MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_014153	CGGCG	2	10	298530	298539	0 %	0 %	60 %	40 %	296134778
7003	NC_014153	CGG	3	9	298563	298571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134778
7004	NC_014153	CTC	2	6	298584	298589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134778
7005	NC_014153	GTG	2	6	298645	298650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134778
7006	NC_014153	GCC	2	6	298795	298800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134778
7007	NC_014153	CG	4	8	298836	298843	0 %	0 %	50 %	50 %	296134778
7008	NC_014153	GCC	2	6	298870	298875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134778
7009	NC_014153	CGC	2	6	298931	298936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134778
7010	NC_014153	GC	3	6	298975	298980	0 %	0 %	50 %	50 %	296134778
7011	NC_014153	GTCG	2	8	299050	299057	0 %	25 %	50 %	25 %	296134778
7012	NC_014153	GCG	2	6	299150	299155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134778
7013	NC_014153	CTG	2	6	299204	299209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134778
7014	NC_014153	GCC	2	6	299229	299234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134778
7015	NC_014153	GC	3	6	299299	299304	0 %	0 %	50 %	50 %	296134779
7016	NC_014153	CAG	2	6	299338	299343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134779
7017	NC_014153	CGG	2	6	299349	299354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134779
7018	NC_014153	CAG	2	6	299368	299373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134779
7019	NC_014153	ACC	2	6	299387	299392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134779
7020	NC_014153	CAG	2	6	299410	299415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134779
7021	NC_014153	ACC	2	6	299465	299470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134779
7022	NC_014153	CCG	2	6	299474	299479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134779
7023	NC_014153	CAG	2	6	299488	299493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134779
7024	NC_014153	CACCCA	2	12	299506	299517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134779
7025	NC_014153	CAC	2	6	299572	299577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134779
7026	NC_014153	GGC	2	6	299578	299583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134779
7027	NC_014153	GAC	2	6	299593	299598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134779
7028	NC_014153	GCG	2	6	299607	299612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134779
7029	NC_014153	CTG	2	6	299635	299640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134779
7030	NC_014153	CGC	2	6	299656	299661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134779
7031	NC_014153	CGG	2	6	299670	299675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134779
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7033	NC_014153	GC	3	6	299703	299708	0 %	0 %	50 %	50 %	296134779
7034	NC_014153	ATC	2	6	299732	299737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134779
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7036	NC_014153	GCG	2	6	299756	299761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134779
7037	NC_014153	GCG	2	6	299787	299792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134779
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7039	NC_014153	TGA	2	6	299823	299828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134779
7040	NC_014153	GAA	2	6	299893	299898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134779
7041	NC_014153	GCGGG	2	10	299964	299973	0 %	0 %	80 %	20 %	296134779
7042	NC_014153	CG	3	6	299980	299985	0 %	0 %	50 %	50 %	296134779
7043	NC_014153	CGGG	2	8	300034	300041	0 %	0 %	75 %	25 %	296134779
7044	NC_014153	CGGCCA	2	12	300093	300104	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296134779
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7051	NC_014153	CGA	3	9	301005	301013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134780
7052	NC_014153	CGT	2	6	301023	301028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134780
7053	NC_014153	GC	3	6	301040	301045	0 %	0 %	50 %	50 %	296134780
7054	NC_014153	GAT	2	6	301144	301149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134780
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7056	NC_014153	CAT	2	6	301176	301181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134780
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7058	NC_014153	TGG	3	9	301262	301270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134780
7059	NC_014153	CGC	2	6	301368	301373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134780
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7102	NC_014153	CCAC	2	8	303261	303268	25 %	0 %	0 %	75 %	296134783
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7120	NC_014153	GTC	2	6	303806	303811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134783
7121	NC_014153	TTG	2	6	303824	303829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134783
7122	NC_014153	GCGCC	3	15	303856	303870	0 %	0 %	40 %	60 %	296134783
7123	NC_014153	GCG	2	6	303879	303884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134783
7124	NC_014153	CCG	2	6	303940	303945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134783
7125	NC_014153	TTC	2	6	303959	303964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134783
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7127	NC_014153	GCCGC	2	10	303998	304007	0 %	0 %	40 %	60 %	296134783
7128	NC_014153	CGG	2	6	304056	304061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134783
7129	NC_014153	CAG	2	6	304103	304108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134783
7130	NC_014153	CTG	2	6	304148	304153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134783
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7132	NC_014153	TGC	2	6	304170	304175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134783
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7135	NC_014153	CTG	2	6	304252	304257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134784
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7137	NC_014153	GC	3	6	304327	304332	0 %	0 %	50 %	50 %	296134784
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7140	NC_014153	CTG	2	6	304405	304410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134784
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7143	NC_014153	CAT	2	6	304437	304442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134784
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7152	NC_014153	GCA	2	6	304655	304660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134784
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7230	NC_014153	GCTGG	2	10	307481	307490	0 %	20 %	60 %	20 %	296134787
7231	NC_014153	CG	4	8	307514	307521	0 %	0 %	50 %	50 %	296134787
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7360	NC_014153	CGG	3	9	312372	312380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134792
7361	NC_014153	ATG	2	6	312428	312433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134792
7362	NC_014153	GTC	2	6	312442	312447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134792
7363	NC_014153	CGC	2	6	312520	312525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134792
7364	NC_014153	GC	4	8	312531	312538	0 %	0 %	50 %	50 %	296134792
7365	NC_014153	GGC	2	6	312568	312573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134792
7366	NC_014153	GATC	2	8	312603	312610	25 %	25 %	25 %	25 %	296134792
7367	NC_014153	GCA	3	9	312666	312674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134792
7368	NC_014153	AGATC	2	10	312756	312765	40 %	20 %	20 %	20 %	296134792
7369	NC_014153	CGG	2	6	312797	312802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134792
7370	NC_014153	GTC	2	6	312808	312813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134792
7371	NC_014153	GCG	2	6	312814	312819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134792
7372	NC_014153	CGC	2	6	312824	312829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134792
7373	NC_014153	CAT	2	6	313144	313149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134793
7374	NC_014153	ACAGC	2	10	313224	313233	40 %	0 %	20 %	40 %	296134793
7375	NC_014153	CGAGCG	2	12	313234	313245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296134793
7376	NC_014153	CTG	2	6	313247	313252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134793
7377	NC_014153	ATG	2	6	313253	313258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134793
7378	NC_014153	GGCC	2	8	313296	313303	0 %	0 %	50 %	50 %	296134793
7379	NC_014153	TGC	2	6	313395	313400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134793
7380	NC_014153	CAT	2	6	313504	313509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134793
7381	NC_014153	TCA	3	9	313515	313523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134793
7382	NC_014153	TGG	2	6	313530	313535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134793
7383	NC_014153	TCA	2	6	313536	313541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134793
7384	NC_014153	CGC	2	6	313602	313607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134794
7385	NC_014153	GC	3	6	313625	313630	0 %	0 %	50 %	50 %	296134794
7386	NC_014153	TGC	2	6	313671	313676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
7387	NC_014153	CGC	2	6	313752	313757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134794
7388	NC_014153	CGG	2	6	313798	313803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134794
7389	NC_014153	TGGC	2	8	313868	313875	0 %	25 %	50 %	25 %	296134794
7390	NC_014153	CAG	2	6	313891	313896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134794
7391	NC_014153	GTC	2	6	313945	313950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
7392	NC_014153	CGG	2	6	313978	313983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134794
7393	NC_014153	CTG	2	6	313985	313990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
7394	NC_014153	GCT	2	6	314011	314016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
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7396	NC_014153	TGC	3	9	314091	314099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
7397	NC_014153	GCT	2	6	314119	314124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
7398	NC_014153	CGC	2	6	314131	314136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134794
7399	NC_014153	CGATAC	2	12	314188	314199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296134794
7400	NC_014153	AGC	2	6	314279	314284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134794
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7402	NC_014153	GCG	2	6	314324	314329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134794
7403	NC_014153	CTG	2	6	314330	314335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
7404	NC_014153	GC	3	6	314343	314348	0 %	0 %	50 %	50 %	296134794
7405	NC_014153	GCTGGC	2	12	314359	314370	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296134794
7406	NC_014153	CTG	2	6	314387	314392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134794
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7411	NC_014153	CTGGCG	2	12	314549	314560	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296134794
7412	NC_014153	CGGGGC	2	12	314580	314591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134794
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7414	NC_014153	ACT	2	6	314753	314758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134795
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7416	NC_014153	TGC	2	6	314815	314820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134795
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7419	NC_014153	GAG	2	6	314935	314940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134795
7420	NC_014153	CGA	2	6	315003	315008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134795
7421	NC_014153	CTG	2	6	315025	315030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134795
7422	NC_014153	GGT	2	6	315039	315044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134795
7423	NC_014153	GCGTCT	2	12	315048	315059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134795
7424	NC_014153	GCT	2	6	315132	315137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134796
7425	NC_014153	CGG	2	6	315149	315154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134796
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7430	NC_014153	CGA	2	6	315390	315395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134796
7431	NC_014153	GCA	2	6	315414	315419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134796
7432	NC_014153	CGC	2	6	315483	315488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134796
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7435	NC_014153	GCA	2	6	315684	315689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134796
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7438	NC_014153	CGC	2	6	316074	316079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134797
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7440	NC_014153	CGC	2	6	316149	316154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134797
7441	NC_014153	GCC	3	9	316221	316229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134797
7442	NC_014153	CTGG	2	8	316248	316255	0 %	25 %	50 %	25 %	296134797
7443	NC_014153	AGG	2	6	316307	316312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134797
7444	NC_014153	TGA	2	6	316334	316339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134797
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7447	NC_014153	CTG	2	6	316477	316482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134797
7448	NC_014153	CGC	2	6	316512	316517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134797
7449	NC_014153	GGC	2	6	316540	316545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134797
7450	NC_014153	TCG	2	6	316559	316564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134797
7451	NC_014153	ATG	2	6	316567	316572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134797
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7453	NC_014153	CCA	2	6	316644	316649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134797
7454	NC_014153	CAC	2	6	316650	316655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134797
7455	NC_014153	CAT	2	6	316671	316676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134797
7456	NC_014153	CCAC	2	8	316679	316686	25 %	0 %	0 %	75 %	296134797
7457	NC_014153	ATC	2	6	316687	316692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134797
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7459	NC_014153	TCAAGG	2	12	316724	316735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296134797
7460	NC_014153	CTG	2	6	316777	316782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134797
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7462	NC_014153	GTG	2	6	316897	316902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134797
7463	NC_014153	GAG	2	6	316933	316938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134797
7464	NC_014153	TGC	2	6	316946	316951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134797
7465	NC_014153	CGA	2	6	316974	316979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134797
7466	NC_014153	ACTG	2	8	317010	317017	25 %	25 %	25 %	25 %	296134797
7467	NC_014153	CTC	2	6	317058	317063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134797
7468	NC_014153	GGT	2	6	317070	317075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134797
7469	NC_014153	CG	3	6	317087	317092	0 %	0 %	50 %	50 %	296134797
7470	NC_014153	GGT	2	6	317118	317123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134797
7471	NC_014153	TGG	2	6	317138	317143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134797
7472	NC_014153	CGC	2	6	317144	317149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134797
7473	NC_014153	TCA	2	6	317225	317230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134797
7474	NC_014153	TGA	2	6	317282	317287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134797
7475	NC_014153	CGG	2	6	317417	317422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134798
7476	NC_014153	CTG	3	9	317427	317435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134798
7477	NC_014153	TGC	2	6	317443	317448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134798
7478	NC_014153	ACGC	2	8	317600	317607	25 %	0 %	25 %	50 %	296134798
7479	NC_014153	CTG	2	6	317634	317639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134798
7480	NC_014153	CTGG	2	8	317665	317672	0 %	25 %	50 %	25 %	296134798
7481	NC_014153	GCG	2	6	317679	317684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134798
7482	NC_014153	AGCC	2	8	317696	317703	25 %	0 %	25 %	50 %	296134798
7483	NC_014153	GGC	2	6	317733	317738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134798
7484	NC_014153	ACC	2	6	317748	317753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134798
7485	NC_014153	GGT	2	6	317815	317820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134798
7486	NC_014153	CGC	2	6	317824	317829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134798
7487	NC_014153	AC	3	6	317866	317871	50 %	0 %	0 %	50 %	296134798
7488	NC_014153	CGG	2	6	317921	317926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134798
7489	NC_014153	GGCTTT	2	12	317962	317973	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296134798
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7491	NC_014153	GCG	2	6	318135	318140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134798
7492	NC_014153	GCC	2	6	318187	318192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134798
7493	NC_014153	GCC	2	6	318230	318235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134798
7494	NC_014153	CAGC	2	8	318253	318260	25 %	0 %	25 %	50 %	296134798
7495	NC_014153	TCGGG	2	10	318312	318321	0 %	20 %	60 %	20 %	296134798
7496	NC_014153	GC	3	6	318371	318376	0 %	0 %	50 %	50 %	296134798
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7500	NC_014153	GGC	2	6	318715	318720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134799

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