MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 106915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014158	CGC	2	6	122036	122041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137862
3002	NC_014158	GGTG	2	8	122056	122063	0 %	25 %	75 %	0 %	296137862
3003	NC_014158	TGG	2	6	122067	122072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137862
3004	NC_014158	CG	4	8	122098	122105	0 %	0 %	50 %	50 %	296137862
3005	NC_014158	TTCC	2	8	122197	122204	0 %	50 %	0 %	50 %	296137863
3006	NC_014158	AGG	2	6	122224	122229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137863
3007	NC_014158	CCG	2	6	122239	122244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137863
3008	NC_014158	CGT	2	6	122259	122264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137863
3009	NC_014158	GGC	2	6	122273	122278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137863
3010	NC_014158	CAG	2	6	122329	122334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137863
3011	NC_014158	CCGCG	2	10	122421	122430	0 %	0 %	40 %	60 %	296137863
3012	NC_014158	CGA	2	6	122477	122482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137863
3013	NC_014158	CG	4	8	122513	122520	0 %	0 %	50 %	50 %	296137863
3014	NC_014158	GCG	2	6	122534	122539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137863
3015	NC_014158	GCG	2	6	122572	122577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137863
3016	NC_014158	CG	3	6	122584	122589	0 %	0 %	50 %	50 %	296137863
3017	NC_014158	AGC	2	6	122590	122595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137863
3018	NC_014158	CCG	2	6	122632	122637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137863
3019	NC_014158	CCCGG	2	10	122674	122683	0 %	0 %	40 %	60 %	296137863
3020	NC_014158	CTG	2	6	122733	122738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137863
3021	NC_014158	TGC	2	6	122803	122808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137863
3022	NC_014158	CCG	2	6	122812	122817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137863
3023	NC_014158	GATTC	2	10	122820	122829	20 %	40 %	20 %	20 %	296137863
3024	NC_014158	GGCCT	2	10	122898	122907	0 %	20 %	40 %	40 %	296137863
3025	NC_014158	GCCGTC	2	12	122969	122980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296137864
3026	NC_014158	CGT	3	9	122996	123004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137864
3027	NC_014158	CCG	2	6	123040	123045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137864
3028	NC_014158	CGG	2	6	123143	123148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137864
3029	NC_014158	CGA	2	6	123170	123175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137864
3030	NC_014158	GCCC	2	8	123177	123184	0 %	0 %	25 %	75 %	296137864
3031	NC_014158	GAT	2	6	123210	123215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137864
3032	NC_014158	CGA	2	6	123221	123226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137864
3033	NC_014158	ACC	2	6	123349	123354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137864
3034	NC_014158	GCG	2	6	123369	123374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137864
3035	NC_014158	GCC	2	6	123375	123380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137864
3036	NC_014158	CCT	2	6	123413	123418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137864
3037	NC_014158	CGA	2	6	123431	123436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137864
3038	NC_014158	TGAAC	2	10	123452	123461	40 %	20 %	20 %	20 %	296137864
3039	NC_014158	CGAT	2	8	123580	123587	25 %	25 %	25 %	25 %	296137865
3040	NC_014158	AGC	2	6	123595	123600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3041	NC_014158	CG	3	6	123607	123612	0 %	0 %	50 %	50 %	296137865
3042	NC_014158	CAC	2	6	123644	123649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137865
3043	NC_014158	CGC	2	6	123699	123704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137865
3044	NC_014158	GCG	2	6	123720	123725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137865
3045	NC_014158	GCGCC	2	10	123782	123791	0 %	0 %	40 %	60 %	296137865
3046	NC_014158	GC	3	6	123828	123833	0 %	0 %	50 %	50 %	296137865
3047	NC_014158	AGG	2	6	123844	123849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137865
3048	NC_014158	CCGC	2	8	123871	123878	0 %	0 %	25 %	75 %	296137865
3049	NC_014158	GCT	2	6	123902	123907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3050	NC_014158	AGA	2	6	123913	123918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137865
3051	NC_014158	TGC	2	6	123931	123936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3052	NC_014158	GTG	2	6	124062	124067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137865
3053	NC_014158	CGC	2	6	124103	124108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137865
3054	NC_014158	GCT	2	6	124115	124120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3055	NC_014158	GGCC	2	8	124127	124134	0 %	0 %	50 %	50 %	296137865
3056	NC_014158	CG	3	6	124138	124143	0 %	0 %	50 %	50 %	296137865
3057	NC_014158	CGT	2	6	124154	124159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3058	NC_014158	GCG	2	6	124171	124176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137865
3059	NC_014158	TCG	2	6	124192	124197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3060	NC_014158	GC	3	6	124199	124204	0 %	0 %	50 %	50 %	296137865
3061	NC_014158	TCG	2	6	124227	124232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3062	NC_014158	CCG	2	6	124285	124290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137865
3063	NC_014158	CGG	2	6	124295	124300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137865
3064	NC_014158	TGG	2	6	124312	124317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137865
3065	NC_014158	CCG	2	6	124345	124350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137865
3066	NC_014158	GCC	2	6	124356	124361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137865
3067	NC_014158	CGC	2	6	124364	124369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137865
3068	NC_014158	TCGA	2	8	124398	124405	25 %	25 %	25 %	25 %	296137865
3069	NC_014158	CGA	2	6	124433	124438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3070	NC_014158	TCGC	2	8	124515	124522	0 %	25 %	25 %	50 %	296137865
3071	NC_014158	CGA	2	6	124559	124564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3072	NC_014158	CGG	2	6	124595	124600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137865
3073	NC_014158	GCCC	2	8	124605	124612	0 %	0 %	25 %	75 %	296137865
3074	NC_014158	CTT	2	6	124625	124630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137865
3075	NC_014158	GGA	2	6	124661	124666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137865
3076	NC_014158	GCTTC	2	10	124675	124684	0 %	40 %	20 %	40 %	296137865
3077	NC_014158	CGA	2	6	124730	124735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137865
3078	NC_014158	GC	3	6	124745	124750	0 %	0 %	50 %	50 %	296137865
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3083	NC_014158	GCC	2	6	124921	124926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137865
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3087	NC_014158	ATC	2	6	125049	125054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137865
3088	NC_014158	TCA	2	6	125213	125218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137866
3089	NC_014158	GC	3	6	125220	125225	0 %	0 %	50 %	50 %	296137866
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3092	NC_014158	GA	3	6	125254	125259	50 %	0 %	50 %	0 %	296137866
3093	NC_014158	CGCGC	2	10	125271	125280	0 %	0 %	40 %	60 %	296137866
3094	NC_014158	GGC	2	6	125281	125286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137866
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3101	NC_014158	TCGCT	2	10	125501	125510	0 %	40 %	20 %	40 %	296137866
3102	NC_014158	CGA	2	6	125577	125582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137866
3103	NC_014158	CGA	2	6	125595	125600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137866
3104	NC_014158	ACG	2	6	125627	125632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137866
3105	NC_014158	CGC	2	6	125639	125644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137866
3106	NC_014158	GC	4	8	125649	125656	0 %	0 %	50 %	50 %	296137866
3107	NC_014158	GGC	2	6	125665	125670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137866
3108	NC_014158	CGG	3	9	125693	125701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137866
3109	NC_014158	GGCCG	2	10	125714	125723	0 %	0 %	60 %	40 %	296137866
3110	NC_014158	CGC	3	9	125747	125755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137867
3111	NC_014158	CTC	2	6	125768	125773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137867
3112	NC_014158	CGG	2	6	125791	125796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137867
3113	NC_014158	CGG	2	6	125899	125904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137867
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3119	NC_014158	CCG	2	6	126118	126123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137867
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3121	NC_014158	CGG	2	6	126157	126162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137867
3122	NC_014158	GCG	3	9	126174	126182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137867
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3242	NC_014158	GCGA	2	8	130074	130081	25 %	0 %	50 %	25 %	296137870
3243	NC_014158	CGG	2	6	130090	130095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137870
3244	NC_014158	GAG	2	6	130394	130399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137871
3245	NC_014158	CGG	2	6	130560	130565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137871
3246	NC_014158	ACT	2	6	130584	130589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137871
3247	NC_014158	GCG	2	6	130604	130609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137871
3248	NC_014158	GCA	2	6	130744	130749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137871
3249	NC_014158	CCG	2	6	130758	130763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137871
3250	NC_014158	CG	3	6	130788	130793	0 %	0 %	50 %	50 %	296137871
3251	NC_014158	GCGT	2	8	130873	130880	0 %	25 %	50 %	25 %	296137872
3252	NC_014158	TCG	2	6	130895	130900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137872
3253	NC_014158	TCTCGA	2	12	130925	130936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296137872
3254	NC_014158	CAGC	2	8	131006	131013	25 %	0 %	25 %	50 %	296137872
3255	NC_014158	TCG	2	6	131047	131052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137872
3256	NC_014158	CGA	2	6	131054	131059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137872
3257	NC_014158	ACT	2	6	131065	131070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137872
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3259	NC_014158	ATC	2	6	131112	131117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137872
3260	NC_014158	GCC	2	6	131175	131180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137872
3261	NC_014158	GCC	2	6	131186	131191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137872
3262	NC_014158	GCC	2	6	131199	131204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137872
3263	NC_014158	ACG	3	9	131227	131235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137872
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3266	NC_014158	GC	3	6	131345	131350	0 %	0 %	50 %	50 %	296137872
3267	NC_014158	G	6	6	131354	131359	0 %	0 %	100 %	0 %	296137872
3268	NC_014158	TTC	2	6	131405	131410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137873
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3270	NC_014158	CTG	2	6	131513	131518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137873
3271	NC_014158	CGG	2	6	131578	131583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137873
3272	NC_014158	TTC	2	6	131627	131632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137873
3273	NC_014158	GTCG	2	8	131710	131717	0 %	25 %	50 %	25 %	296137873
3274	NC_014158	CCACC	2	10	131727	131736	20 %	0 %	0 %	80 %	296137873
3275	NC_014158	TTC	2	6	131795	131800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137873
3276	NC_014158	ATG	2	6	131903	131908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137873
3277	NC_014158	GCTCG	2	10	131932	131941	0 %	20 %	40 %	40 %	296137873
3278	NC_014158	GGT	2	6	131950	131955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137873
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3353	NC_014158	TGGT	2	8	134863	134870	0 %	50 %	50 %	0 %	296137876
3354	NC_014158	TTC	2	6	134896	134901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137876
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3358	NC_014158	GCG	2	6	134965	134970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137876
3359	NC_014158	TGCT	2	8	134998	135005	0 %	50 %	25 %	25 %	296137876
3360	NC_014158	GTG	2	6	135006	135011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137876
3361	NC_014158	GCA	2	6	135236	135241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137877
3362	NC_014158	GGA	2	6	135242	135247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137877
3363	NC_014158	CGTG	2	8	135326	135333	0 %	25 %	50 %	25 %	296137877
3364	NC_014158	ACC	2	6	135427	135432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137877
3365	NC_014158	TCG	2	6	135735	135740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137878
3366	NC_014158	GTG	2	6	135767	135772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137878
3367	NC_014158	CTC	2	6	135782	135787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137878
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3369	NC_014158	CTC	2	6	135923	135928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137878
3370	NC_014158	ACC	2	6	135935	135940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137878
3371	NC_014158	CTG	2	6	135965	135970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137878
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3373	NC_014158	CTG	2	6	136028	136033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137878
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3379	NC_014158	ACTTCG	2	12	136288	136299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296137879
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3403	NC_014158	CGAC	2	8	137608	137615	25 %	0 %	25 %	50 %	296137881
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3472	NC_014158	CCGG	2	8	139914	139921	0 %	0 %	50 %	50 %	296137884
3473	NC_014158	TCA	2	6	139927	139932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137884
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3475	NC_014158	TGG	2	6	140029	140034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137884
3476	NC_014158	GC	3	6	140095	140100	0 %	0 %	50 %	50 %	296137884
3477	NC_014158	GTG	2	6	140102	140107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137884
3478	NC_014158	GCC	2	6	140172	140177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137884
3479	NC_014158	CGC	2	6	140192	140197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137884
3480	NC_014158	CGG	2	6	140198	140203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137884
3481	NC_014158	TCGACC	2	12	140272	140283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296137884
3482	NC_014158	GAT	2	6	140355	140360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137884
3483	NC_014158	CCA	2	6	140446	140451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137885
3484	NC_014158	CGT	2	6	140476	140481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137885
3485	NC_014158	CGT	2	6	140494	140499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137885
3486	NC_014158	CGTTCG	2	12	140526	140537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137885
3487	NC_014158	GGGC	2	8	140545	140552	0 %	0 %	75 %	25 %	296137885
3488	NC_014158	TGGG	2	8	140574	140581	0 %	25 %	75 %	0 %	296137885
3489	NC_014158	TGT	2	6	140602	140607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137885
3490	NC_014158	CAC	3	9	140612	140620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137885
3491	NC_014158	AAC	2	6	140649	140654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137885
3492	NC_014158	TCC	2	6	140667	140672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137885
3493	NC_014158	GTG	2	6	140694	140699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137885
3494	NC_014158	AGG	2	6	140700	140705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137885
3495	NC_014158	GAT	2	6	140738	140743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137885
3496	NC_014158	TCG	2	6	140745	140750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137885
3497	NC_014158	GGTG	2	8	140788	140795	0 %	25 %	75 %	0 %	296137885
3498	NC_014158	CCA	2	6	140815	140820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137885
3499	NC_014158	TCG	2	6	140835	140840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137885
3500	NC_014158	TTC	2	6	140901	140906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137885

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