MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014153	CTG	2	6	500865	500870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11502	NC_014153	GCGG	2	8	500894	500901	0 %	0 %	75 %	25 %	296134962
11503	NC_014153	CTG	2	6	500952	500957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11504	NC_014153	GC	3	6	500983	500988	0 %	0 %	50 %	50 %	296134962
11505	NC_014153	GCT	2	6	501023	501028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11506	NC_014153	CCG	2	6	501061	501066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134962
11507	NC_014153	TCA	2	6	501079	501084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134962
11508	NC_014153	CTG	2	6	501087	501092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11509	NC_014153	TGC	2	6	501109	501114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11510	NC_014153	CTG	2	6	501174	501179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11511	NC_014153	TGC	2	6	501196	501201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11512	NC_014153	A	7	7	501271	501277	100 %	0 %	0 %	0 %	296134962
11513	NC_014153	CCG	2	6	501292	501297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134962
11514	NC_014153	CCA	2	6	501316	501321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134962
11515	NC_014153	CA	3	6	501320	501325	50 %	0 %	0 %	50 %	296134962
11516	NC_014153	GCT	2	6	501350	501355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11517	NC_014153	TCG	2	6	501433	501438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11518	NC_014153	ACG	2	6	501489	501494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11519	NC_014153	CG	3	6	501553	501558	0 %	0 %	50 %	50 %	296134962
11520	NC_014153	GCC	2	6	501634	501639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134962
11521	NC_014153	GCA	3	9	501692	501700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11522	NC_014153	AGC	2	6	501715	501720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11523	NC_014153	TCA	2	6	501760	501765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134962
11524	NC_014153	GCT	2	6	501785	501790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11525	NC_014153	CAA	2	6	501797	501802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134962
11526	NC_014153	GCC	2	6	501804	501809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134962
11527	NC_014153	CTG	2	6	501894	501899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11528	NC_014153	GGC	2	6	501918	501923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134962
11529	NC_014153	GCG	2	6	501931	501936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134962
11530	NC_014153	CCG	2	6	501950	501955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134962
11531	NC_014153	GCT	3	9	501977	501985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11532	NC_014153	CGA	3	9	502010	502018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11533	NC_014153	GC	3	6	502059	502064	0 %	0 %	50 %	50 %	296134962
11534	NC_014153	CCG	2	6	502118	502123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134962
11535	NC_014153	CGC	2	6	502139	502144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134962
11536	NC_014153	CG	3	6	502158	502163	0 %	0 %	50 %	50 %	296134962
11537	NC_014153	GTG	2	6	502185	502190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134962
11538	NC_014153	CAAA	2	8	502214	502221	75 %	0 %	0 %	25 %	296134962
11539	NC_014153	TGCA	2	8	502281	502288	25 %	25 %	25 %	25 %	296134962
11540	NC_014153	TG	3	6	502309	502314	0 %	50 %	50 %	0 %	296134962
11541	NC_014153	G	6	6	502322	502327	0 %	0 %	100 %	0 %	296134962
11542	NC_014153	CTG	2	6	502344	502349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134962
11543	NC_014153	TCCA	2	8	502401	502408	25 %	25 %	0 %	50 %	296134962
11544	NC_014153	CTGC	2	8	502418	502425	0 %	25 %	25 %	50 %	296134962
11545	NC_014153	GC	3	6	502432	502437	0 %	0 %	50 %	50 %	296134962
11546	NC_014153	ACC	2	6	502455	502460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134962
11547	NC_014153	GCC	2	6	502701	502706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134963
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11549	NC_014153	CG	3	6	502715	502720	0 %	0 %	50 %	50 %	296134963
11550	NC_014153	GCA	2	6	502750	502755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134963
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11552	NC_014153	GCA	4	12	502801	502812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134963
11553	NC_014153	CCG	2	6	502829	502834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134963
11554	NC_014153	GCG	2	6	502867	502872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134963
11555	NC_014153	GCA	2	6	502879	502884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134963
11556	NC_014153	TCCAGC	2	12	502938	502949	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296134963
11557	NC_014153	GCAG	2	8	502957	502964	25 %	0 %	50 %	25 %	296134963
11558	NC_014153	GC	3	6	503034	503039	0 %	0 %	50 %	50 %	296134963
11559	NC_014153	CGT	2	6	503117	503122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134963
11560	NC_014153	CGG	2	6	503161	503166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134963
11561	NC_014153	CGA	2	6	503263	503268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134963
11562	NC_014153	TGC	2	6	503271	503276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134963
11563	NC_014153	CGCAG	2	10	503302	503311	20 %	0 %	40 %	40 %	296134963
11564	NC_014153	GC	3	6	503406	503411	0 %	0 %	50 %	50 %	296134963
11565	NC_014153	CCA	2	6	503446	503451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134963
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11567	NC_014153	CTG	2	6	503474	503479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134963
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11572	NC_014153	GC	3	6	503705	503710	0 %	0 %	50 %	50 %	296134964
11573	NC_014153	GCA	2	6	503713	503718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134964
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11576	NC_014153	GC	3	6	503757	503762	0 %	0 %	50 %	50 %	296134964
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11588	NC_014153	CGG	2	6	504089	504094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134965
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11591	NC_014153	CGAGCG	2	12	504183	504194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296134965
11592	NC_014153	GCC	2	6	504205	504210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134965
11593	NC_014153	CAC	2	6	504219	504224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134965
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11599	NC_014153	GGC	2	6	504421	504426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134965
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11601	NC_014153	TGC	2	6	504440	504445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134965
11602	NC_014153	CCGC	2	8	504485	504492	0 %	0 %	25 %	75 %	296134965
11603	NC_014153	AGG	2	6	504497	504502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134965
11604	NC_014153	CATTG	2	10	504515	504524	20 %	40 %	20 %	20 %	296134965
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11606	NC_014153	GCG	2	6	504625	504630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134966
11607	NC_014153	CGT	2	6	504633	504638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134966
11608	NC_014153	CG	3	6	504640	504645	0 %	0 %	50 %	50 %	296134966
11609	NC_014153	GC	3	6	504653	504658	0 %	0 %	50 %	50 %	296134966
11610	NC_014153	CTG	2	6	504666	504671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134966
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11614	NC_014153	ACCG	2	8	504753	504760	25 %	0 %	25 %	50 %	296134966
11615	NC_014153	CGG	2	6	504766	504771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134966
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11618	NC_014153	GC	3	6	504851	504856	0 %	0 %	50 %	50 %	296134966
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11620	NC_014153	TGC	2	6	504877	504882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134966
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11980	NC_014153	GC	3	6	521483	521488	0 %	0 %	50 %	50 %	296134979
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