MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 106915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014158	GGCG	2	8	201136	201143	0 %	0 %	75 %	25 %	296137937
5002	NC_014158	TGA	2	6	201171	201176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137937
5003	NC_014158	CGC	2	6	201250	201255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137937
5004	NC_014158	TGG	2	6	201258	201263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137937
5005	NC_014158	GCG	2	6	201338	201343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137938
5006	NC_014158	GCC	2	6	201384	201389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137938
5007	NC_014158	CAC	2	6	201411	201416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137938
5008	NC_014158	GCG	2	6	201427	201432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137938
5009	NC_014158	CCG	2	6	201433	201438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137938
5010	NC_014158	CAC	2	6	201528	201533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137938
5011	NC_014158	GCCG	2	8	201720	201727	0 %	0 %	50 %	50 %	296137938
5012	NC_014158	AGC	3	9	201739	201747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137938
5013	NC_014158	CGG	2	6	201749	201754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137938
5014	NC_014158	GAC	2	6	201765	201770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137938
5015	NC_014158	GAC	2	6	201789	201794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137938
5016	NC_014158	GGT	2	6	201816	201821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137938
5017	NC_014158	TCG	2	6	201832	201837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137938
5018	NC_014158	GCC	2	6	201840	201845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137938
5019	NC_014158	CGC	2	6	201861	201866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137938
5020	NC_014158	CGG	2	6	201877	201882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137938
5021	NC_014158	GGAC	2	8	202045	202052	25 %	0 %	50 %	25 %	296137939
5022	NC_014158	GCC	2	6	202094	202099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137939
5023	NC_014158	ACG	2	6	202166	202171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137939
5024	NC_014158	CTG	2	6	202250	202255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137939
5025	NC_014158	CAC	2	6	202303	202308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137939
5026	NC_014158	CT	4	8	202325	202332	0 %	50 %	0 %	50 %	296137939
5027	NC_014158	GCT	2	6	202333	202338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137939
5028	NC_014158	GCC	2	6	202391	202396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137939
5029	NC_014158	CG	3	6	202398	202403	0 %	0 %	50 %	50 %	296137939
5030	NC_014158	CGG	2	6	202414	202419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137939
5031	NC_014158	TCG	2	6	202434	202439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137939
5032	NC_014158	CGG	2	6	202444	202449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137939
5033	NC_014158	GC	3	6	202477	202482	0 %	0 %	50 %	50 %	296137939
5034	NC_014158	GTG	2	6	202538	202543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137939
5035	NC_014158	CGA	2	6	202561	202566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137939
5036	NC_014158	GTG	2	6	202589	202594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137939
5037	NC_014158	GGC	2	6	202597	202602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137939
5038	NC_014158	CCG	2	6	202611	202616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137939
5039	NC_014158	GC	3	6	202692	202697	0 %	0 %	50 %	50 %	296137939
5040	NC_014158	ACC	2	6	202791	202796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137939
5041	NC_014158	ATC	2	6	202820	202825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137939
5042	NC_014158	CGC	2	6	202827	202832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137939
5043	NC_014158	CCG	2	6	202844	202849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137939
5044	NC_014158	GCCC	2	8	202861	202868	0 %	0 %	25 %	75 %	296137939
5045	NC_014158	GGT	2	6	202927	202932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137939
5046	NC_014158	CGA	2	6	202995	203000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137940
5047	NC_014158	TCA	2	6	203009	203014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137940
5048	NC_014158	GCC	2	6	203180	203185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137940
5049	NC_014158	CAG	2	6	203235	203240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137940
5050	NC_014158	GCGG	2	8	203271	203278	0 %	0 %	75 %	25 %	296137940
5051	NC_014158	ACCG	2	8	203296	203303	25 %	0 %	25 %	50 %	296137940
5052	NC_014158	GAG	2	6	203323	203328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137940
5053	NC_014158	GC	3	6	203358	203363	0 %	0 %	50 %	50 %	296137940
5054	NC_014158	ATC	2	6	203700	203705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137941
5055	NC_014158	GCC	2	6	203742	203747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5056	NC_014158	CGA	2	6	203755	203760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5057	NC_014158	GGT	2	6	203792	203797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137941
5058	NC_014158	TCC	2	6	203823	203828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137941
5059	NC_014158	GAC	2	6	203835	203840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5060	NC_014158	CGC	2	6	203879	203884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5061	NC_014158	GTG	2	6	203889	203894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137941
5062	NC_014158	CGG	2	6	203914	203919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137941
5063	NC_014158	TCCG	2	8	203935	203942	0 %	25 %	25 %	50 %	296137941
5064	NC_014158	CG	4	8	204052	204059	0 %	0 %	50 %	50 %	296137941
5065	NC_014158	GATG	2	8	204065	204072	25 %	25 %	50 %	0 %	296137941
5066	NC_014158	CGT	2	6	204110	204115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5067	NC_014158	GCG	2	6	204120	204125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137941
5068	NC_014158	TTC	2	6	204141	204146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137941
5069	NC_014158	CCG	3	9	204160	204168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5070	NC_014158	GCC	2	6	204176	204181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5071	NC_014158	CGC	2	6	204221	204226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5072	NC_014158	TGC	2	6	204233	204238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5073	NC_014158	GCTC	2	8	204241	204248	0 %	25 %	25 %	50 %	296137941
5074	NC_014158	TGGG	2	8	204307	204314	0 %	25 %	75 %	0 %	296137941
5075	NC_014158	CGA	2	6	204332	204337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5076	NC_014158	GAC	3	9	204378	204386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5077	NC_014158	CAT	2	6	204437	204442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137941
5078	NC_014158	CAC	2	6	204446	204451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137941
5079	NC_014158	GCC	2	6	204466	204471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5080	NC_014158	ATC	2	6	204483	204488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137941
5081	NC_014158	TCG	2	6	204529	204534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5082	NC_014158	CGG	2	6	204551	204556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137941
5083	NC_014158	CAT	2	6	204611	204616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137941
5084	NC_014158	GAC	2	6	204637	204642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5085	NC_014158	GTG	2	6	204678	204683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137941
5086	NC_014158	GCT	2	6	204695	204700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5087	NC_014158	GA	3	6	204778	204783	50 %	0 %	50 %	0 %	296137941
5088	NC_014158	GCC	3	9	204791	204799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5089	NC_014158	CGG	2	6	204814	204819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137941
5090	NC_014158	GCC	2	6	204828	204833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5091	NC_014158	CGC	2	6	204836	204841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137941
5092	NC_014158	GCAGGC	2	12	204842	204853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137941
5093	NC_014158	AGC	2	6	204865	204870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137941
5094	NC_014158	CCA	2	6	204883	204888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137941
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5096	NC_014158	CCCGA	2	10	204945	204954	20 %	0 %	20 %	60 %	296137941
5097	NC_014158	CTA	2	6	204998	205003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137941
5098	NC_014158	CAC	2	6	205020	205025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137941
5099	NC_014158	TGA	2	6	205042	205047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137941
5100	NC_014158	GTG	2	6	205077	205082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137941
5101	NC_014158	CAT	2	6	205088	205093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137941
5102	NC_014158	AAC	2	6	205107	205112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296137941
5103	NC_014158	CGG	2	6	205169	205174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137941
5104	NC_014158	CCG	2	6	205247	205252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137942
5105	NC_014158	TCG	2	6	205259	205264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5106	NC_014158	GCT	2	6	205269	205274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5107	NC_014158	GGCT	2	8	205324	205331	0 %	25 %	50 %	25 %	296137942
5108	NC_014158	CATCGC	2	12	205353	205364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296137942
5109	NC_014158	GCGCTC	2	12	205375	205386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296137942
5110	NC_014158	TGG	2	6	205424	205429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137942
5111	NC_014158	TGC	2	6	205511	205516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5112	NC_014158	TCG	2	6	205523	205528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5113	NC_014158	CGC	2	6	205533	205538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137942
5114	NC_014158	TCG	2	6	205544	205549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5115	NC_014158	CCA	2	6	205629	205634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137942
5116	NC_014158	GT	3	6	205652	205657	0 %	50 %	50 %	0 %	296137942
5117	NC_014158	TCG	2	6	205688	205693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5118	NC_014158	TGC	2	6	205736	205741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5119	NC_014158	CAG	2	6	205813	205818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5120	NC_014158	GCT	2	6	205824	205829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5121	NC_014158	CTG	2	6	205852	205857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5122	NC_014158	TCG	2	6	205871	205876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5123	NC_014158	CGG	3	9	205884	205892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137942
5124	NC_014158	GTG	2	6	205906	205911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137942
5125	NC_014158	GGC	2	6	205938	205943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137942
5126	NC_014158	CTG	2	6	205975	205980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5127	NC_014158	CAT	2	6	206028	206033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137942
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5129	NC_014158	GCT	2	6	206157	206162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5130	NC_014158	CGT	2	6	206178	206183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5131	NC_014158	GGCGCA	2	12	206211	206222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296137942
5132	NC_014158	ATCC	2	8	206284	206291	25 %	25 %	0 %	50 %	296137942
5133	NC_014158	TGC	2	6	206324	206329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137942
5134	NC_014158	GATG	2	8	206367	206374	25 %	25 %	50 %	0 %	296137942
5135	NC_014158	GAT	2	6	206383	206388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137942
5136	NC_014158	GTG	2	6	206404	206409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137942
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5140	NC_014158	CGG	2	6	206839	206844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137943
5141	NC_014158	GCC	2	6	206853	206858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137943
5142	NC_014158	TCG	2	6	206880	206885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137943
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5149	NC_014158	CGG	2	6	207061	207066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137943
5150	NC_014158	ACCG	2	8	207072	207079	25 %	0 %	25 %	50 %	296137943
5151	NC_014158	GGTCC	2	10	207107	207116	0 %	20 %	40 %	40 %	296137943
5152	NC_014158	CGG	2	6	207136	207141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137943
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5185	NC_014158	CGG	2	6	208180	208185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137945
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5188	NC_014158	GCCGG	2	10	208344	208353	0 %	0 %	60 %	40 %	296137945
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5202	NC_014158	CGCAT	2	10	208750	208759	20 %	20 %	20 %	40 %	296137945
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5238	NC_014158	GGTGCG	2	12	210128	210139	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296137946
5239	NC_014158	GGCC	2	8	210147	210154	0 %	0 %	50 %	50 %	296137946
5240	NC_014158	TTC	3	9	210168	210176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137946
5241	NC_014158	CGGC	2	8	210215	210222	0 %	0 %	50 %	50 %	296137946
5242	NC_014158	GCC	2	6	210226	210231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137946
5243	NC_014158	CGA	2	6	210233	210238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137946
5244	NC_014158	GGA	2	6	210263	210268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137946
5245	NC_014158	GCC	2	6	210285	210290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137946
5246	NC_014158	TCT	2	6	210293	210298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137946
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5248	NC_014158	ACG	2	6	210400	210405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137946
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5250	NC_014158	CG	3	6	210453	210458	0 %	0 %	50 %	50 %	296137946
5251	NC_014158	GTC	2	6	210492	210497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137947
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5255	NC_014158	CGGTCC	2	12	210559	210570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296137947
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5265	NC_014158	CG	3	6	210975	210980	0 %	0 %	50 %	50 %	296137947
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5271	NC_014158	CGA	2	6	211232	211237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137947
5272	NC_014158	GAGT	2	8	211240	211247	25 %	25 %	50 %	0 %	296137947
5273	NC_014158	CGG	3	9	211255	211263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137947
5274	NC_014158	GC	3	6	211340	211345	0 %	0 %	50 %	50 %	296137948
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5322	NC_014158	TCG	2	6	213303	213308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137951
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5364	NC_014158	GCG	2	6	214998	215003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137951
5365	NC_014158	TCG	2	6	215007	215012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137951
5366	NC_014158	TGC	2	6	215017	215022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137951
5367	NC_014158	TCGAGG	2	12	215034	215045	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296137951
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5369	NC_014158	CTC	2	6	215069	215074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137951
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5373	NC_014158	GTA	2	6	215345	215350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137951
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5379	NC_014158	TAC	2	6	215971	215976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137952
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5383	NC_014158	GTG	2	6	216100	216105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137952
5384	NC_014158	GCT	2	6	216129	216134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137952
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5401	NC_014158	CGG	2	6	216764	216769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137953
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5403	NC_014158	CGC	2	6	216792	216797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137953
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5453	NC_014158	GC	3	6	218997	219002	0 %	0 %	50 %	50 %	296137955
5454	NC_014158	TGG	2	6	219027	219032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137955
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5457	NC_014158	CATCA	2	10	219166	219175	40 %	20 %	0 %	40 %	296137955
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5460	NC_014158	CGA	2	6	219258	219263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137955
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5466	NC_014158	CCAC	2	8	219516	219523	25 %	0 %	0 %	75 %	296137955
5467	NC_014158	CCG	2	6	219524	219529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137955
5468	NC_014158	CGATCT	2	12	219534	219545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296137955
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5470	NC_014158	GCG	3	9	219626	219634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137955
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5472	NC_014158	GAG	2	6	219755	219760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137955
5473	NC_014158	CGT	2	6	219768	219773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137955
5474	NC_014158	GCCG	2	8	219783	219790	0 %	0 %	50 %	50 %	296137955
5475	NC_014158	CAG	2	6	219972	219977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5476	NC_014158	GC	3	6	219979	219984	0 %	0 %	50 %	50 %	296137956
5477	NC_014158	CTCGAT	2	12	219994	220005	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296137956
5478	NC_014158	ACG	2	6	220043	220048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5479	NC_014158	CG	4	8	220047	220054	0 %	0 %	50 %	50 %	296137956
5480	NC_014158	GGA	2	6	220086	220091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296137956
5481	NC_014158	GGCC	2	8	220100	220107	0 %	0 %	50 %	50 %	296137956
5482	NC_014158	CGA	2	6	220113	220118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5483	NC_014158	CTG	2	6	220120	220125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5484	NC_014158	GCT	2	6	220128	220133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5485	NC_014158	CCCGC	2	10	220271	220280	0 %	0 %	20 %	80 %	296137956
5486	NC_014158	GCC	2	6	220285	220290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137956
5487	NC_014158	CGC	2	6	220302	220307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137956
5488	NC_014158	GAA	2	6	220318	220323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296137956
5489	NC_014158	AACG	2	8	220377	220384	50 %	0 %	25 %	25 %	296137956
5490	NC_014158	CTC	2	6	220420	220425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137956
5491	NC_014158	CGC	2	6	220479	220484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137956
5492	NC_014158	GCT	2	6	220503	220508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5493	NC_014158	CGA	2	6	220518	220523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5494	NC_014158	CCG	2	6	220544	220549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137956
5495	NC_014158	CTC	2	6	220564	220569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296137956
5496	NC_014158	CG	3	6	220571	220576	0 %	0 %	50 %	50 %	296137956
5497	NC_014158	CGA	2	6	220635	220640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137956
5498	NC_014158	CAG	2	6	220711	220716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5499	NC_014158	GAC	2	6	220787	220792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137957
5500	NC_014158	CCGG	2	8	220805	220812	0 %	0 %	50 %	50 %	296137957

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