MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014152	CATA	2	8	214438	214445	50 %	25 %	0 %	25 %	296131746
3502	NC_014152	AGG	2	6	214476	214481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131746
3503	NC_014152	T	7	7	214621	214627	0 %	100 %	0 %	0 %	296131746
3504	NC_014152	CAT	2	6	214673	214678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131746
3505	NC_014152	GAT	2	6	214682	214687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131746
3506	NC_014152	GAT	2	6	214976	214981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131746
3507	NC_014152	ATTT	2	8	214987	214994	25 %	75 %	0 %	0 %	296131746
3508	NC_014152	GGA	2	6	215032	215037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131746
3509	NC_014152	GAA	2	6	215045	215050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131746
3510	NC_014152	AGA	2	6	215099	215104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131746
3511	NC_014152	CG	3	6	215140	215145	0 %	0 %	50 %	50 %	296131746
3512	NC_014152	CAT	2	6	215149	215154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131746
3513	NC_014152	A	6	6	215241	215246	100 %	0 %	0 %	0 %	296131746
3514	NC_014152	ATT	2	6	215261	215266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131746
3515	NC_014152	CCGG	2	8	215319	215326	0 %	0 %	50 %	50 %	296131746
3516	NC_014152	CAAA	2	8	215368	215375	75 %	0 %	0 %	25 %	296131746
3517	NC_014152	ACA	2	6	215385	215390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131746
3518	NC_014152	T	7	7	215539	215545	0 %	100 %	0 %	0 %	296131746
3519	NC_014152	GTC	2	6	215622	215627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131746
3520	NC_014152	ATT	2	6	215687	215692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131746
3521	NC_014152	TTG	2	6	215789	215794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131747
3522	NC_014152	TA	3	6	215818	215823	50 %	50 %	0 %	0 %	296131747
3523	NC_014152	CAT	2	6	215851	215856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131747
3524	NC_014152	CAAC	2	8	215867	215874	50 %	0 %	0 %	50 %	296131747
3525	NC_014152	GAG	2	6	215960	215965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131747
3526	NC_014152	A	6	6	216005	216010	100 %	0 %	0 %	0 %	296131747
3527	NC_014152	TTC	2	6	216016	216021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131747
3528	NC_014152	CTT	2	6	216059	216064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131747
3529	NC_014152	C	6	6	216107	216112	0 %	0 %	0 %	100 %	296131747
3530	NC_014152	TGG	2	6	216113	216118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131747
3531	NC_014152	T	6	6	216136	216141	0 %	100 %	0 %	0 %	296131747
3532	NC_014152	CTG	2	6	216149	216154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131747
3533	NC_014152	T	8	8	216168	216175	0 %	100 %	0 %	0 %	296131747
3534	NC_014152	A	6	6	216254	216259	100 %	0 %	0 %	0 %	296131747
3535	NC_014152	GAC	2	6	216272	216277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131747
3536	NC_014152	GAA	2	6	216302	216307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3537	NC_014152	AAG	2	6	216341	216346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3538	NC_014152	TAT	2	6	216381	216386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131747
3539	NC_014152	GCCC	2	8	216393	216400	0 %	0 %	25 %	75 %	296131747
3540	NC_014152	ATT	2	6	216415	216420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131747
3541	NC_014152	T	6	6	216454	216459	0 %	100 %	0 %	0 %	296131747
3542	NC_014152	TTTG	2	8	216523	216530	0 %	75 %	25 %	0 %	296131747
3543	NC_014152	A	8	8	216539	216546	100 %	0 %	0 %	0 %	296131747
3544	NC_014152	TATT	2	8	216561	216568	25 %	75 %	0 %	0 %	296131747
3545	NC_014152	GGC	2	6	216614	216619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131747
3546	NC_014152	ACG	2	6	216621	216626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131747
3547	NC_014152	GTT	2	6	216649	216654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131747
3548	NC_014152	AATTAT	2	12	216688	216699	50 %	50 %	0 %	0 %	296131747
3549	NC_014152	CTA	2	6	216705	216710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131747
3550	NC_014152	GAA	2	6	216800	216805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3551	NC_014152	AGA	2	6	216869	216874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3552	NC_014152	GCC	2	6	216932	216937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131747
3553	NC_014152	GAA	2	6	216965	216970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3554	NC_014152	GGA	2	6	216973	216978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131747
3555	NC_014152	GAA	2	6	217009	217014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3556	NC_014152	TTA	2	6	217023	217028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131747
3557	NC_014152	A	6	6	217040	217045	100 %	0 %	0 %	0 %	296131747
3558	NC_014152	TGGT	2	8	217077	217084	0 %	50 %	50 %	0 %	296131747
3559	NC_014152	CTG	2	6	217088	217093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131747
3560	NC_014152	CAT	2	6	217123	217128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131747
3561	NC_014152	CGG	2	6	217144	217149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131747
3562	NC_014152	TAC	2	6	217181	217186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131747
3563	NC_014152	GAA	2	6	217244	217249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3564	NC_014152	GAA	2	6	217427	217432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3565	NC_014152	TGA	2	6	217471	217476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131747
3566	NC_014152	AAG	2	6	217493	217498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131747
3567	NC_014152	ATT	2	6	217499	217504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131747
3568	NC_014152	CA	3	6	217509	217514	50 %	0 %	0 %	50 %	296131747
3569	NC_014152	TTC	2	6	217638	217643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131747
3570	NC_014152	CGG	2	6	217644	217649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131747
3571	NC_014152	A	7	7	217656	217662	100 %	0 %	0 %	0 %	296131747
3572	NC_014152	CTG	2	6	217695	217700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131747
3573	NC_014152	GCC	2	6	217708	217713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131747
3574	NC_014152	ATT	2	6	217820	217825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131748
3575	NC_014152	GAAAG	2	10	217835	217844	60 %	0 %	40 %	0 %	296131748
3576	NC_014152	TGC	2	6	217869	217874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131748
3577	NC_014152	CTTT	2	8	217926	217933	0 %	75 %	0 %	25 %	296131748
3578	NC_014152	CAAC	2	8	218028	218035	50 %	0 %	0 %	50 %	296131748
3579	NC_014152	ATAG	2	8	218117	218124	50 %	25 %	25 %	0 %	296131748
3580	NC_014152	TTTAC	2	10	218145	218154	20 %	60 %	0 %	20 %	296131748
3581	NC_014152	TGA	2	6	218188	218193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131748
3582	NC_014152	CCT	2	6	218552	218557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131749
3583	NC_014152	AGTCA	2	10	218586	218595	40 %	20 %	20 %	20 %	296131749
3584	NC_014152	TGGAA	2	10	218614	218623	40 %	20 %	40 %	0 %	296131749
3585	NC_014152	ATG	2	6	218688	218693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131749
3586	NC_014152	ACGA	2	8	218721	218728	50 %	0 %	25 %	25 %	296131749
3587	NC_014152	AAAGC	2	10	218773	218782	60 %	0 %	20 %	20 %	296131749
3588	NC_014152	AGG	2	6	219215	219220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131750
3589	NC_014152	GGA	2	6	219243	219248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131750
3590	NC_014152	AAT	2	6	219324	219329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131750
3591	NC_014152	A	6	6	219453	219458	100 %	0 %	0 %	0 %	296131750
3592	NC_014152	GGC	2	6	219463	219468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131750
3593	NC_014152	GAA	2	6	219664	219669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131750
3594	NC_014152	TGC	2	6	219741	219746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131750
3595	NC_014152	GGT	2	6	219778	219783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131750
3596	NC_014152	AAGA	2	8	219784	219791	75 %	0 %	25 %	0 %	296131750
3597	NC_014152	CT	3	6	219998	220003	0 %	50 %	0 %	50 %	296131750
3598	NC_014152	GCC	2	6	220138	220143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131750
3599	NC_014152	TGG	2	6	220245	220250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131750
3600	NC_014152	GTC	2	6	220271	220276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131750
3601	NC_014152	CTGC	2	8	220279	220286	0 %	25 %	25 %	50 %	296131750
3602	NC_014152	GAA	2	6	220297	220302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131750
3603	NC_014152	AAG	2	6	220360	220365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131750
3604	NC_014152	TGT	2	6	220380	220385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131750
3605	NC_014152	GAA	2	6	220447	220452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131750
3606	NC_014152	CGG	2	6	220491	220496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131750
3607	NC_014152	GCT	2	6	220504	220509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131750
3608	NC_014152	GTT	2	6	220522	220527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131750
3609	NC_014152	AAG	2	6	220669	220674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131750
3610	NC_014152	ATG	2	6	220711	220716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131750
3611	NC_014152	GGGTT	2	10	220770	220779	0 %	40 %	60 %	0 %	296131750
3612	NC_014152	AAGT	2	8	220913	220920	50 %	25 %	25 %	0 %	296131750
3613	NC_014152	A	6	6	221441	221446	100 %	0 %	0 %	0 %	296131751
3614	NC_014152	AGG	2	6	221495	221500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131751
3615	NC_014152	TGG	2	6	221537	221542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131751
3616	NC_014152	TGC	2	6	221649	221654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131751
3617	NC_014152	AT	3	6	221738	221743	50 %	50 %	0 %	0 %	296131751
3618	NC_014152	TAT	2	6	221778	221783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131751
3619	NC_014152	TAT	2	6	221982	221987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131752
3620	NC_014152	AGT	2	6	222177	222182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131752
3621	NC_014152	AAT	2	6	222202	222207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131752
3622	NC_014152	CCA	2	6	222539	222544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131752
3623	NC_014152	GAAG	2	8	222615	222622	50 %	0 %	50 %	0 %	296131752
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3731	NC_014152	AT	3	6	228860	228865	50 %	50 %	0 %	0 %	296131760
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3741	NC_014152	GGTTT	2	10	229460	229469	0 %	60 %	40 %	0 %	296131760
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3993	NC_014152	GTTA	2	8	243170	243177	25 %	50 %	25 %	0 %	296131772
3994	NC_014152	TGC	2	6	243178	243183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131772
3995	NC_014152	A	6	6	243244	243249	100 %	0 %	0 %	0 %	296131772
3996	NC_014152	TGT	2	6	243687	243692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131773
3997	NC_014152	AGC	2	6	243733	243738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131773
3998	NC_014152	GTA	2	6	243747	243752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131773
3999	NC_014152	GAA	2	6	243788	243793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131773
4000	NC_014152	TGA	2	6	243815	243820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131773

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