MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 106915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014158	AGT	2	6	140914	140919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137885
3502	NC_014158	GC	3	6	140961	140966	0 %	0 %	50 %	50 %	296137885
3503	NC_014158	CGA	2	6	141016	141021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137885
3504	NC_014158	G	6	6	141041	141046	0 %	0 %	100 %	0 %	296137885
3505	NC_014158	GAG	2	6	141111	141116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137886
3506	NC_014158	TCGG	2	8	141117	141124	0 %	25 %	50 %	25 %	296137886
3507	NC_014158	CGG	2	6	141137	141142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3508	NC_014158	GAA	2	6	141153	141158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137886
3509	NC_014158	GTG	2	6	141163	141168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137886
3510	NC_014158	TTC	2	6	141169	141174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137886
3511	NC_014158	TCG	2	6	141196	141201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3512	NC_014158	GCT	2	6	141207	141212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3513	NC_014158	GCC	2	6	141213	141218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137886
3514	NC_014158	GTG	2	6	141226	141231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137886
3515	NC_014158	GCT	2	6	141246	141251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3516	NC_014158	GCC	2	6	141266	141271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137886
3517	NC_014158	GGTG	2	8	141284	141291	0 %	25 %	75 %	0 %	296137886
3518	NC_014158	GC	3	6	141308	141313	0 %	0 %	50 %	50 %	296137886
3519	NC_014158	AGC	2	6	141355	141360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3520	NC_014158	GTC	2	6	141361	141366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3521	NC_014158	CAC	2	6	141414	141419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137886
3522	NC_014158	GCC	2	6	141558	141563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137886
3523	NC_014158	GCC	2	6	141588	141593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137886
3524	NC_014158	CCTTCG	2	12	141626	141637	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296137886
3525	NC_014158	GCC	2	6	141666	141671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137886
3526	NC_014158	GGC	2	6	141681	141686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3527	NC_014158	GTAC	2	8	141719	141726	25 %	25 %	25 %	25 %	296137886
3528	NC_014158	CAG	2	6	141747	141752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3529	NC_014158	ATG	2	6	141784	141789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137886
3530	NC_014158	CGC	2	6	141815	141820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137886
3531	NC_014158	CTG	2	6	141837	141842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3532	NC_014158	CAG	2	6	141879	141884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3533	NC_014158	GGC	2	6	141924	141929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3534	NC_014158	CAGCG	2	10	142018	142027	20 %	0 %	40 %	40 %	296137886
3535	NC_014158	GCG	2	6	142035	142040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3536	NC_014158	CGG	2	6	142056	142061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3537	NC_014158	GCG	2	6	142063	142068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3538	NC_014158	GCC	2	6	142087	142092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137886
3539	NC_014158	GCG	2	6	142095	142100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3540	NC_014158	GAG	2	6	142112	142117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137886
3541	NC_014158	CTG	2	6	142144	142149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3542	NC_014158	CGGCG	2	10	142169	142178	0 %	0 %	60 %	40 %	296137886
3543	NC_014158	GCG	2	6	142211	142216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3544	NC_014158	GCGGG	2	10	142232	142241	0 %	0 %	80 %	20 %	296137886
3545	NC_014158	GCT	2	6	142265	142270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3546	NC_014158	CGG	2	6	142284	142289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3547	NC_014158	GCT	2	6	142307	142312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3548	NC_014158	GCT	2	6	142364	142369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3549	NC_014158	GCG	2	6	142376	142381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137886
3550	NC_014158	TCG	2	6	142459	142464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3551	NC_014158	CGT	2	6	142471	142476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3552	NC_014158	TCG	2	6	142477	142482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137886
3553	NC_014158	GGT	2	6	142594	142599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137887
3554	NC_014158	CCA	2	6	142627	142632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137887
3555	NC_014158	GGC	2	6	142688	142693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137887
3556	NC_014158	CAC	2	6	142712	142717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137887
3557	NC_014158	GGT	2	6	142750	142755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137887
3558	NC_014158	AGC	2	6	142767	142772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137887
3559	NC_014158	GCG	2	6	142779	142784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137887
3560	NC_014158	CG	3	6	142793	142798	0 %	0 %	50 %	50 %	296137887
3561	NC_014158	CAC	3	9	142838	142846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137887
3562	NC_014158	CCT	2	6	142849	142854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137887
3563	NC_014158	CGC	2	6	142871	142876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137887
3564	NC_014158	CCCG	2	8	142913	142920	0 %	0 %	25 %	75 %	296137887
3565	NC_014158	CGTC	2	8	142952	142959	0 %	25 %	25 %	50 %	296137887
3566	NC_014158	GGC	2	6	142997	143002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137887
3567	NC_014158	CGCGA	2	10	143038	143047	20 %	0 %	40 %	40 %	296137887
3568	NC_014158	CAG	2	6	143096	143101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137887
3569	NC_014158	GCGA	2	8	143109	143116	25 %	0 %	50 %	25 %	296137887
3570	NC_014158	AAC	2	6	143127	143132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137887
3571	NC_014158	CGG	2	6	143137	143142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137887
3572	NC_014158	ATCG	2	8	143162	143169	25 %	25 %	25 %	25 %	296137887
3573	NC_014158	CGT	2	6	143204	143209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137887
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3575	NC_014158	TCT	2	6	143320	143325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137887
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3577	NC_014158	AGCG	2	8	143477	143484	25 %	0 %	50 %	25 %	296137888
3578	NC_014158	CGA	2	6	143490	143495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137888
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3585	NC_014158	CAA	3	9	143587	143595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137888
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3588	NC_014158	TGG	2	6	143790	143795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137888
3589	NC_014158	CAT	3	9	143806	143814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137888
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3591	NC_014158	CGC	2	6	143887	143892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137888
3592	NC_014158	GCT	2	6	143901	143906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137888
3593	NC_014158	GCG	2	6	143944	143949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137888
3594	NC_014158	CGG	2	6	144021	144026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137888
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3599	NC_014158	TCG	2	6	144114	144119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137888
3600	NC_014158	CTCG	2	8	144229	144236	0 %	25 %	25 %	50 %	296137888
3601	NC_014158	CTT	2	6	144322	144327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137888
3602	NC_014158	AGG	2	6	144360	144365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137888
3603	NC_014158	TGA	2	6	144372	144377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137888
3604	NC_014158	GCG	3	9	144444	144452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137888
3605	NC_014158	TCG	2	6	144461	144466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137888
3606	NC_014158	GC	4	8	144507	144514	0 %	0 %	50 %	50 %	296137888
3607	NC_014158	CTG	2	6	144551	144556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137888
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3612	NC_014158	CGCC	2	8	144606	144613	0 %	0 %	25 %	75 %	296137888
3613	NC_014158	ATG	2	6	144632	144637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137888
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3616	NC_014158	TCG	2	6	144819	144824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137888
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3619	NC_014158	TCG	2	6	144929	144934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137889
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3621	NC_014158	CTG	2	6	145036	145041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137889
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3743	NC_014158	ACG	2	6	149595	149600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137894
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3745	NC_014158	TCGGA	2	10	149655	149664	20 %	20 %	40 %	20 %	296137894
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3751	NC_014158	TGATC	2	10	149820	149829	20 %	40 %	20 %	20 %	296137894
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3764	NC_014158	CGAG	2	8	150361	150368	25 %	0 %	50 %	25 %	296137895
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3854	NC_014158	AGG	2	6	153563	153568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137899
3855	NC_014158	CGA	2	6	153591	153596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137899
3856	NC_014158	CGA	2	6	153603	153608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137899
3857	NC_014158	ATC	2	6	153634	153639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137899
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3859	NC_014158	GCGCG	2	10	153765	153774	0 %	0 %	60 %	40 %	296137899
3860	NC_014158	GC	3	6	153815	153820	0 %	0 %	50 %	50 %	296137899
3861	NC_014158	GCT	2	6	153834	153839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137899
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3982	NC_014158	ATC	2	6	158780	158785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137906
3983	NC_014158	CGT	2	6	158796	158801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137906
3984	NC_014158	TCG	2	6	158894	158899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137906
3985	NC_014158	CGG	2	6	158932	158937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137906
3986	NC_014158	CCG	2	6	158940	158945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137906
3987	NC_014158	CAC	2	6	158950	158955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137906
3988	NC_014158	GCA	2	6	159090	159095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137906
3989	NC_014158	CGT	2	6	159153	159158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137906
3990	NC_014158	CGG	2	6	159222	159227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137906
3991	NC_014158	GC	4	8	159228	159235	0 %	0 %	50 %	50 %	296137906
3992	NC_014158	GAT	2	6	159241	159246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137906
3993	NC_014158	ATG	2	6	159248	159253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137906
3994	NC_014158	GAA	2	6	159307	159312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137906
3995	NC_014158	GCA	2	6	159369	159374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137906
3996	NC_014158	TTG	2	6	159389	159394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137906
3997	NC_014158	TTC	2	6	159410	159415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137906
3998	NC_014158	TCCAG	2	10	159477	159486	20 %	20 %	20 %	40 %	296137906
3999	NC_014158	CGGGAA	2	12	159499	159510	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296137906
4000	NC_014158	GGT	3	9	159565	159573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137906

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