11021	NC_014160	CTTTG	2	10	637403	637412	0 %	60 %	20 %	20 %	296242412
11022	NC_014160	AGA	2	6	637413	637418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242412
11023	NC_014160	TTCC	2	8	637421	637428	0 %	50 %	0 %	50 %	296242413
11024	NC_014160	TAT	2	6	637453	637458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242413
11025	NC_014160	T	6	6	637519	637524	0 %	100 %	0 %	0 %	296242413
11026	NC_014160	CTC	3	9	637528	637536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242413
11027	NC_014160	TTC	2	6	637591	637596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242413
11028	NC_014160	TAG	2	6	637653	637658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242413
11029	NC_014160	TAA	2	6	637727	637732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242413
11030	NC_014160	AGT	2	6	637749	637754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242413
11031	NC_014160	TTTC	2	8	637787	637794	0 %	75 %	0 %	25 %	296242413
11032	NC_014160	GT	3	6	637896	637901	0 %	50 %	50 %	0 %	296242413
11033	NC_014160	TCC	2	6	637909	637914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242413
11034	NC_014160	AGT	2	6	638042	638047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242413
11035	NC_014160	T	6	6	638142	638147	0 %	100 %	0 %	0 %	296242413
11036	NC_014160	GA	3	6	638236	638241	50 %	0 %	50 %	0 %	296242413
11037	NC_014160	ACC	2	6	638250	638255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242413
11038	NC_014160	GAA	2	6	638380	638385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242413
11039	NC_014160	GA	5	10	638513	638522	50 %	0 %	50 %	0 %	296242413
11040	NC_014160	TTCTCA	2	12	638552	638563	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296242413
11041	NC_014160	ACA	2	6	638564	638569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242413
11042	NC_014160	CAA	2	6	638746	638751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242413
11043	NC_014160	AGT	2	6	638920	638925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242413
11044	NC_014160	CAA	2	6	639031	639036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242413
11045	NC_014160	ATT	3	9	639041	639049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242413
11046	NC_014160	CCAA	2	8	639065	639072	50 %	0 %	0 %	50 %	296242413
11047	NC_014160	GA	3	6	639358	639363	50 %	0 %	50 %	0 %	296242414
11048	NC_014160	CGG	2	6	639371	639376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242414
11049	NC_014160	CTT	2	6	639411	639416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242414
11050	NC_014160	TTGC	2	8	639500	639507	0 %	50 %	25 %	25 %	296242414
11051	NC_014160	TGA	2	6	639533	639538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242414
11052	NC_014160	AAG	2	6	639561	639566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242414
11053	NC_014160	TTC	2	6	639568	639573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242414
11054	NC_014160	GAAGTA	2	12	639598	639609	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296242414
11055	NC_014160	GGA	2	6	639663	639668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242414
11056	NC_014160	ACT	2	6	639852	639857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242414
11057	NC_014160	GA	3	6	639884	639889	50 %	0 %	50 %	0 %	296242414
11058	NC_014160	GGTG	2	8	639907	639914	0 %	25 %	75 %	0 %	296242414
11059	NC_014160	AT	3	6	639979	639984	50 %	50 %	0 %	0 %	296242414
11060	NC_014160	TC	3	6	640037	640042	0 %	50 %	0 %	50 %	296242414
11061	NC_014160	GAG	2	6	640129	640134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242414
11062	NC_014160	GGAA	2	8	640187	640194	50 %	0 %	50 %	0 %	296242415
11063	NC_014160	GCT	2	6	640239	640244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242415
11064	NC_014160	TGG	2	6	640274	640279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242415
11065	NC_014160	TCT	2	6	640293	640298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242415
11066	NC_014160	CTG	2	6	640450	640455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242415
11067	NC_014160	TCA	2	6	640462	640467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242415
11068	NC_014160	CAA	2	6	640531	640536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242415
11069	NC_014160	CTT	2	6	640634	640639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242415
11070	NC_014160	CGT	2	6	640685	640690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242415
11071	NC_014160	GCAA	2	8	640764	640771	50 %	0 %	25 %	25 %	296242415
11072	NC_014160	TGT	2	6	640778	640783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242415
11073	NC_014160	AGC	2	6	640814	640819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242415
11074	NC_014160	AAGGGT	2	12	640829	640840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296242415
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11076	NC_014160	CAA	2	6	640873	640878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242415
11077	NC_014160	ACC	2	6	640951	640956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242415
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11079	NC_014160	AT	3	6	641003	641008	50 %	50 %	0 %	0 %	296242415
11080	NC_014160	ATA	2	6	641016	641021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242415
11081	NC_014160	GGTTG	2	10	641074	641083	0 %	40 %	60 %	0 %	296242415
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11084	NC_014160	GAA	2	6	641177	641182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242416
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11087	NC_014160	AC	3	6	641328	641333	50 %	0 %	0 %	50 %	296242416
11088	NC_014160	GAAG	2	8	641363	641370	50 %	0 %	50 %	0 %	296242416
11089	NC_014160	CTC	2	6	641380	641385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242416
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11092	NC_014160	GTT	2	6	641468	641473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242416
11093	NC_014160	A	6	6	641475	641480	100 %	0 %	0 %	0 %	296242416
11094	NC_014160	CGAA	2	8	641519	641526	50 %	0 %	25 %	25 %	296242417
11095	NC_014160	AAT	2	6	641541	641546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242417
11096	NC_014160	GATT	2	8	641603	641610	25 %	50 %	25 %	0 %	296242417
11097	NC_014160	TGA	2	6	641628	641633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242417
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11099	NC_014160	AAG	2	6	641720	641725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242417
11100	NC_014160	AGTAT	2	10	641749	641758	40 %	40 %	20 %	0 %	296242417
11101	NC_014160	AAGGG	2	10	641794	641803	40 %	0 %	60 %	0 %	296242417
11102	NC_014160	AAAG	2	8	641812	641819	75 %	0 %	25 %	0 %	296242417
11103	NC_014160	ACT	2	6	641964	641969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
11104	NC_014160	ACT	2	6	641985	641990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
11105	NC_014160	GAA	2	6	642003	642008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
11106	NC_014160	TGA	2	6	642033	642038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242418
11107	NC_014160	AGA	2	6	642150	642155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
11108	NC_014160	ACT	2	6	642156	642161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
11109	NC_014160	AGGC	2	8	642163	642170	25 %	0 %	50 %	25 %	296242418
11110	NC_014160	AG	4	8	642230	642237	50 %	0 %	50 %	0 %	296242418
11111	NC_014160	CGA	2	6	642291	642296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242418
11112	NC_014160	ACA	2	6	642366	642371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242418
11113	NC_014160	TAC	2	6	642505	642510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
11114	NC_014160	CCT	2	6	642543	642548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242418
11115	NC_014160	ACC	2	6	642597	642602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242418
11116	NC_014160	CTACA	2	10	642727	642736	40 %	20 %	0 %	40 %	296242418
11117	NC_014160	AGGA	2	8	642796	642803	50 %	0 %	50 %	0 %	296242418
11118	NC_014160	GGA	2	6	642909	642914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242418
11119	NC_014160	GAA	2	6	642931	642936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
11120	NC_014160	GCG	2	6	643003	643008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242418
11121	NC_014160	AAG	2	6	643009	643014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
11122	NC_014160	ACT	2	6	643078	643083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
11123	NC_014160	ATC	2	6	643208	643213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242418
11124	NC_014160	AAG	2	6	643217	643222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
11125	NC_014160	AAG	2	6	643306	643311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242418
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11231	NC_014160	CTG	2	6	649000	649005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242424
11232	NC_014160	GATTG	2	10	649104	649113	20 %	40 %	40 %	0 %	296242424
11233	NC_014160	GTC	2	6	649134	649139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242424
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11235	NC_014160	ATG	2	6	649324	649329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242424
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11237	NC_014160	CTT	2	6	649569	649574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242424
11238	NC_014160	GAG	2	6	649647	649652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242424
11239	NC_014160	TCG	2	6	649813	649818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242424
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11241	NC_014160	TGCT	2	8	649950	649957	0 %	50 %	25 %	25 %	296242425
11242	NC_014160	TTC	2	6	649970	649975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242425
11243	NC_014160	GTC	2	6	650038	650043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242425
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11245	NC_014160	CTT	2	6	650190	650195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242425
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11249	NC_014160	CTT	2	6	650608	650613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242425
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11273	NC_014160	GTT	2	6	651810	651815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242429
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11355	NC_014160	AAAT	2	8	655890	655897	75 %	25 %	0 %	0 %	296242432
11356	NC_014160	TCA	2	6	655905	655910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242432
11357	NC_014160	GCT	2	6	655918	655923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242432
11358	NC_014160	AT	3	6	656021	656026	50 %	50 %	0 %	0 %	296242432
11359	NC_014160	TTG	2	6	656137	656142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242432
11360	NC_014160	GA	3	6	656145	656150	50 %	0 %	50 %	0 %	296242432
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11362	NC_014160	GTA	2	6	656194	656199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242432
11363	NC_014160	T	6	6	656236	656241	0 %	100 %	0 %	0 %	296242432
11364	NC_014160	T	6	6	656258	656263	0 %	100 %	0 %	0 %	296242432
11365	NC_014160	TAAAA	2	10	656273	656282	80 %	20 %	0 %	0 %	296242432
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11367	NC_014160	TTA	2	6	656336	656341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242433
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11483	NC_014160	CG	3	6	663025	663030	0 %	0 %	50 %	50 %	296242439
11484	NC_014160	ATAGT	2	10	663143	663152	40 %	40 %	20 %	0 %	296242439
11485	NC_014160	TAA	3	9	663187	663195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242439
11486	NC_014160	GA	3	6	663219	663224	50 %	0 %	50 %	0 %	296242439
11487	NC_014160	ACA	2	6	663315	663320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242439
11488	NC_014160	TTA	2	6	663397	663402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242439
11489	NC_014160	GA	3	6	663430	663435	50 %	0 %	50 %	0 %	296242439
11490	NC_014160	TCA	2	6	663463	663468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242439
11491	NC_014160	CAGTAT	2	12	663521	663532	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296242439
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