MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20117	NC_014152	TTA	2	6	1234333	1234338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132677
20118	NC_014152	CAA	2	6	1234339	1234344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132677
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20121	NC_014152	CAA	2	6	1234526	1234531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132677
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20230	NC_014152	ATA	2	6	1240703	1240708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132684
20231	NC_014152	GT	3	6	1240870	1240875	0 %	50 %	50 %	0 %	296132684
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20350	NC_014152	GAT	2	6	1249265	1249270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132695
20351	NC_014152	ATG	3	9	1249297	1249305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132695
20352	NC_014152	TGTT	2	8	1249495	1249502	0 %	75 %	25 %	0 %	296132696
20353	NC_014152	T	6	6	1249527	1249532	0 %	100 %	0 %	0 %	296132696
20354	NC_014152	AT	3	6	1249551	1249556	50 %	50 %	0 %	0 %	296132696
20355	NC_014152	A	6	6	1249575	1249580	100 %	0 %	0 %	0 %	296132696
20356	NC_014152	GGAAA	2	10	1249586	1249595	60 %	0 %	40 %	0 %	296132696
20357	NC_014152	TAC	2	6	1249661	1249666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132696
20358	NC_014152	AT	3	6	1249685	1249690	50 %	50 %	0 %	0 %	296132696
20359	NC_014152	C	6	6	1249725	1249730	0 %	0 %	0 %	100 %	296132696
20360	NC_014152	GAT	2	6	1249749	1249754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132696
20361	NC_014152	TTA	3	9	1249771	1249779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132696
20362	NC_014152	CTG	2	6	1249917	1249922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132696
20363	NC_014152	CCT	2	6	1249923	1249928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132696
20364	NC_014152	CCAGG	2	10	1249985	1249994	20 %	0 %	40 %	40 %	296132696
20365	NC_014152	TGA	2	6	1250054	1250059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132696
20366	NC_014152	AGA	2	6	1250066	1250071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132696
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20369	NC_014152	GTG	2	6	1250287	1250292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132697
20370	NC_014152	GAT	2	6	1250336	1250341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132697
20371	NC_014152	AATT	2	8	1250886	1250893	50 %	50 %	0 %	0 %	296132698
20372	NC_014152	TAA	2	6	1250909	1250914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132698
20373	NC_014152	AGA	2	6	1250943	1250948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132698
20374	NC_014152	T	7	7	1250951	1250957	0 %	100 %	0 %	0 %	296132698
20375	NC_014152	CAA	2	6	1250958	1250963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132698
20376	NC_014152	AC	3	6	1250966	1250971	50 %	0 %	0 %	50 %	296132698
20377	NC_014152	GGCA	2	8	1250990	1250997	25 %	0 %	50 %	25 %	296132698
20378	NC_014152	GCC	2	6	1251019	1251024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132698
20379	NC_014152	CGC	2	6	1251053	1251058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132698
20380	NC_014152	CGGG	2	8	1251087	1251094	0 %	0 %	75 %	25 %	296132698
20381	NC_014152	TTTG	2	8	1251134	1251141	0 %	75 %	25 %	0 %	296132698
20382	NC_014152	TGA	2	6	1251159	1251164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132698
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20385	NC_014152	CGT	2	6	1251359	1251364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132699
20386	NC_014152	CTGC	2	8	1251380	1251387	0 %	25 %	25 %	50 %	296132699
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20390	NC_014152	CTT	2	6	1251551	1251556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132699
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20412	NC_014152	TAT	2	6	1252686	1252691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132700
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20421	NC_014152	A	6	6	1253019	1253024	100 %	0 %	0 %	0 %	296132701
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20424	NC_014152	A	6	6	1253128	1253133	100 %	0 %	0 %	0 %	296132701
20425	NC_014152	TGA	2	6	1253153	1253158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132701
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20460	NC_014152	GCT	2	6	1254930	1254935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132704
20461	NC_014152	GAA	2	6	1254967	1254972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132704
20462	NC_014152	CATTG	2	10	1254978	1254987	20 %	40 %	20 %	20 %	296132704
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20465	NC_014152	GCA	2	6	1255141	1255146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132704
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20467	NC_014152	ACA	2	6	1255280	1255285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132704
20468	NC_014152	TGG	2	6	1255311	1255316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132704
20469	NC_014152	GAA	2	6	1255324	1255329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132704
20470	NC_014152	AGAAA	2	10	1255377	1255386	80 %	0 %	20 %	0 %	296132704
20471	NC_014152	TGA	2	6	1255391	1255396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132704
20472	NC_014152	AGC	2	6	1255423	1255428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132704
20473	NC_014152	CTG	2	6	1255454	1255459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132704
20474	NC_014152	AGA	2	6	1255464	1255469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132704
20475	NC_014152	CCG	2	6	1255481	1255486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132704
20476	NC_014152	AAT	2	6	1255489	1255494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132704
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20479	NC_014152	CGA	2	6	1255652	1255657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132704
20480	NC_014152	CAT	2	6	1255689	1255694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132704
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20483	NC_014152	A	6	6	1255907	1255912	100 %	0 %	0 %	0 %	296132705
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20490	NC_014152	ATAA	2	8	1256309	1256316	75 %	25 %	0 %	0 %	296132705
20491	NC_014152	GAA	2	6	1256387	1256392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132705
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20497	NC_014152	G	6	6	1256625	1256630	0 %	0 %	100 %	0 %	296132705
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20499	NC_014152	CCGG	2	8	1256889	1256896	0 %	0 %	50 %	50 %	296132705
20500	NC_014152	A	6	6	1256940	1256945	100 %	0 %	0 %	0 %	296132705

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