MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 22456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014160	ATA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241749
2	NC_014160	TAA	2	6	103	108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241749
3	NC_014160	AGA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241749
4	NC_014160	AGG	2	6	204	209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
5	NC_014160	TTG	2	6	322	327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241749
6	NC_014160	AGG	2	6	474	479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
7	NC_014160	ACT	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241749
8	NC_014160	AGG	2	6	549	554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
9	NC_014160	CCT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241749
10	NC_014160	GAG	2	6	594	599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
11	NC_014160	CCA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241749
12	NC_014160	CTG	2	6	855	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241749
13	NC_014160	GGA	2	6	887	892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
14	NC_014160	AGG	2	6	943	948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
15	NC_014160	TCCT	2	8	969	976	0 %	50 %	0 %	50 %	296241749
16	NC_014160	GAA	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241749
17	NC_014160	ATG	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241749
18	NC_014160	GAA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241749
19	NC_014160	CGA	2	6	1276	1281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241750
20	NC_014160	CTT	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241750
21	NC_014160	GAA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241750
22	NC_014160	ACC	2	6	1319	1324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241750
23	NC_014160	TGT	2	6	1486	1491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241750
24	NC_014160	TCA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241750
25	NC_014160	CAT	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241750
26	NC_014160	AAG	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241750
27	NC_014160	AGG	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
28	NC_014160	AGG	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
29	NC_014160	GAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
30	NC_014160	GAA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241751
31	NC_014160	AT	3	6	2485	2490	50 %	50 %	0 %	0 %	296241751
32	NC_014160	A	6	6	2574	2579	100 %	0 %	0 %	0 %	296241751
33	NC_014160	AGGG	2	8	2613	2620	25 %	0 %	75 %	0 %	296241751
34	NC_014160	ATA	2	6	2643	2648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241751
35	NC_014160	CAG	2	6	2698	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
36	NC_014160	GTA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241751
37	NC_014160	TAT	2	6	2762	2767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241751
38	NC_014160	TGA	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241751
39	NC_014160	TGG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241751
40	NC_014160	AGG	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
41	NC_014160	GTG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241751
42	NC_014160	TAC	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241751
43	NC_014160	CAG	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
44	NC_014160	GGGA	2	8	3138	3145	25 %	0 %	75 %	0 %	296241751
45	NC_014160	CGT	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241751
46	NC_014160	ACC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241751
47	NC_014160	CAGG	2	8	3249	3256	25 %	0 %	50 %	25 %	296241751
48	NC_014160	GA	3	6	3341	3346	50 %	0 %	50 %	0 %	296241751
49	NC_014160	GAGAG	2	10	3389	3398	40 %	0 %	60 %	0 %	296241751
50	NC_014160	TGGA	2	8	3447	3454	25 %	25 %	50 %	0 %	296241751
51	NC_014160	CAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241751
52	NC_014160	AGC	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
53	NC_014160	GGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
54	NC_014160	TTC	2	6	3669	3674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241751
55	NC_014160	AGG	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
56	NC_014160	AGC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
57	NC_014160	CGTG	2	8	3756	3763	0 %	25 %	50 %	25 %	296241751
58	NC_014160	ACA	2	6	4111	4116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241752
59	NC_014160	TAT	2	6	4161	4166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
60	NC_014160	CG	3	6	4173	4178	0 %	0 %	50 %	50 %	296241752
61	NC_014160	GGT	2	6	4207	4212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241752
62	NC_014160	TCA	2	6	4247	4252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241752
63	NC_014160	ATT	2	6	4282	4287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
64	NC_014160	GCT	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241752
65	NC_014160	CTT	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241752
66	NC_014160	ACT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241752
67	NC_014160	CCG	2	6	4436	4441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241752
68	NC_014160	TGA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241752
69	NC_014160	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241752
70	NC_014160	GAA	2	6	4527	4532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241752
71	NC_014160	GAG	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241752
72	NC_014160	CCT	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
73	NC_014160	CGC	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241752
74	NC_014160	TTC	2	6	4670	4675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241752
75	NC_014160	TCA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241752
76	NC_014160	TCC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
77	NC_014160	CTC	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
78	NC_014160	G	6	6	4759	4764	0 %	0 %	100 %	0 %	296241752
79	NC_014160	CGC	2	6	4772	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241752
80	NC_014160	TAT	2	6	4797	4802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
81	NC_014160	TGC	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241752
82	NC_014160	CTT	3	9	4830	4838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241752
83	NC_014160	GAA	2	6	4839	4844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241752
84	NC_014160	CTC	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
85	NC_014160	AC	3	6	4903	4908	50 %	0 %	0 %	50 %	296241752
86	NC_014160	CTC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
87	NC_014160	TGAA	2	8	5030	5037	50 %	25 %	25 %	0 %	296241752
88	NC_014160	TAT	2	6	5112	5117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
89	NC_014160	T	6	6	5121	5126	0 %	100 %	0 %	0 %	296241752
90	NC_014160	AATG	2	8	5204	5211	50 %	25 %	25 %	0 %	296241752
91	NC_014160	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241752
92	NC_014160	AAG	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241752
93	NC_014160	ACG	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241753
94	NC_014160	TGTT	2	8	5729	5736	0 %	75 %	25 %	0 %	296241753
95	NC_014160	ATT	2	6	5770	5775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241753
96	NC_014160	CA	3	6	5788	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	296241753
97	NC_014160	ATT	2	6	5794	5799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241753
98	NC_014160	T	6	6	7426	7431	0 %	100 %	0 %	0 %	296241754
99	NC_014160	CTT	2	6	7501	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241754
100	NC_014160	CTC	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241754
101	NC_014160	GTC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241754
102	NC_014160	CT	3	6	7671	7676	0 %	50 %	0 %	50 %	296241754
103	NC_014160	TAG	2	6	7723	7728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241754
104	NC_014160	CTT	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241754
105	NC_014160	ATG	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241754
106	NC_014160	AGG	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241754
107	NC_014160	GTC	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241754
108	NC_014160	TCC	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241754
109	NC_014160	GAG	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241754
110	NC_014160	CGA	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241754
111	NC_014160	CAC	2	6	8046	8051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241754
112	NC_014160	CTC	2	6	8134	8139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241754
113	NC_014160	TTC	2	6	8192	8197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241754
114	NC_014160	CTT	2	6	8638	8643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241754
115	NC_014160	AGA	2	6	8712	8717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241754
116	NC_014160	CTC	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241754
117	NC_014160	CTT	2	6	8881	8886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241754
118	NC_014160	GTA	2	6	8905	8910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241754
119	NC_014160	CTC	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241754
120	NC_014160	TC	4	8	8966	8973	0 %	50 %	0 %	50 %	296241754
121	NC_014160	ATG	2	6	8978	8983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241754
122	NC_014160	CCT	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241754
123	NC_014160	CTT	2	6	9085	9090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241754
124	NC_014160	AAC	2	6	9341	9346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241755
125	NC_014160	ATG	2	6	9360	9365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241755
126	NC_014160	GAG	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241755
127	NC_014160	TTG	2	6	9423	9428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241755
128	NC_014160	AGGG	2	8	9434	9441	25 %	0 %	75 %	0 %	296241755
129	NC_014160	CGT	2	6	9445	9450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241755
130	NC_014160	AAT	2	6	9472	9477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241755
131	NC_014160	GTT	3	9	9500	9508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241755
132	NC_014160	AG	4	8	9547	9554	50 %	0 %	50 %	0 %	296241755
133	NC_014160	CAA	2	6	9640	9645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241755
134	NC_014160	CAT	2	6	9829	9834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241756
135	NC_014160	GAGC	2	8	9836	9843	25 %	0 %	50 %	25 %	296241756
136	NC_014160	GA	3	6	9846	9851	50 %	0 %	50 %	0 %	296241756
137	NC_014160	CAG	2	6	9914	9919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241756
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139	NC_014160	CAA	2	6	9971	9976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241756
140	NC_014160	CGA	2	6	10004	10009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241756
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142	NC_014160	TGC	2	6	10055	10060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241756
143	NC_014160	AAT	2	6	10169	10174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241756
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153	NC_014160	GTT	2	6	10734	10739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241757
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253	NC_014160	GAG	2	6	16541	16546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241764
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259	NC_014160	TGT	2	6	16995	17000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241765
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261	NC_014160	GAC	2	6	17140	17145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241765
262	NC_014160	TC	3	6	17174	17179	0 %	50 %	0 %	50 %	296241765
263	NC_014160	GAA	2	6	17182	17187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241765
264	NC_014160	CTC	2	6	17209	17214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241765
265	NC_014160	CTC	2	6	17239	17244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241765
266	NC_014160	TGT	2	6	17271	17276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241765
267	NC_014160	CCA	2	6	17313	17318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241765
268	NC_014160	T	6	6	17345	17350	0 %	100 %	0 %	0 %	296241765
269	NC_014160	TCTTAG	2	12	18202	18213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296241766
270	NC_014160	AATA	2	8	18236	18243	75 %	25 %	0 %	0 %	296241766
271	NC_014160	AAT	2	6	18269	18274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241766
272	NC_014160	GAA	2	6	18323	18328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241766
273	NC_014160	CTT	2	6	18359	18364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241766
274	NC_014160	CTC	2	6	18498	18503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241767
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277	NC_014160	CTA	2	6	18712	18717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241767
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279	NC_014160	CTC	2	6	18857	18862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241767
280	NC_014160	CAA	2	6	18880	18885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241767
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282	NC_014160	GCT	2	6	19114	19119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241768
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285	NC_014160	AGG	2	6	19459	19464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241768
286	NC_014160	TGT	2	6	19528	19533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241768
287	NC_014160	CTG	2	6	19694	19699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241768
288	NC_014160	GA	3	6	19723	19728	50 %	0 %	50 %	0 %	296241768
289	NC_014160	GA	3	6	19774	19779	50 %	0 %	50 %	0 %	296241768
290	NC_014160	TGA	2	6	19788	19793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241768
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296	NC_014160	ATT	2	6	20187	20192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241769
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298	NC_014160	GGT	2	6	20388	20393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241769
299	NC_014160	AAGGG	2	10	20467	20476	40 %	0 %	60 %	0 %	296241769
300	NC_014160	ATAGCC	2	12	20587	20598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296241769
301	NC_014160	CT	3	6	20684	20689	0 %	50 %	0 %	50 %	296241769
302	NC_014160	GCC	2	6	20776	20781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241769
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