MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_014153	GCGGCT	2	12	697648	697659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296135135
16003	NC_014153	GCC	2	6	697720	697725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135135
16004	NC_014153	GGC	2	6	697764	697769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135135
16005	NC_014153	CCGCG	2	10	697770	697779	0 %	0 %	40 %	60 %	296135135
16006	NC_014153	CCG	2	6	697780	697785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135135
16007	NC_014153	GCA	2	6	697790	697795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135135
16008	NC_014153	CAG	2	6	697843	697848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135135
16009	NC_014153	GCA	2	6	697859	697864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135135
16010	NC_014153	CGG	2	6	697878	697883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135135
16011	NC_014153	GCT	3	9	697905	697913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135135
16012	NC_014153	TGG	2	6	697933	697938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135135
16013	NC_014153	AAGAC	2	10	697958	697967	60 %	0 %	20 %	20 %	296135135
16014	NC_014153	GCGA	2	8	697984	697991	25 %	0 %	50 %	25 %	296135135
16015	NC_014153	GGC	2	6	697992	697997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135135
16016	NC_014153	GCG	2	6	698002	698007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135135
16017	NC_014153	CGGCTC	2	12	698009	698020	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296135135
16018	NC_014153	CGG	2	6	698027	698032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135135
16019	NC_014153	CG	3	6	698044	698049	0 %	0 %	50 %	50 %	296135135
16020	NC_014153	GCC	2	6	698112	698117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135135
16021	NC_014153	AGCCC	2	10	698153	698162	20 %	0 %	20 %	60 %	296135135
16022	NC_014153	TGC	2	6	698223	698228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135135
16023	NC_014153	GC	3	6	698233	698238	0 %	0 %	50 %	50 %	296135135
16024	NC_014153	GCG	2	6	698242	698247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135135
16025	NC_014153	CCAGCG	2	12	698248	698259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296135135
16026	NC_014153	CGC	2	6	698307	698312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135135
16027	NC_014153	ACGGG	2	10	698326	698335	20 %	0 %	60 %	20 %	296135135
16028	NC_014153	GC	3	6	698346	698351	0 %	0 %	50 %	50 %	296135135
16029	NC_014153	AGC	2	6	698358	698363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135135
16030	NC_014153	GCG	2	6	698429	698434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135135
16031	NC_014153	CGC	2	6	698435	698440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135135
16032	NC_014153	TCG	3	9	698485	698493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135135
16033	NC_014153	GAACA	2	10	698494	698503	60 %	0 %	20 %	20 %	296135135
16034	NC_014153	CAT	2	6	698563	698568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296135136
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16037	NC_014153	TGC	3	9	698598	698606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135136
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16050	NC_014153	TGC	3	9	699038	699046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135137
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16052	NC_014153	GCG	2	6	699067	699072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135137
16053	NC_014153	CG	3	6	699107	699112	0 %	0 %	50 %	50 %	296135137
16054	NC_014153	GCT	2	6	699171	699176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135137
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16059	NC_014153	CGG	2	6	699261	699266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135137
16060	NC_014153	CATGGG	2	12	699267	699278	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296135137
16061	NC_014153	G	6	6	699276	699281	0 %	0 %	100 %	0 %	296135137
16062	NC_014153	CGG	2	6	699285	699290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135137
16063	NC_014153	G	6	6	699303	699308	0 %	0 %	100 %	0 %	296135137
16064	NC_014153	GCG	2	6	699347	699352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135137
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16120	NC_014153	CTCG	2	8	701434	701441	0 %	25 %	25 %	50 %	296135139
16121	NC_014153	GCC	2	6	701492	701497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135139
16122	NC_014153	CG	3	6	701498	701503	0 %	0 %	50 %	50 %	296135139
16123	NC_014153	GCC	2	6	701524	701529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135139
16124	NC_014153	CGCC	2	8	701560	701567	0 %	0 %	25 %	75 %	296135139
16125	NC_014153	TGG	2	6	701580	701585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135139
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16130	NC_014153	GCG	2	6	701931	701936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135139
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16132	NC_014153	GGCT	2	8	702011	702018	0 %	25 %	50 %	25 %	296135139
16133	NC_014153	CG	3	6	702046	702051	0 %	0 %	50 %	50 %	296135139
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16230	NC_014153	GCCA	2	8	707413	707420	25 %	0 %	25 %	50 %	296135143
16231	NC_014153	CCGGC	2	10	707489	707498	0 %	0 %	40 %	60 %	296135143
16232	NC_014153	GCA	2	6	707509	707514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135143
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16234	NC_014153	GGC	3	9	707551	707559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135143
16235	NC_014153	TGGG	2	8	707629	707636	0 %	25 %	75 %	0 %	296135143
16236	NC_014153	ATG	2	6	707662	707667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296135143
16237	NC_014153	ACC	2	6	707758	707763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135143
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16239	NC_014153	GCA	2	6	707801	707806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135143
16240	NC_014153	TGG	2	6	707825	707830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135143
16241	NC_014153	CTG	2	6	707851	707856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135143
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16348	NC_014153	TG	3	6	712250	712255	0 %	50 %	50 %	0 %	296135147
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16355	NC_014153	TTG	2	6	712621	712626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296135148
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16358	NC_014153	GCTGG	2	10	712674	712683	0 %	20 %	60 %	20 %	296135148
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16477	NC_014153	TGG	2	6	717920	717925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135152
16478	NC_014153	GCA	2	6	717945	717950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135152
16479	NC_014153	TGT	2	6	717977	717982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296135152
16480	NC_014153	ATC	2	6	718027	718032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296135152
16481	NC_014153	CA	3	6	718128	718133	50 %	0 %	0 %	50 %	296135152
16482	NC_014153	CGC	2	6	718232	718237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135153
16483	NC_014153	GTG	2	6	718287	718292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135153
16484	NC_014153	GCGCC	2	10	718318	718327	0 %	0 %	40 %	60 %	296135153
16485	NC_014153	GTG	2	6	718443	718448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135153
16486	NC_014153	TGC	2	6	718534	718539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135153
16487	NC_014153	GCC	2	6	718575	718580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135153
16488	NC_014153	GCA	2	6	718666	718671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135153
16489	NC_014153	CAA	2	6	718706	718711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296135153
16490	NC_014153	CCG	2	6	718780	718785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135153
16491	NC_014153	CGT	2	6	718794	718799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135153
16492	NC_014153	GAC	2	6	718917	718922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135153
16493	NC_014153	TCG	3	9	718927	718935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135153
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16495	NC_014153	GCT	2	6	719042	719047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135153
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16498	NC_014153	AAGG	2	8	719187	719194	50 %	0 %	50 %	0 %	296135153
16499	NC_014153	A	6	6	719259	719264	100 %	0 %	0 %	0 %	296135153
16500	NC_014153	GC	3	6	719362	719367	0 %	0 %	50 %	50 %	296135153

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