MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_014152	TGAT	2	8	1287639	1287646	25 %	50 %	25 %	0 %	296132734
21002	NC_014152	AAC	2	6	1287702	1287707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132734
21003	NC_014152	AGCA	2	8	1287754	1287761	50 %	0 %	25 %	25 %	296132734
21004	NC_014152	CCTGT	2	10	1287822	1287831	0 %	40 %	20 %	40 %	296132734
21005	NC_014152	GTTT	2	8	1287839	1287846	0 %	75 %	25 %	0 %	296132734
21006	NC_014152	GAT	2	6	1287881	1287886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132734
21007	NC_014152	A	6	6	1287915	1287920	100 %	0 %	0 %	0 %	296132734
21008	NC_014152	TTTCTT	2	12	1288013	1288024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296132734
21009	NC_014152	TTG	2	6	1288043	1288048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132734
21010	NC_014152	TAT	2	6	1288065	1288070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132734
21011	NC_014152	T	7	7	1288070	1288076	0 %	100 %	0 %	0 %	296132734
21012	NC_014152	T	6	6	1288094	1288099	0 %	100 %	0 %	0 %	296132734
21013	NC_014152	CTT	2	6	1288139	1288144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132734
21014	NC_014152	CAA	2	6	1288145	1288150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132734
21015	NC_014152	TGC	2	6	1288167	1288172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132734
21016	NC_014152	TCC	2	6	1288236	1288241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132734
21017	NC_014152	TTG	2	6	1288557	1288562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132735
21018	NC_014152	GTT	2	6	1288613	1288618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132735
21019	NC_014152	GAAA	2	8	1288837	1288844	75 %	0 %	25 %	0 %	296132736
21020	NC_014152	TTG	2	6	1288929	1288934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132736
21021	NC_014152	CAA	2	6	1289029	1289034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132736
21022	NC_014152	AAG	2	6	1289100	1289105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132736
21023	NC_014152	GGTT	2	8	1289133	1289140	0 %	50 %	50 %	0 %	296132736
21024	NC_014152	CGC	2	6	1289161	1289166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132736
21025	NC_014152	TTA	2	6	1289199	1289204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132736
21026	NC_014152	CAG	2	6	1289210	1289215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132736
21027	NC_014152	GAATA	2	10	1289295	1289304	60 %	20 %	20 %	0 %	296132736
21028	NC_014152	T	6	6	1289325	1289330	0 %	100 %	0 %	0 %	296132736
21029	NC_014152	GAT	2	6	1289351	1289356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132736
21030	NC_014152	AT	3	6	1289355	1289360	50 %	50 %	0 %	0 %	296132736
21031	NC_014152	T	7	7	1289372	1289378	0 %	100 %	0 %	0 %	296132736
21032	NC_014152	CTT	2	6	1289415	1289420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132736
21033	NC_014152	T	6	6	1289419	1289424	0 %	100 %	0 %	0 %	296132736
21034	NC_014152	GAT	2	6	1289459	1289464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132736
21035	NC_014152	AAT	2	6	1289482	1289487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132736
21036	NC_014152	TGC	3	9	1289530	1289538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132736
21037	NC_014152	GGC	2	6	1289548	1289553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132736
21038	NC_014152	AAC	2	6	1289558	1289563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132736
21039	NC_014152	AAC	2	6	1289604	1289609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132736
21040	NC_014152	TGGT	2	8	1289738	1289745	0 %	50 %	50 %	0 %	296132737
21041	NC_014152	AGC	2	6	1289758	1289763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132737
21042	NC_014152	GGA	2	6	1289765	1289770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132737
21043	NC_014152	CCG	2	6	1289795	1289800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132737
21044	NC_014152	CCG	2	6	1289828	1289833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132737
21045	NC_014152	CCTCTG	2	12	1289846	1289857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296132737
21046	NC_014152	TCCA	2	8	1289912	1289919	25 %	25 %	0 %	50 %	296132737
21047	NC_014152	GCA	2	6	1289976	1289981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132737
21048	NC_014152	CTA	2	6	1290117	1290122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132737
21049	NC_014152	TGA	2	6	1290357	1290362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132738
21050	NC_014152	AGGA	2	8	1290404	1290411	50 %	0 %	50 %	0 %	296132738
21051	NC_014152	T	6	6	1290421	1290426	0 %	100 %	0 %	0 %	296132738
21052	NC_014152	CTGAT	2	10	1290473	1290482	20 %	40 %	20 %	20 %	296132738
21053	NC_014152	TGA	2	6	1290494	1290499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132738
21054	NC_014152	ATT	2	6	1290559	1290564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132738
21055	NC_014152	GAT	2	6	1290622	1290627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132738
21056	NC_014152	TA	3	6	1290628	1290633	50 %	50 %	0 %	0 %	296132738
21057	NC_014152	CAG	2	6	1290721	1290726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132738
21058	NC_014152	TTA	2	6	1290820	1290825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132738
21059	NC_014152	CCGG	2	8	1290845	1290852	0 %	0 %	50 %	50 %	296132738
21060	NC_014152	CAG	2	6	1290909	1290914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132738
21061	NC_014152	A	8	8	1290945	1290952	100 %	0 %	0 %	0 %	296132738
21062	NC_014152	GAA	2	6	1290964	1290969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132738
21063	NC_014152	TTTA	2	8	1291042	1291049	25 %	75 %	0 %	0 %	296132739
21064	NC_014152	A	6	6	1291049	1291054	100 %	0 %	0 %	0 %	296132739
21065	NC_014152	TGG	2	6	1291071	1291076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132739
21066	NC_014152	TGA	2	6	1291122	1291127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132739
21067	NC_014152	AGG	2	6	1291149	1291154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132739
21068	NC_014152	AGT	2	6	1291184	1291189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132739
21069	NC_014152	TA	3	6	1291238	1291243	50 %	50 %	0 %	0 %	296132739
21070	NC_014152	TTG	2	6	1291263	1291268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132739
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21072	NC_014152	GAT	3	9	1291345	1291353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132739
21073	NC_014152	AAAC	2	8	1291383	1291390	75 %	0 %	0 %	25 %	296132739
21074	NC_014152	TTG	2	6	1291473	1291478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132739
21075	NC_014152	CGGC	2	8	1291485	1291492	0 %	0 %	50 %	50 %	296132739
21076	NC_014152	T	7	7	1291515	1291521	0 %	100 %	0 %	0 %	296132739
21077	NC_014152	TTA	2	6	1291575	1291580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132739
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21079	NC_014152	TGGCCA	2	12	1291677	1291688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296132739
21080	NC_014152	CG	3	6	1291704	1291709	0 %	0 %	50 %	50 %	296132739
21081	NC_014152	TGA	2	6	1291726	1291731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132739
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21087	NC_014152	CCTGGC	2	12	1292044	1292055	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296132739
21088	NC_014152	ATA	2	6	1292265	1292270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132739
21089	NC_014152	TAA	2	6	1292271	1292276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132739
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21094	NC_014152	GGGCTT	2	12	1292707	1292718	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296132739
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21098	NC_014152	GCA	2	6	1293120	1293125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132740
21099	NC_014152	TTC	2	6	1293139	1293144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132740
21100	NC_014152	TCA	2	6	1293177	1293182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132740
21101	NC_014152	CAT	2	6	1293211	1293216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132740
21102	NC_014152	T	6	6	1293252	1293257	0 %	100 %	0 %	0 %	296132740
21103	NC_014152	CAT	2	6	1293259	1293264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132740
21104	NC_014152	GGGCC	2	10	1293270	1293279	0 %	0 %	60 %	40 %	296132740
21105	NC_014152	TCA	2	6	1293312	1293317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132740
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21107	NC_014152	GCC	2	6	1293341	1293346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132740
21108	NC_014152	CAT	2	6	1293358	1293363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132740
21109	NC_014152	CAT	2	6	1293370	1293375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132740
21110	NC_014152	ATT	2	6	1293398	1293403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132740
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21112	NC_014152	GCA	2	6	1293647	1293652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132740
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21114	NC_014152	GCA	2	6	1293673	1293678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132740
21115	NC_014152	TTC	2	6	1293853	1293858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132740
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21117	NC_014152	TGG	2	6	1293929	1293934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132740
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21352	NC_014152	GA	3	6	1306144	1306149	50 %	0 %	50 %	0 %	296132752
21353	NC_014152	GAA	2	6	1306180	1306185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132752
21354	NC_014152	GCG	2	6	1306217	1306222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132752
21355	NC_014152	CAGCGG	2	12	1306225	1306236	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296132752
21356	NC_014152	TGA	2	6	1306284	1306289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132752
21357	NC_014152	TCT	2	6	1306297	1306302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132752
21358	NC_014152	CTG	2	6	1306336	1306341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132752
21359	NC_014152	AAG	2	6	1306342	1306347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132752
21360	NC_014152	GGT	2	6	1306446	1306451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132752
21361	NC_014152	AAG	2	6	1306467	1306472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132752
21362	NC_014152	GTT	3	9	1306503	1306511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132752
21363	NC_014152	ATC	2	6	1306512	1306517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132752
21364	NC_014152	AACC	2	8	1306545	1306552	50 %	0 %	0 %	50 %	296132752
21365	NC_014152	A	6	6	1306570	1306575	100 %	0 %	0 %	0 %	296132752
21366	NC_014152	GAA	2	6	1306669	1306674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132752
21367	NC_014152	GTT	2	6	1306683	1306688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132752
21368	NC_014152	AAC	2	6	1306703	1306708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132752
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21370	NC_014152	CTGA	2	8	1306757	1306764	25 %	25 %	25 %	25 %	296132752
21371	NC_014152	ATG	2	6	1306812	1306817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132753
21372	NC_014152	CAC	2	6	1306891	1306896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132753
21373	NC_014152	AAAG	2	8	1307014	1307021	75 %	0 %	25 %	0 %	296132753
21374	NC_014152	CCGG	2	8	1307038	1307045	0 %	0 %	50 %	50 %	296132753
21375	NC_014152	TGCT	2	8	1307268	1307275	0 %	50 %	25 %	25 %	296132753
21376	NC_014152	GCC	2	6	1307347	1307352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132753
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21379	NC_014152	GGC	2	6	1308088	1308093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132754
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21381	NC_014152	TAA	2	6	1308234	1308239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132754
21382	NC_014152	ACT	2	6	1308328	1308333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132754
21383	NC_014152	AAGA	2	8	1308364	1308371	75 %	0 %	25 %	0 %	296132754
21384	NC_014152	T	6	6	1308405	1308410	0 %	100 %	0 %	0 %	296132754
21385	NC_014152	T	6	6	1308754	1308759	0 %	100 %	0 %	0 %	296132755
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21388	NC_014152	TGC	2	6	1309015	1309020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132755
21389	NC_014152	ATG	2	6	1309053	1309058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132755
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21403	NC_014152	CTG	2	6	1309801	1309806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132756
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21423	NC_014152	AAATA	2	10	1310850	1310859	80 %	20 %	0 %	0 %	296132757
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21450	NC_014152	T	7	7	1312120	1312126	0 %	100 %	0 %	0 %	296132758
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21456	NC_014152	T	6	6	1312468	1312473	0 %	100 %	0 %	0 %	296132758
21457	NC_014152	CTGGG	2	10	1312480	1312489	0 %	20 %	60 %	20 %	296132758
21458	NC_014152	TA	3	6	1312597	1312602	50 %	50 %	0 %	0 %	296132758
21459	NC_014152	CAA	2	6	1312660	1312665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132758
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21462	NC_014152	CTT	2	6	1312734	1312739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132759
21463	NC_014152	ACAGA	2	10	1312748	1312757	60 %	0 %	20 %	20 %	296132759
21464	NC_014152	CTT	2	6	1312764	1312769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132759
21465	NC_014152	CCT	2	6	1312775	1312780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132759
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21469	NC_014152	T	6	6	1312882	1312887	0 %	100 %	0 %	0 %	296132759
21470	NC_014152	AGT	2	6	1312901	1312906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132759
21471	NC_014152	CGG	2	6	1312920	1312925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132759
21472	NC_014152	GGT	2	6	1312963	1312968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132759
21473	NC_014152	CTG	2	6	1312976	1312981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132759
21474	NC_014152	ATA	2	6	1313009	1313014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132759
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21480	NC_014152	TG	3	6	1313347	1313352	0 %	50 %	50 %	0 %	296132759
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21492	NC_014152	GCA	2	6	1314035	1314040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132760
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21499	NC_014152	G	6	6	1314362	1314367	0 %	0 %	100 %	0 %	296132760
21500	NC_014152	GCT	2	6	1314377	1314382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132760

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