MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40117	NC_014152	ATT	2	6	2448776	2448781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133868
40118	NC_014152	GCA	2	6	2448808	2448813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133868
40119	NC_014152	CTG	2	6	2448838	2448843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133868
40120	NC_014152	GCC	2	6	2448884	2448889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133868
40121	NC_014152	CTT	2	6	2448910	2448915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133868
40122	NC_014152	TCC	2	6	2449485	2449490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133869
40123	NC_014152	GCA	2	6	2449518	2449523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133869
40124	NC_014152	AGA	2	6	2449584	2449589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133869
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40129	NC_014152	TAG	2	6	2449987	2449992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133869
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40132	NC_014152	CTT	2	6	2450116	2450121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133869
40133	NC_014152	C	7	7	2450147	2450153	0 %	0 %	0 %	100 %	296133869
40134	NC_014152	T	6	6	2450197	2450202	0 %	100 %	0 %	0 %	296133869
40135	NC_014152	CAAT	2	8	2450206	2450213	50 %	25 %	0 %	25 %	296133869
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40143	NC_014152	GAT	2	6	2451442	2451447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133870
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40145	NC_014152	AAGG	2	8	2451464	2451471	50 %	0 %	50 %	0 %	296133870
40146	NC_014152	TCTG	2	8	2451531	2451538	0 %	50 %	25 %	25 %	296133870
40147	NC_014152	CTG	2	6	2451547	2451552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133870
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40153	NC_014152	T	8	8	2451731	2451738	0 %	100 %	0 %	0 %	296133870
40154	NC_014152	CTG	2	6	2451754	2451759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133870
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40187	NC_014152	T	8	8	2453342	2453349	0 %	100 %	0 %	0 %	296133872
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40192	NC_014152	TCA	2	6	2453687	2453692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133873
40193	NC_014152	TA	3	6	2453722	2453727	50 %	50 %	0 %	0 %	296133873
40194	NC_014152	CTG	2	6	2453804	2453809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133873
40195	NC_014152	CTG	2	6	2453826	2453831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133873
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40201	NC_014152	CTGG	2	8	2454118	2454125	0 %	25 %	50 %	25 %	296133873
40202	NC_014152	AAT	2	6	2454127	2454132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133873
40203	NC_014152	CAACTG	2	12	2454168	2454179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296133873
40204	NC_014152	TGC	2	6	2454216	2454221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133873
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40206	NC_014152	TATC	2	8	2454243	2454250	25 %	50 %	0 %	25 %	296133873
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40209	NC_014152	TTTTC	2	10	2454279	2454288	0 %	80 %	0 %	20 %	296133874
40210	NC_014152	A	6	6	2454309	2454314	100 %	0 %	0 %	0 %	296133874
40211	NC_014152	T	6	6	2454335	2454340	0 %	100 %	0 %	0 %	296133874
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40218	NC_014152	T	6	6	2454606	2454611	0 %	100 %	0 %	0 %	296133875
40219	NC_014152	TAAT	2	8	2454659	2454666	50 %	50 %	0 %	0 %	296133875
40220	NC_014152	ACC	2	6	2454688	2454693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133875
40221	NC_014152	TTA	2	6	2454757	2454762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133875
40222	NC_014152	TAA	2	6	2455955	2455960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133876
40223	NC_014152	TCA	2	6	2456029	2456034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133876
40224	NC_014152	GTA	2	6	2456037	2456042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133876
40225	NC_014152	CTG	2	6	2456044	2456049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133876
40226	NC_014152	AAG	2	6	2456099	2456104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133876
40227	NC_014152	CCTG	2	8	2456168	2456175	0 %	25 %	25 %	50 %	296133876
40228	NC_014152	CAT	2	6	2456216	2456221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133876
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40230	NC_014152	CTT	2	6	2456248	2456253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133876
40231	NC_014152	ATC	2	6	2456310	2456315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133876
40232	NC_014152	TCA	2	6	2456350	2456355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133876
40233	NC_014152	TTC	2	6	2456402	2456407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133876
40234	NC_014152	GCA	2	6	2456435	2456440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133876
40235	NC_014152	TAA	2	6	2456513	2456518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133876
40236	NC_014152	TC	3	6	2456526	2456531	0 %	50 %	0 %	50 %	296133876
40237	NC_014152	TCA	3	9	2456572	2456580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133876
40238	NC_014152	ATT	2	6	2456598	2456603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133876
40239	NC_014152	TC	3	6	2456610	2456615	0 %	50 %	0 %	50 %	296133877
40240	NC_014152	CAAT	2	8	2456619	2456626	50 %	25 %	0 %	25 %	296133877
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40244	NC_014152	TCAT	2	8	2456858	2456865	25 %	50 %	0 %	25 %	296133877
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40315	NC_014152	TTAA	2	8	2461316	2461323	50 %	50 %	0 %	0 %	296133881
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40337	NC_014152	TGA	2	6	2462534	2462539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133883
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40340	NC_014152	CAG	2	6	2462572	2462577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133883
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40342	NC_014152	TGC	2	6	2462691	2462696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133883
40343	NC_014152	ATC	2	6	2462707	2462712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133883
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40345	NC_014152	TA	3	6	2463068	2463073	50 %	50 %	0 %	0 %	296133884
40346	NC_014152	GCCT	2	8	2463076	2463083	0 %	25 %	25 %	50 %	296133884
40347	NC_014152	CGA	2	6	2463094	2463099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133884
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40351	NC_014152	GAA	2	6	2463296	2463301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133885
40352	NC_014152	ATG	2	6	2463305	2463310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133885
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40356	NC_014152	CCCAA	2	10	2463466	2463475	40 %	0 %	0 %	60 %	296133885
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40358	NC_014152	AT	3	6	2463557	2463562	50 %	50 %	0 %	0 %	296133886
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40467	NC_014152	ATC	2	6	2470954	2470959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133893
40468	NC_014152	AAC	2	6	2470965	2470970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133893
40469	NC_014152	TCT	2	6	2471056	2471061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133893
40470	NC_014152	TAAT	2	8	2471257	2471264	50 %	50 %	0 %	0 %	296133893
40471	NC_014152	CAA	2	6	2471312	2471317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133893
40472	NC_014152	ATC	2	6	2471385	2471390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133893
40473	NC_014152	CTG	2	6	2471430	2471435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133893
40474	NC_014152	ACC	2	6	2471467	2471472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133893
40475	NC_014152	GCAG	2	8	2471478	2471485	25 %	0 %	50 %	25 %	296133893
40476	NC_014152	GGA	2	6	2471552	2471557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133893
40477	NC_014152	CTT	2	6	2471594	2471599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133893
40478	NC_014152	CTT	2	6	2471615	2471620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133893
40479	NC_014152	AGC	2	6	2471646	2471651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133893
40480	NC_014152	GAG	2	6	2471748	2471753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133893
40481	NC_014152	TAA	2	6	2471861	2471866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133893
40482	NC_014152	T	7	7	2471884	2471890	0 %	100 %	0 %	0 %	296133893
40483	NC_014152	ATC	2	6	2471988	2471993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133893
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40486	NC_014152	CAT	2	6	2472372	2472377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133893
40487	NC_014152	GAAC	2	8	2472403	2472410	50 %	0 %	25 %	25 %	296133893
40488	NC_014152	CTT	2	6	2472491	2472496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133893
40489	NC_014152	ATA	2	6	2472528	2472533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133893
40490	NC_014152	CTT	2	6	2472650	2472655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133893
40491	NC_014152	CTT	2	6	2472672	2472677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133893
40492	NC_014152	ATCC	2	8	2472687	2472694	25 %	25 %	0 %	50 %	296133894
40493	NC_014152	TTA	2	6	2472698	2472703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133894
40494	NC_014152	TTC	2	6	2472730	2472735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133894
40495	NC_014152	AAT	2	6	2472757	2472762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133894
40496	NC_014152	TCT	2	6	2472788	2472793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133894
40497	NC_014152	CGG	2	6	2472875	2472880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133894
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40499	NC_014152	TGG	2	6	2472984	2472989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133894
40500	NC_014152	ATG	2	6	2473052	2473057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133894

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