MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

< Previous12...3233343536373839404142...149150Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_014153	CGC	2	6	793802	793807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135211
18003	NC_014153	T	6	6	793812	793817	0 %	100 %	0 %	0 %	296135211
18004	NC_014153	A	6	6	793871	793876	100 %	0 %	0 %	0 %	296135211
18005	NC_014153	CAA	2	6	793900	793905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296135211
18006	NC_014153	ACG	2	6	793906	793911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135211
18007	NC_014153	CT	3	6	794011	794016	0 %	50 %	0 %	50 %	296135212
18008	NC_014153	GCA	2	6	794023	794028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135212
18009	NC_014153	GC	3	6	794108	794113	0 %	0 %	50 %	50 %	296135212
18010	NC_014153	CCA	2	6	794272	794277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135212
18011	NC_014153	CAG	2	6	794320	794325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135212
18012	NC_014153	GC	3	6	794344	794349	0 %	0 %	50 %	50 %	296135212
18013	NC_014153	GCC	2	6	794356	794361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135212
18014	NC_014153	TGC	2	6	794379	794384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135212
18015	NC_014153	CAGAT	2	10	794394	794403	40 %	20 %	20 %	20 %	296135212
18016	NC_014153	GGC	2	6	794405	794410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135212
18017	NC_014153	CAC	2	6	794423	794428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135212
18018	NC_014153	CCAGCA	2	12	794488	794499	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296135212
18019	NC_014153	GTG	2	6	794546	794551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135212
18020	NC_014153	ATGG	2	8	794561	794568	25 %	25 %	50 %	0 %	296135212
18021	NC_014153	GGC	2	6	794600	794605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135212
18022	NC_014153	TGA	2	6	794617	794622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296135212
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18024	NC_014153	GTC	2	6	794634	794639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135212
18025	NC_014153	CTG	2	6	795134	795139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135213
18026	NC_014153	CCA	2	6	795149	795154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135213
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18028	NC_014153	GTC	2	6	795172	795177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135213
18029	NC_014153	TGC	2	6	795215	795220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135213
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18033	NC_014153	CG	3	6	795276	795281	0 %	0 %	50 %	50 %	296135213
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18039	NC_014153	GC	3	6	795473	795478	0 %	0 %	50 %	50 %	296135213
18040	NC_014153	GCT	2	6	795480	795485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135213
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18043	NC_014153	CGCCA	2	10	795548	795557	20 %	0 %	20 %	60 %	296135213
18044	NC_014153	GTG	2	6	795586	795591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135213
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18048	NC_014153	GCTG	2	8	795681	795688	0 %	25 %	50 %	25 %	296135213
18049	NC_014153	GC	4	8	795725	795732	0 %	0 %	50 %	50 %	296135213
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18052	NC_014153	CTG	2	6	795799	795804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135213
18053	NC_014153	GC	3	6	795854	795859	0 %	0 %	50 %	50 %	296135213
18054	NC_014153	GGC	2	6	795870	795875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135213
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18059	NC_014153	TTCT	2	8	796018	796025	0 %	75 %	0 %	25 %	296135213
18060	NC_014153	CGGCG	2	10	796056	796065	0 %	0 %	60 %	40 %	296135213
18061	NC_014153	CTG	3	9	796075	796083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135213
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18082	NC_014153	GGC	2	6	796859	796864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135214
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18086	NC_014153	CA	4	8	797095	797102	50 %	0 %	0 %	50 %	296135214
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18091	NC_014153	TCG	2	6	797310	797315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135214
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18102	NC_014153	GGCG	2	8	797794	797801	0 %	0 %	75 %	25 %	296135215
18103	NC_014153	GC	3	6	797855	797860	0 %	0 %	50 %	50 %	296135215
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18107	NC_014153	GC	3	6	798121	798126	0 %	0 %	50 %	50 %	296135215
18108	NC_014153	TGC	2	6	798127	798132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135215
18109	NC_014153	GCTG	2	8	798148	798155	0 %	25 %	50 %	25 %	296135215
18110	NC_014153	ATC	2	6	798204	798209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296135215
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18235	NC_014153	CGA	2	6	803856	803861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135219
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18357	NC_014153	GTC	2	6	808963	808968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135227
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18477	NC_014153	GACGGT	2	12	813676	813687	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296135233
18478	NC_014153	AAGT	2	8	813689	813696	50 %	25 %	25 %	0 %	296135233
18479	NC_014153	GC	4	8	813713	813720	0 %	0 %	50 %	50 %	296135234
18480	NC_014153	AGC	2	6	813721	813726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234
18481	NC_014153	CAG	2	6	813747	813752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234
18482	NC_014153	CGC	2	6	813753	813758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135234
18483	NC_014153	GC	3	6	813818	813823	0 %	0 %	50 %	50 %	296135234
18484	NC_014153	CAC	2	6	813951	813956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135234
18485	NC_014153	GGC	2	6	813957	813962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135234
18486	NC_014153	AGCC	2	8	813963	813970	25 %	0 %	25 %	50 %	296135234
18487	NC_014153	CGCC	2	8	814007	814014	0 %	0 %	25 %	75 %	296135234
18488	NC_014153	CAG	2	6	814017	814022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234
18489	NC_014153	C	6	6	814114	814119	0 %	0 %	0 %	100 %	296135234
18490	NC_014153	CCA	2	6	814136	814141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135234
18491	NC_014153	GGCCGT	2	12	814148	814159	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296135234
18492	NC_014153	CAG	2	6	814185	814190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234
18493	NC_014153	TTG	2	6	814204	814209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296135234
18494	NC_014153	CGTGG	2	10	814239	814248	0 %	20 %	60 %	20 %	296135234
18495	NC_014153	GC	4	8	814360	814367	0 %	0 %	50 %	50 %	296135234
18496	NC_014153	CAGGG	2	10	814369	814378	20 %	0 %	60 %	20 %	296135234
18497	NC_014153	CAG	2	6	814392	814397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234
18498	NC_014153	CAG	2	6	814425	814430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234
18499	NC_014153	CAG	2	6	814440	814445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234
18500	NC_014153	CGA	2	6	814460	814465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135234

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