MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014153	CGA	2	6	522554	522559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12003	NC_014153	CGC	2	6	522576	522581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134979
12004	NC_014153	AGA	2	6	522652	522657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134979
12005	NC_014153	TC	3	6	522665	522670	0 %	50 %	0 %	50 %	296134979
12006	NC_014153	TTC	2	6	522738	522743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134979
12007	NC_014153	CTG	2	6	522748	522753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12008	NC_014153	CGA	2	6	522761	522766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12009	NC_014153	GCT	2	6	522797	522802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12010	NC_014153	TCG	2	6	522808	522813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12011	NC_014153	GGC	2	6	522822	522827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134979
12012	NC_014153	GCG	2	6	522889	522894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134979
12013	NC_014153	TCA	2	6	522898	522903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134979
12014	NC_014153	CGC	2	6	522947	522952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134979
12015	NC_014153	CTG	2	6	522975	522980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12016	NC_014153	GCT	2	6	523022	523027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12017	NC_014153	GC	3	6	523040	523045	0 %	0 %	50 %	50 %	296134979
12018	NC_014153	GCT	2	6	523100	523105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134979
12019	NC_014153	CGG	2	6	523109	523114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134979
12020	NC_014153	GCG	2	6	523132	523137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134979
12021	NC_014153	AT	3	6	523187	523192	50 %	50 %	0 %	0 %	296134979
12022	NC_014153	CGG	2	6	523269	523274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134980
12023	NC_014153	CGG	2	6	523406	523411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134980
12024	NC_014153	GCC	2	6	523422	523427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134980
12025	NC_014153	GAT	2	6	523443	523448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134980
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12027	NC_014153	AGAA	2	8	523495	523502	75 %	0 %	25 %	0 %	296134980
12028	NC_014153	AG	3	6	523503	523508	50 %	0 %	50 %	0 %	296134980
12029	NC_014153	CTC	2	6	523528	523533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134981
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12031	NC_014153	GC	3	6	523610	523615	0 %	0 %	50 %	50 %	296134981
12032	NC_014153	CAC	2	6	523616	523621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134981
12033	NC_014153	GGTGA	2	10	523652	523661	20 %	20 %	60 %	0 %	296134981
12034	NC_014153	TTGG	2	8	523676	523683	0 %	50 %	50 %	0 %	296134981
12035	NC_014153	GCA	2	6	523690	523695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134981
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12039	NC_014153	GAC	2	6	523899	523904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134981
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12041	NC_014153	CGGC	2	8	523975	523982	0 %	0 %	50 %	50 %	296134981
12042	NC_014153	GTC	2	6	524012	524017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134981
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12044	NC_014153	TGA	2	6	524161	524166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134981
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12053	NC_014153	CGG	2	6	524455	524460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134982
12054	NC_014153	CCGCG	2	10	524516	524525	0 %	0 %	40 %	60 %	296134982
12055	NC_014153	CAGC	2	8	524542	524549	25 %	0 %	25 %	50 %	296134982
12056	NC_014153	GC	3	6	524563	524568	0 %	0 %	50 %	50 %	296134982
12057	NC_014153	TGAC	2	8	524610	524617	25 %	25 %	25 %	25 %	296134982
12058	NC_014153	GCGG	2	8	524671	524678	0 %	0 %	75 %	25 %	296134982
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12068	NC_014153	GCT	2	6	525067	525072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134982
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12074	NC_014153	CGT	2	6	525338	525343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134983
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12085	NC_014153	GC	3	6	525641	525646	0 %	0 %	50 %	50 %	296134983
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12092	NC_014153	CAGC	2	8	525929	525936	25 %	0 %	25 %	50 %	296134983
12093	NC_014153	G	8	8	525942	525949	0 %	0 %	100 %	0 %	296134983
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12101	NC_014153	CA	3	6	526443	526448	50 %	0 %	0 %	50 %	296134984
12102	NC_014153	GTG	2	6	526449	526454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134984
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12105	NC_014153	CGT	2	6	526519	526524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134984
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12108	NC_014153	GC	3	6	526590	526595	0 %	0 %	50 %	50 %	296134984
12109	NC_014153	GCGCC	2	10	526647	526656	0 %	0 %	40 %	60 %	296134984
12110	NC_014153	CAG	2	6	526667	526672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134984
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12121	NC_014153	TCA	2	6	527066	527071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134985
12122	NC_014153	CCA	2	6	527114	527119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134985
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12125	NC_014153	GC	3	6	527228	527233	0 %	0 %	50 %	50 %	296134985
12126	NC_014153	CCT	2	6	527264	527269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134985
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12359	NC_014153	AAC	2	6	537790	537795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134994
12360	NC_014153	GC	3	6	537846	537851	0 %	0 %	50 %	50 %	296134994
12361	NC_014153	GCCATT	2	12	537901	537912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296134994
12362	NC_014153	CGC	2	6	537913	537918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134994
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12364	NC_014153	CG	3	6	537973	537978	0 %	0 %	50 %	50 %	296134994
12365	NC_014153	CGA	2	6	537993	537998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134994
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12369	NC_014153	ACA	2	6	538121	538126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134994
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12471	NC_014153	GGC	3	9	547155	547163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135000
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12474	NC_014153	CAT	2	6	547244	547249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296135000
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12480	NC_014153	CGG	2	6	547640	547645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135001
12481	NC_014153	CGG	2	6	547649	547654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296135001
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