MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014153	TGC	2	6	635207	635212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14502	NC_014153	ACC	2	6	635236	635241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135086
14503	NC_014153	GCT	2	6	635268	635273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14504	NC_014153	GTG	2	6	635299	635304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135086
14505	NC_014153	GCT	2	6	635391	635396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14506	NC_014153	GCA	2	6	635397	635402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14507	NC_014153	TGC	2	6	635414	635419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14508	NC_014153	CGG	2	6	635423	635428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135086
14509	NC_014153	TGC	2	6	635471	635476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14510	NC_014153	TGC	2	6	635480	635485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14511	NC_014153	ACG	2	6	635642	635647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135086
14512	NC_014153	CAT	2	6	635650	635655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296135086
14513	NC_014153	CCA	2	6	635734	635739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135087
14514	NC_014153	ACG	2	6	635743	635748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14515	NC_014153	GCA	2	6	635750	635755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14516	NC_014153	CCT	2	6	635765	635770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296135087
14517	NC_014153	CTG	2	6	635862	635867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14518	NC_014153	GCA	2	6	635885	635890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14519	NC_014153	ACC	3	9	635988	635996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135087
14520	NC_014153	CGC	2	6	635999	636004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135087
14521	NC_014153	TGG	2	6	636007	636012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135087
14522	NC_014153	CGGCG	2	10	636032	636041	0 %	0 %	60 %	40 %	296135087
14523	NC_014153	CTG	2	6	636051	636056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14524	NC_014153	CGGC	2	8	636067	636074	0 %	0 %	50 %	50 %	296135087
14525	NC_014153	CTG	2	6	636081	636086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14526	NC_014153	AGG	2	6	636148	636153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296135087
14527	NC_014153	GTT	2	6	636158	636163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296135087
14528	NC_014153	CGGCAA	2	12	636206	636217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14529	NC_014153	CAA	2	6	636227	636232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296135087
14530	NC_014153	CCG	2	6	636260	636265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135087
14531	NC_014153	CGC	2	6	636308	636313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135087
14532	NC_014153	CTG	2	6	636321	636326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135087
14533	NC_014153	CAA	2	6	636434	636439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296135087
14534	NC_014153	CAAG	2	8	636524	636531	50 %	0 %	25 %	25 %	296135087
14535	NC_014153	TGGG	2	8	636534	636541	0 %	25 %	75 %	0 %	296135087
14536	NC_014153	GGC	2	6	636545	636550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135087
14537	NC_014153	TGCTGG	2	12	636662	636673	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296135088
14538	NC_014153	GGCG	2	8	636696	636703	0 %	0 %	75 %	25 %	296135088
14539	NC_014153	GCT	2	6	636741	636746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135088
14540	NC_014153	GCT	2	6	636750	636755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135088
14541	NC_014153	GC	4	8	636775	636782	0 %	0 %	50 %	50 %	296135088
14542	NC_014153	GAT	2	6	636828	636833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296135088
14543	NC_014153	GGGC	2	8	636863	636870	0 %	0 %	75 %	25 %	296135088
14544	NC_014153	GCG	2	6	636877	636882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135088
14545	NC_014153	GGC	2	6	636908	636913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135088
14546	NC_014153	AGCGCC	2	12	636943	636954	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296135088
14547	NC_014153	GCC	2	6	636958	636963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135088
14548	NC_014153	TTG	2	6	636994	636999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296135088
14549	NC_014153	GC	3	6	637006	637011	0 %	0 %	50 %	50 %	296135088
14550	NC_014153	GCT	2	6	637014	637019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135088
14551	NC_014153	TGG	2	6	637088	637093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296135088
14552	NC_014153	GCC	2	6	637124	637129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135088
14553	NC_014153	GCT	2	6	637140	637145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135088
14554	NC_014153	GCA	2	6	637158	637163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135088
14555	NC_014153	AGGCG	2	10	637197	637206	20 %	0 %	60 %	20 %	296135088
14556	NC_014153	CG	3	6	637211	637216	0 %	0 %	50 %	50 %	296135088
14557	NC_014153	GGC	2	6	637218	637223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135088
14558	NC_014153	TGC	2	6	637259	637264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135088
14559	NC_014153	GCT	2	6	637281	637286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135088
14560	NC_014153	CAC	2	6	637314	637319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135088
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14562	NC_014153	CGC	2	6	637398	637403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135088
14563	NC_014153	CG	3	6	637471	637476	0 %	0 %	50 %	50 %	296135089
14564	NC_014153	GCA	2	6	637481	637486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
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14566	NC_014153	GGC	2	6	637514	637519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135089
14567	NC_014153	TGC	2	6	637522	637527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135089
14568	NC_014153	GCG	2	6	637556	637561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135089
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14570	NC_014153	GGC	2	6	637680	637685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135089
14571	NC_014153	CGA	2	6	637715	637720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
14572	NC_014153	CCAC	2	8	637721	637728	25 %	0 %	0 %	75 %	296135089
14573	NC_014153	GC	3	6	637757	637762	0 %	0 %	50 %	50 %	296135089
14574	NC_014153	GCGCAG	2	12	637848	637859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296135089
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14583	NC_014153	GGCG	2	8	638231	638238	0 %	0 %	75 %	25 %	296135089
14584	NC_014153	CTG	2	6	638320	638325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135089
14585	NC_014153	GCA	2	6	638339	638344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
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14588	NC_014153	GC	3	6	638430	638435	0 %	0 %	50 %	50 %	296135089
14589	NC_014153	CGCGC	3	15	638431	638445	0 %	0 %	40 %	60 %	296135089
14590	NC_014153	GCC	2	6	638463	638468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135089
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14592	NC_014153	CGGT	2	8	638503	638510	0 %	25 %	50 %	25 %	296135089
14593	NC_014153	GGC	2	6	638523	638528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135089
14594	NC_014153	CG	3	6	638546	638551	0 %	0 %	50 %	50 %	296135089
14595	NC_014153	GGCCGT	2	12	638625	638636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296135089
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14599	NC_014153	GC	3	6	638768	638773	0 %	0 %	50 %	50 %	296135089
14600	NC_014153	GGC	2	6	638802	638807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135089
14601	NC_014153	CG	3	6	638950	638955	0 %	0 %	50 %	50 %	296135089
14602	NC_014153	AAC	2	6	638959	638964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296135089
14603	NC_014153	CG	3	6	638984	638989	0 %	0 %	50 %	50 %	296135089
14604	NC_014153	CGAT	2	8	639013	639020	25 %	25 %	25 %	25 %	296135089
14605	NC_014153	CAG	2	6	639054	639059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
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14607	NC_014153	CAG	2	6	639129	639134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
14608	NC_014153	AGC	3	9	639145	639153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
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14610	NC_014153	GAG	2	6	639213	639218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296135089
14611	NC_014153	CGT	2	6	639233	639238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135089
14612	NC_014153	CGA	2	6	639284	639289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
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14614	NC_014153	TGCGCT	2	12	639319	639330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135089
14615	NC_014153	CCA	2	6	639405	639410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296135089
14616	NC_014153	GAC	2	6	639413	639418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
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14618	NC_014153	GCA	2	6	639569	639574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296135089
14619	NC_014153	CGG	2	6	639595	639600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135089
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14977	NC_014153	TGCT	2	8	654289	654296	0 %	50 %	25 %	25 %	296135102
14978	NC_014153	TC	3	6	654331	654336	0 %	50 %	0 %	50 %	296135102
14979	NC_014153	TGC	2	6	654370	654375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135102
14980	NC_014153	TGC	2	6	654409	654414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135102
14981	NC_014153	GCAGT	2	10	654463	654472	20 %	20 %	40 %	20 %	296135102
14982	NC_014153	GCCC	2	8	654488	654495	0 %	0 %	25 %	75 %	296135102
14983	NC_014153	GCC	2	6	654537	654542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296135102
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14985	NC_014153	TGCC	2	8	654691	654698	0 %	25 %	25 %	50 %	296135102
14986	NC_014153	G	7	7	654710	654716	0 %	0 %	100 %	0 %	296135102
14987	NC_014153	GC	3	6	654721	654726	0 %	0 %	50 %	50 %	296135102
14988	NC_014153	TGC	2	6	654772	654777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135102
14989	NC_014153	CGT	2	6	654836	654841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135102
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14991	NC_014153	TGA	2	6	654865	654870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296135102
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14993	NC_014153	CTG	2	6	654966	654971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296135102
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15000	NC_014153	GCATGG	2	12	655367	655378	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296135103

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