MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014160	TAC	2	6	499448	499453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242269
8502	NC_014160	TCC	2	6	499461	499466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242269
8503	NC_014160	GAT	2	6	499475	499480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242269
8504	NC_014160	CAA	2	6	499566	499571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242269
8505	NC_014160	ACC	2	6	499580	499585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242269
8506	NC_014160	ACA	3	9	499598	499606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242269
8507	NC_014160	ACA	2	6	499631	499636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242269
8508	NC_014160	TAC	3	9	499675	499683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242269
8509	NC_014160	AGT	2	6	499688	499693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242269
8510	NC_014160	ACT	2	6	499718	499723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242269
8511	NC_014160	AAC	2	6	499729	499734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242269
8512	NC_014160	ACA	2	6	499778	499783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242269
8513	NC_014160	ATTC	2	8	499805	499812	25 %	50 %	0 %	25 %	296242269
8514	NC_014160	TTACT	2	10	499857	499866	20 %	60 %	0 %	20 %	296242269
8515	NC_014160	A	6	6	499898	499903	100 %	0 %	0 %	0 %	296242269
8516	NC_014160	T	6	6	499915	499920	0 %	100 %	0 %	0 %	296242270
8517	NC_014160	TTA	2	6	500019	500024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242270
8518	NC_014160	CT	3	6	500095	500100	0 %	50 %	0 %	50 %	296242270
8519	NC_014160	TCT	2	6	500166	500171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242270
8520	NC_014160	GAA	2	6	500173	500178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242270
8521	NC_014160	TTG	2	6	500181	500186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242270
8522	NC_014160	CTG	2	6	500241	500246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242270
8523	NC_014160	CCA	2	6	500258	500263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242270
8524	NC_014160	ATT	2	6	500309	500314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242270
8525	NC_014160	TAA	2	6	500355	500360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242270
8526	NC_014160	TC	3	6	500469	500474	0 %	50 %	0 %	50 %	296242270
8527	NC_014160	ATT	2	6	500557	500562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242270
8528	NC_014160	CCA	2	6	500564	500569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242270
8529	NC_014160	GAT	2	6	500578	500583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242270
8530	NC_014160	TC	4	8	500591	500598	0 %	50 %	0 %	50 %	296242270
8531	NC_014160	AGT	2	6	500658	500663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242270
8532	NC_014160	CTC	2	6	500671	500676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242270
8533	NC_014160	TC	4	8	500675	500682	0 %	50 %	0 %	50 %	296242270
8534	NC_014160	CTC	3	9	500798	500806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242270
8535	NC_014160	CT	3	6	500821	500826	0 %	50 %	0 %	50 %	296242270
8536	NC_014160	CGG	2	6	500934	500939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242270
8537	NC_014160	ACA	2	6	500952	500957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242270
8538	NC_014160	AGGTC	2	10	500976	500985	20 %	20 %	40 %	20 %	296242270
8539	NC_014160	GA	3	6	500993	500998	50 %	0 %	50 %	0 %	296242270
8540	NC_014160	TCC	2	6	501032	501037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242270
8541	NC_014160	ATT	2	6	501163	501168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242270
8542	NC_014160	TC	3	6	501197	501202	0 %	50 %	0 %	50 %	296242270
8543	NC_014160	TCT	2	6	501358	501363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242271
8544	NC_014160	TC	3	6	501384	501389	0 %	50 %	0 %	50 %	296242271
8545	NC_014160	CCA	2	6	501398	501403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242271
8546	NC_014160	AAT	2	6	501546	501551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242271
8547	NC_014160	TC	4	8	501580	501587	0 %	50 %	0 %	50 %	296242271
8548	NC_014160	ATGCT	2	10	501710	501719	20 %	40 %	20 %	20 %	296242271
8549	NC_014160	CTC	2	6	501757	501762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242271
8550	NC_014160	ATT	2	6	501781	501786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242271
8551	NC_014160	CTG	2	6	501928	501933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242271
8552	NC_014160	CTC	2	6	501935	501940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242271
8553	NC_014160	TC	3	6	501960	501965	0 %	50 %	0 %	50 %	296242271
8554	NC_014160	TC	3	6	501980	501985	0 %	50 %	0 %	50 %	296242271
8555	NC_014160	GTTT	2	8	502088	502095	0 %	75 %	25 %	0 %	296242271
8556	NC_014160	CTC	2	6	502101	502106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242271
8557	NC_014160	GAT	2	6	502136	502141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242271
8558	NC_014160	TTA	2	6	502157	502162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242271
8559	NC_014160	CCG	2	6	502304	502309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242271
8560	NC_014160	CAA	2	6	502361	502366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242271
8561	NC_014160	CTC	2	6	502382	502387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242271
8562	NC_014160	ACT	2	6	502423	502428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242271
8563	NC_014160	CGA	2	6	502448	502453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242271
8564	NC_014160	CTG	2	6	502474	502479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242271
8565	NC_014160	T	6	6	502533	502538	0 %	100 %	0 %	0 %	296242271
8566	NC_014160	GTCA	2	8	502560	502567	25 %	25 %	25 %	25 %	296242271
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8569	NC_014160	TCC	2	6	502738	502743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242271
8570	NC_014160	CTT	2	6	502749	502754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242271
8571	NC_014160	CA	3	6	502762	502767	50 %	0 %	0 %	50 %	296242271
8572	NC_014160	CTTG	2	8	502777	502784	0 %	50 %	25 %	25 %	296242271
8573	NC_014160	GCA	2	6	502951	502956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242271
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8575	NC_014160	TCT	2	6	503051	503056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242271
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8579	NC_014160	TCT	2	6	503237	503242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242271
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8585	NC_014160	TAAG	2	8	503376	503383	50 %	25 %	25 %	0 %	296242271
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8593	NC_014160	CGG	2	6	503708	503713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242271
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8596	NC_014160	GAAC	2	8	503789	503796	50 %	0 %	25 %	25 %	296242271
8597	NC_014160	CT	4	8	503943	503950	0 %	50 %	0 %	50 %	296242272
8598	NC_014160	GTA	3	9	503960	503968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242272
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8600	NC_014160	TCC	2	6	504009	504014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242272
8601	NC_014160	T	6	6	504106	504111	0 %	100 %	0 %	0 %	296242272
8602	NC_014160	TA	3	6	504160	504165	50 %	50 %	0 %	0 %	296242272
8603	NC_014160	TTC	2	6	504422	504427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242272
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8606	NC_014160	TCT	2	6	504617	504622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242272
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8609	NC_014160	TCT	2	6	504757	504762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242272
8610	NC_014160	ACACT	2	10	504777	504786	40 %	20 %	0 %	40 %	296242272
8611	NC_014160	CT	4	8	504785	504792	0 %	50 %	0 %	50 %	296242272
8612	NC_014160	CTT	2	6	504904	504909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242272
8613	NC_014160	CGT	2	6	504937	504942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242272
8614	NC_014160	CCCTT	2	10	504944	504953	0 %	40 %	0 %	60 %	296242272
8615	NC_014160	CCA	2	6	504981	504986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242272
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8620	NC_014160	A	6	6	505206	505211	100 %	0 %	0 %	0 %	296242272
8621	NC_014160	AGC	2	6	505250	505255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242272
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8992	NC_014160	AT	3	6	523746	523751	50 %	50 %	0 %	0 %	296242288
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