MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014160	TTG	2	6	32637	32642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241783
502	NC_014160	GGA	2	6	32651	32656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241783
503	NC_014160	AT	3	6	32745	32750	50 %	50 %	0 %	0 %	296241783
504	NC_014160	AAG	2	6	32777	32782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241783
505	NC_014160	GTG	2	6	32811	32816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241784
506	NC_014160	GGA	3	9	32837	32845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241784
507	NC_014160	CAAG	2	8	32876	32883	50 %	0 %	25 %	25 %	296241784
508	NC_014160	TGT	2	6	32912	32917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241784
509	NC_014160	GAA	2	6	32930	32935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241784
510	NC_014160	TAA	2	6	32957	32962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241784
511	NC_014160	TGA	2	6	33020	33025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241784
512	NC_014160	GT	3	6	33238	33243	0 %	50 %	50 %	0 %	296241784
513	NC_014160	TCTAC	2	10	33251	33260	20 %	40 %	0 %	40 %	296241784
514	NC_014160	AGG	2	6	33309	33314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241784
515	NC_014160	TTGC	2	8	33348	33355	0 %	50 %	25 %	25 %	296241785
516	NC_014160	TTC	2	6	33373	33378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241785
517	NC_014160	ATT	2	6	33409	33414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241785
518	NC_014160	AGGG	2	8	33466	33473	25 %	0 %	75 %	0 %	296241785
519	NC_014160	AAG	2	6	33514	33519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241785
520	NC_014160	AGCA	2	8	33604	33611	50 %	0 %	25 %	25 %	296241785
521	NC_014160	GTT	2	6	33648	33653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241785
522	NC_014160	CTC	2	6	33681	33686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241785
523	NC_014160	ACC	2	6	33811	33816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241785
524	NC_014160	TGA	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241785
525	NC_014160	GAG	2	6	33892	33897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241785
526	NC_014160	TTA	2	6	33947	33952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241785
527	NC_014160	ATC	2	6	34026	34031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241786
528	NC_014160	TGA	2	6	34077	34082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241786
529	NC_014160	AGG	2	6	34083	34088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241786
530	NC_014160	AGT	2	6	34105	34110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241786
531	NC_014160	CAT	2	6	34116	34121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241786
532	NC_014160	AG	3	6	34142	34147	50 %	0 %	50 %	0 %	296241786
533	NC_014160	TAA	2	6	34161	34166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241786
534	NC_014160	AAG	2	6	34173	34178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241786
535	NC_014160	GTGG	2	8	34211	34218	0 %	25 %	75 %	0 %	296241786
536	NC_014160	GGA	2	6	34427	34432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241787
537	NC_014160	TTG	2	6	34515	34520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241787
538	NC_014160	AGC	2	6	34522	34527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241787
539	NC_014160	TAA	2	6	34555	34560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241787
540	NC_014160	GT	3	6	34614	34619	0 %	50 %	50 %	0 %	296241787
541	NC_014160	GGA	2	6	34677	34682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241788
542	NC_014160	ATA	2	6	34708	34713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241788
543	NC_014160	GTC	2	6	34784	34789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241788
544	NC_014160	TAC	2	6	34902	34907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241788
545	NC_014160	GAT	2	6	34910	34915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241788
546	NC_014160	GCT	2	6	34926	34931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241788
547	NC_014160	GCC	2	6	34937	34942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241788
548	NC_014160	AGT	2	6	34993	34998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241788
549	NC_014160	GAT	2	6	35101	35106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241789
550	NC_014160	TGA	2	6	35125	35130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241789
551	NC_014160	CGA	2	6	35146	35151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241789
552	NC_014160	TAG	2	6	35196	35201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241789
553	NC_014160	GGA	2	6	35272	35277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241789
554	NC_014160	TCCC	2	8	35406	35413	0 %	25 %	0 %	75 %	296241789
555	NC_014160	GAG	3	9	35537	35545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241789
556	NC_014160	AAT	2	6	35548	35553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241789
557	NC_014160	GCG	2	6	35607	35612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241789
558	NC_014160	CGG	2	6	35682	35687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241789
559	NC_014160	ACT	2	6	35833	35838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241790
560	NC_014160	CCT	2	6	35859	35864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241790
561	NC_014160	TAT	2	6	35994	35999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241790
562	NC_014160	GGAT	2	8	36048	36055	25 %	25 %	50 %	0 %	296241790
563	NC_014160	GGT	2	6	36174	36179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241790
564	NC_014160	TGAC	2	8	36262	36269	25 %	25 %	25 %	25 %	296241790
565	NC_014160	TTC	2	6	36294	36299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241790
566	NC_014160	TGCT	2	8	36343	36350	0 %	50 %	25 %	25 %	296241790
567	NC_014160	GAG	2	6	36360	36365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241790
568	NC_014160	AG	4	8	36439	36446	50 %	0 %	50 %	0 %	296241790
569	NC_014160	GAG	2	6	36482	36487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241790
570	NC_014160	AAGG	2	8	36524	36531	50 %	0 %	50 %	0 %	296241790
571	NC_014160	GTT	2	6	36575	36580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241790
572	NC_014160	TCG	2	6	36652	36657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241790
573	NC_014160	AT	3	6	36798	36803	50 %	50 %	0 %	0 %	296241790
574	NC_014160	GATC	2	8	36812	36819	25 %	25 %	25 %	25 %	296241790
575	NC_014160	TGTA	2	8	36862	36869	25 %	50 %	25 %	0 %	296241790
576	NC_014160	AT	3	6	36891	36896	50 %	50 %	0 %	0 %	296241790
577	NC_014160	TCC	2	6	36985	36990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241791
578	NC_014160	ACA	2	6	37053	37058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241791
579	NC_014160	ATT	2	6	37067	37072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241791
580	NC_014160	TTG	2	6	37112	37117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241791
581	NC_014160	GAG	2	6	37154	37159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241791
582	NC_014160	AGA	2	6	37199	37204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241791
583	NC_014160	AGCA	2	8	37218	37225	50 %	0 %	25 %	25 %	296241791
584	NC_014160	AGT	2	6	37238	37243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241791
585	NC_014160	TAG	3	9	37245	37253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241791
586	NC_014160	CTCA	2	8	37331	37338	25 %	25 %	0 %	50 %	296241791
587	NC_014160	AGA	2	6	37407	37412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241791
588	NC_014160	GAA	2	6	37459	37464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241792
589	NC_014160	TC	3	6	37525	37530	0 %	50 %	0 %	50 %	296241792
590	NC_014160	GTA	2	6	37581	37586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241792
591	NC_014160	GAG	2	6	37619	37624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241792
592	NC_014160	ATG	2	6	37685	37690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241792
593	NC_014160	TCA	2	6	37821	37826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241792
594	NC_014160	TGAA	2	8	37920	37927	50 %	25 %	25 %	0 %	296241793
595	NC_014160	TAA	2	6	37957	37962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241793
596	NC_014160	CAG	2	6	38010	38015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241793
597	NC_014160	ATT	2	6	38080	38085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241793
598	NC_014160	TAC	2	6	38130	38135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241793
599	NC_014160	TC	3	6	38267	38272	0 %	50 %	0 %	50 %	296241793
600	NC_014160	CTC	3	9	38270	38278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241793
601	NC_014160	GAG	2	6	38381	38386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241793
602	NC_014160	CT	3	6	38434	38439	0 %	50 %	0 %	50 %	296241793
603	NC_014160	TAT	2	6	38485	38490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241793
604	NC_014160	GGC	2	6	38546	38551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241793
605	NC_014160	TGCT	2	8	38601	38608	0 %	50 %	25 %	25 %	296241793
606	NC_014160	TTC	2	6	38685	38690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241793
607	NC_014160	TTCT	2	8	38697	38704	0 %	75 %	0 %	25 %	296241793
608	NC_014160	CGG	2	6	38899	38904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241793
609	NC_014160	TCC	2	6	38908	38913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241793
610	NC_014160	TCC	2	6	38923	38928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241793
611	NC_014160	TAG	2	6	38980	38985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241793
612	NC_014160	TCA	2	6	39012	39017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241793
613	NC_014160	TTG	2	6	39022	39027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241793
614	NC_014160	AAT	3	9	39065	39073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241793
615	NC_014160	GCC	2	6	39123	39128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241793
616	NC_014160	TCTA	2	8	39160	39167	25 %	50 %	0 %	25 %	296241793
617	NC_014160	GAG	2	6	39239	39244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241793
618	NC_014160	TGG	2	6	39245	39250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241793
619	NC_014160	TAG	2	6	39259	39264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241793
620	NC_014160	ACT	2	6	39277	39282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241793
621	NC_014160	GTG	2	6	39284	39289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241793
622	NC_014160	TGG	2	6	39305	39310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241793
623	NC_014160	GAA	2	6	39416	39421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241793
624	NC_014160	GAC	2	6	39431	39436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241793
625	NC_014160	GTC	2	6	39459	39464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241793
626	NC_014160	CAA	2	6	39503	39508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241793
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628	NC_014160	TAC	2	6	39567	39572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241793
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1000	NC_014160	TCC	2	6	66354	66359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241820

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