MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_014152	GCT	2	6	2318197	2318202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133733
38002	NC_014152	TCCGG	2	10	2318273	2318282	0 %	20 %	40 %	40 %	296133733
38003	NC_014152	ACGG	2	8	2318453	2318460	25 %	0 %	50 %	25 %	296133733
38004	NC_014152	TTTG	2	8	2318471	2318478	0 %	75 %	25 %	0 %	296133733
38005	NC_014152	GACA	2	8	2318498	2318505	50 %	0 %	25 %	25 %	296133733
38006	NC_014152	GCC	2	6	2318605	2318610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133733
38007	NC_014152	CA	3	6	2318637	2318642	50 %	0 %	0 %	50 %	296133733
38008	NC_014152	GGT	2	6	2318684	2318689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133733
38009	NC_014152	CTTT	2	8	2318734	2318741	0 %	75 %	0 %	25 %	296133733
38010	NC_014152	T	6	6	2318786	2318791	0 %	100 %	0 %	0 %	296133733
38011	NC_014152	GAT	2	6	2318813	2318818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133733
38012	NC_014152	CAG	2	6	2318823	2318828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133733
38013	NC_014152	CAG	2	6	2318835	2318840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133733
38014	NC_014152	GC	3	6	2318847	2318852	0 %	0 %	50 %	50 %	296133733
38015	NC_014152	CCA	2	6	2318855	2318860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133733
38016	NC_014152	CAC	2	6	2318880	2318885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133733
38017	NC_014152	CCG	2	6	2318900	2318905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133733
38018	NC_014152	GCC	3	9	2318914	2318922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133733
38019	NC_014152	CGATGC	2	12	2319011	2319022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296133733
38020	NC_014152	CCG	2	6	2319050	2319055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133733
38021	NC_014152	AAT	2	6	2319254	2319259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133734
38022	NC_014152	TGA	2	6	2319347	2319352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133734
38023	NC_014152	CAG	2	6	2319370	2319375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133734
38024	NC_014152	CTC	2	6	2319391	2319396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133734
38025	NC_014152	GCC	2	6	2319419	2319424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133734
38026	NC_014152	GCC	2	6	2319449	2319454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133734
38027	NC_014152	TTC	2	6	2319472	2319477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133734
38028	NC_014152	CCG	2	6	2319506	2319511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133734
38029	NC_014152	ACT	2	6	2319515	2319520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133734
38030	NC_014152	ATT	2	6	2319827	2319832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133735
38031	NC_014152	CTT	2	6	2319906	2319911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133735
38032	NC_014152	ACC	2	6	2319958	2319963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133735
38033	NC_014152	T	7	7	2320212	2320218	0 %	100 %	0 %	0 %	296133735
38034	NC_014152	TGA	2	6	2320409	2320414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133735
38035	NC_014152	GCC	2	6	2320426	2320431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133735
38036	NC_014152	TTC	2	6	2320545	2320550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133736
38037	NC_014152	GAAA	2	8	2320580	2320587	75 %	0 %	25 %	0 %	296133736
38038	NC_014152	T	7	7	2320595	2320601	0 %	100 %	0 %	0 %	296133736
38039	NC_014152	CAA	2	6	2320731	2320736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133736
38040	NC_014152	CCT	2	6	2320752	2320757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133736
38041	NC_014152	GCC	2	6	2320790	2320795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133736
38042	NC_014152	GCA	2	6	2320796	2320801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133736
38043	NC_014152	CGC	2	6	2320809	2320814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133736
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38045	NC_014152	TTG	2	6	2320907	2320912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133737
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38049	NC_014152	C	6	6	2321018	2321023	0 %	0 %	0 %	100 %	296133737
38050	NC_014152	GGCCAG	2	12	2321038	2321049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296133737
38051	NC_014152	CCT	2	6	2321126	2321131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133738
38052	NC_014152	ATGG	2	8	2321153	2321160	25 %	25 %	50 %	0 %	296133738
38053	NC_014152	ATCC	2	8	2321246	2321253	25 %	25 %	0 %	50 %	296133738
38054	NC_014152	AG	3	6	2321294	2321299	50 %	0 %	50 %	0 %	296133738
38055	NC_014152	GCA	2	6	2321366	2321371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133738
38056	NC_014152	GAT	2	6	2321401	2321406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133738
38057	NC_014152	CAT	2	6	2321481	2321486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133738
38058	NC_014152	CACC	2	8	2321496	2321503	25 %	0 %	0 %	75 %	296133738
38059	NC_014152	TAT	2	6	2321514	2321519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133738
38060	NC_014152	TTA	2	6	2321535	2321540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133738
38061	NC_014152	TGCC	2	8	2321589	2321596	0 %	25 %	25 %	50 %	296133738
38062	NC_014152	GCC	2	6	2321670	2321675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133738
38063	NC_014152	CT	3	6	2321693	2321698	0 %	50 %	0 %	50 %	296133738
38064	NC_014152	GT	3	6	2321703	2321708	0 %	50 %	50 %	0 %	296133738
38065	NC_014152	CCGG	2	8	2321726	2321733	0 %	0 %	50 %	50 %	296133738
38066	NC_014152	GCT	2	6	2321823	2321828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133738
38067	NC_014152	CCT	2	6	2321836	2321841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133738
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38069	NC_014152	ATC	2	6	2322016	2322021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133738
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38099	NC_014152	CA	3	6	2323597	2323602	50 %	0 %	0 %	50 %	296133738
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38234	NC_014152	CGC	2	6	2331427	2331432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133748
38235	NC_014152	A	6	6	2331546	2331551	100 %	0 %	0 %	0 %	296133748
38236	NC_014152	AAT	2	6	2331574	2331579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133748
38237	NC_014152	ATA	2	6	2331603	2331608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133748
38238	NC_014152	CAA	2	6	2331623	2331628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133748
38239	NC_014152	TCA	2	6	2331819	2331824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133748
38240	NC_014152	GGAA	2	8	2331835	2331842	50 %	0 %	50 %	0 %	296133748
38241	NC_014152	T	7	7	2331915	2331921	0 %	100 %	0 %	0 %	296133749
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38246	NC_014152	CAA	2	6	2332109	2332114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133749
38247	NC_014152	CCA	2	6	2332166	2332171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133749
38248	NC_014152	CTG	2	6	2332175	2332180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133749
38249	NC_014152	CATC	2	8	2332234	2332241	25 %	25 %	0 %	50 %	296133749
38250	NC_014152	CT	3	6	2332285	2332290	0 %	50 %	0 %	50 %	296133749
38251	NC_014152	A	6	6	2332356	2332361	100 %	0 %	0 %	0 %	296133749
38252	NC_014152	GCT	2	6	2332455	2332460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133749
38253	NC_014152	TAC	2	6	2332472	2332477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133749
38254	NC_014152	T	6	6	2332502	2332507	0 %	100 %	0 %	0 %	296133749
38255	NC_014152	TCC	2	6	2332539	2332544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133749
38256	NC_014152	ATG	2	6	2332554	2332559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133749
38257	NC_014152	TAG	2	6	2332666	2332671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133749
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38263	NC_014152	T	6	6	2332952	2332957	0 %	100 %	0 %	0 %	296133750
38264	NC_014152	CTGG	2	8	2332979	2332986	0 %	25 %	50 %	25 %	296133750
38265	NC_014152	CTT	2	6	2333122	2333127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133750
38266	NC_014152	AT	3	6	2333230	2333235	50 %	50 %	0 %	0 %	296133750
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38287	NC_014152	GCA	2	6	2334873	2334878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133751
38288	NC_014152	A	6	6	2334883	2334888	100 %	0 %	0 %	0 %	296133751
38289	NC_014152	ACT	2	6	2334951	2334956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133751
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38332	NC_014152	TCC	2	6	2337770	2337775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133754
38333	NC_014152	ATC	2	6	2337785	2337790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133754
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38336	NC_014152	CAA	2	6	2337879	2337884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133754
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38339	NC_014152	CAG	2	6	2338085	2338090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133755
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38343	NC_014152	CTT	2	6	2338465	2338470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133755
38344	NC_014152	TC	3	6	2338677	2338682	0 %	50 %	0 %	50 %	296133755
38345	NC_014152	C	6	6	2338689	2338694	0 %	0 %	0 %	100 %	296133755
38346	NC_014152	ACCA	2	8	2338727	2338734	50 %	0 %	0 %	50 %	296133755
38347	NC_014152	CGG	2	6	2338789	2338794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133755
38348	NC_014152	AGC	2	6	2338842	2338847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133755
38349	NC_014152	TTG	2	6	2338860	2338865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133755
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38351	NC_014152	TCA	2	6	2338896	2338901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133755
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38466	NC_014152	AGC	2	6	2345961	2345966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133762
38467	NC_014152	ATC	2	6	2345979	2345984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133762
38468	NC_014152	TCAT	2	8	2346037	2346044	25 %	50 %	0 %	25 %	296133762
38469	NC_014152	T	6	6	2346116	2346121	0 %	100 %	0 %	0 %	296133762
38470	NC_014152	CAA	2	6	2346138	2346143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133762
38471	NC_014152	TTTA	2	8	2346288	2346295	25 %	75 %	0 %	0 %	296133762
38472	NC_014152	A	6	6	2346304	2346309	100 %	0 %	0 %	0 %	296133762
38473	NC_014152	TTG	2	6	2346428	2346433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133762
38474	NC_014152	CCT	2	6	2346482	2346487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133762
38475	NC_014152	A	7	7	2346831	2346837	100 %	0 %	0 %	0 %	296133763
38476	NC_014152	AGA	2	6	2346858	2346863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133763
38477	NC_014152	GAA	2	6	2346886	2346891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133763
38478	NC_014152	TC	3	6	2346924	2346929	0 %	50 %	0 %	50 %	296133763
38479	NC_014152	CGG	2	6	2347029	2347034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133763
38480	NC_014152	CTT	2	6	2347191	2347196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133764
38481	NC_014152	GAT	2	6	2347222	2347227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133764
38482	NC_014152	CTG	2	6	2347287	2347292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133764
38483	NC_014152	TGA	2	6	2347323	2347328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133764
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38485	NC_014152	CAG	3	9	2347474	2347482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133764
38486	NC_014152	GC	3	6	2347527	2347532	0 %	0 %	50 %	50 %	296133764
38487	NC_014152	TGG	2	6	2347599	2347604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133764
38488	NC_014152	TCC	2	6	2347640	2347645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133764
38489	NC_014152	AAT	2	6	2347665	2347670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133764
38490	NC_014152	TTG	2	6	2347700	2347705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133764
38491	NC_014152	CAA	2	6	2347728	2347733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133764
38492	NC_014152	AGC	2	6	2347760	2347765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133764
38493	NC_014152	CAA	2	6	2347912	2347917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133764
38494	NC_014152	T	6	6	2347938	2347943	0 %	100 %	0 %	0 %	296133764
38495	NC_014152	CCT	2	6	2347945	2347950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133765
38496	NC_014152	T	6	6	2347958	2347963	0 %	100 %	0 %	0 %	296133765
38497	NC_014152	CAG	2	6	2348018	2348023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133765
38498	NC_014152	TA	3	6	2348035	2348040	50 %	50 %	0 %	0 %	296133765
38499	NC_014152	ATA	2	6	2348043	2348048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133765
38500	NC_014152	GTA	2	6	2348063	2348068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133765

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