MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 106915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014158	CCA	2	6	549383	549388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138256
13002	NC_014158	CCG	2	6	549449	549454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138256
13003	NC_014158	CCG	2	6	549462	549467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138256
13004	NC_014158	ACC	2	6	549481	549486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138256
13005	NC_014158	CGT	2	6	549542	549547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138256
13006	NC_014158	CGA	2	6	549548	549553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138256
13007	NC_014158	ACG	3	9	549566	549574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138256
13008	NC_014158	GCA	2	6	549627	549632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138256
13009	NC_014158	ACG	2	6	549661	549666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138256
13010	NC_014158	GTC	2	6	549798	549803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138257
13011	NC_014158	GTT	2	6	549812	549817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296138257
13012	NC_014158	CGGCGA	2	12	549875	549886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296138257
13013	NC_014158	CGA	2	6	549962	549967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138257
13014	NC_014158	CGC	2	6	549971	549976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138257
13015	NC_014158	TCG	2	6	549982	549987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138257
13016	NC_014158	CGGGCA	2	12	549991	550002	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296138257
13017	NC_014158	CCG	3	9	550021	550029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138257
13018	NC_014158	CGA	2	6	550037	550042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138257
13019	NC_014158	CGA	2	6	550070	550075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138257
13020	NC_014158	TGC	2	6	550111	550116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138257
13021	NC_014158	GC	3	6	550121	550126	0 %	0 %	50 %	50 %	296138257
13022	NC_014158	CCG	2	6	550133	550138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138257
13023	NC_014158	TGG	2	6	550267	550272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138257
13024	NC_014158	GCG	2	6	550282	550287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138257
13025	NC_014158	TGA	2	6	550451	550456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138257
13026	NC_014158	GCC	2	6	550461	550466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138258
13027	NC_014158	TGG	2	6	550517	550522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138258
13028	NC_014158	CTG	2	6	550531	550536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138258
13029	NC_014158	CGT	2	6	550542	550547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138258
13030	NC_014158	TCC	2	6	550556	550561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138258
13031	NC_014158	GCC	2	6	550669	550674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138258
13032	NC_014158	CGG	2	6	550728	550733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138258
13033	NC_014158	GGCC	2	8	550743	550750	0 %	0 %	50 %	50 %	296138258
13034	NC_014158	GCTC	3	12	550805	550816	0 %	25 %	25 %	50 %	296138258
13035	NC_014158	GGGCC	2	10	550833	550842	0 %	0 %	60 %	40 %	296138258
13036	NC_014158	AAC	3	9	550910	550918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296138258
13037	NC_014158	CGC	2	6	550923	550928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138258
13038	NC_014158	GC	3	6	550987	550992	0 %	0 %	50 %	50 %	296138258
13039	NC_014158	CGA	4	12	551007	551018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138258
13040	NC_014158	CTGCTC	2	12	551074	551085	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296138258
13041	NC_014158	TCG	2	6	551097	551102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138258
13042	NC_014158	GGA	2	6	551142	551147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138258
13043	NC_014158	CAC	2	6	551220	551225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138258
13044	NC_014158	CAG	2	6	551245	551250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138258
13045	NC_014158	GCG	2	6	551297	551302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138258
13046	NC_014158	CGTGCG	2	12	551307	551318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296138258
13047	NC_014158	GGT	2	6	551385	551390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138258
13048	NC_014158	CGGA	2	8	551424	551431	25 %	0 %	50 %	25 %	296138258
13049	NC_014158	GCG	2	6	551435	551440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138258
13050	NC_014158	TCGGTC	2	12	551453	551464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138258
13051	NC_014158	CG	3	6	551488	551493	0 %	0 %	50 %	50 %	296138258
13052	NC_014158	ACG	2	6	551495	551500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138258
13053	NC_014158	CGC	2	6	551559	551564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138258
13054	NC_014158	CGCGG	2	10	551641	551650	0 %	0 %	60 %	40 %	296138259
13055	NC_014158	CGC	2	6	551656	551661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138259
13056	NC_014158	GGT	2	6	551686	551691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138259
13057	NC_014158	TCG	2	6	551702	551707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138259
13058	NC_014158	CCA	2	6	551722	551727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138259
13059	NC_014158	TCC	2	6	551756	551761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138259
13060	NC_014158	GTG	2	6	551821	551826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138259
13061	NC_014158	GGT	2	6	551886	551891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138259
13062	NC_014158	TGC	2	6	551910	551915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138259
13063	NC_014158	GCT	2	6	551991	551996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138259
13064	NC_014158	GC	3	6	552047	552052	0 %	0 %	50 %	50 %	296138259
13065	NC_014158	CAG	2	6	552073	552078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138259
13066	NC_014158	TCG	2	6	552242	552247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138259
13067	NC_014158	TCA	2	6	552267	552272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296138259
13068	NC_014158	TCC	2	6	552276	552281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138260
13069	NC_014158	CGG	3	9	552332	552340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138260
13070	NC_014158	CAT	2	6	552342	552347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296138260
13071	NC_014158	GAC	2	6	552402	552407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138260
13072	NC_014158	CGC	2	6	552410	552415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138260
13073	NC_014158	AGC	2	6	552452	552457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138260
13074	NC_014158	GC	4	8	552475	552482	0 %	0 %	50 %	50 %	296138260
13075	NC_014158	CTG	2	6	552486	552491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138260
13076	NC_014158	CCG	2	6	552509	552514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138260
13077	NC_014158	CGG	2	6	552521	552526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138260
13078	NC_014158	TCC	2	6	552568	552573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138260
13079	NC_014158	TGG	2	6	552574	552579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138260
13080	NC_014158	GAA	2	6	552585	552590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296138260
13081	NC_014158	GCC	2	6	552718	552723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138260
13082	NC_014158	CGG	2	6	552821	552826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138260
13083	NC_014158	GCGA	2	8	552901	552908	25 %	0 %	50 %	25 %	296138260
13084	NC_014158	GCACC	2	10	552983	552992	20 %	0 %	20 %	60 %	296138260
13085	NC_014158	GCA	2	6	553013	553018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138260
13086	NC_014158	GGA	2	6	553022	553027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138260
13087	NC_014158	ACC	2	6	553042	553047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296138260
13088	NC_014158	CAG	2	6	553071	553076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138260
13089	NC_014158	CGC	2	6	553085	553090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138260
13090	NC_014158	GC	3	6	553218	553223	0 %	0 %	50 %	50 %	296138260
13091	NC_014158	CTC	2	6	553257	553262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296138260
13092	NC_014158	GATCCT	2	12	553287	553298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296138260
13093	NC_014158	GTTCTC	2	12	553307	553318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296138261
13094	NC_014158	CAG	2	6	553337	553342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13095	NC_014158	TGT	2	6	553345	553350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296138261
13096	NC_014158	GGC	2	6	553385	553390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138261
13097	NC_014158	TGA	2	6	553399	553404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138261
13098	NC_014158	TGC	2	6	553419	553424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13099	NC_014158	GCA	2	6	553429	553434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13100	NC_014158	CGA	2	6	553461	553466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13101	NC_014158	AGA	2	6	553474	553479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296138261
13102	NC_014158	GCC	2	6	553514	553519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138261
13103	NC_014158	CGA	2	6	553543	553548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13104	NC_014158	CGC	2	6	553622	553627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138261
13105	NC_014158	TGA	2	6	553638	553643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138261
13106	NC_014158	TGA	2	6	553672	553677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138261
13107	NC_014158	GCT	2	6	553682	553687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13108	NC_014158	AGG	2	6	553692	553697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138261
13109	NC_014158	CGA	2	6	553774	553779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13110	NC_014158	CCG	2	6	553780	553785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138261
13111	NC_014158	AGCATC	2	12	553914	553925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296138261
13112	NC_014158	AGT	2	6	553954	553959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138261
13113	NC_014158	CAG	2	6	554066	554071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13114	NC_014158	TGA	3	9	554164	554172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138261
13115	NC_014158	GCC	2	6	554193	554198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138261
13116	NC_014158	AAC	2	6	554205	554210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296138261
13117	NC_014158	TCG	2	6	554217	554222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138261
13118	NC_014158	GCG	2	6	554257	554262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138261
13119	NC_014158	GTG	2	6	554376	554381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138262
13120	NC_014158	CG	4	8	554385	554392	0 %	0 %	50 %	50 %	296138262
13121	NC_014158	GCCC	2	8	554429	554436	0 %	0 %	25 %	75 %	296138262
13122	NC_014158	GCC	2	6	554512	554517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138262
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13130	NC_014158	GGC	2	6	554906	554911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138262
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13154	NC_014158	GTA	2	6	555891	555896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138263
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13221	NC_014158	GCCG	2	8	558315	558322	0 %	0 %	50 %	50 %	296138264
13222	NC_014158	GCG	2	6	558355	558360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138264
13223	NC_014158	CGTCC	2	10	558374	558383	0 %	20 %	20 %	60 %	296138264
13224	NC_014158	GACC	2	8	558385	558392	25 %	0 %	25 %	50 %	296138264
13225	NC_014158	GCG	2	6	558449	558454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138264
13226	NC_014158	AGT	2	6	558465	558470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138264
13227	NC_014158	CAG	2	6	558495	558500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138264
13228	NC_014158	GGA	2	6	558506	558511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138264
13229	NC_014158	GCG	2	6	558610	558615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138265
13230	NC_014158	GC	3	6	558766	558771	0 %	0 %	50 %	50 %	296138265
13231	NC_014158	CG	3	6	558772	558777	0 %	0 %	50 %	50 %	296138265
13232	NC_014158	CGG	2	6	558802	558807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138265
13233	NC_014158	TCA	2	6	558911	558916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296138265
13234	NC_014158	GCC	2	6	558924	558929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138265
13235	NC_014158	CGG	2	6	558943	558948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138265
13236	NC_014158	TCG	2	6	559063	559068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138265
13237	NC_014158	TGG	2	6	559103	559108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138265
13238	NC_014158	GCG	2	6	559122	559127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138265
13239	NC_014158	TCG	2	6	559147	559152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138265
13240	NC_014158	CGA	2	6	559157	559162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138265
13241	NC_014158	TGCGCC	2	12	559203	559214	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296138265
13242	NC_014158	GAT	2	6	559251	559256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138265
13243	NC_014158	GAT	2	6	559272	559277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138265
13244	NC_014158	CGGT	2	8	559282	559289	0 %	25 %	50 %	25 %	296138265
13245	NC_014158	GCCG	2	8	559313	559320	0 %	0 %	50 %	50 %	296138265
13246	NC_014158	CTT	2	6	559587	559592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296138266
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13252	NC_014158	GTG	2	6	559801	559806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138266
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13258	NC_014158	TCG	2	6	560047	560052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138266
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13339	NC_014158	CGG	2	6	564251	564256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138271
13340	NC_014158	TCAG	2	8	564316	564323	25 %	25 %	25 %	25 %	296138271
13341	NC_014158	TAC	2	6	564336	564341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296138271
13342	NC_014158	GC	3	6	564343	564348	0 %	0 %	50 %	50 %	296138271
13343	NC_014158	GCC	2	6	564450	564455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138271
13344	NC_014158	TCA	2	6	564541	564546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296138271
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13346	NC_014158	GCT	2	6	564661	564666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138272
13347	NC_014158	ACG	2	6	564669	564674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138272
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13349	NC_014158	CGC	2	6	564752	564757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138272
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13351	NC_014158	TCG	2	6	564768	564773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138272
13352	NC_014158	TCG	2	6	564813	564818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138272
13353	NC_014158	CCG	2	6	564826	564831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138272
13354	NC_014158	CGA	2	6	564844	564849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138272
13355	NC_014158	GGC	2	6	564904	564909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138272
13356	NC_014158	CGG	3	9	564912	564920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138272
13357	NC_014158	GGC	2	6	564959	564964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138272
13358	NC_014158	GGC	2	6	565020	565025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138272
13359	NC_014158	CGG	2	6	565099	565104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138273
13360	NC_014158	TGC	2	6	565107	565112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138273
13361	NC_014158	GCA	2	6	565113	565118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138273
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13363	NC_014158	GCC	2	6	565181	565186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138273
13364	NC_014158	GGC	2	6	565189	565194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138273
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13368	NC_014158	TGC	2	6	565347	565352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138273
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13381	NC_014158	GC	3	6	565837	565842	0 %	0 %	50 %	50 %	296138273
13382	NC_014158	CG	3	6	565896	565901	0 %	0 %	50 %	50 %	296138273
13383	NC_014158	GCA	2	6	565939	565944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138273
13384	NC_014158	CGG	2	6	565972	565977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138273
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13390	NC_014158	TGC	2	6	566175	566180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138273
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13423	NC_014158	GCA	2	6	567594	567599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138275
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13425	NC_014158	CGA	2	6	567647	567652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138275
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13428	NC_014158	CGC	2	6	567754	567759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138275
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13431	NC_014158	GCG	2	6	567942	567947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138275
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13433	NC_014158	CA	3	6	568026	568031	50 %	0 %	0 %	50 %	296138275
13434	NC_014158	CGA	2	6	568050	568055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138275
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13443	NC_014158	ACA	2	6	568460	568465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296138276
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13453	NC_014158	CTG	2	6	568654	568659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138276
13454	NC_014158	TCCACG	2	12	568671	568682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296138276
13455	NC_014158	CGA	2	6	568803	568808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138276
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13457	NC_014158	ACG	2	6	568865	568870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138276
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13459	NC_014158	GAC	2	6	568978	568983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296138277
13460	NC_014158	GCC	2	6	568994	568999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296138277
13461	NC_014158	ATCG	2	8	569082	569089	25 %	25 %	25 %	25 %	296138277
13462	NC_014158	GAT	2	6	569118	569123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138277
13463	NC_014158	ATC	2	6	569176	569181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296138277
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13466	NC_014158	GAT	2	6	569271	569276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296138277
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13469	NC_014158	GGT	2	6	569325	569330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296138277
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13471	NC_014158	CG	3	6	569361	569366	0 %	0 %	50 %	50 %	296138277
13472	NC_014158	GGA	2	6	569472	569477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296138277
13473	NC_014158	GTC	2	6	569488	569493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296138277
13474	NC_014158	TCGCGA	2	12	569622	569633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296138278
13475	NC_014158	CGG	2	6	569643	569648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138278
13476	NC_014158	CGGG	2	8	569730	569737	0 %	0 %	75 %	25 %	296138278
13477	NC_014158	CGG	2	6	569742	569747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138278
13478	NC_014158	CGG	2	6	569805	569810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138278
13479	NC_014158	TCCG	2	8	569822	569829	0 %	25 %	25 %	50 %	296138278
13480	NC_014158	GCG	2	6	569846	569851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138278
13481	NC_014158	TCGC	2	8	569919	569926	0 %	25 %	25 %	50 %	296138278
13482	NC_014158	CGG	2	6	569931	569936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296138278
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13492	NC_014158	GCGG	2	8	572088	572095	0 %	0 %	75 %	25 %	296138279
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