MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014160	CAT	2	6	327575	327580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242097
5502	NC_014160	CCA	2	6	327604	327609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242097
5503	NC_014160	CTT	2	6	327623	327628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242097
5504	NC_014160	GAA	2	6	327703	327708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242097
5505	NC_014160	GAC	2	6	327808	327813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242097
5506	NC_014160	ATT	2	6	327894	327899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242097
5507	NC_014160	TCC	2	6	327975	327980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242097
5508	NC_014160	CT	3	6	328028	328033	0 %	50 %	0 %	50 %	296242097
5509	NC_014160	CT	3	6	328046	328051	0 %	50 %	0 %	50 %	296242097
5510	NC_014160	T	6	6	328072	328077	0 %	100 %	0 %	0 %	296242097
5511	NC_014160	AAT	2	6	328098	328103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242097
5512	NC_014160	AGT	2	6	328107	328112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242097
5513	NC_014160	TTC	2	6	328121	328126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242097
5514	NC_014160	CAT	2	6	328139	328144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242097
5515	NC_014160	TAA	2	6	328178	328183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242098
5516	NC_014160	CT	3	6	328248	328253	0 %	50 %	0 %	50 %	296242098
5517	NC_014160	AAAT	2	8	328302	328309	75 %	25 %	0 %	0 %	296242098
5518	NC_014160	GT	3	6	328354	328359	0 %	50 %	50 %	0 %	296242098
5519	NC_014160	GTA	2	6	328487	328492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242098
5520	NC_014160	ATG	2	6	328605	328610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242098
5521	NC_014160	TCA	2	6	328641	328646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242098
5522	NC_014160	GCA	2	6	328751	328756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242098
5523	NC_014160	C	6	6	328788	328793	0 %	0 %	0 %	100 %	296242098
5524	NC_014160	GTA	2	6	328830	328835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242099
5525	NC_014160	TC	3	6	328845	328850	0 %	50 %	0 %	50 %	296242099
5526	NC_014160	ATT	2	6	328864	328869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242099
5527	NC_014160	TGG	2	6	328908	328913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242099
5528	NC_014160	TTC	2	6	328924	328929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242099
5529	NC_014160	AGG	2	6	328998	329003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242099
5530	NC_014160	TAT	2	6	329004	329009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242099
5531	NC_014160	CAT	2	6	329012	329017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242099
5532	NC_014160	AAT	2	6	329043	329048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242099
5533	NC_014160	GT	3	6	329067	329072	0 %	50 %	50 %	0 %	296242099
5534	NC_014160	CTG	2	6	329105	329110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242099
5535	NC_014160	TTG	2	6	329126	329131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242099
5536	NC_014160	GTTACT	2	12	329137	329148	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296242099
5537	NC_014160	ATC	2	6	329341	329346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242099
5538	NC_014160	CAG	2	6	329610	329615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242100
5539	NC_014160	GTT	2	6	329637	329642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242100
5540	NC_014160	AGA	2	6	329740	329745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242100
5541	NC_014160	GTG	2	6	329776	329781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242100
5542	NC_014160	ATT	2	6	329785	329790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242100
5543	NC_014160	TTG	2	6	329809	329814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242100
5544	NC_014160	TTA	2	6	329859	329864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242100
5545	NC_014160	TCC	2	6	329913	329918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242100
5546	NC_014160	CTA	2	6	329962	329967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242100
5547	NC_014160	ATG	2	6	329998	330003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242100
5548	NC_014160	TTA	2	6	330009	330014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242100
5549	NC_014160	CTT	2	6	330019	330024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242101
5550	NC_014160	AAT	2	6	330054	330059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242101
5551	NC_014160	TCA	2	6	330163	330168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242101
5552	NC_014160	CTT	2	6	330246	330251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242101
5553	NC_014160	GAT	2	6	330252	330257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242101
5554	NC_014160	GTA	2	6	330336	330341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242101
5555	NC_014160	CTT	2	6	330719	330724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242102
5556	NC_014160	TAC	3	9	330757	330765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242102
5557	NC_014160	ATC	2	6	330884	330889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242103
5558	NC_014160	TCC	2	6	330992	330997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242103
5559	NC_014160	GGA	2	6	331032	331037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242103
5560	NC_014160	TCA	2	6	331139	331144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242104
5561	NC_014160	TC	3	6	331148	331153	0 %	50 %	0 %	50 %	296242104
5562	NC_014160	GACT	2	8	331168	331175	25 %	25 %	25 %	25 %	296242104
5563	NC_014160	ACA	2	6	331202	331207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242104
5564	NC_014160	AT	3	6	331241	331246	50 %	50 %	0 %	0 %	296242104
5565	NC_014160	AAT	2	6	331255	331260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242104
5566	NC_014160	TC	3	6	331313	331318	0 %	50 %	0 %	50 %	296242104
5567	NC_014160	T	6	6	331354	331359	0 %	100 %	0 %	0 %	296242104
5568	NC_014160	CTC	2	6	331440	331445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242104
5569	NC_014160	ACT	2	6	331463	331468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242104
5570	NC_014160	AT	3	6	331474	331479	50 %	50 %	0 %	0 %	296242104
5571	NC_014160	CTG	2	6	331504	331509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242104
5572	NC_014160	ATT	2	6	331517	331522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242104
5573	NC_014160	CAA	2	6	331525	331530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242104
5574	NC_014160	GT	3	6	331540	331545	0 %	50 %	50 %	0 %	296242104
5575	NC_014160	ATT	2	6	331613	331618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242104
5576	NC_014160	TCA	2	6	331640	331645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242104
5577	NC_014160	CAT	2	6	331666	331671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242104
5578	NC_014160	GAT	2	6	331777	331782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242104
5579	NC_014160	GTA	2	6	331822	331827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242104
5580	NC_014160	C	6	6	331875	331880	0 %	0 %	0 %	100 %	296242104
5581	NC_014160	TC	3	6	331948	331953	0 %	50 %	0 %	50 %	296242104
5582	NC_014160	TGA	2	6	331955	331960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242104
5583	NC_014160	CTCG	2	8	331972	331979	0 %	25 %	25 %	50 %	296242104
5584	NC_014160	TAG	2	6	331988	331993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242104
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5586	NC_014160	T	7	7	332138	332144	0 %	100 %	0 %	0 %	296242104
5587	NC_014160	AAT	2	6	332153	332158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242104
5588	NC_014160	TTG	2	6	332207	332212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242104
5589	NC_014160	CTT	2	6	332352	332357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242104
5590	NC_014160	AG	3	6	332364	332369	50 %	0 %	50 %	0 %	296242104
5591	NC_014160	TTC	2	6	332533	332538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242104
5592	NC_014160	TTG	2	6	332546	332551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242104
5593	NC_014160	TA	3	6	332565	332570	50 %	50 %	0 %	0 %	296242104
5594	NC_014160	TGCT	2	8	332612	332619	0 %	50 %	25 %	25 %	296242104
5595	NC_014160	GT	3	6	332623	332628	0 %	50 %	50 %	0 %	296242104
5596	NC_014160	TTTG	2	8	332822	332829	0 %	75 %	25 %	0 %	296242105
5597	NC_014160	TTC	2	6	332851	332856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242105
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5599	NC_014160	GTA	2	6	333084	333089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242106
5600	NC_014160	TTAT	2	8	333155	333162	25 %	75 %	0 %	0 %	296242106
5601	NC_014160	TAC	2	6	333178	333183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242106
5602	NC_014160	GAA	2	6	333241	333246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242106
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5604	NC_014160	GAA	2	6	333412	333417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242106
5605	NC_014160	ATT	3	9	333425	333433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242106
5606	NC_014160	CTT	2	6	333532	333537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242106
5607	NC_014160	ATC	2	6	333584	333589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242106
5608	NC_014160	AAAT	2	8	333592	333599	75 %	25 %	0 %	0 %	296242106
5609	NC_014160	CCAG	2	8	333957	333964	25 %	0 %	25 %	50 %	296242107
5610	NC_014160	AGAA	2	8	334048	334055	75 %	0 %	25 %	0 %	296242107
5611	NC_014160	GGGGC	2	10	334119	334128	0 %	0 %	80 %	20 %	296242107
5612	NC_014160	ATC	2	6	334135	334140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242107
5613	NC_014160	TG	3	6	334149	334154	0 %	50 %	50 %	0 %	296242107
5614	NC_014160	TC	3	6	334166	334171	0 %	50 %	0 %	50 %	296242107
5615	NC_014160	ATA	2	6	334249	334254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242107
5616	NC_014160	GTA	2	6	334366	334371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242107
5617	NC_014160	CAT	2	6	334428	334433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242107
5618	NC_014160	TTC	2	6	334491	334496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242107
5619	NC_014160	TCA	2	6	334542	334547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242107
5620	NC_014160	GGT	2	6	334549	334554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242107
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5622	NC_014160	TC	3	6	334649	334654	0 %	50 %	0 %	50 %	296242107
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