MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_014152	CAG	2	6	1100797	1100802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132574
18003	NC_014152	CCG	2	6	1100803	1100808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132574
18004	NC_014152	TGATT	2	10	1100924	1100933	20 %	60 %	20 %	0 %	296132574
18005	NC_014152	GCC	2	6	1101006	1101011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132574
18006	NC_014152	AGA	2	6	1101077	1101082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132574
18007	NC_014152	AAG	2	6	1101112	1101117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132574
18008	NC_014152	GAAA	2	8	1101143	1101150	75 %	0 %	25 %	0 %	296132574
18009	NC_014152	GCT	3	9	1101159	1101167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132574
18010	NC_014152	GGC	2	6	1101200	1101205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132574
18011	NC_014152	ACAG	2	8	1101335	1101342	50 %	0 %	25 %	25 %	296132575
18012	NC_014152	A	6	6	1101388	1101393	100 %	0 %	0 %	0 %	296132575
18013	NC_014152	ATT	2	6	1101414	1101419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132575
18014	NC_014152	GAC	2	6	1101467	1101472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132575
18015	NC_014152	TGA	2	6	1101520	1101525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132575
18016	NC_014152	A	6	6	1101540	1101545	100 %	0 %	0 %	0 %	296132575
18017	NC_014152	GTC	2	6	1101552	1101557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132575
18018	NC_014152	GGA	2	6	1101558	1101563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132575
18019	NC_014152	GAA	2	6	1101609	1101614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132575
18020	NC_014152	ATG	2	6	1101757	1101762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132575
18021	NC_014152	TGG	2	6	1101769	1101774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132575
18022	NC_014152	GTT	2	6	1101860	1101865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132575
18023	NC_014152	T	6	6	1101888	1101893	0 %	100 %	0 %	0 %	296132575
18024	NC_014152	AAC	2	6	1101894	1101899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132575
18025	NC_014152	TAT	2	6	1102071	1102076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132575
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18027	NC_014152	GGA	2	6	1102313	1102318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132576
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18032	NC_014152	GC	3	6	1102568	1102573	0 %	0 %	50 %	50 %	296132576
18033	NC_014152	ATTG	2	8	1102628	1102635	25 %	50 %	25 %	0 %	296132576
18034	NC_014152	GAG	2	6	1102680	1102685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132576
18035	NC_014152	CTCA	2	8	1102736	1102743	25 %	25 %	0 %	50 %	296132576
18036	NC_014152	GGC	2	6	1102845	1102850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132576
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18039	NC_014152	TGT	2	6	1103142	1103147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132577
18040	NC_014152	A	6	6	1103160	1103165	100 %	0 %	0 %	0 %	296132577
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18042	NC_014152	A	6	6	1103368	1103373	100 %	0 %	0 %	0 %	296132577
18043	NC_014152	TCA	2	6	1104179	1104184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132578
18044	NC_014152	TTC	2	6	1104203	1104208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132578
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18046	NC_014152	AT	3	6	1104221	1104226	50 %	50 %	0 %	0 %	296132578
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18048	NC_014152	TAA	2	6	1104327	1104332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132578
18049	NC_014152	GAAA	2	8	1104382	1104389	75 %	0 %	25 %	0 %	296132578
18050	NC_014152	A	8	8	1104387	1104394	100 %	0 %	0 %	0 %	296132578
18051	NC_014152	GAT	2	6	1104418	1104423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132578
18052	NC_014152	ACC	2	6	1104584	1104589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132578
18053	NC_014152	GA	3	6	1104727	1104732	50 %	0 %	50 %	0 %	296132578
18054	NC_014152	CATTT	2	10	1104801	1104810	20 %	60 %	0 %	20 %	296132578
18055	NC_014152	TG	3	6	1104881	1104886	0 %	50 %	50 %	0 %	296132579
18056	NC_014152	ATTCCC	2	12	1104946	1104957	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296132579
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18061	NC_014152	TGTT	2	8	1105055	1105062	0 %	75 %	25 %	0 %	296132579
18062	NC_014152	TGG	2	6	1105097	1105102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132579
18063	NC_014152	CTG	2	6	1105129	1105134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132579
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18091	NC_014152	A	6	6	1105963	1105968	100 %	0 %	0 %	0 %	296132579
18092	NC_014152	ATA	2	6	1105973	1105978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132579
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18117	NC_014152	A	6	6	1107533	1107538	100 %	0 %	0 %	0 %	296132580
18118	NC_014152	GCAG	2	8	1107543	1107550	25 %	0 %	50 %	25 %	296132580
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18120	NC_014152	GAT	3	9	1107577	1107585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132580
18121	NC_014152	TGT	2	6	1107616	1107621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132581
18122	NC_014152	TTA	2	6	1107693	1107698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132581
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18125	NC_014152	TGA	2	6	1108040	1108045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132582
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18132	NC_014152	CTG	2	6	1108324	1108329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132582
18133	NC_014152	AAG	2	6	1108336	1108341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132582
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18138	NC_014152	TGA	2	6	1108635	1108640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132582
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18147	NC_014152	T	6	6	1108971	1108976	0 %	100 %	0 %	0 %	296132583
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18221	NC_014152	A	6	6	1113634	1113639	100 %	0 %	0 %	0 %	296132585
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18226	NC_014152	CCA	2	6	1113809	1113814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132585
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18229	NC_014152	GCC	2	6	1114062	1114067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132585
18230	NC_014152	TCATT	2	10	1114076	1114085	20 %	60 %	0 %	20 %	296132585
18231	NC_014152	AAAG	2	8	1114104	1114111	75 %	0 %	25 %	0 %	296132585
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18233	NC_014152	TGA	2	6	1114292	1114297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132585
18234	NC_014152	GGA	3	9	1114370	1114378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132585
18235	NC_014152	TCAGG	2	10	1114426	1114435	20 %	20 %	40 %	20 %	296132585
18236	NC_014152	GCA	2	6	1114456	1114461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132585
18237	NC_014152	ATG	2	6	1114486	1114491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132585
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18239	NC_014152	TGCGG	2	10	1114629	1114638	0 %	20 %	60 %	20 %	296132585
18240	NC_014152	GTA	2	6	1114806	1114811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132586
18241	NC_014152	CTG	2	6	1114813	1114818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132586
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18247	NC_014152	CGG	2	6	1115077	1115082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132586
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18249	NC_014152	GGT	2	6	1115098	1115103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132586
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18265	NC_014152	TGA	2	6	1116198	1116203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132588
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18344	NC_014152	TGA	2	6	1122528	1122533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132591
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18350	NC_014152	ATA	3	9	1122926	1122934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132591
18351	NC_014152	TAT	2	6	1122990	1122995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132591
18352	NC_014152	ATT	2	6	1123067	1123072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132591
18353	NC_014152	T	6	6	1123095	1123100	0 %	100 %	0 %	0 %	296132591
18354	NC_014152	TCT	2	6	1123142	1123147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132591
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18357	NC_014152	CTG	2	6	1123241	1123246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132591
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18370	NC_014152	AGAT	2	8	1123806	1123813	50 %	25 %	25 %	0 %	296132592
18371	NC_014152	TGA	2	6	1123968	1123973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132592
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18377	NC_014152	TTTA	2	8	1124258	1124265	25 %	75 %	0 %	0 %	296132592
18378	NC_014152	TGA	2	6	1124322	1124327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132592
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18458	NC_014152	ATAA	2	8	1129522	1129529	75 %	25 %	0 %	0 %	296132596
18459	NC_014152	AAAC	2	8	1129551	1129558	75 %	0 %	0 %	25 %	296132596
18460	NC_014152	CCG	2	6	1129721	1129726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132596
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18464	NC_014152	GGT	2	6	1129963	1129968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132596
18465	NC_014152	GACCT	2	10	1129970	1129979	20 %	20 %	20 %	40 %	296132596
18466	NC_014152	GCA	2	6	1130048	1130053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132596
18467	NC_014152	TCTG	2	8	1130055	1130062	0 %	50 %	25 %	25 %	296132596
18468	NC_014152	AGAT	2	8	1130063	1130070	50 %	25 %	25 %	0 %	296132596
18469	NC_014152	CTTG	2	8	1130178	1130185	0 %	50 %	25 %	25 %	296132596
18470	NC_014152	GAA	2	6	1130236	1130241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132596
18471	NC_014152	TAA	2	6	1130282	1130287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132596
18472	NC_014152	AT	3	6	1130297	1130302	50 %	50 %	0 %	0 %	296132596
18473	NC_014152	TTC	2	6	1130310	1130315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132596
18474	NC_014152	TGAAC	2	10	1130370	1130379	40 %	20 %	20 %	20 %	296132596
18475	NC_014152	AAG	3	9	1130412	1130420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132596
18476	NC_014152	A	8	8	1130421	1130428	100 %	0 %	0 %	0 %	296132596
18477	NC_014152	TA	3	6	1130820	1130825	50 %	50 %	0 %	0 %	296132597
18478	NC_014152	ATTTT	2	10	1130837	1130846	20 %	80 %	0 %	0 %	296132597
18479	NC_014152	AAT	2	6	1130905	1130910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132597
18480	NC_014152	TTG	2	6	1130990	1130995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132597
18481	NC_014152	TATTGG	2	12	1131172	1131183	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296132597
18482	NC_014152	ATT	3	9	1131215	1131223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132597
18483	NC_014152	TATT	2	8	1131302	1131309	25 %	75 %	0 %	0 %	296132597
18484	NC_014152	T	6	6	1131949	1131954	0 %	100 %	0 %	0 %	296132598
18485	NC_014152	TTC	2	6	1132045	1132050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132598
18486	NC_014152	GCTG	2	8	1132063	1132070	0 %	25 %	50 %	25 %	296132598
18487	NC_014152	ATG	2	6	1132137	1132142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132598
18488	NC_014152	GAT	2	6	1132156	1132161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132598
18489	NC_014152	AGA	2	6	1132163	1132168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132598
18490	NC_014152	TAA	2	6	1132219	1132224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132598
18491	NC_014152	CTG	2	6	1132299	1132304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132598
18492	NC_014152	TGC	2	6	1132344	1132349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132598
18493	NC_014152	TAA	2	6	1132374	1132379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132598
18494	NC_014152	GTA	2	6	1132382	1132387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132598
18495	NC_014152	GGC	2	6	1132397	1132402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132598
18496	NC_014152	AGC	2	6	1132411	1132416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132598
18497	NC_014152	ACA	2	6	1132428	1132433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132598
18498	NC_014152	TGG	2	6	1132516	1132521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132598
18499	NC_014152	GAGG	2	8	1132522	1132529	25 %	0 %	75 %	0 %	296132598
18500	NC_014152	A	6	6	1132546	1132551	100 %	0 %	0 %	0 %	296132598

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