MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014153	GCC	2	6	279002	279007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134757
6502	NC_014153	CGA	2	6	279032	279037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134757
6503	NC_014153	GCA	2	6	279065	279070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134757
6504	NC_014153	GGC	2	6	279083	279088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134757
6505	NC_014153	CGG	2	6	279094	279099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134757
6506	NC_014153	CGA	2	6	279110	279115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134757
6507	NC_014153	GC	3	6	279145	279150	0 %	0 %	50 %	50 %	296134757
6508	NC_014153	GC	3	6	279152	279157	0 %	0 %	50 %	50 %	296134757
6509	NC_014153	GGGC	2	8	279178	279185	0 %	0 %	75 %	25 %	296134757
6510	NC_014153	GCA	2	6	279218	279223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134757
6511	NC_014153	GC	4	8	279303	279310	0 %	0 %	50 %	50 %	296134757
6512	NC_014153	CGC	2	6	279326	279331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134757
6513	NC_014153	GGT	2	6	279338	279343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134757
6514	NC_014153	ACG	2	6	279354	279359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134757
6515	NC_014153	GC	4	8	279365	279372	0 %	0 %	50 %	50 %	296134757
6516	NC_014153	GGC	2	6	279389	279394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134757
6517	NC_014153	GCC	2	6	279399	279404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134757
6518	NC_014153	GTG	2	6	279480	279485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134757
6519	NC_014153	GCT	2	6	279491	279496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134757
6520	NC_014153	CGC	2	6	279569	279574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134757
6521	NC_014153	CAT	2	6	279714	279719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134758
6522	NC_014153	C	6	6	279734	279739	0 %	0 %	0 %	100 %	296134758
6523	NC_014153	GGC	2	6	279780	279785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134758
6524	NC_014153	CTG	2	6	279847	279852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134758
6525	NC_014153	GAA	2	6	279862	279867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134758
6526	NC_014153	GCT	2	6	279975	279980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134758
6527	NC_014153	CCTG	2	8	279993	280000	0 %	25 %	25 %	50 %	296134758
6528	NC_014153	TGG	2	6	280067	280072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134758
6529	NC_014153	GCT	2	6	280113	280118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134758
6530	NC_014153	GC	3	6	280153	280158	0 %	0 %	50 %	50 %	296134758
6531	NC_014153	ACG	2	6	280193	280198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134758
6532	NC_014153	ATC	2	6	280220	280225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134758
6533	NC_014153	GC	3	6	280227	280232	0 %	0 %	50 %	50 %	296134758
6534	NC_014153	TTC	2	6	280234	280239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134758
6535	NC_014153	GAGC	2	8	280314	280321	25 %	0 %	50 %	25 %	296134758
6536	NC_014153	GCC	2	6	280364	280369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134759
6537	NC_014153	CGG	2	6	280371	280376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134759
6538	NC_014153	ATG	2	6	280391	280396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134759
6539	NC_014153	CAG	2	6	280414	280419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134759
6540	NC_014153	GC	3	6	280425	280430	0 %	0 %	50 %	50 %	296134759
6541	NC_014153	GCG	2	6	280445	280450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134759
6542	NC_014153	GGC	2	6	280470	280475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134759
6543	NC_014153	TGCAG	2	10	280593	280602	20 %	20 %	40 %	20 %	296134759
6544	NC_014153	CTG	2	6	280630	280635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134759
6545	NC_014153	GGC	2	6	280659	280664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134759
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6553	NC_014153	GGC	2	6	280855	280860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134759
6554	NC_014153	TGC	2	6	280874	280879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134759
6555	NC_014153	GGC	2	6	280909	280914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134759
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6557	NC_014153	CAAAA	2	10	280969	280978	80 %	0 %	0 %	20 %	296134759
6558	NC_014153	CGG	3	9	281007	281015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134760
6559	NC_014153	GGCCG	2	10	281019	281028	0 %	0 %	60 %	40 %	296134760
6560	NC_014153	TCAG	2	8	281062	281069	25 %	25 %	25 %	25 %	296134760
6561	NC_014153	GCTG	2	8	281078	281085	0 %	25 %	50 %	25 %	296134760
6562	NC_014153	GCT	2	6	281090	281095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134760
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6564	NC_014153	GGT	3	9	281181	281189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134760
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6569	NC_014153	GGCG	2	8	281348	281355	0 %	0 %	75 %	25 %	296134760
6570	NC_014153	TGAT	2	8	281368	281375	25 %	50 %	25 %	0 %	296134760
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6580	NC_014153	CGA	2	6	281598	281603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134760
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6985	NC_014153	CCA	2	6	297775	297780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134777
6986	NC_014153	TGCC	2	8	297840	297847	0 %	25 %	25 %	50 %	296134777
6987	NC_014153	GCC	3	9	297868	297876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134777
6988	NC_014153	CT	3	6	297916	297921	0 %	50 %	0 %	50 %	296134777
6989	NC_014153	CCA	2	6	297949	297954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134777
6990	NC_014153	G	6	6	298054	298059	0 %	0 %	100 %	0 %	296134777
6991	NC_014153	GCG	2	6	298181	298186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134777
6992	NC_014153	CAT	2	6	298248	298253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134778
6993	NC_014153	CTG	2	6	298300	298305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134778
6994	NC_014153	CAA	2	6	298340	298345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134778
6995	NC_014153	CCT	2	6	298358	298363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134778
6996	NC_014153	CA	3	6	298411	298416	50 %	0 %	0 %	50 %	296134778
6997	NC_014153	TCGCT	2	10	298439	298448	0 %	40 %	20 %	40 %	296134778
6998	NC_014153	TGA	2	6	298493	298498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134778
6999	NC_014153	AAG	2	6	298507	298512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134778
7000	NC_014153	CTG	2	6	298513	298518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134778

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