MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014153	CGA	2	6	239139	239144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5502	NC_014153	AGC	2	6	239171	239176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5503	NC_014153	CGGCG	2	10	239190	239199	0 %	0 %	60 %	40 %	296134720
5504	NC_014153	GAA	2	6	239209	239214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134720
5505	NC_014153	TGC	2	6	239228	239233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5506	NC_014153	CCG	2	6	239242	239247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134720
5507	NC_014153	CG	3	6	239332	239337	0 %	0 %	50 %	50 %	296134720
5508	NC_014153	GCT	2	6	239352	239357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5509	NC_014153	ACG	2	6	239375	239380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5510	NC_014153	CGA	2	6	239391	239396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5511	NC_014153	GGT	2	6	239415	239420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134720
5512	NC_014153	GAG	2	6	239422	239427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134720
5513	NC_014153	GGA	2	6	239445	239450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134720
5514	NC_014153	GC	4	8	239486	239493	0 %	0 %	50 %	50 %	296134720
5515	NC_014153	CCA	2	6	239534	239539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134720
5516	NC_014153	CG	4	8	239540	239547	0 %	0 %	50 %	50 %	296134720
5517	NC_014153	TCG	2	6	239585	239590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5518	NC_014153	CCG	2	6	239609	239614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134720
5519	NC_014153	TGC	2	6	239633	239638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5520	NC_014153	CGC	2	6	239695	239700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134720
5521	NC_014153	CGC	2	6	239711	239716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134720
5522	NC_014153	CTG	2	6	239731	239736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5523	NC_014153	GCC	2	6	239767	239772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134720
5524	NC_014153	GCT	2	6	239856	239861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5525	NC_014153	GGT	2	6	239868	239873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134720
5526	NC_014153	CGG	2	6	239886	239891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134720
5527	NC_014153	CAG	2	6	239974	239979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134720
5528	NC_014153	CG	3	6	239999	240004	0 %	0 %	50 %	50 %	296134720
5529	NC_014153	GCG	2	6	240019	240024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134720
5530	NC_014153	GCCGC	2	10	240046	240055	0 %	0 %	40 %	60 %	296134720
5531	NC_014153	GCG	2	6	240065	240070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134720
5532	NC_014153	CGG	2	6	240078	240083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134720
5533	NC_014153	GC	3	6	240123	240128	0 %	0 %	50 %	50 %	296134721
5534	NC_014153	GCC	2	6	240209	240214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134721
5535	NC_014153	GCG	2	6	240236	240241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134721
5536	NC_014153	GCC	2	6	240326	240331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134721
5537	NC_014153	CGC	2	6	240387	240392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134721
5538	NC_014153	TAA	2	6	240404	240409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134721
5539	NC_014153	CCGTT	2	10	240444	240453	0 %	40 %	20 %	40 %	296134721
5540	NC_014153	GC	3	6	240498	240503	0 %	0 %	50 %	50 %	296134721
5541	NC_014153	GTT	2	6	240514	240519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134721
5542	NC_014153	GC	3	6	240564	240569	0 %	0 %	50 %	50 %	296134721
5543	NC_014153	TGC	2	6	240603	240608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134721
5544	NC_014153	GTT	2	6	240610	240615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134721
5545	NC_014153	GTC	2	6	240668	240673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134721
5546	NC_014153	TGC	2	6	240684	240689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134721
5547	NC_014153	GC	3	6	240726	240731	0 %	0 %	50 %	50 %	296134721
5548	NC_014153	CCCG	2	8	240814	240821	0 %	0 %	25 %	75 %	296134721
5549	NC_014153	GCG	2	6	240842	240847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134721
5550	NC_014153	GCG	2	6	240854	240859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134721
5551	NC_014153	GGATCG	2	12	240873	240884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296134721
5552	NC_014153	GTG	2	6	240890	240895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134721
5553	NC_014153	CGC	2	6	240923	240928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134721
5554	NC_014153	TGC	2	6	240930	240935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134721
5555	NC_014153	GC	3	6	240960	240965	0 %	0 %	50 %	50 %	296134721
5556	NC_014153	GCC	2	6	240968	240973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134721
5557	NC_014153	CCA	2	6	241068	241073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134721
5558	NC_014153	GCC	2	6	241102	241107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134721
5559	NC_014153	GC	3	6	241110	241115	0 %	0 %	50 %	50 %	296134721
5560	NC_014153	GTGACG	2	12	241121	241132	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296134721
5561	NC_014153	GTG	3	9	241154	241162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134721
5562	NC_014153	TGC	2	6	241164	241169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134721
5563	NC_014153	G	6	6	241222	241227	0 %	0 %	100 %	0 %	296134721
5564	NC_014153	CCT	2	6	241292	241297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134721
5565	NC_014153	GCG	2	6	241331	241336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134721
5566	NC_014153	TGC	2	6	241345	241350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134721
5567	NC_014153	GCGTTG	2	12	241497	241508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296134722
5568	NC_014153	CTG	2	6	241509	241514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134722
5569	NC_014153	TCC	2	6	241515	241520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134722
5570	NC_014153	GAC	2	6	241537	241542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134722
5571	NC_014153	GGC	2	6	241583	241588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134722
5572	NC_014153	GCC	2	6	241592	241597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134722
5573	NC_014153	GC	3	6	241663	241668	0 %	0 %	50 %	50 %	296134722
5574	NC_014153	GCTGA	2	10	241679	241688	20 %	20 %	40 %	20 %	296134722
5575	NC_014153	GCT	2	6	241706	241711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134722
5576	NC_014153	GCG	2	6	241731	241736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134722
5577	NC_014153	GTCGAG	2	12	241763	241774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296134722
5578	NC_014153	GTT	2	6	241889	241894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134722
5579	NC_014153	TGCCGA	2	12	241903	241914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296134722
5580	NC_014153	TGC	2	6	241975	241980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134722
5581	NC_014153	CGGT	2	8	242088	242095	0 %	25 %	50 %	25 %	296134722
5582	NC_014153	TGAA	2	8	242133	242140	50 %	25 %	25 %	0 %	296134722
5583	NC_014153	GCG	2	6	242205	242210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134722
5584	NC_014153	GCG	2	6	242223	242228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134722
5585	NC_014153	TGAAC	2	10	242248	242257	40 %	20 %	20 %	20 %	296134722
5586	NC_014153	CGC	2	6	242281	242286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134722
5587	NC_014153	TGC	2	6	242311	242316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134722
5588	NC_014153	GCAG	2	8	242345	242352	25 %	0 %	50 %	25 %	296134722
5589	NC_014153	GC	3	6	242356	242361	0 %	0 %	50 %	50 %	296134722
5590	NC_014153	TTG	2	6	242400	242405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134722
5591	NC_014153	CCA	2	6	242437	242442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134722
5592	NC_014153	TGG	2	6	242518	242523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134722
5593	NC_014153	GCGG	2	8	242607	242614	0 %	0 %	75 %	25 %	296134722
5594	NC_014153	GCT	2	6	242618	242623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134722
5595	NC_014153	CCG	4	12	242625	242636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134722
5596	NC_014153	CAA	2	6	242645	242650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134722
5597	NC_014153	GCCA	2	8	242654	242661	25 %	0 %	25 %	50 %	296134722
5598	NC_014153	CGAG	2	8	242779	242786	25 %	0 %	50 %	25 %	296134723
5599	NC_014153	CAC	2	6	242834	242839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134723
5600	NC_014153	GTT	2	6	242872	242877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134723
5601	NC_014153	GCG	2	6	242892	242897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134723
5602	NC_014153	CAG	2	6	242924	242929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134723
5603	NC_014153	TTG	2	6	242930	242935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134723
5604	NC_014153	CGC	2	6	242984	242989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134723
5605	NC_014153	GCG	2	6	243019	243024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134723
5606	NC_014153	GCT	2	6	243176	243181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134723
5607	NC_014153	GA	4	8	243203	243210	50 %	0 %	50 %	0 %	296134723
5608	NC_014153	GAG	2	6	243228	243233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134723
5609	NC_014153	TTTG	2	8	243292	243299	0 %	75 %	25 %	0 %	296134723
5610	NC_014153	TTCA	2	8	243343	243350	25 %	50 %	0 %	25 %	296134724
5611	NC_014153	CCA	2	6	243384	243389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134724
5612	NC_014153	GCG	2	6	243428	243433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134724
5613	NC_014153	GCG	2	6	243453	243458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134724
5614	NC_014153	GGC	2	6	243478	243483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134724
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5616	NC_014153	CG	3	6	243545	243550	0 %	0 %	50 %	50 %	296134724
5617	NC_014153	GC	5	10	243573	243582	0 %	0 %	50 %	50 %	296134724
5618	NC_014153	CCG	2	6	243605	243610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134724
5619	NC_014153	GC	4	8	243643	243650	0 %	0 %	50 %	50 %	296134724
5620	NC_014153	TGC	2	6	243662	243667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134724
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5622	NC_014153	GCG	2	6	243753	243758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134724
5623	NC_014153	CGG	2	6	243771	243776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134724
5624	NC_014153	GC	3	6	243785	243790	0 %	0 %	50 %	50 %	296134724
5625	NC_014153	TCG	2	6	243824	243829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134724
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5636	NC_014153	CG	4	8	244216	244223	0 %	0 %	50 %	50 %	296134725
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5742	NC_014153	CGGAC	2	10	248162	248171	20 %	0 %	40 %	40 %	296134729
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5988	NC_014153	ATC	2	6	256844	256849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134736
5989	NC_014153	GCA	2	6	256873	256878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134736
5990	NC_014153	GAT	2	6	256916	256921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134736
5991	NC_014153	GCGGG	2	10	256943	256952	0 %	0 %	80 %	20 %	296134736
5992	NC_014153	TCGG	2	8	257400	257407	0 %	25 %	50 %	25 %	296134737
5993	NC_014153	TCA	2	6	257484	257489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134737
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