MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_014152	CGG	2	6	2821164	2821169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134202
46003	NC_014152	ATC	2	6	2821248	2821253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
46004	NC_014152	T	7	7	2821265	2821271	0 %	100 %	0 %	0 %	296134202
46005	NC_014152	A	6	6	2821322	2821327	100 %	0 %	0 %	0 %	296134202
46006	NC_014152	TTCAA	2	10	2821332	2821341	40 %	40 %	0 %	20 %	296134202
46007	NC_014152	TTG	2	6	2821368	2821373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134202
46008	NC_014152	GCC	2	6	2821447	2821452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134202
46009	NC_014152	CCA	2	6	2821486	2821491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134202
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46011	NC_014152	T	6	6	2821605	2821610	0 %	100 %	0 %	0 %	296134202
46012	NC_014152	AACC	2	8	2821637	2821644	50 %	0 %	0 %	50 %	296134202
46013	NC_014152	CAG	2	6	2821651	2821656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134202
46014	NC_014152	ATT	2	6	2821698	2821703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134202
46015	NC_014152	CAT	2	6	2821726	2821731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
46016	NC_014152	TAA	2	6	2821774	2821779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134202
46017	NC_014152	CATT	2	8	2821813	2821820	25 %	50 %	0 %	25 %	296134202
46018	NC_014152	CAG	2	6	2821925	2821930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134202
46019	NC_014152	GCC	2	6	2822031	2822036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134202
46020	NC_014152	TCA	2	6	2822067	2822072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
46021	NC_014152	TCAG	2	8	2822121	2822128	25 %	25 %	25 %	25 %	296134202
46022	NC_014152	TGTAG	2	10	2822154	2822163	20 %	40 %	40 %	0 %	296134202
46023	NC_014152	AT	3	6	2822176	2822181	50 %	50 %	0 %	0 %	296134202
46024	NC_014152	ATA	2	6	2822186	2822191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134202
46025	NC_014152	TTC	2	6	2822195	2822200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134202
46026	NC_014152	TTC	2	6	2822204	2822209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134202
46027	NC_014152	GGT	2	6	2822216	2822221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134202
46028	NC_014152	TCC	2	6	2822295	2822300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134202
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46030	NC_014152	AT	3	6	2822358	2822363	50 %	50 %	0 %	0 %	296134202
46031	NC_014152	CAGC	2	8	2822365	2822372	25 %	0 %	25 %	50 %	296134202
46032	NC_014152	GGA	2	6	2822389	2822394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134202
46033	NC_014152	TCA	2	6	2822422	2822427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134202
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46036	NC_014152	T	6	6	2822927	2822932	0 %	100 %	0 %	0 %	296134203
46037	NC_014152	CCTCTA	2	12	2822949	2822960	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296134203
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46039	NC_014152	AGTA	2	8	2823118	2823125	50 %	25 %	25 %	0 %	296134203
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46100	NC_014152	TATTT	2	10	2827571	2827580	20 %	80 %	0 %	0 %	296134207
46101	NC_014152	G	6	6	2827631	2827636	0 %	0 %	100 %	0 %	296134207
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46113	NC_014152	TTC	2	6	2828355	2828360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134208
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46117	NC_014152	A	6	6	2828526	2828531	100 %	0 %	0 %	0 %	296134208
46118	NC_014152	GCA	2	6	2828638	2828643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134209
46119	NC_014152	CAT	2	6	2828660	2828665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134209
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46121	NC_014152	TAAA	2	8	2828747	2828754	75 %	25 %	0 %	0 %	296134209
46122	NC_014152	TAT	2	6	2828784	2828789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134209
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46210	NC_014152	AT	3	6	2833518	2833523	50 %	50 %	0 %	0 %	296134212
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46215	NC_014152	GCA	2	6	2833704	2833709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134212
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46218	NC_014152	GGCC	3	12	2833879	2833890	0 %	0 %	50 %	50 %	296134213
46219	NC_014152	TCCG	2	8	2833928	2833935	0 %	25 %	25 %	50 %	296134213
46220	NC_014152	GC	3	6	2833983	2833988	0 %	0 %	50 %	50 %	296134213
46221	NC_014152	GCCA	2	8	2834003	2834010	25 %	0 %	25 %	50 %	296134213
46222	NC_014152	GCC	2	6	2834071	2834076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134213
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46224	NC_014152	ATC	2	6	2834194	2834199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134213
46225	NC_014152	CTG	2	6	2834260	2834265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134213
46226	NC_014152	GGT	2	6	2834268	2834273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134213
46227	NC_014152	T	7	7	2834298	2834304	0 %	100 %	0 %	0 %	296134213
46228	NC_014152	T	8	8	2834323	2834330	0 %	100 %	0 %	0 %	296134213
46229	NC_014152	C	6	6	2834446	2834451	0 %	0 %	0 %	100 %	296134213
46230	NC_014152	CAGCGG	2	12	2834457	2834468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296134213
46231	NC_014152	TTC	2	6	2834491	2834496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134213
46232	NC_014152	AACG	2	8	2834539	2834546	50 %	0 %	25 %	25 %	296134213
46233	NC_014152	CCAG	2	8	2834674	2834681	25 %	0 %	25 %	50 %	296134213
46234	NC_014152	GCC	2	6	2834744	2834749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134213
46235	NC_014152	GGC	2	6	2834764	2834769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134213
46236	NC_014152	CAG	2	6	2834828	2834833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134213
46237	NC_014152	TACCCG	2	12	2834834	2834845	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296134213
46238	NC_014152	CATC	2	8	2834865	2834872	25 %	25 %	0 %	50 %	296134213
46239	NC_014152	CCG	2	6	2834891	2834896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134213
46240	NC_014152	CA	3	6	2834907	2834912	50 %	0 %	0 %	50 %	296134213
46241	NC_014152	CAA	2	6	2834926	2834931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134213
46242	NC_014152	TA	3	6	2834940	2834945	50 %	50 %	0 %	0 %	296134213
46243	NC_014152	CAT	2	6	2834961	2834966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134213
46244	NC_014152	CCTG	2	8	2834976	2834983	0 %	25 %	25 %	50 %	296134213
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46246	NC_014152	CTG	2	6	2835043	2835048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134213
46247	NC_014152	GC	3	6	2835222	2835227	0 %	0 %	50 %	50 %	296134213
46248	NC_014152	CCG	2	6	2835263	2835268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134213
46249	NC_014152	TAA	2	6	2835293	2835298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134213
46250	NC_014152	CAT	2	6	2835306	2835311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134213
46251	NC_014152	GTT	2	6	2835346	2835351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134213
46252	NC_014152	GGC	2	6	2835364	2835369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134213
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46254	NC_014152	CCTGA	2	10	2835469	2835478	20 %	20 %	20 %	40 %	296134213
46255	NC_014152	GCC	2	6	2835546	2835551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134213
46256	NC_014152	GTCA	2	8	2835562	2835569	25 %	25 %	25 %	25 %	296134213
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46260	NC_014152	T	6	6	2835948	2835953	0 %	100 %	0 %	0 %	296134214
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46266	NC_014152	CTG	2	6	2836226	2836231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134214
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46288	NC_014152	AAC	2	6	2837636	2837641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134216
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46337	NC_014152	GTA	2	6	2839914	2839919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134218
46338	NC_014152	ATA	2	6	2839923	2839928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134218
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46343	NC_014152	T	6	6	2840101	2840106	0 %	100 %	0 %	0 %	296134218
46344	NC_014152	CCAA	2	8	2840214	2840221	50 %	0 %	0 %	50 %	296134218
46345	NC_014152	CAA	2	6	2840339	2840344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134218
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46348	NC_014152	AAT	2	6	2840518	2840523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134218
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46350	NC_014152	GCA	2	6	2840616	2840621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134218
46351	NC_014152	CAA	2	6	2840653	2840658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134218
46352	NC_014152	TGA	2	6	2840704	2840709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134219
46353	NC_014152	AGC	2	6	2840788	2840793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134219
46354	NC_014152	AAT	2	6	2840817	2840822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134219
46355	NC_014152	TCT	2	6	2840829	2840834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134219
46356	NC_014152	GGT	2	6	2840900	2840905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296134219
46357	NC_014152	GCA	2	6	2840945	2840950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134219
46358	NC_014152	CTGTC	2	10	2840990	2840999	0 %	40 %	20 %	40 %	296134219
46359	NC_014152	TCC	3	9	2841016	2841024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134219
46360	NC_014152	ATT	2	6	2841112	2841117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134219
46361	NC_014152	CTTGGC	2	12	2841141	2841152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134219
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46363	NC_014152	TTC	2	6	2841186	2841191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134219
46364	NC_014152	TTTTA	2	10	2841261	2841270	20 %	80 %	0 %	0 %	296134219
46365	NC_014152	AT	3	6	2841353	2841358	50 %	50 %	0 %	0 %	296134219
46366	NC_014152	TCC	2	6	2841403	2841408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134219
46367	NC_014152	GC	3	6	2841432	2841437	0 %	0 %	50 %	50 %	296134219
46368	NC_014152	TTC	2	6	2841474	2841479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134219
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46370	NC_014152	CCA	2	6	2841503	2841508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134219
46371	NC_014152	TTTC	2	8	2841620	2841627	0 %	75 %	0 %	25 %	296134219
46372	NC_014152	TAA	2	6	2841659	2841664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134219
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46376	NC_014152	GCA	2	6	2841765	2841770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134219
46377	NC_014152	GTCAG	2	10	2841811	2841820	20 %	20 %	40 %	20 %	296134219
46378	NC_014152	GCC	2	6	2841883	2841888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134219
46379	NC_014152	TTC	2	6	2841948	2841953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134219
46380	NC_014152	TGATT	2	10	2842013	2842022	20 %	60 %	20 %	0 %	296134219
46381	NC_014152	T	6	6	2842041	2842046	0 %	100 %	0 %	0 %	296134219
46382	NC_014152	T	8	8	2842090	2842097	0 %	100 %	0 %	0 %	296134219
46383	NC_014152	CAC	2	6	2842194	2842199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134219
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46387	NC_014152	TCC	2	6	2842369	2842374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134219
46388	NC_014152	CTGGA	2	10	2842417	2842426	20 %	20 %	40 %	20 %	296134219
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46403	NC_014152	ATCA	2	8	2843326	2843333	50 %	25 %	0 %	25 %	296134220
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46407	NC_014152	CATA	2	8	2843724	2843731	50 %	25 %	0 %	25 %	296134220
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46450	NC_014152	ATCT	2	8	2846111	2846118	25 %	50 %	0 %	25 %	296134221
46451	NC_014152	ACC	2	6	2846184	2846189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134221
46452	NC_014152	CG	3	6	2846190	2846195	0 %	0 %	50 %	50 %	296134221
46453	NC_014152	AGGC	2	8	2846300	2846307	25 %	0 %	50 %	25 %	296134221
46454	NC_014152	ATC	2	6	2846400	2846405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134221
46455	NC_014152	ATC	2	6	2846411	2846416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134221
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46457	NC_014152	G	6	6	2846441	2846446	0 %	0 %	100 %	0 %	296134221
46458	NC_014152	AGT	2	6	2846479	2846484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134221
46459	NC_014152	CAT	2	6	2846516	2846521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134221
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46461	NC_014152	A	6	6	2846756	2846761	100 %	0 %	0 %	0 %	296134221
46462	NC_014152	AAG	2	6	2846788	2846793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134221
46463	NC_014152	CCA	2	6	2846806	2846811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134221
46464	NC_014152	CCTGTC	2	12	2846894	2846905	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296134221
46465	NC_014152	CGG	2	6	2846919	2846924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134221
46466	NC_014152	AAC	2	6	2846930	2846935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134221
46467	NC_014152	TCC	2	6	2846949	2846954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134221
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