MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014153	GTG	2	6	152374	152379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134641
3502	NC_014153	CTT	2	6	152394	152399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134641
3503	NC_014153	GTG	2	6	152449	152454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134641
3504	NC_014153	GAC	2	6	152473	152478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134641
3505	NC_014153	CCG	2	6	152537	152542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134641
3506	NC_014153	CCT	2	6	152543	152548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134641
3507	NC_014153	CAC	2	6	152550	152555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134641
3508	NC_014153	TGA	2	6	152615	152620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134641
3509	NC_014153	CGC	2	6	152631	152636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134641
3510	NC_014153	AGA	2	6	152648	152653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134641
3511	NC_014153	GCG	2	6	152684	152689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134641
3512	NC_014153	ACA	2	6	152705	152710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134641
3513	NC_014153	GCG	2	6	152872	152877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134641
3514	NC_014153	GGT	2	6	152934	152939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134641
3515	NC_014153	GCT	2	6	152957	152962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134641
3516	NC_014153	ATG	2	6	153064	153069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134641
3517	NC_014153	GAA	2	6	153188	153193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134642
3518	NC_014153	ATTC	2	8	153229	153236	25 %	50 %	0 %	25 %	296134642
3519	NC_014153	GC	3	6	153295	153300	0 %	0 %	50 %	50 %	296134642
3520	NC_014153	TGA	2	6	153345	153350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134642
3521	NC_014153	GCC	2	6	153366	153371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134642
3522	NC_014153	GAGC	2	8	153427	153434	25 %	0 %	50 %	25 %	296134642
3523	NC_014153	CGG	2	6	153475	153480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134642
3524	NC_014153	CAA	2	6	153529	153534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134642
3525	NC_014153	ACG	3	9	153549	153557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134642
3526	NC_014153	A	6	6	153567	153572	100 %	0 %	0 %	0 %	296134642
3527	NC_014153	ACG	2	6	153600	153605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134642
3528	NC_014153	ACC	2	6	153635	153640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134642
3529	NC_014153	GCT	2	6	153682	153687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134642
3530	NC_014153	GGC	2	6	153688	153693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134642
3531	NC_014153	CG	3	6	153713	153718	0 %	0 %	50 %	50 %	296134642
3532	NC_014153	GC	3	6	153731	153736	0 %	0 %	50 %	50 %	296134642
3533	NC_014153	TGG	2	6	153741	153746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134642
3534	NC_014153	TCG	2	6	153750	153755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134642
3535	NC_014153	CCA	2	6	153771	153776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134642
3536	NC_014153	GCG	2	6	153828	153833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134642
3537	NC_014153	TGG	2	6	153900	153905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134642
3538	NC_014153	GAA	2	6	153913	153918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134642
3539	NC_014153	TGG	3	9	153972	153980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134642
3540	NC_014153	CCG	2	6	153999	154004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134642
3541	NC_014153	GGC	2	6	154084	154089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134642
3542	NC_014153	GTTCGA	2	12	154138	154149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296134642
3543	NC_014153	CAG	2	6	154192	154197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134642
3544	NC_014153	CGG	3	9	154216	154224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134642
3545	NC_014153	GGC	2	6	154234	154239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134642
3546	NC_014153	ACCG	2	8	154259	154266	25 %	0 %	25 %	50 %	296134642
3547	NC_014153	CGG	3	9	154285	154293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134642
3548	NC_014153	GCA	2	6	154345	154350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134642
3549	NC_014153	GC	3	6	154351	154356	0 %	0 %	50 %	50 %	296134642
3550	NC_014153	AGC	2	6	154359	154364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134642
3551	NC_014153	CAA	2	6	154503	154508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134643
3552	NC_014153	GC	3	6	154521	154526	0 %	0 %	50 %	50 %	296134643
3553	NC_014153	CAT	2	6	154527	154532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134643
3554	NC_014153	GCC	2	6	154537	154542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134643
3555	NC_014153	GC	4	8	154583	154590	0 %	0 %	50 %	50 %	296134643
3556	NC_014153	TCCA	2	8	154708	154715	25 %	25 %	0 %	50 %	296134643
3557	NC_014153	TGA	2	6	154733	154738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134643
3558	NC_014153	ACC	2	6	154774	154779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134643
3559	NC_014153	CGC	2	6	154804	154809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134643
3560	NC_014153	GTG	2	6	154810	154815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134643
3561	NC_014153	GCG	2	6	154832	154837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134643
3562	NC_014153	GTCG	2	8	154839	154846	0 %	25 %	50 %	25 %	296134643
3563	NC_014153	GCTC	2	8	154868	154875	0 %	25 %	25 %	50 %	296134643
3564	NC_014153	CCG	2	6	154886	154891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134643
3565	NC_014153	GAA	2	6	154894	154899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134643
3566	NC_014153	CAGC	2	8	154932	154939	25 %	0 %	25 %	50 %	296134643
3567	NC_014153	GACC	2	8	154944	154951	25 %	0 %	25 %	50 %	296134643
3568	NC_014153	CTC	3	9	155127	155135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134643
3569	NC_014153	ATC	2	6	155158	155163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134643
3570	NC_014153	CGG	2	6	155172	155177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134643
3571	NC_014153	TCG	2	6	155216	155221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134643
3572	NC_014153	TGG	2	6	155447	155452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134643
3573	NC_014153	GC	3	6	155468	155473	0 %	0 %	50 %	50 %	296134643
3574	NC_014153	CCG	2	6	155613	155618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134644
3575	NC_014153	GCA	2	6	155673	155678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134644
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3577	NC_014153	GC	3	6	155794	155799	0 %	0 %	50 %	50 %	296134644
3578	NC_014153	ACG	2	6	155832	155837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134644
3579	NC_014153	ACA	2	6	155865	155870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134644
3580	NC_014153	CGC	2	6	155881	155886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134644
3581	NC_014153	GCA	2	6	155887	155892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134644
3582	NC_014153	T	6	6	155968	155973	0 %	100 %	0 %	0 %	296134644
3583	NC_014153	GCC	2	6	156035	156040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134644
3584	NC_014153	CGCC	2	8	156049	156056	0 %	0 %	25 %	75 %	296134644
3585	NC_014153	GCT	2	6	156129	156134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134644
3586	NC_014153	GC	3	6	156174	156179	0 %	0 %	50 %	50 %	296134645
3587	NC_014153	GCC	2	6	156299	156304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134645
3588	NC_014153	CGG	2	6	156318	156323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134645
3589	NC_014153	GATC	2	8	156354	156361	25 %	25 %	25 %	25 %	296134645
3590	NC_014153	GCG	2	6	156385	156390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134645
3591	NC_014153	CCG	2	6	156411	156416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134645
3592	NC_014153	GGC	2	6	156451	156456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134645
3593	NC_014153	CTG	2	6	156484	156489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134645
3594	NC_014153	GC	3	6	156496	156501	0 %	0 %	50 %	50 %	296134645
3595	NC_014153	ACG	2	6	156529	156534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134645
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3598	NC_014153	A	6	6	156634	156639	100 %	0 %	0 %	0 %	296134645
3599	NC_014153	CCA	2	6	156716	156721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134645
3600	NC_014153	GC	3	6	156729	156734	0 %	0 %	50 %	50 %	296134645
3601	NC_014153	CAC	2	6	156765	156770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134645
3602	NC_014153	GC	3	6	156803	156808	0 %	0 %	50 %	50 %	296134645
3603	NC_014153	GGCG	2	8	156834	156841	0 %	0 %	75 %	25 %	296134645
3604	NC_014153	CAGC	2	8	156864	156871	25 %	0 %	25 %	50 %	296134645
3605	NC_014153	GAGC	2	8	156894	156901	25 %	0 %	50 %	25 %	296134645
3606	NC_014153	CTGA	2	8	156914	156921	25 %	25 %	25 %	25 %	296134645
3607	NC_014153	GTT	2	6	157209	157214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134646
3608	NC_014153	CGG	2	6	157238	157243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134646
3609	NC_014153	CAA	2	6	157244	157249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134646
3610	NC_014153	GGCGC	2	10	157277	157286	0 %	0 %	60 %	40 %	296134646
3611	NC_014153	GCTGC	2	10	157306	157315	0 %	20 %	40 %	40 %	296134646
3612	NC_014153	CG	3	6	157344	157349	0 %	0 %	50 %	50 %	296134646
3613	NC_014153	CCCG	2	8	157414	157421	0 %	0 %	25 %	75 %	296134646
3614	NC_014153	CGG	2	6	157522	157527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134646
3615	NC_014153	GGC	2	6	157616	157621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134646
3616	NC_014153	GC	4	8	157636	157643	0 %	0 %	50 %	50 %	296134646
3617	NC_014153	CAGG	2	8	157644	157651	25 %	0 %	50 %	25 %	296134646
3618	NC_014153	GCA	2	6	157708	157713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134646
3619	NC_014153	CATCA	2	10	157718	157727	40 %	20 %	0 %	40 %	296134646
3620	NC_014153	CGGGCG	2	12	157765	157776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134646
3621	NC_014153	GCA	2	6	157798	157803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134646
3622	NC_014153	GGC	2	6	157805	157810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134646
3623	NC_014153	CGG	2	6	158048	158053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134647
3624	NC_014153	GCA	2	6	158173	158178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134647
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3739	NC_014153	CGC	3	9	162707	162715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134650
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3862	NC_014153	GCG	2	6	168435	168440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134656
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3985	NC_014153	TGG	2	6	173425	173430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134661
3986	NC_014153	CGG	2	6	173441	173446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134661
3987	NC_014153	GGC	2	6	173489	173494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134661
3988	NC_014153	TTG	2	6	173505	173510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134661
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