MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71003	NC_014153	TCG	2	6	3220173	3220178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137460
71004	NC_014153	CTG	2	6	3220181	3220186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137460
71005	NC_014153	CG	3	6	3220303	3220308	0 %	0 %	50 %	50 %	296137461
71006	NC_014153	CTG	2	6	3220320	3220325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137461
71007	NC_014153	TGC	2	6	3220369	3220374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137461
71008	NC_014153	TGC	2	6	3220393	3220398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137461
71009	NC_014153	GGC	2	6	3220407	3220412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137461
71010	NC_014153	CTT	2	6	3220419	3220424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137461
71011	NC_014153	GTT	2	6	3220445	3220450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137461
71012	NC_014153	GTG	2	6	3220470	3220475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137461
71013	NC_014153	CG	3	6	3220512	3220517	0 %	0 %	50 %	50 %	296137461
71014	NC_014153	TC	3	6	3220535	3220540	0 %	50 %	0 %	50 %	296137461
71015	NC_014153	CGC	2	6	3220543	3220548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137461
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71017	NC_014153	GTG	3	9	3220599	3220607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137461
71018	NC_014153	CTG	2	6	3220614	3220619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137461
71019	NC_014153	TGC	2	6	3220621	3220626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137461
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71021	NC_014153	GCT	2	6	3220691	3220696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137461
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71043	NC_014153	GCCA	2	8	3221661	3221668	25 %	0 %	25 %	50 %	296137461
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71056	NC_014153	CGCTG	2	10	3222089	3222098	0 %	20 %	40 %	40 %	296137461
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71117	NC_014153	GC	3	6	3224071	3224076	0 %	0 %	50 %	50 %	296137463
71118	NC_014153	CGC	2	6	3224083	3224088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137463
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71145	NC_014153	CG	3	6	3225078	3225083	0 %	0 %	50 %	50 %	296137464
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71226	NC_014153	GTC	2	6	3227930	3227935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137465
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71230	NC_014153	CGC	2	6	3228149	3228154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137465
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71232	NC_014153	GCG	2	6	3228261	3228266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137465
71233	NC_014153	CAC	2	6	3228275	3228280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137465
71234	NC_014153	CCA	2	6	3228353	3228358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296137465
71235	NC_014153	CCG	2	6	3228392	3228397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137465
71236	NC_014153	CGA	2	6	3228419	3228424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137465
71237	NC_014153	CG	3	6	3228460	3228465	0 %	0 %	50 %	50 %	296137465
71238	NC_014153	CTG	2	6	3228552	3228557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137465
71239	NC_014153	GTG	2	6	3228561	3228566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137465
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71243	NC_014153	CCCG	2	8	3228817	3228824	0 %	0 %	25 %	75 %	296137465
71244	NC_014153	TGA	2	6	3228829	3228834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137465
71245	NC_014153	CCG	6	18	3228835	3228852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137465
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71250	NC_014153	CTG	2	6	3228957	3228962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137465
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71345	NC_014153	TCT	2	6	3233858	3233863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137471
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71463	NC_014153	CTG	2	6	3238768	3238773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137474
71464	NC_014153	CGC	2	6	3238797	3238802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137474
71465	NC_014153	CG	3	6	3238807	3238812	0 %	0 %	50 %	50 %	296137474
71466	NC_014153	GCA	2	6	3238997	3239002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137475
71467	NC_014153	GAC	2	6	3239151	3239156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137475
71468	NC_014153	TCT	2	6	3239185	3239190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137475
71469	NC_014153	A	6	6	3239208	3239213	100 %	0 %	0 %	0 %	296137475
71470	NC_014153	GCA	2	6	3239274	3239279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137476
71471	NC_014153	TGGCCT	2	12	3239296	3239307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137476
71472	NC_014153	AAAC	2	8	3239331	3239338	75 %	0 %	0 %	25 %	296137476
71473	NC_014153	CATC	2	8	3239386	3239393	25 %	25 %	0 %	50 %	296137476
71474	NC_014153	CTGCGC	2	12	3239426	3239437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296137476
71475	NC_014153	CAG	2	6	3239441	3239446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137476
71476	NC_014153	ATC	2	6	3239507	3239512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137476
71477	NC_014153	GC	5	10	3239548	3239557	0 %	0 %	50 %	50 %	296137476
71478	NC_014153	AGC	2	6	3239613	3239618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137476
71479	NC_014153	CGC	2	6	3239630	3239635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137476
71480	NC_014153	CGC	2	6	3239651	3239656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137476
71481	NC_014153	TGT	2	6	3239784	3239789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137476
71482	NC_014153	CGG	2	6	3239818	3239823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137476
71483	NC_014153	CGA	2	6	3239965	3239970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137477
71484	NC_014153	GCT	2	6	3239971	3239976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137477
71485	NC_014153	GCA	2	6	3240046	3240051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137477
71486	NC_014153	CAT	2	6	3240182	3240187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137477
71487	NC_014153	GGC	2	6	3240194	3240199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137477
71488	NC_014153	TCA	2	6	3240223	3240228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296137477
71489	NC_014153	GCT	2	6	3240474	3240479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137478
71490	NC_014153	GGC	2	6	3240493	3240498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296137478
71491	NC_014153	TGG	2	6	3240502	3240507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296137478
71492	NC_014153	ACG	2	6	3240542	3240547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137478
71493	NC_014153	GTA	2	6	3240569	3240574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137478
71494	NC_014153	CTT	2	6	3240659	3240664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296137478
71495	NC_014153	CGA	2	6	3240721	3240726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296137478
71496	NC_014153	TGA	2	6	3240802	3240807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296137478
71497	NC_014153	GTT	2	6	3240860	3240865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296137478
71498	NC_014153	GAACTT	2	12	3240872	3240883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296137478
71499	NC_014153	GCC	2	6	3240897	3240902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296137478
71500	NC_014153	GTC	2	6	3240968	3240973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296137478

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