MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_014152	TGGG	2	8	2637942	2637949	0 %	25 %	75 %	0 %	296134033
43003	NC_014152	GCA	2	6	2637963	2637968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134033
43004	NC_014152	CCG	2	6	2637987	2637992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134033
43005	NC_014152	ATGATA	2	12	2638026	2638037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296134033
43006	NC_014152	T	6	6	2638205	2638210	0 %	100 %	0 %	0 %	296134033
43007	NC_014152	T	6	6	2638263	2638268	0 %	100 %	0 %	0 %	296134033
43008	NC_014152	AAT	2	6	2638281	2638286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134033
43009	NC_014152	TTC	2	6	2638308	2638313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134033
43010	NC_014152	TGC	3	9	2638517	2638525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134034
43011	NC_014152	C	6	6	2638579	2638584	0 %	0 %	0 %	100 %	296134034
43012	NC_014152	CGA	2	6	2638647	2638652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134034
43013	NC_014152	ACCA	2	8	2638653	2638660	50 %	0 %	0 %	50 %	296134034
43014	NC_014152	GCT	2	6	2638757	2638762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134034
43015	NC_014152	ACC	2	6	2638765	2638770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134034
43016	NC_014152	CCCTG	2	10	2638869	2638878	0 %	20 %	20 %	60 %	296134034
43017	NC_014152	TTATC	2	10	2638887	2638896	20 %	60 %	0 %	20 %	296134034
43018	NC_014152	AT	3	6	2638901	2638906	50 %	50 %	0 %	0 %	296134034
43019	NC_014152	CCAG	2	8	2639028	2639035	25 %	0 %	25 %	50 %	296134034
43020	NC_014152	TTCT	2	8	2639080	2639087	0 %	75 %	0 %	25 %	296134034
43021	NC_014152	GA	3	6	2639095	2639100	50 %	0 %	50 %	0 %	296134034
43022	NC_014152	TTTC	2	8	2639102	2639109	0 %	75 %	0 %	25 %	296134034
43023	NC_014152	TCT	2	6	2639150	2639155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134034
43024	NC_014152	TCT	2	6	2639169	2639174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134034
43025	NC_014152	T	6	6	2639241	2639246	0 %	100 %	0 %	0 %	296134034
43026	NC_014152	T	6	6	2639476	2639481	0 %	100 %	0 %	0 %	296134034
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43031	NC_014152	CGGCCC	2	12	2639697	2639708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134034
43032	NC_014152	T	6	6	2639722	2639727	0 %	100 %	0 %	0 %	296134034
43033	NC_014152	GCC	2	6	2639780	2639785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134034
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43037	NC_014152	T	6	6	2640001	2640006	0 %	100 %	0 %	0 %	296134034
43038	NC_014152	AT	3	6	2640027	2640032	50 %	50 %	0 %	0 %	296134034
43039	NC_014152	GAG	2	6	2640033	2640038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296134034
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43042	NC_014152	ATTT	2	8	2640199	2640206	25 %	75 %	0 %	0 %	296134034
43043	NC_014152	T	7	7	2640238	2640244	0 %	100 %	0 %	0 %	296134034
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43118	NC_014152	AAC	2	6	2643808	2643813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134039
43119	NC_014152	TCC	2	6	2643836	2643841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134039
43120	NC_014152	ATC	3	9	2643908	2643916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134039
43121	NC_014152	TTA	2	6	2644000	2644005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134039
43122	NC_014152	TGT	2	6	2644013	2644018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134039
43123	NC_014152	GCA	2	6	2644033	2644038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134039
43124	NC_014152	ACA	2	6	2644092	2644097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134039
43125	NC_014152	GGC	2	6	2644196	2644201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134039
43126	NC_014152	T	6	6	2644207	2644212	0 %	100 %	0 %	0 %	296134039
43127	NC_014152	CT	3	6	2644265	2644270	0 %	50 %	0 %	50 %	296134039
43128	NC_014152	TTTC	2	8	2644300	2644307	0 %	75 %	0 %	25 %	296134039
43129	NC_014152	TA	3	6	2644339	2644344	50 %	50 %	0 %	0 %	296134040
43130	NC_014152	A	6	6	2644357	2644362	100 %	0 %	0 %	0 %	296134040
43131	NC_014152	TATT	2	8	2644379	2644386	25 %	75 %	0 %	0 %	296134040
43132	NC_014152	CCG	2	6	2644522	2644527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134040
43133	NC_014152	CAGCGC	2	12	2644539	2644550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296134040
43134	NC_014152	GTA	2	6	2644885	2644890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134041
43135	NC_014152	T	6	6	2644910	2644915	0 %	100 %	0 %	0 %	296134041
43136	NC_014152	ATA	2	6	2644969	2644974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134041
43137	NC_014152	CAGGC	2	10	2644982	2644991	20 %	0 %	40 %	40 %	296134041
43138	NC_014152	CAAC	2	8	2645034	2645041	50 %	0 %	0 %	50 %	296134041
43139	NC_014152	TCC	2	6	2645079	2645084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134041
43140	NC_014152	TGCCCA	2	12	2645131	2645142	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296134041
43141	NC_014152	GTT	2	6	2645176	2645181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134041
43142	NC_014152	C	7	7	2645239	2645245	0 %	0 %	0 %	100 %	296134041
43143	NC_014152	CAT	2	6	2645288	2645293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134041
43144	NC_014152	T	6	6	2645394	2645399	0 %	100 %	0 %	0 %	296134042
43145	NC_014152	TTC	2	6	2645514	2645519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134042
43146	NC_014152	T	6	6	2645544	2645549	0 %	100 %	0 %	0 %	296134042
43147	NC_014152	AT	3	6	2645590	2645595	50 %	50 %	0 %	0 %	296134042
43148	NC_014152	TAACG	2	10	2645608	2645617	40 %	20 %	20 %	20 %	296134042
43149	NC_014152	GCA	2	6	2645693	2645698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134042
43150	NC_014152	ATC	2	6	2645706	2645711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134042
43151	NC_014152	TCA	2	6	2645800	2645805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134042
43152	NC_014152	CAT	2	6	2645883	2645888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134042
43153	NC_014152	GCC	2	6	2645952	2645957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134042
43154	NC_014152	CCT	2	6	2645965	2645970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134042
43155	NC_014152	ACC	2	6	2646006	2646011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134042
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43157	NC_014152	AAT	2	6	2646159	2646164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134042
43158	NC_014152	GGC	2	6	2646241	2646246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134042
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43160	NC_014152	TTA	2	6	2646284	2646289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296134042
43161	NC_014152	TCT	2	6	2646298	2646303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134042
43162	NC_014152	GCCC	2	8	2646318	2646325	0 %	0 %	25 %	75 %	296134042
43163	NC_014152	TCG	2	6	2646568	2646573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134042
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43165	NC_014152	CAGT	2	8	2646614	2646621	25 %	25 %	25 %	25 %	296134042
43166	NC_014152	CTC	2	6	2646647	2646652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134042
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43168	NC_014152	T	7	7	2646675	2646681	0 %	100 %	0 %	0 %	296134042
43169	NC_014152	TCG	2	6	2646769	2646774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134042
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43171	NC_014152	CTGGT	2	10	2646808	2646817	0 %	40 %	40 %	20 %	296134042
43172	NC_014152	GAA	2	6	2646822	2646827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134042
43173	NC_014152	CAG	2	6	2646879	2646884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134042
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43177	NC_014152	ATA	2	6	2646985	2646990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134042
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43180	NC_014152	GCC	2	6	2647234	2647239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134043
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43182	NC_014152	CAAGC	2	10	2647346	2647355	40 %	0 %	20 %	40 %	296134043
43183	NC_014152	AGCC	2	8	2647365	2647372	25 %	0 %	25 %	50 %	296134043
43184	NC_014152	TAACA	2	10	2647393	2647402	60 %	20 %	0 %	20 %	296134043
43185	NC_014152	T	6	6	2647675	2647680	0 %	100 %	0 %	0 %	296134043
43186	NC_014152	TACATG	2	12	2647912	2647923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296134044
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43188	NC_014152	AAG	2	6	2648098	2648103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296134044
43189	NC_014152	T	6	6	2648104	2648109	0 %	100 %	0 %	0 %	296134044
43190	NC_014152	CAA	2	6	2648142	2648147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134044
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43193	NC_014152	TAG	2	6	2648448	2648453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134044
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43200	NC_014152	AAT	2	6	2648988	2648993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134045
43201	NC_014152	A	6	6	2649026	2649031	100 %	0 %	0 %	0 %	296134045
43202	NC_014152	CTGC	2	8	2649102	2649109	0 %	25 %	25 %	50 %	296134045
43203	NC_014152	CCCT	2	8	2649136	2649143	0 %	25 %	0 %	75 %	296134045
43204	NC_014152	A	6	6	2649150	2649155	100 %	0 %	0 %	0 %	296134045
43205	NC_014152	A	6	6	2649289	2649294	100 %	0 %	0 %	0 %	296134045
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43219	NC_014152	TTTC	2	8	2650245	2650252	0 %	75 %	0 %	25 %	296134046
43220	NC_014152	CGTG	2	8	2650259	2650266	0 %	25 %	50 %	25 %	296134046
43221	NC_014152	CCG	2	6	2650297	2650302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134046
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43229	NC_014152	CAC	2	6	2650763	2650768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134046
43230	NC_014152	T	6	6	2650775	2650780	0 %	100 %	0 %	0 %	296134046
43231	NC_014152	CAG	2	6	2650802	2650807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134046
43232	NC_014152	TTC	2	6	2650808	2650813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134046
43233	NC_014152	CCAAA	2	10	2650822	2650831	60 %	0 %	0 %	40 %	296134046
43234	NC_014152	ATTC	2	8	2650883	2650890	25 %	50 %	0 %	25 %	296134046
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43236	NC_014152	TCT	2	6	2651110	2651115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134047
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43338	NC_014152	T	6	6	2657019	2657024	0 %	100 %	0 %	0 %	296134051
43339	NC_014152	CCCGG	2	10	2657055	2657064	0 %	0 %	40 %	60 %	296134051
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43345	NC_014152	T	7	7	2657554	2657560	0 %	100 %	0 %	0 %	296134051
43346	NC_014152	GCT	2	6	2657575	2657580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296134051
43347	NC_014152	TCT	3	9	2657752	2657760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134051
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43349	NC_014152	TA	3	6	2657874	2657879	50 %	50 %	0 %	0 %	296134051
43350	NC_014152	GTT	2	6	2657895	2657900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134051
43351	NC_014152	GCC	2	6	2657929	2657934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296134051
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43353	NC_014152	AAT	2	6	2658024	2658029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134051
43354	NC_014152	TCA	2	6	2658082	2658087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134051
43355	NC_014152	C	7	7	2658092	2658098	0 %	0 %	0 %	100 %	296134051
43356	NC_014152	GGC	2	6	2658172	2658177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296134051
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43360	NC_014152	T	6	6	2658465	2658470	0 %	100 %	0 %	0 %	296134051
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43363	NC_014152	TCTT	2	8	2658608	2658615	0 %	75 %	0 %	25 %	296134051
43364	NC_014152	TCT	2	6	2658671	2658676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134051
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43454	NC_014152	ACT	2	6	2663612	2663617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134054
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43459	NC_014152	CAC	2	6	2663781	2663786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134054
43460	NC_014152	GGTT	2	8	2663787	2663794	0 %	50 %	50 %	0 %	296134054
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43462	NC_014152	AT	3	6	2663822	2663827	50 %	50 %	0 %	0 %	296134054
43463	NC_014152	TTTA	2	8	2663896	2663903	25 %	75 %	0 %	0 %	296134055
43464	NC_014152	CCA	2	6	2663917	2663922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134055
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43466	NC_014152	TCT	3	9	2664057	2664065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134055
43467	NC_014152	T	6	6	2664083	2664088	0 %	100 %	0 %	0 %	296134055
43468	NC_014152	TTC	2	6	2664191	2664196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134055
43469	NC_014152	CCA	2	6	2664310	2664315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296134055
43470	NC_014152	TTCAT	2	10	2664324	2664333	20 %	60 %	0 %	20 %	296134055
43471	NC_014152	CTT	2	6	2664355	2664360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134055
43472	NC_014152	CTT	2	6	2664380	2664385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134055
43473	NC_014152	GTT	2	6	2664448	2664453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134055
43474	NC_014152	CAG	2	6	2664508	2664513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134055
43475	NC_014152	TCC	2	6	2664641	2664646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134055
43476	NC_014152	CAA	2	6	2664664	2664669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134055
43477	NC_014152	GAC	2	6	2664686	2664691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134055
43478	NC_014152	TAA	2	6	2664727	2664732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134055
43479	NC_014152	AAC	2	6	2664899	2664904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134055
43480	NC_014152	TCA	2	6	2664990	2664995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134055
43481	NC_014152	TTTC	2	8	2665017	2665024	0 %	75 %	0 %	25 %	296134055
43482	NC_014152	TTC	2	6	2665155	2665160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134055
43483	NC_014152	TCT	2	6	2665165	2665170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296134055
43484	NC_014152	T	6	6	2666913	2666918	0 %	100 %	0 %	0 %	296134056
43485	NC_014152	T	6	6	2667056	2667061	0 %	100 %	0 %	0 %	296134056
43486	NC_014152	T	6	6	2667064	2667069	0 %	100 %	0 %	0 %	296134056
43487	NC_014152	CAA	2	6	2667119	2667124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296134056
43488	NC_014152	CCT	2	6	2667151	2667156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296134056
43489	NC_014152	TGCC	2	8	2667187	2667194	0 %	25 %	25 %	50 %	296134056
43490	NC_014152	AAT	2	6	2667264	2667269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296134056
43491	NC_014152	TCCTT	2	10	2667366	2667375	0 %	60 %	0 %	40 %	296134057
43492	NC_014152	T	6	6	2667434	2667439	0 %	100 %	0 %	0 %	296134057
43493	NC_014152	CAGG	2	8	2667477	2667484	25 %	0 %	50 %	25 %	296134057
43494	NC_014152	AGT	2	6	2667559	2667564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296134057
43495	NC_014152	AC	3	6	2667599	2667604	50 %	0 %	0 %	50 %	296134057
43496	NC_014152	GCA	2	6	2667651	2667656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296134057
43497	NC_014152	ATC	2	6	2667754	2667759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296134057
43498	NC_014152	T	6	6	2667802	2667807	0 %	100 %	0 %	0 %	296134057
43499	NC_014152	ACCTT	2	10	2667926	2667935	20 %	40 %	0 %	40 %	296134057
43500	NC_014152	TGT	2	6	2668043	2668048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296134058

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