MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 106915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014158	TGA	2	6	188	193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137751
2	NC_014158	CGT	2	6	225	230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137751
3	NC_014158	CGA	2	6	231	236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137751
4	NC_014158	TGA	2	6	353	358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137751
5	NC_014158	ATCG	2	8	367	374	25 %	25 %	25 %	25 %	296137751
6	NC_014158	ATC	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137751
7	NC_014158	CGC	2	6	461	466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137751
8	NC_014158	CGC	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137751
9	NC_014158	CCGG	2	8	496	503	0 %	0 %	50 %	50 %	296137751
10	NC_014158	C	6	6	537	542	0 %	0 %	0 %	100 %	296137751
11	NC_014158	GCG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137751
12	NC_014158	CCG	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137751
13	NC_014158	TCG	2	6	601	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137751
14	NC_014158	CGC	3	9	702	710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137751
15	NC_014158	GCCC	2	8	729	736	0 %	0 %	25 %	75 %	296137751
16	NC_014158	CTG	2	6	790	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137751
17	NC_014158	CGC	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137751
18	NC_014158	GAG	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137751
19	NC_014158	ACGA	2	8	868	875	50 %	0 %	25 %	25 %	296137751
20	NC_014158	TCA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137751
21	NC_014158	GAC	2	6	895	900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137751
22	NC_014158	CTG	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137751
23	NC_014158	GAC	2	6	952	957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137751
24	NC_014158	AGG	2	6	989	994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137751
25	NC_014158	TTC	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137751
26	NC_014158	CAA	2	6	1029	1034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137751
27	NC_014158	CCG	2	6	1060	1065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137751
28	NC_014158	AGC	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137751
29	NC_014158	GCC	2	6	1134	1139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137751
30	NC_014158	AAG	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137751
31	NC_014158	ACC	3	9	1357	1365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137751
32	NC_014158	GTG	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137751
33	NC_014158	GC	3	6	1446	1451	0 %	0 %	50 %	50 %	296137751
34	NC_014158	ACCAC	2	10	1547	1556	40 %	0 %	0 %	60 %	296137751
35	NC_014158	GCG	2	6	1599	1604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137751
36	NC_014158	ACC	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137751
37	NC_014158	ACG	2	6	1647	1652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137751
38	NC_014158	TTCTG	2	10	1754	1763	0 %	60 %	20 %	20 %	296137752
39	NC_014158	GAC	2	6	1765	1770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137752
40	NC_014158	CGC	2	6	1986	1991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137752
41	NC_014158	GGT	3	9	2047	2055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137752
42	NC_014158	CGT	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137752
43	NC_014158	CGC	3	9	2112	2120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137752
44	NC_014158	TCG	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137752
45	NC_014158	CAC	3	9	2134	2142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137752
46	NC_014158	CGG	2	6	2169	2174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137752
47	NC_014158	CTT	2	6	2194	2199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137752
48	NC_014158	ATTGCC	2	12	2200	2211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296137752
49	NC_014158	CGT	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137752
50	NC_014158	CGG	2	6	2263	2268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137752
51	NC_014158	GCG	2	6	2277	2282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137752
52	NC_014158	GCT	2	6	2283	2288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137752
53	NC_014158	GCC	2	6	2335	2340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137752
54	NC_014158	GCC	2	6	2389	2394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137752
55	NC_014158	GCG	2	6	2400	2405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137752
56	NC_014158	GGGT	2	8	2428	2435	0 %	25 %	75 %	0 %	296137752
57	NC_014158	GCCG	2	8	2440	2447	0 %	0 %	50 %	50 %	296137752
58	NC_014158	GCCG	2	8	2458	2465	0 %	0 %	50 %	50 %	296137752
59	NC_014158	GCG	2	6	2469	2474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137752
60	NC_014158	CTG	2	6	2509	2514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137752
61	NC_014158	GAG	2	6	2986	2991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137753
62	NC_014158	TCC	2	6	3036	3041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137753
63	NC_014158	CGG	2	6	3054	3059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137753
64	NC_014158	CTG	2	6	3064	3069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137753
65	NC_014158	GAC	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137753
66	NC_014158	CGA	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137753
67	NC_014158	CAA	2	6	3210	3215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137753
68	NC_014158	GCA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137753
69	NC_014158	GCA	2	6	3350	3355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137753
70	NC_014158	GAC	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137753
71	NC_014158	ACCG	2	8	3469	3476	25 %	0 %	25 %	50 %	296137753
72	NC_014158	GCC	2	6	3532	3537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137753
73	NC_014158	GGTG	2	8	3627	3634	0 %	25 %	75 %	0 %	296137753
74	NC_014158	CGC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137753
75	NC_014158	ACC	3	9	3673	3681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137753
76	NC_014158	CCT	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137753
77	NC_014158	CGC	2	6	3761	3766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137753
78	NC_014158	TGG	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137753
79	NC_014158	CGGC	2	8	3854	3861	0 %	0 %	50 %	50 %	296137753
80	NC_014158	GAC	2	6	3865	3870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137753
81	NC_014158	GAG	3	9	3883	3891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137753
82	NC_014158	CCG	2	6	3896	3901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137753
83	NC_014158	CAC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137753
84	NC_014158	TGC	2	6	4019	4024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137753
85	NC_014158	GAC	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137753
86	NC_014158	CGC	2	6	4076	4081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137753
87	NC_014158	CTG	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137753
88	NC_014158	GC	3	6	4225	4230	0 %	0 %	50 %	50 %	296137754
89	NC_014158	CGG	2	6	4231	4236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137754
90	NC_014158	TCG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137754
91	NC_014158	GTC	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137754
92	NC_014158	CCG	2	6	4344	4349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137754
93	NC_014158	CGG	2	6	4417	4422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137754
94	NC_014158	CGA	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137754
95	NC_014158	CGG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137754
96	NC_014158	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137754
97	NC_014158	TGCGC	2	10	4591	4600	0 %	20 %	40 %	40 %	296137754
98	NC_014158	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137754
99	NC_014158	CGT	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137754
100	NC_014158	CTC	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137754
101	NC_014158	CCT	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137754
102	NC_014158	GAG	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137754
103	NC_014158	CGG	2	6	4941	4946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137754
104	NC_014158	CGG	2	6	5023	5028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137754
105	NC_014158	GC	3	6	5041	5046	0 %	0 %	50 %	50 %	296137754
106	NC_014158	TCG	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137755
107	NC_014158	CG	3	6	5339	5344	0 %	0 %	50 %	50 %	296137755
108	NC_014158	GGC	2	6	5456	5461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137755
109	NC_014158	CGA	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137755
110	NC_014158	TCC	2	6	5490	5495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137755
111	NC_014158	GCT	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137755
112	NC_014158	CGC	3	9	5575	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137755
113	NC_014158	GC	3	6	5648	5653	0 %	0 %	50 %	50 %	296137755
114	NC_014158	GGC	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137755
115	NC_014158	GGT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137755
116	NC_014158	CGC	2	6	5692	5697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137755
117	NC_014158	GC	3	6	5727	5732	0 %	0 %	50 %	50 %	296137755
118	NC_014158	GCC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137755
119	NC_014158	GCCACC	2	12	5807	5818	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296137755
120	NC_014158	GGA	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137755
121	NC_014158	GATC	2	8	5875	5882	25 %	25 %	25 %	25 %	296137755
122	NC_014158	TGG	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137755
123	NC_014158	CGA	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137755
124	NC_014158	GC	3	6	6019	6024	0 %	0 %	50 %	50 %	296137755
125	NC_014158	CTC	2	6	6047	6052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137755
126	NC_014158	GAC	2	6	6053	6058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137755
127	NC_014158	GCC	2	6	6157	6162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137755
128	NC_014158	GCCG	2	8	6202	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	296137755
129	NC_014158	GAC	3	9	6242	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137755
130	NC_014158	CG	3	6	6408	6413	0 %	0 %	50 %	50 %	296137756
131	NC_014158	ACC	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137756
132	NC_014158	TCC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137756
133	NC_014158	TTC	2	6	6590	6595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137756
134	NC_014158	CGA	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137756
135	NC_014158	CGA	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137756
136	NC_014158	ATC	2	6	6716	6721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137756
137	NC_014158	GC	3	6	6727	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	296137756
138	NC_014158	CACC	2	8	6742	6749	25 %	0 %	0 %	75 %	296137756
139	NC_014158	CTG	2	6	6863	6868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137756
140	NC_014158	AAG	2	6	6917	6922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137756
141	NC_014158	CGG	2	6	6956	6961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137756
142	NC_014158	ATC	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137756
143	NC_014158	CCG	2	6	7034	7039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137756
144	NC_014158	CG	3	6	7054	7059	0 %	0 %	50 %	50 %	296137756
145	NC_014158	TCGGA	2	10	7066	7075	20 %	20 %	40 %	20 %	296137756
146	NC_014158	CGC	2	6	7108	7113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137756
147	NC_014158	CGA	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137756
148	NC_014158	CCGT	2	8	7153	7160	0 %	25 %	25 %	50 %	296137756
149	NC_014158	GCA	2	6	7179	7184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137756
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154	NC_014158	CGA	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137756
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156	NC_014158	CTG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137756
157	NC_014158	TGC	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137756
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163	NC_014158	GCCGGT	2	12	7481	7492	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296137756
164	NC_014158	GCT	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137756
165	NC_014158	GC	3	6	7520	7525	0 %	0 %	50 %	50 %	296137756
166	NC_014158	CGA	2	6	7558	7563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137756
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174	NC_014158	CTG	3	9	7872	7880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137757
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176	NC_014158	CG	3	6	8000	8005	0 %	0 %	50 %	50 %	296137757
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250	NC_014158	ACGC	2	8	10974	10981	25 %	0 %	25 %	50 %	296137759
251	NC_014158	ATC	2	6	11009	11014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137759
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253	NC_014158	GAG	2	6	11135	11140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137759
254	NC_014158	CGT	2	6	11164	11169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137759
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256	NC_014158	GAAGGA	2	12	11200	11211	50 %	0 %	50 %	0 %	296137759
257	NC_014158	CGA	2	6	11227	11232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137759
258	NC_014158	CGC	2	6	11248	11253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137759
259	NC_014158	AGC	2	6	11355	11360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137759
260	NC_014158	TTCGA	2	10	11372	11381	20 %	40 %	20 %	20 %	296137759
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262	NC_014158	CGC	2	6	11440	11445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137759
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496	NC_014158	ACC	2	6	20198	20203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137767
497	NC_014158	GCCGGT	2	12	20281	20292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296137767
498	NC_014158	CG	3	6	20299	20304	0 %	0 %	50 %	50 %	296137767
499	NC_014158	GC	3	6	20332	20337	0 %	0 %	50 %	50 %	296137767
500	NC_014158	GATC	2	8	20418	20425	25 %	25 %	25 %	25 %	296137767

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