MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014153	GGC	2	6	109949	109954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134604
2502	NC_014153	CGC	3	9	109981	109989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134604
2503	NC_014153	CTG	2	6	110028	110033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134604
2504	NC_014153	GGC	2	6	110040	110045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134604
2505	NC_014153	ACC	2	6	110115	110120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134604
2506	NC_014153	GC	3	6	110182	110187	0 %	0 %	50 %	50 %	296134604
2507	NC_014153	CGT	2	6	110219	110224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134604
2508	NC_014153	ACG	2	6	110233	110238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134604
2509	NC_014153	CTG	2	6	110244	110249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134604
2510	NC_014153	CCA	2	6	110291	110296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134604
2511	NC_014153	CGC	2	6	110345	110350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134604
2512	NC_014153	AAC	2	6	110361	110366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134604
2513	NC_014153	GCT	2	6	110498	110503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134604
2514	NC_014153	GCCTG	2	10	110520	110529	0 %	20 %	40 %	40 %	296134604
2515	NC_014153	AGC	3	9	110533	110541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134604
2516	NC_014153	GC	3	6	110567	110572	0 %	0 %	50 %	50 %	296134604
2517	NC_014153	GGC	2	6	110594	110599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134604
2518	NC_014153	CGC	2	6	110603	110608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134604
2519	NC_014153	GC	4	8	110645	110652	0 %	0 %	50 %	50 %	296134604
2520	NC_014153	GGT	2	6	110723	110728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134604
2521	NC_014153	AC	3	6	110735	110740	50 %	0 %	0 %	50 %	296134604
2522	NC_014153	TGG	2	6	110746	110751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134604
2523	NC_014153	GC	3	6	110754	110759	0 %	0 %	50 %	50 %	296134604
2524	NC_014153	GCT	2	6	110777	110782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134604
2525	NC_014153	GCG	2	6	110804	110809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134604
2526	NC_014153	TGG	2	6	110818	110823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134604
2527	NC_014153	GCC	2	6	110873	110878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134605
2528	NC_014153	CTG	2	6	110927	110932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134605
2529	NC_014153	G	6	6	110938	110943	0 %	0 %	100 %	0 %	296134605
2530	NC_014153	GGC	2	6	110984	110989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134605
2531	NC_014153	TCA	2	6	111003	111008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134605
2532	NC_014153	GGCT	2	8	111014	111021	0 %	25 %	50 %	25 %	296134605
2533	NC_014153	CGCTG	2	10	111037	111046	0 %	20 %	40 %	40 %	296134605
2534	NC_014153	CGG	3	9	111112	111120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134605
2535	NC_014153	CCCTGC	2	12	111132	111143	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296134605
2536	NC_014153	GCGCC	2	10	111147	111156	0 %	0 %	40 %	60 %	296134605
2537	NC_014153	ACC	2	6	111185	111190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134605
2538	NC_014153	CGC	2	6	111229	111234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134605
2539	NC_014153	GCA	2	6	111241	111246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134605
2540	NC_014153	GCG	2	6	111251	111256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134605
2541	NC_014153	GC	3	6	111339	111344	0 %	0 %	50 %	50 %	296134605
2542	NC_014153	CGGG	2	8	111451	111458	0 %	0 %	75 %	25 %	296134605
2543	NC_014153	GCG	2	6	111462	111467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134605
2544	NC_014153	GCG	2	6	111537	111542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134605
2545	NC_014153	CGC	2	6	111620	111625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134606
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2547	NC_014153	CGC	3	9	111646	111654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134606
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2549	NC_014153	CTG	2	6	111671	111676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134606
2550	NC_014153	CTA	2	6	111742	111747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134606
2551	NC_014153	CTG	2	6	111776	111781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134606
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2553	NC_014153	CGC	2	6	111883	111888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134606
2554	NC_014153	GC	3	6	111887	111892	0 %	0 %	50 %	50 %	296134606
2555	NC_014153	CGC	2	6	111910	111915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134606
2556	NC_014153	GCT	2	6	111952	111957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134606
2557	NC_014153	GTG	2	6	111976	111981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134606
2558	NC_014153	GCTG	2	8	112023	112030	0 %	25 %	50 %	25 %	296134606
2559	NC_014153	GC	3	6	112039	112044	0 %	0 %	50 %	50 %	296134606
2560	NC_014153	CCGCG	2	10	112065	112074	0 %	0 %	40 %	60 %	296134606
2561	NC_014153	CGA	2	6	112102	112107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134606
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2563	NC_014153	GCC	2	6	112200	112205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134606
2564	NC_014153	CTG	2	6	112211	112216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134606
2565	NC_014153	CCG	2	6	112220	112225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134606
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2570	NC_014153	CCG	2	6	112449	112454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134606
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2579	NC_014153	GC	3	6	112837	112842	0 %	0 %	50 %	50 %	296134606
2580	NC_014153	CGA	2	6	112846	112851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134606
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2584	NC_014153	CGG	2	6	112912	112917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134606
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2589	NC_014153	GACC	2	8	113523	113530	25 %	0 %	25 %	50 %	296134607
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2593	NC_014153	CGG	2	6	113864	113869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134607
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2600	NC_014153	CAGC	2	8	114384	114391	25 %	0 %	25 %	50 %	296134608
2601	NC_014153	CGA	2	6	114422	114427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134608
2602	NC_014153	TGCT	2	8	114475	114482	0 %	50 %	25 %	25 %	296134608
2603	NC_014153	GGA	2	6	114506	114511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134608
2604	NC_014153	AGG	2	6	114512	114517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134608
2605	NC_014153	ATG	2	6	114535	114540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134608
2606	NC_014153	TCA	2	6	114609	114614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134609
2607	NC_014153	CAC	2	6	114615	114620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134609
2608	NC_014153	GCG	2	6	114762	114767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134609
2609	NC_014153	CGC	2	6	114782	114787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134609
2610	NC_014153	GC	3	6	114791	114796	0 %	0 %	50 %	50 %	296134609
2611	NC_014153	GGCGCG	2	12	114825	114836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134609
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2617	NC_014153	GCC	2	6	115170	115175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134609
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2619	NC_014153	GGC	2	6	115193	115198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134609
2620	NC_014153	CGCGCA	2	12	115247	115258	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296134609
2621	NC_014153	GCA	2	6	115301	115306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134609
2622	NC_014153	CAGC	2	8	115307	115314	25 %	0 %	25 %	50 %	296134609
2623	NC_014153	CG	3	6	115315	115320	0 %	0 %	50 %	50 %	296134609
2624	NC_014153	GCG	2	6	115402	115407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134609
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2626	NC_014153	GC	4	8	115561	115568	0 %	0 %	50 %	50 %	296134610
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2634	NC_014153	GCCAG	2	10	116000	116009	20 %	0 %	40 %	40 %	296134610
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2744	NC_014153	GC	3	6	120359	120364	0 %	0 %	50 %	50 %	296134611
2745	NC_014153	GGC	2	6	120384	120389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134611
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2850	NC_014153	GCT	2	6	123801	123806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134612
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2855	NC_014153	TGCG	2	8	124118	124125	0 %	25 %	50 %	25 %	296134612
2856	NC_014153	CTGG	2	8	124197	124204	0 %	25 %	50 %	25 %	296134612
2857	NC_014153	GCC	2	6	124207	124212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134612
2858	NC_014153	CTT	2	6	124215	124220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134612
2859	NC_014153	TGC	2	6	124241	124246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134612
2860	NC_014153	TCCA	2	8	124285	124292	25 %	25 %	0 %	50 %	296134612
2861	NC_014153	T	7	7	124334	124340	0 %	100 %	0 %	0 %	296134612
2862	NC_014153	TCGTGG	2	12	124352	124363	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296134612
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2864	NC_014153	CGG	2	6	124439	124444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134612
2865	NC_014153	CTG	2	6	124453	124458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134612
2866	NC_014153	TGA	2	6	124469	124474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134612
2867	NC_014153	TTC	2	6	124480	124485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134612
2868	NC_014153	CTGG	2	8	124506	124513	0 %	25 %	50 %	25 %	296134612
2869	NC_014153	GGC	2	6	124547	124552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134612
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2877	NC_014153	TGC	2	6	124809	124814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134613
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2967	NC_014153	TCG	2	6	128558	128563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134614
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2974	NC_014153	GTC	2	6	129345	129350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134616
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2980	NC_014153	GCCC	2	8	129614	129621	0 %	0 %	25 %	75 %	296134616
2981	NC_014153	CAA	2	6	129651	129656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134616
2982	NC_014153	GCT	2	6	129669	129674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134616
2983	NC_014153	GCG	2	6	129746	129751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134616
2984	NC_014153	GAC	2	6	129769	129774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134616
2985	NC_014153	AGC	2	6	129809	129814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134616
2986	NC_014153	GC	3	6	129947	129952	0 %	0 %	50 %	50 %	296134616
2987	NC_014153	CAT	3	9	129954	129962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134616
2988	NC_014153	CGG	2	6	129978	129983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134616
2989	NC_014153	TGC	3	9	130031	130039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134616
2990	NC_014153	CAC	2	6	130081	130086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134616
2991	NC_014153	ACC	2	6	130136	130141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134616
2992	NC_014153	GTG	2	6	130156	130161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134616
2993	NC_014153	CTG	2	6	130207	130212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134616
2994	NC_014153	GAT	2	6	130351	130356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134616
2995	NC_014153	TGC	2	6	130361	130366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134616
2996	NC_014153	CGG	3	9	130371	130379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134616
2997	NC_014153	CGGC	2	8	130406	130413	0 %	0 %	50 %	50 %	296134616
2998	NC_014153	GTC	2	6	130466	130471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134616
2999	NC_014153	AAGG	2	8	130480	130487	50 %	0 %	50 %	0 %	296134616
3000	NC_014153	GCC	2	6	130507	130512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134616

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