MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014160	TAT	2	6	266609	266614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242037
4502	NC_014160	CTT	2	6	266653	266658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242037
4503	NC_014160	TGC	2	6	266670	266675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242037
4504	NC_014160	ATT	2	6	266763	266768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242037
4505	NC_014160	CTT	2	6	266868	266873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242037
4506	NC_014160	CAGC	2	8	266886	266893	25 %	0 %	25 %	50 %	296242037
4507	NC_014160	ATA	2	6	266911	266916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242037
4508	NC_014160	TATG	2	8	266924	266931	25 %	50 %	25 %	0 %	296242037
4509	NC_014160	ATT	2	6	266985	266990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242037
4510	NC_014160	GTC	2	6	267019	267024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242037
4511	NC_014160	TCT	2	6	267052	267057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242037
4512	NC_014160	GAAAA	2	10	267072	267081	80 %	0 %	20 %	0 %	296242037
4513	NC_014160	CAA	2	6	267148	267153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242038
4514	NC_014160	TAA	2	6	267167	267172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242038
4515	NC_014160	AGAC	2	8	267177	267184	50 %	0 %	25 %	25 %	296242038
4516	NC_014160	TA	3	6	267280	267285	50 %	50 %	0 %	0 %	296242038
4517	NC_014160	TTC	2	6	267297	267302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242038
4518	NC_014160	TC	3	6	267429	267434	0 %	50 %	0 %	50 %	296242038
4519	NC_014160	ACA	2	6	267436	267441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242038
4520	NC_014160	TTC	2	6	267455	267460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242038
4521	NC_014160	GCTT	2	8	267502	267509	0 %	50 %	25 %	25 %	296242038
4522	NC_014160	TAA	2	6	267534	267539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242038
4523	NC_014160	TG	3	6	267605	267610	0 %	50 %	50 %	0 %	296242038
4524	NC_014160	ATA	2	6	267652	267657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242038
4525	NC_014160	GGGT	2	8	267742	267749	0 %	25 %	75 %	0 %	296242038
4526	NC_014160	AG	3	6	267796	267801	50 %	0 %	50 %	0 %	296242038
4527	NC_014160	TCC	2	6	267970	267975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242038
4528	NC_014160	TCT	2	6	268019	268024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242038
4529	NC_014160	CTA	2	6	268046	268051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242038
4530	NC_014160	GAC	2	6	268069	268074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242038
4531	NC_014160	TTC	2	6	268296	268301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242038
4532	NC_014160	AT	3	6	268380	268385	50 %	50 %	0 %	0 %	296242038
4533	NC_014160	TC	3	6	268542	268547	0 %	50 %	0 %	50 %	296242038
4534	NC_014160	CTT	2	6	268596	268601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242038
4535	NC_014160	AT	3	6	268655	268660	50 %	50 %	0 %	0 %	296242038
4536	NC_014160	CTT	2	6	268740	268745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242038
4537	NC_014160	T	6	6	268764	268769	0 %	100 %	0 %	0 %	296242038
4538	NC_014160	TAA	2	6	268773	268778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242038
4539	NC_014160	ATA	2	6	268859	268864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242039
4540	NC_014160	ATT	2	6	268873	268878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242039
4541	NC_014160	AAT	2	6	268879	268884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242039
4542	NC_014160	CCTG	2	8	268920	268927	0 %	25 %	25 %	50 %	296242039
4543	NC_014160	GGA	2	6	269019	269024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242039
4544	NC_014160	ACT	2	6	269125	269130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242039
4545	NC_014160	TGA	2	6	269231	269236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242039
4546	NC_014160	GA	3	6	269291	269296	50 %	0 %	50 %	0 %	296242039
4547	NC_014160	TGGTA	2	10	269316	269325	20 %	40 %	40 %	0 %	296242039
4548	NC_014160	CCCA	2	8	269367	269374	25 %	0 %	0 %	75 %	296242039
4549	NC_014160	CGT	2	6	269382	269387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242039
4550	NC_014160	CCG	2	6	269444	269449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242039
4551	NC_014160	AGC	2	6	269497	269502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242039
4552	NC_014160	TTG	2	6	269505	269510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242039
4553	NC_014160	AG	3	6	269520	269525	50 %	0 %	50 %	0 %	296242039
4554	NC_014160	CCA	2	6	269574	269579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242039
4555	NC_014160	TTC	2	6	269687	269692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242039
4556	NC_014160	GC	3	6	269751	269756	0 %	0 %	50 %	50 %	296242039
4557	NC_014160	TCC	2	6	269834	269839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242039
4558	NC_014160	CA	3	6	269867	269872	50 %	0 %	0 %	50 %	296242039
4559	NC_014160	ATTG	2	8	269903	269910	25 %	50 %	25 %	0 %	296242039
4560	NC_014160	TGA	2	6	269925	269930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242039
4561	NC_014160	TCA	2	6	269940	269945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242039
4562	NC_014160	CTTA	2	8	269968	269975	25 %	50 %	0 %	25 %	296242039
4563	NC_014160	CAA	2	6	270162	270167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242039
4564	NC_014160	AAT	2	6	270199	270204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242039
4565	NC_014160	T	6	6	270235	270240	0 %	100 %	0 %	0 %	296242039
4566	NC_014160	TTG	2	6	270306	270311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242039
4567	NC_014160	TC	4	8	270333	270340	0 %	50 %	0 %	50 %	296242039
4568	NC_014160	GAG	2	6	270406	270411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242039
4569	NC_014160	TC	3	6	270413	270418	0 %	50 %	0 %	50 %	296242039
4570	NC_014160	TC	3	6	270438	270443	0 %	50 %	0 %	50 %	296242039
4571	NC_014160	GAA	2	6	270587	270592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242040
4572	NC_014160	CGG	2	6	270600	270605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242040
4573	NC_014160	CTG	2	6	270631	270636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242040
4574	NC_014160	T	6	6	270677	270682	0 %	100 %	0 %	0 %	296242040
4575	NC_014160	CT	3	6	270769	270774	0 %	50 %	0 %	50 %	296242040
4576	NC_014160	AG	3	6	270777	270782	50 %	0 %	50 %	0 %	296242040
4577	NC_014160	AGG	2	6	270892	270897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242040
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4580	NC_014160	AG	3	6	271029	271034	50 %	0 %	50 %	0 %	296242040
4581	NC_014160	CAT	2	6	271083	271088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242040
4582	NC_014160	AG	3	6	271144	271149	50 %	0 %	50 %	0 %	296242040
4583	NC_014160	TTG	2	6	271217	271222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242040
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4585	NC_014160	AAG	2	6	271235	271240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242040
4586	NC_014160	TGC	2	6	271245	271250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242040
4587	NC_014160	AG	3	6	271376	271381	50 %	0 %	50 %	0 %	296242040
4588	NC_014160	GAT	2	6	271413	271418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242040
4589	NC_014160	AACGTT	2	12	271435	271446	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296242040
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4591	NC_014160	AGG	2	6	271474	271479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242040
4592	NC_014160	GAA	2	6	271522	271527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242040
4593	NC_014160	TTC	2	6	271546	271551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242040
4594	NC_014160	GAA	2	6	271602	271607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242040
4595	NC_014160	CAG	2	6	271785	271790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242040
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4597	NC_014160	AT	3	6	271870	271875	50 %	50 %	0 %	0 %	296242040
4598	NC_014160	ACT	2	6	271910	271915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242040
4599	NC_014160	AG	3	6	272029	272034	50 %	0 %	50 %	0 %	296242040
4600	NC_014160	A	6	6	272041	272046	100 %	0 %	0 %	0 %	296242040
4601	NC_014160	TAT	2	6	272047	272052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242040
4602	NC_014160	TTA	2	6	272098	272103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242041
4603	NC_014160	CTT	2	6	272185	272190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242041
4604	NC_014160	CTTAGC	2	12	272291	272302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296242041
4605	NC_014160	ACT	2	6	272346	272351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242041
4606	NC_014160	TTC	2	6	272474	272479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242041
4607	NC_014160	A	6	6	272532	272537	100 %	0 %	0 %	0 %	296242042
4608	NC_014160	C	6	6	272549	272554	0 %	0 %	0 %	100 %	296242042
4609	NC_014160	ACT	2	6	272582	272587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242042
4610	NC_014160	CAC	2	6	272644	272649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242042
4611	NC_014160	TAT	2	6	272701	272706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242042
4612	NC_014160	TGG	2	6	272784	272789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242042
4613	NC_014160	TGCT	2	8	272834	272841	0 %	50 %	25 %	25 %	296242042
4614	NC_014160	AAC	2	6	272923	272928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242042
4615	NC_014160	ATT	2	6	272942	272947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242042
4616	NC_014160	ATG	2	6	272983	272988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242042
4617	NC_014160	TCC	2	6	273041	273046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242042
4618	NC_014160	C	6	6	273057	273062	0 %	0 %	0 %	100 %	296242042
4619	NC_014160	TCA	2	6	273182	273187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242042
4620	NC_014160	ATT	2	6	273317	273322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242042
4621	NC_014160	GAT	2	6	273326	273331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242042
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4623	NC_014160	CT	3	6	273516	273521	0 %	50 %	0 %	50 %	296242042
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4747	NC_014160	CAG	2	6	281960	281965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242051
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4776	NC_014160	CTCA	2	8	283967	283974	25 %	25 %	0 %	50 %	296242052
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4991	NC_014160	TCG	2	6	297855	297860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242068
4992	NC_014160	CTC	2	6	297947	297952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242068
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