MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 106915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_014158	CGGCC	2	10	4300733	4300742	0 %	0 %	40 %	60 %	296141842
105002	NC_014158	GCA	2	6	4300747	4300752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141842
105003	NC_014158	GCCT	2	8	4300912	4300919	0 %	25 %	25 %	50 %	296141842
105004	NC_014158	CGAT	2	8	4300951	4300958	25 %	25 %	25 %	25 %	296141842
105005	NC_014158	CGA	2	6	4300997	4301002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141842
105006	NC_014158	CGC	2	6	4301008	4301013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141842
105007	NC_014158	GGT	2	6	4301040	4301045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141842
105008	NC_014158	CGC	2	6	4301051	4301056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141842
105009	NC_014158	CGGCC	3	15	4301065	4301079	0 %	0 %	40 %	60 %	296141842
105010	NC_014158	CGG	2	6	4301080	4301085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141842
105011	NC_014158	CGC	3	9	4301101	4301109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141842
105012	NC_014158	GCG	2	6	4301115	4301120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141842
105013	NC_014158	CCCCGA	2	12	4301137	4301148	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296141842
105014	NC_014158	ACG	3	9	4301163	4301171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141843
105015	NC_014158	CGA	2	6	4301176	4301181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141843
105016	NC_014158	CGA	2	6	4301184	4301189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141843
105017	NC_014158	CCG	2	6	4301190	4301195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141843
105018	NC_014158	CCG	2	6	4301228	4301233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141843
105019	NC_014158	CGTC	2	8	4301246	4301253	0 %	25 %	25 %	50 %	296141843
105020	NC_014158	CGG	2	6	4301310	4301315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141843
105021	NC_014158	CGC	2	6	4301317	4301322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141843
105022	NC_014158	CAC	2	6	4301329	4301334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141843
105023	NC_014158	GCT	2	6	4301365	4301370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141843
105024	NC_014158	GGC	2	6	4301377	4301382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141843
105025	NC_014158	CTT	2	6	4301395	4301400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141843
105026	NC_014158	GGC	3	9	4301440	4301448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141843
105027	NC_014158	CG	3	6	4301459	4301464	0 %	0 %	50 %	50 %	296141843
105028	NC_014158	GCC	2	6	4301585	4301590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141843
105029	NC_014158	TGG	3	9	4301604	4301612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141843
105030	NC_014158	CGA	2	6	4301662	4301667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141843
105031	NC_014158	GTC	2	6	4301693	4301698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141843
105032	NC_014158	CCA	2	6	4301712	4301717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141843
105033	NC_014158	GAC	2	6	4301737	4301742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141843
105034	NC_014158	TGA	2	6	4301790	4301795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141843
105035	NC_014158	GGC	2	6	4301819	4301824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141843
105036	NC_014158	GGCGCC	2	12	4301881	4301892	0 %	0 %	50 %	50 %	296141843
105037	NC_014158	GCG	2	6	4301968	4301973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141844
105038	NC_014158	GC	3	6	4302089	4302094	0 %	0 %	50 %	50 %	296141844
105039	NC_014158	TCA	2	6	4302159	4302164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141844
105040	NC_014158	GCG	2	6	4302209	4302214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141844
105041	NC_014158	ACC	2	6	4302245	4302250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141844
105042	NC_014158	GCG	2	6	4302251	4302256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141844
105043	NC_014158	CGC	2	6	4302271	4302276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141844
105044	NC_014158	GC	4	8	4302291	4302298	0 %	0 %	50 %	50 %	296141844
105045	NC_014158	CGGA	2	8	4302339	4302346	25 %	0 %	50 %	25 %	296141844
105046	NC_014158	GCCG	2	8	4302352	4302359	0 %	0 %	50 %	50 %	296141844
105047	NC_014158	TCG	2	6	4302422	4302427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141844
105048	NC_014158	CGTC	2	8	4302450	4302457	0 %	25 %	25 %	50 %	296141844
105049	NC_014158	GGA	2	6	4302466	4302471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141844
105050	NC_014158	CGG	3	9	4302472	4302480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141844
105051	NC_014158	GGGCG	2	10	4302499	4302508	0 %	0 %	80 %	20 %	296141844
105052	NC_014158	GC	3	6	4302554	4302559	0 %	0 %	50 %	50 %	296141844
105053	NC_014158	TGA	2	6	4302606	4302611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141844
105054	NC_014158	ATC	2	6	4302689	4302694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141844
105055	NC_014158	TCCGAT	2	12	4302714	4302725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296141844
105056	NC_014158	GCT	2	6	4302744	4302749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141844
105057	NC_014158	GCC	2	6	4302857	4302862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141844
105058	NC_014158	CG	3	6	4303037	4303042	0 %	0 %	50 %	50 %	296141844
105059	NC_014158	TCC	2	6	4303071	4303076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141844
105060	NC_014158	CGCACC	2	12	4303244	4303255	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296141845
105061	NC_014158	CGG	3	9	4303276	4303284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141845
105062	NC_014158	CAC	2	6	4303367	4303372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141845
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105064	NC_014158	GTG	2	6	4303422	4303427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141845
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105066	NC_014158	CAC	2	6	4303520	4303525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141845
105067	NC_014158	ACCT	2	8	4303530	4303537	25 %	25 %	0 %	50 %	296141845
105068	NC_014158	GCCGTG	2	12	4303539	4303550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141845
105069	NC_014158	GAC	2	6	4303563	4303568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141845
105070	NC_014158	GCA	2	6	4303615	4303620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141845
105071	NC_014158	GCT	2	6	4303715	4303720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141845
105072	NC_014158	CAC	2	6	4303781	4303786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141845
105073	NC_014158	GAG	2	6	4303824	4303829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141845
105074	NC_014158	CGC	2	6	4303835	4303840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141845
105075	NC_014158	TCG	2	6	4303906	4303911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141845
105076	NC_014158	TCG	2	6	4303921	4303926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141845
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105078	NC_014158	GC	3	6	4304033	4304038	0 %	0 %	50 %	50 %	296141845
105079	NC_014158	TGG	2	6	4304059	4304064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141845
105080	NC_014158	TCC	2	6	4304080	4304085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141845
105081	NC_014158	CTG	2	6	4304244	4304249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141846
105082	NC_014158	CAC	3	9	4304304	4304312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141846
105083	NC_014158	TCAGC	2	10	4304375	4304384	20 %	20 %	20 %	40 %	296141846
105084	NC_014158	CAC	2	6	4304400	4304405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141846
105085	NC_014158	TCG	2	6	4304431	4304436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141846
105086	NC_014158	GCG	2	6	4304476	4304481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141846
105087	NC_014158	CCT	2	6	4304495	4304500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141846
105088	NC_014158	CGC	2	6	4304516	4304521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141846
105089	NC_014158	GAT	2	6	4304526	4304531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141846
105090	NC_014158	CTC	2	6	4304568	4304573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141846
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105093	NC_014158	GTT	2	6	4304640	4304645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141846
105094	NC_014158	CAT	2	6	4304658	4304663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141846
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105096	NC_014158	CG	4	8	4304732	4304739	0 %	0 %	50 %	50 %	296141846
105097	NC_014158	ACC	2	6	4304752	4304757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141846
105098	NC_014158	GCA	2	6	4304882	4304887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141846
105099	NC_014158	TCGC	2	8	4304893	4304900	0 %	25 %	25 %	50 %	296141846
105100	NC_014158	GCG	2	6	4304905	4304910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141846
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105104	NC_014158	ATG	2	6	4305265	4305270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141846
105105	NC_014158	ACCG	2	8	4305339	4305346	25 %	0 %	25 %	50 %	296141846
105106	NC_014158	CCA	2	6	4305419	4305424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141846
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105109	NC_014158	GCC	2	6	4305553	4305558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141846
105110	NC_014158	CGCC	2	8	4305602	4305609	0 %	0 %	25 %	75 %	296141846
105111	NC_014158	CCT	2	6	4305677	4305682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141846
105112	NC_014158	CTC	2	6	4305774	4305779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141846
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105114	NC_014158	CG	3	6	4305967	4305972	0 %	0 %	50 %	50 %	296141847
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