MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_014152	AGC	2	6	2130141	2130146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133563
35002	NC_014152	ATCA	2	8	2130216	2130223	50 %	25 %	0 %	25 %	296133563
35003	NC_014152	TGA	2	6	2130260	2130265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133563
35004	NC_014152	ATG	2	6	2130336	2130341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133563
35005	NC_014152	T	8	8	2130345	2130352	0 %	100 %	0 %	0 %	296133563
35006	NC_014152	CATTC	2	10	2130419	2130428	20 %	40 %	0 %	40 %	296133563
35007	NC_014152	ATA	2	6	2130543	2130548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133563
35008	NC_014152	TGA	2	6	2130599	2130604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133563
35009	NC_014152	CAG	2	6	2130615	2130620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133563
35010	NC_014152	GCA	2	6	2130670	2130675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133563
35011	NC_014152	A	7	7	2130679	2130685	100 %	0 %	0 %	0 %	296133563
35012	NC_014152	TAA	2	6	2130820	2130825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133563
35013	NC_014152	GGC	2	6	2131348	2131353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133564
35014	NC_014152	ATA	2	6	2131407	2131412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133564
35015	NC_014152	GCT	2	6	2131415	2131420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133564
35016	NC_014152	ACTCCT	2	12	2131442	2131453	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296133564
35017	NC_014152	TCA	2	6	2131473	2131478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133564
35018	NC_014152	ATG	3	9	2131547	2131555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133564
35019	NC_014152	AG	3	6	2131724	2131729	50 %	0 %	50 %	0 %	296133564
35020	NC_014152	CAG	2	6	2131772	2131777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133564
35021	NC_014152	CTG	2	6	2131796	2131801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133564
35022	NC_014152	CAG	2	6	2131837	2131842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133564
35023	NC_014152	GCTG	2	8	2131849	2131856	0 %	25 %	50 %	25 %	296133564
35024	NC_014152	GAT	2	6	2131907	2131912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133564
35025	NC_014152	AAAT	2	8	2131929	2131936	75 %	25 %	0 %	0 %	296133564
35026	NC_014152	CCCAAT	2	12	2131967	2131978	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	296133564
35027	NC_014152	GCA	2	6	2132051	2132056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133564
35028	NC_014152	A	7	7	2132056	2132062	100 %	0 %	0 %	0 %	296133564
35029	NC_014152	TAA	2	6	2132070	2132075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133564
35030	NC_014152	CCG	2	6	2132163	2132168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133564
35031	NC_014152	CAT	2	6	2132177	2132182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133564
35032	NC_014152	GCT	2	6	2132252	2132257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133564
35033	NC_014152	CCA	2	6	2132283	2132288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133564
35034	NC_014152	AATG	2	8	2133346	2133353	50 %	25 %	25 %	0 %	296133565
35035	NC_014152	AGC	2	6	2133360	2133365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133565
35036	NC_014152	TC	3	6	2133385	2133390	0 %	50 %	0 %	50 %	296133565
35037	NC_014152	CCTG	2	8	2133391	2133398	0 %	25 %	25 %	50 %	296133565
35038	NC_014152	GCA	2	6	2133418	2133423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133565
35039	NC_014152	GCA	2	6	2133456	2133461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133565
35040	NC_014152	AACA	2	8	2133466	2133473	75 %	0 %	0 %	25 %	296133565
35041	NC_014152	CACGG	2	10	2133493	2133502	20 %	0 %	40 %	40 %	296133565
35042	NC_014152	TTC	2	6	2133561	2133566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133565
35043	NC_014152	CGA	2	6	2133598	2133603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133565
35044	NC_014152	TTA	2	6	2133637	2133642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133565
35045	NC_014152	AACT	2	8	2133699	2133706	50 %	25 %	0 %	25 %	296133565
35046	NC_014152	CAA	2	6	2133891	2133896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133566
35047	NC_014152	TA	3	6	2133909	2133914	50 %	50 %	0 %	0 %	296133566
35048	NC_014152	CTG	2	6	2133947	2133952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133566
35049	NC_014152	ACT	2	6	2133971	2133976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133566
35050	NC_014152	AAT	2	6	2134005	2134010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133566
35051	NC_014152	CTA	2	6	2134083	2134088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133567
35052	NC_014152	ACT	2	6	2134277	2134282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133567
35053	NC_014152	ACC	2	6	2134298	2134303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133567
35054	NC_014152	AGGGC	2	10	2134392	2134401	20 %	0 %	60 %	20 %	296133567
35055	NC_014152	T	6	6	2134448	2134453	0 %	100 %	0 %	0 %	296133567
35056	NC_014152	CTG	2	6	2134521	2134526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133567
35057	NC_014152	GCA	2	6	2134561	2134566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133567
35058	NC_014152	T	6	6	2134627	2134632	0 %	100 %	0 %	0 %	296133567
35059	NC_014152	TCA	2	6	2134647	2134652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133567
35060	NC_014152	TCA	2	6	2134659	2134664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133567
35061	NC_014152	CGC	2	6	2134790	2134795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133568
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35100	NC_014152	GCC	2	6	2136644	2136649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133570
35101	NC_014152	TCAGGG	2	12	2136726	2136737	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296133570
35102	NC_014152	CGG	2	6	2136755	2136760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133570
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35110	NC_014152	ATC	2	6	2137434	2137439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133570
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35116	NC_014152	GA	3	6	2137804	2137809	50 %	0 %	50 %	0 %	296133570
35117	NC_014152	AAC	2	6	2137826	2137831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133570
35118	NC_014152	T	6	6	2137835	2137840	0 %	100 %	0 %	0 %	296133570
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35121	NC_014152	T	6	6	2138026	2138031	0 %	100 %	0 %	0 %	296133571
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35213	NC_014152	AACCA	2	10	2142407	2142416	60 %	0 %	0 %	40 %	296133576
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35230	NC_014152	GGCC	2	8	2143419	2143426	0 %	0 %	50 %	50 %	296133577
35231	NC_014152	CTT	2	6	2143517	2143522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133577
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35233	NC_014152	GGA	2	6	2143548	2143553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133577
35234	NC_014152	TCTTT	2	10	2143557	2143566	0 %	80 %	0 %	20 %	296133577
35235	NC_014152	CGGC	2	8	2143577	2143584	0 %	0 %	50 %	50 %	296133577
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35237	NC_014152	ACCA	2	8	2143683	2143690	50 %	0 %	0 %	50 %	296133577
35238	NC_014152	AAC	2	6	2143692	2143697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133577
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35241	NC_014152	TTCGA	2	10	2143863	2143872	20 %	40 %	20 %	20 %	296133578
35242	NC_014152	TA	3	6	2143880	2143885	50 %	50 %	0 %	0 %	296133578
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35248	NC_014152	TGT	2	6	2144691	2144696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133579
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35254	NC_014152	T	7	7	2145289	2145295	0 %	100 %	0 %	0 %	296133581
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35337	NC_014152	AT	3	6	2151273	2151278	50 %	50 %	0 %	0 %	296133585
35338	NC_014152	CT	3	6	2151399	2151404	0 %	50 %	0 %	50 %	296133586
35339	NC_014152	ATCAA	2	10	2151458	2151467	60 %	20 %	0 %	20 %	296133586
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35341	NC_014152	T	7	7	2151542	2151548	0 %	100 %	0 %	0 %	296133586
35342	NC_014152	CG	3	6	2151571	2151576	0 %	0 %	50 %	50 %	296133586
35343	NC_014152	TA	3	6	2151648	2151653	50 %	50 %	0 %	0 %	296133586
35344	NC_014152	TTCCTG	2	12	2151720	2151731	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296133586
35345	NC_014152	CAAA	2	8	2151732	2151739	75 %	0 %	0 %	25 %	296133586
35346	NC_014152	A	7	7	2151743	2151749	100 %	0 %	0 %	0 %	296133586
35347	NC_014152	AATT	2	8	2151753	2151760	50 %	50 %	0 %	0 %	296133586
35348	NC_014152	AAC	2	6	2151782	2151787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133586
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35351	NC_014152	ATG	2	6	2152255	2152260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133587
35352	NC_014152	GTCGA	2	10	2152335	2152344	20 %	20 %	40 %	20 %	296133587
35353	NC_014152	TTG	2	6	2152372	2152377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133587
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35362	NC_014152	T	6	6	2152723	2152728	0 %	100 %	0 %	0 %	296133587
35363	NC_014152	T	6	6	2152977	2152982	0 %	100 %	0 %	0 %	296133587
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35469	NC_014152	TCA	2	6	2160565	2160570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133592
35470	NC_014152	AAAC	2	8	2160612	2160619	75 %	0 %	0 %	25 %	296133592
35471	NC_014152	TTA	2	6	2160643	2160648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133592
35472	NC_014152	CAT	2	6	2160650	2160655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133592
35473	NC_014152	TACA	2	8	2160695	2160702	50 %	25 %	0 %	25 %	296133592
35474	NC_014152	ACA	2	6	2160733	2160738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133592
35475	NC_014152	GGA	2	6	2160806	2160811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133592
35476	NC_014152	CCT	2	6	2160818	2160823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133592
35477	NC_014152	AG	3	6	2161076	2161081	50 %	0 %	50 %	0 %	296133592
35478	NC_014152	GTA	2	6	2161206	2161211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133592
35479	NC_014152	GCT	2	6	2161215	2161220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133592
35480	NC_014152	CAA	2	6	2161254	2161259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133592
35481	NC_014152	TGA	2	6	2161382	2161387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133592
35482	NC_014152	TAA	2	6	2161394	2161399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133592
35483	NC_014152	GCC	2	6	2161416	2161421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133592
35484	NC_014152	A	6	6	2161483	2161488	100 %	0 %	0 %	0 %	296133592
35485	NC_014152	CTG	2	6	2161554	2161559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133593
35486	NC_014152	ACC	2	6	2161611	2161616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133593
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35488	NC_014152	GGA	2	6	2161635	2161640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133593
35489	NC_014152	AGC	2	6	2161689	2161694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133593
35490	NC_014152	CTAT	2	8	2162210	2162217	25 %	50 %	0 %	25 %	296133594
35491	NC_014152	AGC	2	6	2162263	2162268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133594
35492	NC_014152	TGG	2	6	2162346	2162351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133594
35493	NC_014152	CTATC	2	10	2162587	2162596	20 %	40 %	0 %	40 %	296133594
35494	NC_014152	GTC	2	6	2162639	2162644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133594
35495	NC_014152	GCC	2	6	2162646	2162651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133594
35496	NC_014152	GT	3	6	2162663	2162668	0 %	50 %	50 %	0 %	296133594
35497	NC_014152	AGC	2	6	2162959	2162964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133594
35498	NC_014152	TGA	2	6	2162995	2163000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133594
35499	NC_014152	GAA	2	6	2163029	2163034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133594
35500	NC_014152	CGG	2	6	2163064	2163069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133594

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