MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_014152	GGC	2	6	2531430	2531435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133948
41503	NC_014152	CAT	2	6	2531532	2531537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133948
41504	NC_014152	GCA	2	6	2531647	2531652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133948
41505	NC_014152	CGG	3	9	2531661	2531669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133948
41506	NC_014152	CCTT	2	8	2531713	2531720	0 %	50 %	0 %	50 %	296133948
41507	NC_014152	AAT	2	6	2531829	2531834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133948
41508	NC_014152	GCAG	2	8	2531925	2531932	25 %	0 %	50 %	25 %	296133948
41509	NC_014152	GTAA	2	8	2531952	2531959	50 %	25 %	25 %	0 %	296133948
41510	NC_014152	CCCGTT	2	12	2532059	2532070	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296133948
41511	NC_014152	AAT	2	6	2532180	2532185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133948
41512	NC_014152	GTG	2	6	2532204	2532209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133948
41513	NC_014152	TTA	2	6	2532299	2532304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133949
41514	NC_014152	CAG	2	6	2532330	2532335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133949
41515	NC_014152	TAA	2	6	2532424	2532429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133949
41516	NC_014152	CCA	2	6	2532473	2532478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133949
41517	NC_014152	CCGG	2	8	2532491	2532498	0 %	0 %	50 %	50 %	296133949
41518	NC_014152	A	6	6	2532504	2532509	100 %	0 %	0 %	0 %	296133949
41519	NC_014152	ATA	2	6	2532521	2532526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133949
41520	NC_014152	GCC	2	6	2532531	2532536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133949
41521	NC_014152	TTA	2	6	2532557	2532562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133949
41522	NC_014152	TGGC	2	8	2532604	2532611	0 %	25 %	50 %	25 %	296133949
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41524	NC_014152	AAAAG	2	10	2532782	2532791	80 %	0 %	20 %	0 %	296133950
41525	NC_014152	CAG	2	6	2532921	2532926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133950
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41527	NC_014152	T	7	7	2532984	2532990	0 %	100 %	0 %	0 %	296133950
41528	NC_014152	ATC	2	6	2533001	2533006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133950
41529	NC_014152	CCTC	2	8	2533055	2533062	0 %	25 %	0 %	75 %	296133950
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41532	NC_014152	A	6	6	2533212	2533217	100 %	0 %	0 %	0 %	296133950
41533	NC_014152	AGC	2	6	2533274	2533279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133950
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41539	NC_014152	GGCC	2	8	2533692	2533699	0 %	0 %	50 %	50 %	296133950
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41544	NC_014152	CAT	2	6	2533831	2533836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133950
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41553	NC_014152	TTTA	2	8	2534662	2534669	25 %	75 %	0 %	0 %	296133951
41554	NC_014152	CAAAA	2	10	2534683	2534692	80 %	0 %	0 %	20 %	296133951
41555	NC_014152	CTA	2	6	2534966	2534971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133952
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41557	NC_014152	TTA	2	6	2534990	2534995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133952
41558	NC_014152	TTTC	2	8	2535032	2535039	0 %	75 %	0 %	25 %	296133952
41559	NC_014152	TAAA	2	8	2535114	2535121	75 %	25 %	0 %	0 %	296133952
41560	NC_014152	T	6	6	2535150	2535155	0 %	100 %	0 %	0 %	296133952
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41565	NC_014152	TGTT	2	8	2535234	2535241	0 %	75 %	25 %	0 %	296133952
41566	NC_014152	TGA	2	6	2535259	2535264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133952
41567	NC_014152	CCCCA	2	10	2535365	2535374	20 %	0 %	0 %	80 %	296133952
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41578	NC_014152	CCTC	2	8	2535975	2535982	0 %	25 %	0 %	75 %	296133952
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41586	NC_014152	CCCTG	2	10	2536330	2536339	0 %	20 %	20 %	60 %	296133953
41587	NC_014152	CTG	2	6	2536396	2536401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133953
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41601	NC_014152	TAA	2	6	2537408	2537413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133955
41602	NC_014152	TGC	2	6	2537474	2537479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133955
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41607	NC_014152	T	7	7	2537747	2537753	0 %	100 %	0 %	0 %	296133955
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41612	NC_014152	TCT	2	6	2537950	2537955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133955
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41972	NC_014152	CTT	2	6	2563940	2563945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133970
41973	NC_014152	T	7	7	2564032	2564038	0 %	100 %	0 %	0 %	296133970
41974	NC_014152	TGA	2	6	2564049	2564054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133970
41975	NC_014152	CGG	2	6	2564130	2564135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133970
41976	NC_014152	TAA	2	6	2564166	2564171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133970
41977	NC_014152	TAC	2	6	2564183	2564188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133970
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41979	NC_014152	TCTT	2	8	2564406	2564413	0 %	75 %	0 %	25 %	296133971
41980	NC_014152	T	6	6	2564472	2564477	0 %	100 %	0 %	0 %	296133971
41981	NC_014152	CCA	2	6	2564546	2564551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133971
41982	NC_014152	TCA	2	6	2564587	2564592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133971
41983	NC_014152	TTA	2	6	2564653	2564658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133971
41984	NC_014152	GGT	2	6	2564678	2564683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133971
41985	NC_014152	AATT	2	8	2564810	2564817	50 %	50 %	0 %	0 %	296133971
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41987	NC_014152	AAT	2	6	2564916	2564921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133971
41988	NC_014152	CAGCTC	2	12	2564955	2564966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296133971
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41991	NC_014152	T	6	6	2565131	2565136	0 %	100 %	0 %	0 %	296133971
41992	NC_014152	GCAA	2	8	2565250	2565257	50 %	0 %	25 %	25 %	296133971
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41997	NC_014152	TTC	2	6	2565552	2565557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133971
41998	NC_014152	CAT	2	6	2565686	2565691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133971
41999	NC_014152	GCA	2	6	2565761	2565766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133971
42000	NC_014152	GCC	2	6	2565810	2565815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133971

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