MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 74891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_014153	CCG	2	6	2631997	2632002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136907
58002	NC_014153	GCA	2	6	2632010	2632015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136907
58003	NC_014153	TGC	2	6	2632183	2632188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136907
58004	NC_014153	GGT	2	6	2632229	2632234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296136907
58005	NC_014153	GAGC	2	8	2632235	2632242	25 %	0 %	50 %	25 %	296136907
58006	NC_014153	GCT	3	9	2632283	2632291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136907
58007	NC_014153	CGCACC	2	12	2632299	2632310	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296136907
58008	NC_014153	GCA	2	6	2632339	2632344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136907
58009	NC_014153	TGC	2	6	2632438	2632443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136907
58010	NC_014153	TGG	3	9	2632504	2632512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296136907
58011	NC_014153	GTC	2	6	2632536	2632541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136907
58012	NC_014153	CAG	2	6	2632605	2632610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136907
58013	NC_014153	GC	3	6	2632622	2632627	0 %	0 %	50 %	50 %	296136907
58014	NC_014153	GCC	2	6	2632629	2632634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136907
58015	NC_014153	CGG	2	6	2632637	2632642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136907
58016	NC_014153	AGCCC	2	10	2632658	2632667	20 %	0 %	20 %	60 %	296136907
58017	NC_014153	GCC	2	6	2632710	2632715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136907
58018	NC_014153	CTG	2	6	2632777	2632782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136908
58019	NC_014153	CGA	2	6	2632785	2632790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136908
58020	NC_014153	TCG	2	6	2632803	2632808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136908
58021	NC_014153	GGT	2	6	2632848	2632853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296136908
58022	NC_014153	CAT	2	6	2632911	2632916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296136908
58023	NC_014153	AG	3	6	2632962	2632967	50 %	0 %	50 %	0 %	296136908
58024	NC_014153	GCC	2	6	2632978	2632983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136908
58025	NC_014153	GGC	2	6	2633022	2633027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136908
58026	NC_014153	CGGCG	2	10	2633034	2633043	0 %	0 %	60 %	40 %	296136908
58027	NC_014153	GC	3	6	2633046	2633051	0 %	0 %	50 %	50 %	296136908
58028	NC_014153	GAGC	2	8	2633054	2633061	25 %	0 %	50 %	25 %	296136908
58029	NC_014153	CGA	2	6	2633088	2633093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136908
58030	NC_014153	CGG	2	6	2633100	2633105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136908
58031	NC_014153	TGCGC	2	10	2633115	2633124	0 %	20 %	40 %	40 %	296136908
58032	NC_014153	GTC	2	6	2633131	2633136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136908
58033	NC_014153	ACG	2	6	2633188	2633193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136908
58034	NC_014153	GAAG	2	8	2633202	2633209	50 %	0 %	50 %	0 %	296136908
58035	NC_014153	CGC	2	6	2633240	2633245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136908
58036	NC_014153	CGC	3	9	2633268	2633276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136908
58037	NC_014153	TCGC	2	8	2633279	2633286	0 %	25 %	25 %	50 %	296136908
58038	NC_014153	GCAA	2	8	2633290	2633297	50 %	0 %	25 %	25 %	296136908
58039	NC_014153	CG	4	8	2633307	2633314	0 %	0 %	50 %	50 %	296136908
58040	NC_014153	CGC	2	6	2633490	2633495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136909
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58042	NC_014153	TGC	2	6	2633535	2633540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136909
58043	NC_014153	GC	3	6	2633574	2633579	0 %	0 %	50 %	50 %	296136909
58044	NC_014153	GGC	2	6	2633599	2633604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136909
58045	NC_014153	GC	3	6	2633603	2633608	0 %	0 %	50 %	50 %	296136909
58046	NC_014153	GAC	2	6	2633641	2633646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136909
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58048	NC_014153	CAT	2	6	2636748	2636753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296136910
58049	NC_014153	CAC	2	6	2636826	2636831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296136910
58050	NC_014153	GCA	2	6	2636871	2636876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136910
58051	NC_014153	GCTCGT	2	12	2636918	2636929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136910
58052	NC_014153	GCA	2	6	2636970	2636975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136910
58053	NC_014153	GCG	2	6	2637035	2637040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136910
58054	NC_014153	GCC	2	6	2637098	2637103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136910
58055	NC_014153	TGA	2	6	2637104	2637109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296136910
58056	NC_014153	GC	3	6	2637124	2637129	0 %	0 %	50 %	50 %	296136910
58057	NC_014153	GC	4	8	2637225	2637232	0 %	0 %	50 %	50 %	296136910
58058	NC_014153	GAT	2	6	2637252	2637257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296136910
58059	NC_014153	CGC	2	6	2637258	2637263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136910
58060	NC_014153	ACCTCA	2	12	2637365	2637376	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	296136910
58061	NC_014153	CGC	2	6	2637431	2637436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136910
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58063	NC_014153	GC	3	6	2637559	2637564	0 %	0 %	50 %	50 %	296136910
58064	NC_014153	ACT	2	6	2637599	2637604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296136910
58065	NC_014153	CGA	2	6	2637624	2637629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136910
58066	NC_014153	TGGCCA	2	12	2637665	2637676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296136910
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58074	NC_014153	CG	4	8	2637999	2638006	0 %	0 %	50 %	50 %	296136910
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58089	NC_014153	GCTG	2	8	2638757	2638764	0 %	25 %	50 %	25 %	296136910
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58115	NC_014153	GGC	2	6	2640340	2640345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136910
58116	NC_014153	CGG	2	6	2640393	2640398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136910
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58459	NC_014153	GGC	2	6	2661992	2661997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136933
58460	NC_014153	GCA	2	6	2662017	2662022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136933
58461	NC_014153	GAC	2	6	2662064	2662069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136933
58462	NC_014153	GCG	2	6	2662101	2662106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136933
58463	NC_014153	GCCCGC	2	12	2662127	2662138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136933
58464	NC_014153	CTG	2	6	2662145	2662150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136933
58465	NC_014153	GC	3	6	2662181	2662186	0 %	0 %	50 %	50 %	296136933
58466	NC_014153	TCC	2	6	2662246	2662251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296136933
58467	NC_014153	CT	4	8	2662303	2662310	0 %	50 %	0 %	50 %	296136934
58468	NC_014153	CGACC	2	10	2662311	2662320	20 %	0 %	20 %	60 %	296136934
58469	NC_014153	CGC	2	6	2662323	2662328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136934
58470	NC_014153	CG	4	8	2662365	2662372	0 %	0 %	50 %	50 %	296136934
58471	NC_014153	TGC	2	6	2662376	2662381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58472	NC_014153	GCT	2	6	2662383	2662388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58473	NC_014153	GCC	2	6	2662406	2662411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136934
58474	NC_014153	GGC	2	6	2662439	2662444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136934
58475	NC_014153	GAC	2	6	2662456	2662461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58476	NC_014153	GCG	2	6	2662523	2662528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136934
58477	NC_014153	GCGCC	2	10	2662554	2662563	0 %	0 %	40 %	60 %	296136934
58478	NC_014153	GCT	2	6	2662587	2662592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58479	NC_014153	GCT	2	6	2662596	2662601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58480	NC_014153	ATC	2	6	2662618	2662623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296136934
58481	NC_014153	CG	3	6	2662627	2662632	0 %	0 %	50 %	50 %	296136934
58482	NC_014153	TCT	2	6	2662677	2662682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296136934
58483	NC_014153	ACA	2	6	2662712	2662717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296136934
58484	NC_014153	GCC	2	6	2662834	2662839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136934
58485	NC_014153	GC	3	6	2662880	2662885	0 %	0 %	50 %	50 %	296136934
58486	NC_014153	CGGCTG	2	12	2662899	2662910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296136934
58487	NC_014153	GGC	2	6	2662912	2662917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136934
58488	NC_014153	CCG	2	6	2662970	2662975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136934
58489	NC_014153	CGCCCG	2	12	2662989	2663000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136934
58490	NC_014153	CGC	2	6	2663015	2663020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296136934
58491	NC_014153	ACG	2	6	2663081	2663086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58492	NC_014153	GC	3	6	2663155	2663160	0 %	0 %	50 %	50 %	296136934
58493	NC_014153	ACCATC	2	12	2663194	2663205	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	296136934
58494	NC_014153	CGA	2	6	2663208	2663213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58495	NC_014153	CGA	2	6	2663220	2663225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58496	NC_014153	CGG	2	6	2663268	2663273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296136934
58497	NC_014153	TGC	2	6	2663276	2663281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58498	NC_014153	CGCGC	2	10	2663285	2663294	0 %	0 %	40 %	60 %	296136934
58499	NC_014153	GTC	2	6	2663329	2663334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296136934
58500	NC_014153	CGA	2	6	2663430	2663435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296136934

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