MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014153	CTG	2	6	65483	65488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1502	NC_014153	GCG	2	6	65496	65501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1503	NC_014153	GCC	2	6	65507	65512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134568
1504	NC_014153	CTG	2	6	65558	65563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1505	NC_014153	GCT	2	6	65569	65574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1506	NC_014153	TGC	2	6	65604	65609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1507	NC_014153	GCA	2	6	65620	65625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1508	NC_014153	GAT	2	6	65734	65739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134568
1509	NC_014153	CGG	2	6	65766	65771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1510	NC_014153	CG	3	6	65812	65817	0 %	0 %	50 %	50 %	296134568
1511	NC_014153	TGC	2	6	65880	65885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1512	NC_014153	TGC	2	6	65895	65900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1513	NC_014153	CAC	2	6	65959	65964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134568
1514	NC_014153	GCC	2	6	66026	66031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134568
1515	NC_014153	GCA	2	6	66043	66048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1516	NC_014153	GACCGT	2	12	66049	66060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1517	NC_014153	CAG	2	6	66065	66070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1518	NC_014153	AGG	2	6	66099	66104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134568
1519	NC_014153	G	6	6	66131	66136	0 %	0 %	100 %	0 %	296134568
1520	NC_014153	GAT	2	6	66199	66204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134568
1521	NC_014153	TGC	2	6	66210	66215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1522	NC_014153	CGC	2	6	66223	66228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134568
1523	NC_014153	TGGCC	2	10	66244	66253	0 %	20 %	40 %	40 %	296134568
1524	NC_014153	CTG	2	6	66281	66286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1525	NC_014153	GCG	2	6	66287	66292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1526	NC_014153	CAG	2	6	66341	66346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1527	NC_014153	CGC	2	6	66361	66366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134568
1528	NC_014153	GC	3	6	66390	66395	0 %	0 %	50 %	50 %	296134568
1529	NC_014153	CGG	2	6	66403	66408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1530	NC_014153	CGC	2	6	66442	66447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134568
1531	NC_014153	ACC	4	12	66470	66481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134568
1532	NC_014153	GCG	2	6	66486	66491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1533	NC_014153	CGC	2	6	66519	66524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134568
1534	NC_014153	GGGC	2	8	66526	66533	0 %	0 %	75 %	25 %	296134568
1535	NC_014153	GTG	2	6	66566	66571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134568
1536	NC_014153	TGG	2	6	66618	66623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134568
1537	NC_014153	TCG	2	6	66630	66635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1538	NC_014153	TGA	2	6	66642	66647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134568
1539	NC_014153	AAG	2	6	66674	66679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134568
1540	NC_014153	TGC	2	6	66717	66722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1541	NC_014153	TGC	2	6	66738	66743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1542	NC_014153	CGGCA	2	10	66745	66754	20 %	0 %	40 %	40 %	296134568
1543	NC_014153	CGT	2	6	66760	66765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1544	NC_014153	GCCG	2	8	66769	66776	0 %	0 %	50 %	50 %	296134568
1545	NC_014153	TCT	2	6	66822	66827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134568
1546	NC_014153	AAC	3	9	66848	66856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134568
1547	NC_014153	GGCT	2	8	66902	66909	0 %	25 %	50 %	25 %	296134568
1548	NC_014153	GCG	2	6	66914	66919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1549	NC_014153	CTGGCG	2	12	66956	66967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296134568
1550	NC_014153	GGC	2	6	66976	66981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1551	NC_014153	GGC	3	9	67001	67009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134568
1552	NC_014153	TGC	3	9	67056	67064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1553	NC_014153	TGG	2	6	67065	67070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134568
1554	NC_014153	GC	3	6	67071	67076	0 %	0 %	50 %	50 %	296134568
1555	NC_014153	CTT	2	6	67081	67086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134568
1556	NC_014153	TCG	2	6	67110	67115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134568
1557	NC_014153	TCCCT	2	10	67202	67211	0 %	40 %	0 %	60 %	296134569
1558	NC_014153	CTG	2	6	67226	67231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1559	NC_014153	GTG	2	6	67241	67246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134569
1560	NC_014153	GC	3	6	67329	67334	0 %	0 %	50 %	50 %	296134569
1561	NC_014153	CTGTGG	2	12	67397	67408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296134569
1562	NC_014153	GTT	2	6	67417	67422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134569
1563	NC_014153	GGC	2	6	67468	67473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134569
1564	NC_014153	A	7	7	67490	67496	100 %	0 %	0 %	0 %	296134569
1565	NC_014153	AAG	2	6	67508	67513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134569
1566	NC_014153	CTG	2	6	67604	67609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1567	NC_014153	CGG	2	6	67696	67701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134569
1568	NC_014153	CCG	2	6	67710	67715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1569	NC_014153	GTG	2	6	67751	67756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134569
1570	NC_014153	TCCT	2	8	67781	67788	0 %	50 %	0 %	50 %	296134569
1571	NC_014153	GCG	2	6	67822	67827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134569
1572	NC_014153	CTG	2	6	67859	67864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1573	NC_014153	CTG	2	6	67886	67891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1574	NC_014153	GTGACG	2	12	67892	67903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296134569
1575	NC_014153	CTG	2	6	67979	67984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1576	NC_014153	ACC	2	6	68000	68005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134569
1577	NC_014153	CGG	2	6	68008	68013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134569
1578	NC_014153	CTG	2	6	68015	68020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1579	NC_014153	TGC	2	6	68052	68057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1580	NC_014153	TGG	2	6	68067	68072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134569
1581	NC_014153	GCG	2	6	68096	68101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134569
1582	NC_014153	TGC	2	6	68118	68123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1583	NC_014153	CGC	2	6	68212	68217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1584	NC_014153	GC	3	6	68216	68221	0 %	0 %	50 %	50 %	296134569
1585	NC_014153	CGA	2	6	68236	68241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1586	NC_014153	GCA	2	6	68256	68261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1587	NC_014153	AGG	2	6	68280	68285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134569
1588	NC_014153	CGC	2	6	68302	68307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1589	NC_014153	TCG	2	6	68325	68330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1590	NC_014153	CCTG	2	8	68365	68372	0 %	25 %	25 %	50 %	296134569
1591	NC_014153	GGCGC	2	10	68473	68482	0 %	0 %	60 %	40 %	296134569
1592	NC_014153	GCA	2	6	68484	68489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1593	NC_014153	CGC	2	6	68490	68495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1594	NC_014153	GC	3	6	68509	68514	0 %	0 %	50 %	50 %	296134569
1595	NC_014153	CGT	2	6	68551	68556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1596	NC_014153	TGA	2	6	68631	68636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134569
1597	NC_014153	CGC	2	6	68671	68676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1598	NC_014153	GAC	2	6	68690	68695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1599	NC_014153	ACG	2	6	68790	68795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1600	NC_014153	GCC	2	6	68849	68854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1601	NC_014153	AGG	2	6	68856	68861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134569
1602	NC_014153	TGG	2	6	68871	68876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134569
1603	NC_014153	GTG	2	6	68909	68914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134569
1604	NC_014153	TGA	2	6	68934	68939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134569
1605	NC_014153	CG	3	6	68940	68945	0 %	0 %	50 %	50 %	296134569
1606	NC_014153	GC	3	6	68946	68951	0 %	0 %	50 %	50 %	296134569
1607	NC_014153	CAC	2	6	68953	68958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134569
1608	NC_014153	CAT	2	6	68995	69000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134569
1609	NC_014153	TCG	2	6	69012	69017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1610	NC_014153	GC	3	6	69036	69041	0 %	0 %	50 %	50 %	296134569
1611	NC_014153	CGG	2	6	69084	69089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134569
1612	NC_014153	ATC	2	6	69107	69112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134569
1613	NC_014153	GCC	2	6	69164	69169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1614	NC_014153	CTG	2	6	69188	69193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1615	NC_014153	GGC	2	6	69206	69211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134569
1616	NC_014153	CGC	2	6	69214	69219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134569
1617	NC_014153	TGC	3	9	69249	69257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134569
1618	NC_014153	CTG	2	6	69358	69363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134570
1619	NC_014153	GCCGT	2	10	69470	69479	0 %	20 %	40 %	40 %	296134570
1620	NC_014153	CCA	2	6	69542	69547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134570
1621	NC_014153	CAA	2	6	69558	69563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134570
1622	NC_014153	CGG	2	6	69576	69581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134570
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1624	NC_014153	CGC	2	6	69636	69641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134570
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1996	NC_014153	GGC	2	6	88040	88045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134583
1997	NC_014153	TGG	2	6	88050	88055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134583
1998	NC_014153	TGC	2	6	88068	88073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134583
1999	NC_014153	CAG	2	6	88115	88120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134583
2000	NC_014153	CCG	2	6	88131	88136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134583

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