MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 106915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014158	AGG	2	6	220838	220843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137957
5502	NC_014158	CGG	2	6	220884	220889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137957
5503	NC_014158	GCC	2	6	220907	220912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137957
5504	NC_014158	AAC	2	6	220922	220927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137957
5505	NC_014158	AGC	2	6	220943	220948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5506	NC_014158	GAT	2	6	220960	220965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137957
5507	NC_014158	CCA	2	6	221022	221027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137957
5508	NC_014158	AGC	2	6	221042	221047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5509	NC_014158	GCG	2	6	221051	221056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137957
5510	NC_014158	GCCG	2	8	221085	221092	0 %	0 %	50 %	50 %	296137957
5511	NC_014158	AGC	2	6	221150	221155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5512	NC_014158	CGA	2	6	221196	221201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5513	NC_014158	CAG	2	6	221221	221226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5514	NC_014158	GGT	2	6	221230	221235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137957
5515	NC_014158	GC	3	6	221295	221300	0 %	0 %	50 %	50 %	296137957
5516	NC_014158	GC	3	6	221322	221327	0 %	0 %	50 %	50 %	296137957
5517	NC_014158	CGG	2	6	221391	221396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137957
5518	NC_014158	AGG	2	6	221405	221410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137957
5519	NC_014158	GAC	2	6	221461	221466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5520	NC_014158	TTC	2	6	221522	221527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137957
5521	NC_014158	GCC	2	6	221651	221656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137958
5522	NC_014158	CGG	2	6	221676	221681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137958
5523	NC_014158	CGC	2	6	221722	221727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137958
5524	NC_014158	CGA	2	6	221860	221865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137958
5525	NC_014158	GC	3	6	221869	221874	0 %	0 %	50 %	50 %	296137958
5526	NC_014158	GGT	2	6	221938	221943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137958
5527	NC_014158	CGC	2	6	221953	221958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137958
5528	NC_014158	CGGCTG	2	12	221975	221986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296137958
5529	NC_014158	CGC	2	6	222013	222018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137958
5530	NC_014158	TCGCCG	2	12	222033	222044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296137958
5531	NC_014158	CTG	2	6	222098	222103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137958
5532	NC_014158	ATC	2	6	222135	222140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137958
5533	NC_014158	ACG	2	6	222201	222206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137958
5534	NC_014158	ACC	2	6	222284	222289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137958
5535	NC_014158	TCG	2	6	222312	222317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137958
5536	NC_014158	CG	4	8	222316	222323	0 %	0 %	50 %	50 %	296137958
5537	NC_014158	TAC	2	6	222339	222344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137958
5538	NC_014158	TG	3	6	222391	222396	0 %	50 %	50 %	0 %	296137958
5539	NC_014158	CGCGC	2	10	222403	222412	0 %	0 %	40 %	60 %	296137958
5540	NC_014158	GCT	2	6	222478	222483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137958
5541	NC_014158	CGG	2	6	222492	222497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137958
5542	NC_014158	AGCG	2	8	222552	222559	25 %	0 %	50 %	25 %	296137959
5543	NC_014158	GC	3	6	222671	222676	0 %	0 %	50 %	50 %	296137959
5544	NC_014158	TCG	2	6	222694	222699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137959
5545	NC_014158	CTGCG	2	10	222701	222710	0 %	20 %	40 %	40 %	296137959
5546	NC_014158	CCAGCG	2	12	222830	222841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296137959
5547	NC_014158	CAG	2	6	222843	222848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137959
5548	NC_014158	AGT	2	6	222931	222936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137959
5549	NC_014158	GCG	2	6	222937	222942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137959
5550	NC_014158	TCA	2	6	222947	222952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137959
5551	NC_014158	GAA	2	6	223023	223028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137959
5552	NC_014158	CGG	2	6	223094	223099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137959
5553	NC_014158	TGC	2	6	223137	223142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137959
5554	NC_014158	CAGC	2	8	223145	223152	25 %	0 %	25 %	50 %	296137959
5555	NC_014158	GCC	2	6	223167	223172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137959
5556	NC_014158	GCG	2	6	223175	223180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137959
5557	NC_014158	CGG	2	6	223199	223204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137959
5558	NC_014158	CGC	2	6	223212	223217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137959
5559	NC_014158	CGG	2	6	223245	223250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137959
5560	NC_014158	TCG	2	6	223252	223257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137959
5561	NC_014158	AGG	2	6	223319	223324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137959
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5564	NC_014158	CAC	2	6	223488	223493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137959
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5566	NC_014158	CAG	2	6	223572	223577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137959
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5569	NC_014158	GCG	2	6	223610	223615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137959
5570	NC_014158	CCAC	2	8	223634	223641	25 %	0 %	0 %	75 %	296137959
5571	NC_014158	CCCA	2	8	223645	223652	25 %	0 %	0 %	75 %	296137959
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5603	NC_014158	GTG	2	6	224541	224546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137960
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5617	NC_014158	CG	3	6	225173	225178	0 %	0 %	50 %	50 %	296137960
5618	NC_014158	CGA	2	6	225212	225217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137960
5619	NC_014158	GAC	2	6	225228	225233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137960
5620	NC_014158	GCG	2	6	225243	225248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137960
5621	NC_014158	CGC	2	6	225254	225259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137960
5622	NC_014158	CCG	2	6	225382	225387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137961
5623	NC_014158	GCT	2	6	225396	225401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137961
5624	NC_014158	AGG	2	6	225524	225529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137961
5625	NC_014158	CCT	2	6	225530	225535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137961
5626	NC_014158	AGC	2	6	225547	225552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137961
5627	NC_014158	CGG	2	6	225567	225572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137961
5628	NC_014158	TCG	2	6	225587	225592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137961
5629	NC_014158	GTG	2	6	225593	225598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137961
5630	NC_014158	TGG	2	6	225611	225616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137961
5631	NC_014158	CGC	2	6	225642	225647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137961
5632	NC_014158	CCTCGT	2	12	225664	225675	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296137962
5633	NC_014158	GCT	2	6	225685	225690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5634	NC_014158	CGCTG	2	10	225827	225836	0 %	20 %	40 %	40 %	296137962
5635	NC_014158	CG	3	6	225843	225848	0 %	0 %	50 %	50 %	296137962
5636	NC_014158	ACG	2	6	225858	225863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5637	NC_014158	GCA	2	6	225889	225894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5638	NC_014158	ATCG	2	8	225938	225945	25 %	25 %	25 %	25 %	296137962
5639	NC_014158	CGG	2	6	226000	226005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137962
5640	NC_014158	TCG	2	6	226011	226016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5641	NC_014158	GCG	2	6	226017	226022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137962
5642	NC_014158	TCG	2	6	226032	226037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5643	NC_014158	TGA	2	6	226048	226053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137962
5644	NC_014158	CCG	2	6	226065	226070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137962
5645	NC_014158	CAG	2	6	226106	226111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5646	NC_014158	CCA	2	6	226159	226164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137962
5647	NC_014158	TCG	2	6	226186	226191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5648	NC_014158	CTC	2	6	226205	226210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137962
5649	NC_014158	TCA	2	6	226225	226230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137962
5650	NC_014158	CGC	3	9	226241	226249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137962
5651	NC_014158	GCC	3	9	226255	226263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137962
5652	NC_014158	CGT	2	6	226330	226335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5653	NC_014158	CG	3	6	226341	226346	0 %	0 %	50 %	50 %	296137962
5654	NC_014158	ATC	2	6	226365	226370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137962
5655	NC_014158	CAC	2	6	226427	226432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137962
5656	NC_014158	CAGCG	2	10	226463	226472	20 %	0 %	40 %	40 %	296137962
5657	NC_014158	CGT	2	6	226492	226497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5658	NC_014158	GTC	3	9	226517	226525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137962
5659	NC_014158	CCG	2	6	226543	226548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137962
5660	NC_014158	CCA	2	6	226553	226558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137962
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5665	NC_014158	GC	3	6	226775	226780	0 %	0 %	50 %	50 %	296137963
5666	NC_014158	GGC	2	6	226805	226810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137963
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5672	NC_014158	CTA	2	6	227135	227140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137963
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5674	NC_014158	TCG	2	6	227158	227163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137963
5675	NC_014158	GCA	2	6	227272	227277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137963
5676	NC_014158	TGA	2	6	227287	227292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137963
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5679	NC_014158	GCC	2	6	227321	227326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137963
5680	NC_014158	CTG	2	6	227358	227363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137963
5681	NC_014158	G	6	6	227427	227432	0 %	0 %	100 %	0 %	296137963
5682	NC_014158	CG	3	6	227448	227453	0 %	0 %	50 %	50 %	296137963
5683	NC_014158	CCG	2	6	227465	227470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137963
5684	NC_014158	GGA	2	6	227474	227479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137963
5685	NC_014158	CGATG	2	10	227492	227501	20 %	20 %	40 %	20 %	296137963
5686	NC_014158	GCG	2	6	227517	227522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137963
5687	NC_014158	GAG	2	6	227535	227540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137963
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5689	NC_014158	CCA	2	6	227572	227577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137963
5690	NC_014158	TAC	2	6	227610	227615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137963
5691	NC_014158	CCGGC	2	10	227627	227636	0 %	0 %	40 %	60 %	296137963
5692	NC_014158	GTG	2	6	227658	227663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137963
5693	NC_014158	CCG	3	9	227680	227688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137963
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5700	NC_014158	GGC	2	6	228060	228065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137963
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5703	NC_014158	CGGG	2	8	228174	228181	0 %	0 %	75 %	25 %	296137964
5704	NC_014158	TGC	2	6	228218	228223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137964
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5708	NC_014158	CGC	2	6	228345	228350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137964
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5712	NC_014158	ATC	2	6	228472	228477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137964
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5718	NC_014158	ACGAC	2	10	228727	228736	40 %	0 %	20 %	40 %	296137965
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5720	NC_014158	TCG	2	6	228775	228780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137965
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5722	NC_014158	GCT	2	6	228827	228832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137965
5723	NC_014158	ACG	2	6	228880	228885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137965
5724	NC_014158	GCGCG	2	10	228914	228923	0 %	0 %	60 %	40 %	296137965
5725	NC_014158	GCC	2	6	228935	228940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137965
5726	NC_014158	CCGC	2	8	228946	228953	0 %	0 %	25 %	75 %	296137965
5727	NC_014158	GC	3	6	228952	228957	0 %	0 %	50 %	50 %	296137965
5728	NC_014158	CGAGCA	2	12	228971	228982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137965
5729	NC_014158	GGT	2	6	228983	228988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137965
5730	NC_014158	GTC	2	6	229016	229021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137965
5731	NC_014158	AGG	2	6	229027	229032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137965
5732	NC_014158	GCCG	2	8	229071	229078	0 %	0 %	50 %	50 %	296137965
5733	NC_014158	CCAG	2	8	229081	229088	25 %	0 %	25 %	50 %	296137965
5734	NC_014158	CGA	2	6	229151	229156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137965
5735	NC_014158	ACT	2	6	229228	229233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137965
5736	NC_014158	ACC	2	6	229242	229247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137965
5737	NC_014158	GTG	2	6	229313	229318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137965
5738	NC_014158	GCT	2	6	229379	229384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137965
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5740	NC_014158	CTT	2	6	229439	229444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137965
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5861	NC_014158	GTC	2	6	235636	235641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137971
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5965	NC_014158	CAG	2	6	239791	239796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137974
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5975	NC_014158	CAGT	2	8	240274	240281	25 %	25 %	25 %	25 %	296137975
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5978	NC_014158	TGCAG	2	10	240370	240379	20 %	20 %	40 %	20 %	296137975
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