MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014153	GCA	2	6	453	458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134505
2	NC_014153	TGC	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134505
3	NC_014153	CGC	2	6	501	506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134505
4	NC_014153	TCC	2	6	523	528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134505
5	NC_014153	C	6	6	527	532	0 %	0 %	0 %	100 %	296134505
6	NC_014153	GC	4	8	611	618	0 %	0 %	50 %	50 %	296134505
7	NC_014153	GTC	2	6	647	652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134505
8	NC_014153	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134505
9	NC_014153	CCG	2	6	779	784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134505
10	NC_014153	CCACG	2	10	786	795	20 %	0 %	20 %	60 %	296134505
11	NC_014153	GA	3	6	837	842	50 %	0 %	50 %	0 %	296134505
12	NC_014153	CGC	2	6	936	941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134505
13	NC_014153	CGG	2	6	996	1001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134505
14	NC_014153	GCT	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134505
15	NC_014153	GC	4	8	1067	1074	0 %	0 %	50 %	50 %	296134505
16	NC_014153	GTG	2	6	1111	1116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134505
17	NC_014153	CTA	2	6	1155	1160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134505
18	NC_014153	CTCG	2	8	1164	1171	0 %	25 %	25 %	50 %	296134505
19	NC_014153	CTG	3	9	1174	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134505
20	NC_014153	CGA	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134505
21	NC_014153	AAGAC	2	10	1211	1220	60 %	0 %	20 %	20 %	296134505
22	NC_014153	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134505
23	NC_014153	CTG	2	6	1399	1404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134505
24	NC_014153	GAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134505
25	NC_014153	T	6	6	1450	1455	0 %	100 %	0 %	0 %	296134505
26	NC_014153	GC	3	6	1496	1501	0 %	0 %	50 %	50 %	296134505
27	NC_014153	CTG	2	6	1579	1584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134505
28	NC_014153	GTCG	2	8	1605	1612	0 %	25 %	50 %	25 %	296134505
29	NC_014153	CAC	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134505
30	NC_014153	TGC	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134505
31	NC_014153	CAAC	2	8	1845	1852	50 %	0 %	0 %	50 %	296134505
32	NC_014153	AGAA	2	8	2131	2138	75 %	0 %	25 %	0 %	296134506
33	NC_014153	TGA	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134506
34	NC_014153	TCG	2	6	2199	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134506
35	NC_014153	GCC	2	6	2208	2213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134506
36	NC_014153	TCA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134506
37	NC_014153	GCT	2	6	2368	2373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134506
38	NC_014153	GC	3	6	2383	2388	0 %	0 %	50 %	50 %	296134506
39	NC_014153	GCC	2	6	2444	2449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134506
40	NC_014153	AGA	2	6	2482	2487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134506
41	NC_014153	CGAC	2	8	2508	2515	25 %	0 %	25 %	50 %	296134506
42	NC_014153	GCT	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134506
43	NC_014153	GCA	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134506
44	NC_014153	CTA	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134506
45	NC_014153	TGT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134506
46	NC_014153	GCA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134506
47	NC_014153	TGG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134506
48	NC_014153	GCG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134506
49	NC_014153	GCC	2	6	2760	2765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134506
50	NC_014153	GAC	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134506
51	NC_014153	GC	3	6	2819	2824	0 %	0 %	50 %	50 %	296134506
52	NC_014153	CGT	2	6	2890	2895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134506
53	NC_014153	TGC	2	6	2916	2921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134506
54	NC_014153	GGC	2	6	2944	2949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134506
55	NC_014153	AAG	3	9	3048	3056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134506
56	NC_014153	GAA	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134506
57	NC_014153	CGG	2	6	3082	3087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134506
58	NC_014153	CAG	2	6	3184	3189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134506
59	NC_014153	CGA	2	6	3208	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134506
60	NC_014153	TGA	2	6	3367	3372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134507
61	NC_014153	GAA	2	6	3380	3385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134507
62	NC_014153	CAT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134507
63	NC_014153	GTC	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
64	NC_014153	CGA	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
65	NC_014153	TGA	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134507
66	NC_014153	TCG	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
67	NC_014153	AGCGC	2	10	3652	3661	20 %	0 %	40 %	40 %	296134507
68	NC_014153	CGG	2	6	3728	3733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134507
69	NC_014153	GGCGTG	2	12	3741	3752	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296134507
70	NC_014153	GCG	2	6	3794	3799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134507
71	NC_014153	GC	3	6	3835	3840	0 %	0 %	50 %	50 %	296134507
72	NC_014153	GAT	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134507
73	NC_014153	CAC	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134507
74	NC_014153	TCCT	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	296134507
75	NC_014153	TGG	2	6	4039	4044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134507
76	NC_014153	GAA	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134507
77	NC_014153	CGG	2	6	4082	4087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134507
78	NC_014153	TGC	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
79	NC_014153	T	6	6	4144	4149	0 %	100 %	0 %	0 %	296134507
80	NC_014153	GCA	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
81	NC_014153	ACG	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
82	NC_014153	CAA	2	6	4250	4255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134507
83	NC_014153	CGG	2	6	4271	4276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134507
84	NC_014153	CACC	2	8	4277	4284	25 %	0 %	0 %	75 %	296134507
85	NC_014153	GC	3	6	4295	4300	0 %	0 %	50 %	50 %	296134507
86	NC_014153	TGA	2	6	4315	4320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134507
87	NC_014153	CGA	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
88	NC_014153	A	6	6	4350	4355	100 %	0 %	0 %	0 %	296134507
89	NC_014153	GCG	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134507
90	NC_014153	CAG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
91	NC_014153	TGG	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134507
92	NC_014153	CGAC	2	8	4534	4541	25 %	0 %	25 %	50 %	296134507
93	NC_014153	ATC	2	6	4548	4553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134507
94	NC_014153	ATC	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134507
95	NC_014153	CGC	2	6	4571	4576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134507
96	NC_014153	CG	3	6	4592	4597	0 %	0 %	50 %	50 %	296134507
97	NC_014153	GC	3	6	4602	4607	0 %	0 %	50 %	50 %	296134507
98	NC_014153	CGC	2	6	4617	4622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134507
99	NC_014153	TGG	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134507
100	NC_014153	CCG	2	6	4720	4725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134507
101	NC_014153	CAAG	2	8	4736	4743	50 %	0 %	25 %	25 %	296134507
102	NC_014153	GCT	2	6	4820	4825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
103	NC_014153	TCA	2	6	4849	4854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134507
104	NC_014153	ACC	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134507
105	NC_014153	CAT	4	12	4916	4927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134507
106	NC_014153	GC	3	6	4948	4953	0 %	0 %	50 %	50 %	296134507
107	NC_014153	CTG	2	6	4965	4970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
108	NC_014153	TCT	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134507
109	NC_014153	GCC	2	6	5033	5038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134507
110	NC_014153	CTG	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
111	NC_014153	AAC	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134507
112	NC_014153	TCGC	2	8	5188	5195	0 %	25 %	25 %	50 %	296134507
113	NC_014153	GC	3	6	5258	5263	0 %	0 %	50 %	50 %	296134507
114	NC_014153	TCG	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
115	NC_014153	GTC	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
116	NC_014153	GCG	2	6	5298	5303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134507
117	NC_014153	CGATG	2	10	5315	5324	20 %	20 %	40 %	20 %	296134507
118	NC_014153	CGT	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
119	NC_014153	CAC	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134507
120	NC_014153	CGC	2	6	5528	5533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134507
121	NC_014153	GCG	2	6	5546	5551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134507
122	NC_014153	GCC	2	6	5577	5582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134507
123	NC_014153	GCC	2	6	5641	5646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134507
124	NC_014153	ACC	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134507
125	NC_014153	CTG	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134507
126	NC_014153	CGA	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
127	NC_014153	CCGA	2	8	5755	5762	25 %	0 %	25 %	50 %	296134507
128	NC_014153	CGA	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
129	NC_014153	GCGG	2	8	5828	5835	0 %	0 %	75 %	25 %	296134507
130	NC_014153	GAC	2	6	5851	5856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134507
131	NC_014153	CAT	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134508
132	NC_014153	GCTG	2	8	6242	6249	0 %	25 %	50 %	25 %	296134508
133	NC_014153	GCA	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134508
134	NC_014153	CGC	2	6	6282	6287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134508
135	NC_014153	CTG	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134508
136	NC_014153	TGG	2	6	6352	6357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134508
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141	NC_014153	GCGA	2	8	6504	6511	25 %	0 %	50 %	25 %	296134508
142	NC_014153	GTG	2	6	6603	6608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134508
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163	NC_014153	CGG	2	6	7550	7555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134508
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177	NC_014153	CG	3	6	8362	8367	0 %	0 %	50 %	50 %	296134509
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261	NC_014153	GAAA	2	8	12244	12251	75 %	0 %	25 %	0 %	296134511
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263	NC_014153	CGC	2	6	12292	12297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134511
264	NC_014153	GC	3	6	12296	12301	0 %	0 %	50 %	50 %	296134511
265	NC_014153	GCC	2	6	12324	12329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134511
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382	NC_014153	TGA	2	6	16949	16954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134516
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386	NC_014153	AGC	3	9	17062	17070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134516
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388	NC_014153	TGC	2	6	17111	17116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134516
389	NC_014153	CAG	4	12	17154	17165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134516
390	NC_014153	CGC	3	9	17228	17236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134516
391	NC_014153	GCG	2	6	17295	17300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134516
392	NC_014153	GCA	2	6	17327	17332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134516
393	NC_014153	CGA	2	6	17375	17380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134516
394	NC_014153	CAC	2	6	17401	17406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134516
395	NC_014153	ACC	2	6	17486	17491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134517
396	NC_014153	CGTGC	2	10	17543	17552	0 %	20 %	40 %	40 %	296134517
397	NC_014153	CTTG	2	8	17563	17570	0 %	50 %	25 %	25 %	296134517
398	NC_014153	CG	3	6	17573	17578	0 %	0 %	50 %	50 %	296134517
399	NC_014153	CCA	2	6	17632	17637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134517
400	NC_014153	GCA	2	6	17689	17694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134517
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403	NC_014153	ATC	2	6	17772	17777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134517
404	NC_014153	TTC	2	6	17805	17810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134517
405	NC_014153	GCT	2	6	17812	17817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134517
406	NC_014153	GGC	2	6	17843	17848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134517
407	NC_014153	CAG	2	6	17870	17875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134517
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490	NC_014153	CAC	3	9	21285	21293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134520
491	NC_014153	CGGT	2	8	21375	21382	0 %	25 %	50 %	25 %	296134520
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493	NC_014153	TGA	2	6	21508	21513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134520
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495	NC_014153	ACC	2	6	21603	21608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134520
496	NC_014153	GCA	2	6	21616	21621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134520
497	NC_014153	CCA	2	6	21667	21672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134520
498	NC_014153	TGG	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134520
499	NC_014153	GGTCGG	2	12	21824	21835	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296134521
500	NC_014153	CTG	2	6	21857	21862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134521

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