MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_014160	ACC	2	6	524235	524240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242288
9002	NC_014160	GAC	2	6	524339	524344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
9003	NC_014160	GGT	2	6	524432	524437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242288
9004	NC_014160	GAG	2	6	524442	524447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
9005	NC_014160	GGCAT	2	10	524692	524701	20 %	20 %	40 %	20 %	296242288
9006	NC_014160	GAT	2	6	524724	524729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242288
9007	NC_014160	GAAG	2	8	524730	524737	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
9008	NC_014160	TGTT	2	8	524770	524777	0 %	75 %	25 %	0 %	296242288
9009	NC_014160	ATT	2	6	524796	524801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242288
9010	NC_014160	AG	4	8	524811	524818	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
9011	NC_014160	AGT	2	6	524835	524840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242288
9012	NC_014160	CTG	2	6	524864	524869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242288
9013	NC_014160	CAG	2	6	524904	524909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
9014	NC_014160	CAA	2	6	524946	524951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242288
9015	NC_014160	A	6	6	524959	524964	100 %	0 %	0 %	0 %	296242288
9016	NC_014160	ACTCC	2	10	525057	525066	20 %	20 %	0 %	60 %	296242288
9017	NC_014160	GTG	2	6	525099	525104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242288
9018	NC_014160	CGG	2	6	525131	525136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242288
9019	NC_014160	CGAG	2	8	525145	525152	25 %	0 %	50 %	25 %	296242288
9020	NC_014160	GATG	2	8	525230	525237	25 %	25 %	50 %	0 %	296242288
9021	NC_014160	GAA	2	6	525284	525289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
9022	NC_014160	GAC	2	6	525300	525305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
9023	NC_014160	ATA	2	6	525306	525311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242288
9024	NC_014160	TTC	2	6	525354	525359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242288
9025	NC_014160	CTC	2	6	525363	525368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242288
9026	NC_014160	GA	3	6	525509	525514	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
9027	NC_014160	TAC	2	6	525542	525547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242288
9028	NC_014160	GGA	2	6	525551	525556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
9029	NC_014160	GAA	2	6	525582	525587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
9030	NC_014160	ACAT	2	8	525636	525643	50 %	25 %	0 %	25 %	296242288
9031	NC_014160	TTG	2	6	525814	525819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242288
9032	NC_014160	TAA	2	6	525847	525852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242288
9033	NC_014160	GA	3	6	525881	525886	50 %	0 %	50 %	0 %	296242288
9034	NC_014160	GGC	2	6	525893	525898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242288
9035	NC_014160	CTA	2	6	525911	525916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242288
9036	NC_014160	TAGA	2	8	525922	525929	50 %	25 %	25 %	0 %	296242288
9037	NC_014160	TCA	2	6	525961	525966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242288
9038	NC_014160	GAA	2	6	526008	526013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
9039	NC_014160	AGG	2	6	526072	526077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
9040	NC_014160	AGC	3	9	526106	526114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242288
9041	NC_014160	GTT	2	6	526203	526208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242288
9042	NC_014160	AAACC	2	10	526255	526264	60 %	0 %	0 %	40 %	296242288
9043	NC_014160	AGG	2	6	526279	526284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242288
9044	NC_014160	GAA	2	6	526548	526553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242288
9045	NC_014160	TGA	2	6	526600	526605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242288
9046	NC_014160	GTC	2	6	526644	526649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242288
9047	NC_014160	ACA	2	6	526807	526812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242288
9048	NC_014160	CGA	2	6	526837	526842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242289
9049	NC_014160	GCA	2	6	526913	526918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242289
9050	NC_014160	GCTA	2	8	526970	526977	25 %	25 %	25 %	25 %	296242289
9051	NC_014160	CCG	2	6	527004	527009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242289
9052	NC_014160	GA	3	6	527033	527038	50 %	0 %	50 %	0 %	296242289
9053	NC_014160	CCT	2	6	527084	527089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242289
9054	NC_014160	AAT	2	6	527137	527142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242289
9055	NC_014160	TCA	2	6	527156	527161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242289
9056	NC_014160	TCA	2	6	527238	527243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242290
9057	NC_014160	ACT	3	9	527282	527290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242290
9058	NC_014160	CT	3	6	527318	527323	0 %	50 %	0 %	50 %	296242290
9059	NC_014160	TC	3	6	527365	527370	0 %	50 %	0 %	50 %	296242290
9060	NC_014160	GT	3	6	527577	527582	0 %	50 %	50 %	0 %	296242290
9061	NC_014160	TTA	2	6	527604	527609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242290
9062	NC_014160	TTC	2	6	527690	527695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242290
9063	NC_014160	TAG	2	6	527954	527959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242291
9064	NC_014160	CTT	2	6	527971	527976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242291
9065	NC_014160	CAG	2	6	528015	528020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242291
9066	NC_014160	CAC	2	6	528138	528143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242291
9067	NC_014160	ATT	2	6	528194	528199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242291
9068	NC_014160	TCG	2	6	528231	528236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242291
9069	NC_014160	CGG	2	6	528307	528312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242291
9070	NC_014160	GTCTT	2	10	528340	528349	0 %	60 %	20 %	20 %	296242291
9071	NC_014160	ATTT	2	8	528411	528418	25 %	75 %	0 %	0 %	296242291
9072	NC_014160	TCA	2	6	528630	528635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242291
9073	NC_014160	TCC	2	6	528650	528655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242291
9074	NC_014160	ACCTT	2	10	528666	528675	20 %	40 %	0 %	40 %	296242291
9075	NC_014160	TGC	2	6	528775	528780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242291
9076	NC_014160	GCT	2	6	528815	528820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242291
9077	NC_014160	T	6	6	528820	528825	0 %	100 %	0 %	0 %	296242291
9078	NC_014160	GAA	2	6	528832	528837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242291
9079	NC_014160	TCTCG	2	10	528895	528904	0 %	40 %	20 %	40 %	296242291
9080	NC_014160	CTAGT	2	10	528942	528951	20 %	40 %	20 %	20 %	296242291
9081	NC_014160	AG	3	6	528960	528965	50 %	0 %	50 %	0 %	296242291
9082	NC_014160	GA	3	6	528982	528987	50 %	0 %	50 %	0 %	296242291
9083	NC_014160	CAC	2	6	528988	528993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242291
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9085	NC_014160	GTT	2	6	529126	529131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242291
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9087	NC_014160	CA	3	6	529303	529308	50 %	0 %	0 %	50 %	296242292
9088	NC_014160	CCCCGG	2	12	529422	529433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242292
9089	NC_014160	TCC	2	6	529472	529477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242292
9090	NC_014160	GCT	2	6	529562	529567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242292
9091	NC_014160	CTT	2	6	529864	529869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242292
9092	NC_014160	CAA	2	6	529942	529947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242292
9093	NC_014160	GTC	2	6	529948	529953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242292
9094	NC_014160	TAT	2	6	529957	529962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242292
9095	NC_014160	GCC	2	6	530050	530055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242292
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9097	NC_014160	CATG	2	8	530273	530280	25 %	25 %	25 %	25 %	296242293
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9102	NC_014160	AGC	2	6	530403	530408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242293
9103	NC_014160	GTA	2	6	530445	530450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242293
9104	NC_014160	GCT	2	6	530482	530487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242293
9105	NC_014160	CAT	2	6	530513	530518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242293
9106	NC_014160	TC	3	6	530577	530582	0 %	50 %	0 %	50 %	296242293
9107	NC_014160	CTT	2	6	530588	530593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242293
9108	NC_014160	GGC	2	6	530652	530657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242293
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9110	NC_014160	CCAG	2	8	530780	530787	25 %	0 %	25 %	50 %	296242293
9111	NC_014160	CTG	2	6	530813	530818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242293
9112	NC_014160	TTC	2	6	530854	530859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242293
9113	NC_014160	C	6	6	530864	530869	0 %	0 %	0 %	100 %	296242293
9114	NC_014160	GGA	2	6	530954	530959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242293
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9117	NC_014160	CTG	2	6	531116	531121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242294
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9119	NC_014160	T	6	6	531278	531283	0 %	100 %	0 %	0 %	296242294
9120	NC_014160	ATT	2	6	531316	531321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242294
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9122	NC_014160	ATT	2	6	531367	531372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242294
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9491	NC_014160	ATTA	2	8	551324	551331	50 %	50 %	0 %	0 %	296242317
9492	NC_014160	TA	3	6	551423	551428	50 %	50 %	0 %	0 %	296242317
9493	NC_014160	CACC	2	8	551557	551564	25 %	0 %	0 %	75 %	296242317
9494	NC_014160	GTT	2	6	551604	551609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242317
9495	NC_014160	AGTG	2	8	551615	551622	25 %	25 %	50 %	0 %	296242317
9496	NC_014160	AGGA	2	8	551688	551695	50 %	0 %	50 %	0 %	296242317
9497	NC_014160	ATT	2	6	551718	551723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242317
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9499	NC_014160	CAG	2	6	551770	551775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242317
9500	NC_014160	CAG	2	6	551833	551838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242317

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